上海生科院通过生物大数据揭示反式剪接的基因演化功能
11月2日,Nature Communications 发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组题为The evolutionary landscape of intergenic trans-splicing events in insects 的研究论文。该工作揭示了反式剪接引导基因功能多样化的过程,并首次阐述了反式剪接在维持破碎基因功能方面的作用。 真核生物的基因具有复杂的剪接(splicing)机制。与比较常见的发生在同一个转录本(pre-mRNA)上的顺式剪接(cis-splicing)不同,RNA反式剪接(trans-splicing)是将不同基因转录本上的外显子连接起来,形成嵌合mRNA的现象。虽然真核生物中已有一些基因反式剪接案例的报道,但反式剪接的一些关键问题仍然没有得到解决: 包括反式剪接是剪接过程中的噪音还是具有显著的生物学功能?基因反式剪接在多大程度上影响了一个物种的转录组和蛋......阅读全文
上海生科院973计划最新Cell子刊文章
来自中科院上海生科院神经所的研究人员采用活体共聚焦和双光子成像等多种技术,发现了静息态小胶质细胞与神经元之间的双向功能调节,这首次证明了神经元电活动可以调控静息态小胶质细胞的运动,并揭示了小胶质细胞对神经元活动的稳态调节,为神经-免疫交叉领域提供了新的研究思路。相关成果公布在 Develop
上海生科院揭示离子通道功能调控机制
2月4日,中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所蔡时青组在《神经科学杂志》发表了题为《线虫Kv4钾离子通道KChIP辅助亚基调控肌肉兴奋性和控制雄虫交配行为》的研究论文。文章报道了线虫KChIP辅助亚基通过促进Kv4钾离子通道的生成,调控神经元和肌肉细胞的兴奋性,进而影响动物的一些重要行为。
上海生科院Cancer-cell发表癌症研究新成果
来自中国科学院上海生命科学研究院的研究人员证实,VGLL4是胃癌中一种潜在的肿瘤抑制因子,其可通过直接与YAP竞争结合TEADs抑制胃癌生长。并由此提出了对抗YAP驱动的一些人类癌症的一种新治疗策略。这些研究成果在线发表在2月10日的《癌细胞》(Cancer cell)杂志上。 中科院
上海生科院揭示动物防御行为的神经机制
7月20日,中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所王佐仁研究组在《神经科学杂志》发表了题为《导水管周围灰质神经活动在不同类型的防御行为中的作用》的研究论文。该研究报道了中脑导水管周围灰质脑区periaqueductal gray (PAG)参与动物防御行为的神经机制。 防御行为,比如逃跑、
上海生科院揭示水稻籽粒大小调控机制
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所国家基因研究中心团队在水稻控制籽粒大小的分子机制研究方面取得重要进展。他们经过多年的努力成功克隆和鉴定了一个控制水稻粒长与千粒重的关键基因GLW7,并深入研究了其分子机理及在水稻遗传改良中的作用,相关研究论文于3月7日在线发表在Nature Gene
上海生科院PNAS解析泛酸跨膜转运蛋白
12月15日,PNAS 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所张鹏研究组题为Structure of a pantothenate transporter and implications for ECF module sharing and energy co
上海生科院科研人员研发了-premRNA可变剪接分析软件CASH
4 月 6 日,国际著名生物信息学期刊 Briefings in Bioinformatics 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)冯英组和浙江农林大学吴文武博士,上海列冰生物科技有限公司宗杰博士的最新研究进展“CASH: a constructing comprehensiv
生科院发布首个全球人群基因组多样性和祖源信息数据库
11月3日,中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)计算生物学研究所徐书华课题组的研究成果,以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human popula
韩敬东任中科院上海生科院计算生物学研究所所长
据中国科学院上海生命科学研究院网站消息,9月1日,中国科学院上海生命科学研究院举行计算生物学研究所所长聘任会议,韩敬东研究员被聘任为上海生命科学研究院计算生物学研究所所长。 韩敬东,1991年获中国药科大学学士;1996年获Albert Einstein College of
上海生科院在多不饱和脂肪酸遗传易感基因研究中取得进展
1月6日,国际遗传学期刊Human Molecular Genetics(《人类分子遗传学》)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所林旭研究组开展亚洲人群多不饱和脂肪酸全基因组关联研究的成果:Genome-wide meta-analyses identify novel loci
上海生科院合作完成世界首例双峰驼全基因组序列图谱
11月13日,中国科学院上海生命科学研究院/中国科学院系统生物学重点实验室李亦学研究员课题组与内蒙古农业大学、上海交通大学、南开大学等研究机构的科研人员合作完成了世界首例双峰驼全基因组序列图谱绘制和破译工作,成果在Nature Communications(DOI: 10.103
上海生科院SBI基因编码GA2氧化酶调控水稻品种研究获进展
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李来庚研究组与湖南亚华种业科学研究院杨远柱团队合作,发现了一个新的特异调控水稻茎秆基部节长度的基因,该基因在培育水稻半矮秆性状,提高抗倒伏能力,增加大面积水稻产量方面显示了重要的应用价值。SBI基因编码GA2氧化酶调控水稻品种株高及茎秆基部节间长度
南京古生物所揭示寒武纪大爆发前夕动物的重要演化事件
身体两侧对称和分节现象的产生是动物演化史上极为重要的事件。分节的出现意味着身体的结构有了分区,功能上也就有了分工。但是,这类体型复杂的动物何时出现?自达尔文以来,这个问题一直是古生物学家和演化生物学家关注的焦点。 “寒武纪大爆发”中出现了大量的以三叶虫为代表的具分节的两侧对称动物,因此,寒武纪
首届全国合成微生物学学术研讨会成功举行
