上海生科院通过生物大数据揭示反式剪接的基因演化功能

11月2日,Nature Communications 发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组题为The evolutionary landscape of intergenic trans-splicing events in insects 的研究论文。该工作揭示了反式剪接引导基因功能多样化的过程,并首次阐述了反式剪接在维持破碎基因功能方面的作用。 真核生物的基因具有复杂的剪接(splicing)机制。与比较常见的发生在同一个转录本(pre-mRNA)上的顺式剪接(cis-splicing)不同,RNA反式剪接(trans-splicing)是将不同基因转录本上的外显子连接起来,形成嵌合mRNA的现象。虽然真核生物中已有一些基因反式剪接案例的报道,但反式剪接的一些关键问题仍然没有得到解决: 包括反式剪接是剪接过程中的噪音还是具有显著的生物学功能?基因反式剪接在多大程度上影响了一个物种的转录组和蛋......阅读全文

上海生科院Cell子刊发表免疫研究新成果

  来自中科院上海生命科学研究院、约翰霍普金斯大学医学院的研究人员证实,泛素连接酶Stub1通过促进转录因子Foxp3降解,负向调控了调节性T (Treg)细胞的抑制活性。研究论文发表在8月22日的《免疫》(Immunity)杂志上。   中科院上海生命科学研究院的李斌(Bin Li)研究员和

上海生科院揭示脑室旁灰质异位发生机制

  1月14日,中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所熊志奇研究组在《神经科学杂志》在线发表了题为《Rcan1缺乏引起神经元迁移缺陷并引发脑室旁灰质异位》的研究论文。该论文报道了钙调磷酸酶调节蛋白Rcan1在大脑皮层的发育以及脑室旁灰质异位发生过程中的重要作用。  脑室旁灰质异位(periven

上海生科院揭示Pinna旋转错觉感知的脑机制

  眼睛是心灵的窗口,自古以来,视觉感知吸引着人类强烈的好奇心和经久不衰的研究热情。睁开眼睛看世界,这个看似毫不费力的动作实际上蕴含了极其复杂的神经网络和海量的神经运算。视觉错觉,是一种真实的感知觉,它反映的是人视网膜物理(光)输入和大脑视皮层感知之间的不一致,是人类大脑通过复杂的脑区之间的相互作用

丹麦科技创新部部长率团访问上海生科院

  9月14日上午,丹麦科技创新部部长Charlotte Sahl-Madsen女士一行30余人访问中科院上海生命科学研究院。  上海生科院副院长吴家睿欢迎代表团一行,并介绍了上海生科院及“上海生命科学研究院-诺和诺德公司糖尿病前期转化型研究中心”概况。诺和诺德公司副总裁Børge

上海生科院创建更精准谱系示踪技术

  近日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组的科研成果,以Enhancing the precision of genetic lineage tracing using dual recombinases为题,在线发表在Nature Medicine上。该研究将Dre

上海生科院发现视网膜自发活动波的起源

  9月3日,《自然-通讯》期刊在线发表了中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所杜久林研究组题为《双极细胞通过突触前NMDA自受体放大机制介导视网膜波的发生》的研究论文。该研究发现谷氨酸能视网膜自发活动波的发生是由双极细胞轴突末梢NMDA自受体依赖的放大机制所介导。  在发育早期的视网膜中,相邻

上海生科院发现植物抗虫调控新机制

  植物固着生长,演化出多种防御策略来抵御病虫害,适应干旱、高温等环境变化。许多昆虫以植物为食,虫害给农作物生产带来巨大损失。然而过于活跃的防御反应大量消耗能量,影响植物正常的生长及繁衍。因此,生长和防御是一个相互制约、此消彼长的动态过程。植物从发芽、生长到开花结实,可能遭遇不同种群不同密度的昆虫侵

上海生科院揭示肺纤维化的分子机制

  10月28日,国际学术期刊Journal of Molecular Cell Biology 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所葛高翔研究组的最新研究成果“Lysyl oxidase promotes bleomycin-induced lung fibrosis

上海生科院合作研究深度解析脑功能联接图谱

  5月8日,中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所王征研究组在IEEE Transactions on Medical Imaging 杂志在线发表了题为Discriminative Structured Feature Engineering for Macroscale Brain Con

上海生科院揭示植物花青素合成调控机理

  5月2日,中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所黄继荣课题组在2016年5月出版的最新一期《分子植物》(Molecular Plant)上发表了题为DELLA proteins promote anthocyanin biosynthesis through sequestering M

上海生科院发现调控炎症反应的新机制

  近日,国际学术期刊《细胞研究》(Cell Research)发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所谢东研究组题为RACK1 modulates NF-κB activation by interfering with the interaction between TRAF2 an

上海生科院揭示介导树突棘修剪的分子机制

  8月7日,《细胞》期刊在线发表了中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所于翔研究组题为《树突棘的协同修剪与成熟由树突棘间对Cadherin/catenin复合物的竞争所介导》的研究论文。该研究发现相邻树突棘之间对cadherin/catenin复合物的竞争决定了它们在树突棘修剪过程中的不同命运

上海生科院实现肌肉干细胞在体外扩增

  5月15日,学术期刊Cell Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所胡苹研究组和王红艳研究组合作研究的最新论文:Combination of inflammation-related cytokines promotes long-term muscl

“新功能人造生物器件的构建与集成”项目启动会召开

  12月18日,由中科院合成生物学重点实验室主持承担的国家973计划项目“新功能人造生物器件的构建与集成”启动工作会议在上海市召开。出席会议的有科技部基础司副司长彭以祺、上海市科委副主任施强华、上海市科委基础处处长胡睦、中科院上海生科院副院长李林、中科院上海生科院植生生态所所长薛红卫;出席会议的专

上海生科院参加上海市事业档案工作学术研讨会

  7月2日下午,2010年上海市事业档案工作学术研讨会在上海理工大学举行。来自区县档案局、银行、卫生、高校、中科院系统的百余名机构负责人、论文作者及从业人员代表参加了会议。上海市档案局局长兼上海市档案馆馆长、上海市档案学会会长吴辰,上海市档案局副局长、上海市档案馆副馆长、上海市档案学

揭开蛇“毒”基因里演化的“秘密”

  近日,中国科学院成都生物研究所李家堂研究团队基于多种高通量测序技术,组装了染色体水平的银环蛇参考基因组,同时结合多组织转录组,对银环蛇毒素基因家族的构成进行了深入探索,并进一步解析了眼镜蛇科毒液中重要毒素成分之一——三指毒家族的演化。相关研究成果以《三指毒亚家族的新发现及其结构和功能的分化》为题

GenOrigin——一种多物种蛋白质编码基因起源与演化的数据库

  2021年6月14日,JGG在线发表了华中农业大学陈振夏教授课题组题为“GenOrigin: A Comprehensive Protein-coding Gene Origination Database on the Evolutionary Timescale of Life”的研究论文。

上海生科院与赛诺菲-安万特公司签订ZL技术许可合同

  上海生科院与跨国医药企业赛诺菲-安万特公司ZL技术许可合同签约仪式于7月21日上午举行。中科院副院长李家洋、上海市副市长沈晓明出席并致辞。国家知识产权局原局长王景川,上海市委副秘书长李逸平,赛诺菲-安万特全球研发执行副总裁Marc Cluzel等出席仪式。中科院上海生命科学研究院

上海生科院多项成果获2010年度上海市科技奖

  4月27日上午,上海市2010年度科技奖励大会在上海展览中心友谊会堂举行,俞正声、韩正等市委、市政府主要领导出席、颁奖,并做讲话。 2010年度上海市科学技术奖授奖298项(人),其中自然科学奖25项、技术发明奖32项、科技进步奖240项、国际科技合作奖1人。  中科院上海生命科学研究院共有3项

上海生科院在二萜类化合物的合成生物学研究中取得进展

  9月14日,Cell Research 期刊在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所王勇研究组的研究论文:Pathway mining-based integration of critical enzyme parts for de novo biosynthesis of s

上海生科院等发表综述聚焦中国糖尿病危机

  目前我国成人2型糖尿病患病人数超过1亿,居全球之首。2型糖尿病及其并发症已成为我国最为主要的公共卫生危机之一。预计到2030年,中国糖尿病的医疗开支将达到3600亿元人民币。   9月11日,The Lancet Diabetes & Endocrinology 杂志发表了三篇系列综述聚

Development发表上海生科院关于精原细胞分化新发现

  3月10日,国际学术期刊Development 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所童明汉研究组的最新研究成果:Retinoid signaling controls spermatogonial differentiation by regulating expre

上海生科院揭示冠状病毒编码校正的分子机制

  中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心•上海(筹)特聘研究员兼清华大学教授、中科院院士饶子和与国家蛋白质中心研究员张荣光领导的研究团队在新发MERS/SARS冠状病毒研究中取得新进展,首次揭示了nsp14–nsp10复合体的结构基础,阐明了冠状病毒编码校正的分子

上海生科院Cell-Res心血管研究新发现

  来自中国科学院上海生命科学研究院营养所的研究人员,利用转基因小鼠模型揭示了冠状动脉的起源与发育程序,证实冠状动脉是由心外膜内皮细胞侵入到胚胎心室壁而形成。这一研究发现在线发表在6月25日的《细胞研究》(Cell research)杂志上。   文章的通讯作者是中科院上海生命科学研究院营养所

上海生科院揭示节食导致线虫寿命延长的分子机制

  3月8日,国际学术期刊Cell Metabolism 发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学伙伴研究所韩敬东研究组的论文A Systems Approach to Reverse Engineer Lifespan Extension by Dietary Restriction。该研究揭

上海生科院揭示心脏修复再生中新血管形成的机制

  6月26日,国际学术期刊Journal of Clinical Investigation 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组的科研成果Preexisting coronary endothelial cells mediate cardiac neova

上海生科院等建立人的单倍体胚胎干细胞

  5月17日,国际学术期刊Cell Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所李劲松研究组和上海交通大学仁济医院陈子江研究组的合作研究论文,该研究建立了来自人孤雌囊胚的单倍体胚胎干细胞系。  哺乳动物,包括小鼠、大鼠和猴,其单倍体胚胎干细胞的建立为遗传筛选研

上海生科院揭示棉纤维伸长发育的调控机制

  中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所陈晓亚研究组克隆鉴定了控制棉纤维生长的一个关键基因,成果于11月21日在Nature Communications 发表,题为《异形框转录因子GhHOX3控制棉纤维生长》(Control of cotton fiber elongation by a

上海生科院提出植物芽从头再生的分子框架图

  在合适培养环境条件下,植物离体组织或器官(也称为外植体)能够从头再生出新的分生组织。六十多年前,Skoog和Miller发现细胞分裂素和生长素是诱导外植体从头建立茎尖或根尖分生组织的关键要素,但其中蕴含的分子机制尚不清晰。4月7日,《植物细胞》(The Plant Cell)杂志在线发表了中国科

上海生科院利用STTM技术发现水稻miRNA的新功能

   5月1日,《美国科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Short tandem target mimic rice lines uncover functions of miRNAs in regulating importan