由中国微生物学会分子微生物学及生物工程专业委员会和上海市微生物学会共同主办,中科院上海生科院植物生理生态研究所中科院合成生物学重点实验室和上海医药工业研究院创新药物与制药工艺国家重点实验室(筹)联合承办的“首届全国合成微生物学学术研讨会”于2010年9月26日―9月27日在上海举行
各种模式生物必需基因在线数据库
Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation
上海推进转基因生物检测技术标准研究
新华报业网讯 据上海市农业科学院提供的最新消息说,上海农业科研人员在国内外率先开展了转基因油菜和玉米的定性、定量检测方法研究,并参与制定了相关的国家标准,在国内开展了转基因农产品的检测服务。目前,农业部在上海的转基因植物环境安全监督检验测试中心已建成。 据上海市农科院相关负责人介绍,200
发现重复基因剪接信号演化特点
近日,中科院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所孔祥银课题组张振国等人发现基因重复后基因剪接信号演化特点,以及这些变化对基因新结构形成的影响,该成果在线发表在《基因组生物学》(Genome Biology)杂志上。 在物种进化过程中,基因重复是经常发生的。那么基因重复后,基
上海生科院揭示果蝇精巢稳态调控新机制
中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所赵允研究组的研究成果,以Repression of Abd-B by Polycomb is critical for cell identity maintenance in adult Drosophila testis为题,在线发表在S
上海生科院发现DNA碱基编辑的新方法
10月10日,国际学术期刊《自然-方法》(Nature Methods)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所常兴研究组题为Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic div
上海生科院发现视网膜自发活动波的起源
9月3日,《自然-通讯》期刊在线发表了中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所杜久林研究组题为《双极细胞通过突触前NMDA自受体放大机制介导视网膜波的发生》的研究论文。该研究发现谷氨酸能视网膜自发活动波的发生是由双极细胞轴突末梢NMDA自受体依赖的放大机制所介导。 在发育早期的视网膜中,相邻
上海生科院完整染色体敲除研究获进展
11月25日,中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心杨辉研究组与北京大学胡家志实验室合作完成的研究论文,以《CRISPR/Cas9介导的基因编辑技术敲除目标染色体》为题,发表在《基因组生物学》上。该研究介绍了CRISPR/Cas9技术的新型应用,即在细胞、胚胎或
上海生科院第一作者讲坛第51期举行
9月17日下午,上海生科院研究生部主办的第51期“第一作者讲坛”在中科大厦一楼报告厅如期举行。植生生态所龚继明研究员指导的博士生李建勇为大家带来了一场题为“NO3-:小分子、大作用”的精彩报告。 随着现代化的发展,我国面临着严重的氮肥过度使用和土壤重金属污染问题,不但对农业的可持续发展造成
上海生科院创建更精准谱系示踪技术
近日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组的科研成果,以Enhancing the precision of genetic lineage tracing using dual recombinases为题,在线发表在Nature Medicine上。该研究将Dre
上海生科院揭示果蝇精巢稳态调控新机制
中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所赵允研究组的研究成果,以Repression of Abd-B by Polycomb is critical for cell identity maintenance in adult Drosophila testis为题,在线发表在S
上海生科院合作研究深度解析脑功能联接图谱
5月8日,中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所王征研究组在IEEE Transactions on Medical Imaging 杂志在线发表了题为Discriminative Structured Feature Engineering for Macroscale Brain Con
上海生科院葛高翔连发两项重要成果
中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所葛高翔主要研究方向为细胞微环境对肿瘤发生及转移的调控。五月份,其带领的课题组先后在国际学术期刊《Journal of Cellular Biochemistry》和《PLOS Genetics》发表了两项最新研究成果,分别解析了肿瘤坏死因子T
《科学》杂志编辑Kristen-Mueller博士访问上海生科院
讲座现场 10月17日,《科学》(Science)杂志编辑Kristen Mueller博士在《科学》国际合作与运营副总监吴若蕾女士陪同下访问中科院上海生命科学研究院,并举行题为Scientific Publishing from the Inside Out的讲座。 上
丹麦科技创新部部长率团访问上海生科院
9月14日上午,丹麦科技创新部部长Charlotte Sahl-Madsen女士一行30余人访问中科院上海生命科学研究院。 上海生科院副院长吴家睿欢迎代表团一行,并介绍了上海生科院及“上海生命科学研究院-诺和诺德公司糖尿病前期转化型研究中心”概况。诺和诺德公司副总裁Børge
上海生科院发现植物抗虫调控新机制
植物固着生长,演化出多种防御策略来抵御病虫害,适应干旱、高温等环境变化。许多昆虫以植物为食,虫害给农作物生产带来巨大损失。然而过于活跃的防御反应大量消耗能量,影响植物正常的生长及繁衍。因此,生长和防御是一个相互制约、此消彼长的动态过程。植物从发芽、生长到开花结实,可能遭遇不同种群不同密度的昆虫侵
上海生科院完整染色体敲除研究获进展
11月25日,中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心杨辉研究组与北京大学胡家志实验室合作完成的研究论文,以《CRISPR/Cas9介导的基因编辑技术敲除目标染色体》为题,发表在《基因组生物学》上。该研究介绍了CRISPR/Cas9技术的新型应用,即在细胞、胚胎或