NatChemBiol:首次解析癌症蛋白的3D晶体结构
来自格里菲斯大学的科学家日前在Nature Chemical Biology杂志上刊登了他们的最新研究成果,研究者通过研究确定了一种和癌症扩散相关的特殊蛋白的三维结构图谱,研究者表示,这种关键蛋白的3-D图谱展示了细菌的乙酰肝素酶的架构及原子水平细节,而乙酰肝素酶是一种可以降解名为硫酸类肝素的酶类。 文章中,研究者von Itzstein说道,我们在功能上鉴别出了在人类癌症中过度表达的一种酶类的结构,这种酶类和肿瘤血管发生直接相关,而且还同机体炎性及癌症潜在转移直接相关,这或许可以帮助开发一种新型潜在的药物靶点。截至目前为止全球科学家们仅仅可以利用计算研究分析来解析这种特殊酶类的3-D结构,而本文研究中研究者通过X射线晶体学技术对该酶类的结构进行了结晶及研究,从而首次在全球报道了类肝素酶的X-射线晶体学结构。 该研究可以精细地告诉我们基底物质可以结合在催化域的什么部位,同时研究者还可以通过突变特定的氨基酸来深入研究该催化......阅读全文
Nat-Chem-Biol:首次解析癌症蛋白的3D晶体结构
来自格里菲斯大学的科学家日前在Nature Chemical Biology杂志上刊登了他们的最新研究成果,研究者通过研究确定了一种和癌症扩散相关的特殊蛋白的三维结构图谱,研究者表示,这种关键蛋白的3-D图谱展示了细菌的乙酰肝素酶的架构及原子水平细节,而乙酰肝素酶是一种可以降解名为硫酸类肝素的酶
如何选择蛋白晶体结构
在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。 1. 确定蛋白种属 在实验当中,研究人员通常使用动物模型(如小鼠)来研究人源蛋白。这样做有许
如何选择蛋白晶体结构?
在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。1. 确定蛋白种属在实验当中,研究人员通常使用动物模型(如小鼠)来研究人源蛋白。这样做有许多原因,比如:1) 无
中科院发现寨卡病毒关键蛋白晶体结构
近日,中科院微生物研究所院士高福和中科院北京生命科学研究院副研究员施一带领的科研团队针对寨卡病毒(ZIKV)进行分析,发现非结构蛋白1(NS1)的分子结构。该研究成果提供了非结构蛋白1的原子层面图像,在这之前非结构蛋白1同样参与了登革热、西尼罗河病毒等疾病的发病机制,相关研究成果在线发表于4月1
中国科学家解析寨卡病毒蛋白晶体结构
近日,《自然—结构和分子生物学》网络版发表了中科院微生物研究所研究员施一和中科院院士高福团队最新发现的寨卡病毒(ZIKV)的非结构蛋白1(NS1)的分子结构,并提供了一个原子层面的图像。NS1参与了例如登革热、西尼罗河病毒等疾病的发病机制当中。 蚊子传播的寨卡病毒目前正在美洲流行。虽然寨卡病毒
微生物所解析寨卡病毒蛋白晶体结构
中国科学院微生物研究所研究员施一和中国科学院院士高福团队通力合作在揭示寨卡病毒致病机制方面取得新进展,研究结果以Zika virus NS1 structure reveals diversity of electrostatic surfaces among flaviviruses(《寨卡病
Nature癌症综述:癌症中的黏连蛋白
大量的癌症基因组测序项目,每天都在发现可能与肿瘤形成有关的新基因。黏连蛋白(cohesin)就是一个很好的例子,cohesin是一种围绕DNA的环状蛋白复合体,控制着细胞的分裂。就在几个月前,人们通过测序数以千计的肿瘤样本发现,STAG2是一些癌症中(例如膀胱癌和黑色素瘤)突变最为频繁的基因之一
黄病毒重要蛋白NS5晶体结构研究取得突破
中国科学院武汉病毒研究所龚鹏学科组在乙型脑炎非结构蛋白NS5的研究中取得突破,相关结果于8月8日在线发表于病毒学期刊PLoS Pathogens上,题为Crystal Structure of the Full-Length Japanese Encephalitis Virus NS5
硅的晶体结构
两个面心立方结构相互套构而成,其中一个面心立方结构沿另一个的体对角线平移1/4。
晶体结构测定方法
晶体结构测定方法,crystal structure determination,即利用晶体 X射线衍射可测定晶体结构。但衍射实验只能测得衍射强度(即结构振幅)而测不到相角,这样就不可能直接从强度得到晶体结构数据,而要利用其他方法。
晶体结构测定方法
晶体结构测定方法,crystal structure determination,即利用晶体 X射线衍射可测定晶体结构。但衍射实验只能测得衍射强度(即结构振幅)而测不到相角,这样就不可能直接从强度得到晶体结构数据,而要利用其他方法。
什么是晶体结构?
晶体结构是指晶体以其内部原子、离子、分子在空间作三维周期性的规则排列为其最基本的结构特征。任一晶体总可找到一套与三维周期性对应的基向量及与之相应的晶胞,因此可以将晶体结构看作是由内含相同的具平行六面体形状的晶胞按前、后、左、右、上、下方向彼此相邻“并置”而组成的一个集合。晶体学中对晶体结构的表达可采
高福、施一等解析寨卡病毒蛋白晶体结构
近日,《自然—结构和分子生物学》网络版发表了中科院微生物研究所研究员施一和中科院院士高福团队最新发现的寨卡病毒(ZIKV)的非结构蛋白1(NS1)的分子结构,并提供了一个原子层面的图像。NS1参与了例如登革热、西尼罗河病毒等疾病的发病机制当中。 蚊子传播的寨卡病毒目前正在美洲流行。虽然寨卡病
鱼蛋白可抑制癌症转移
据物理学家组织网近日报道,美国马里兰大学医学院的研究人员发现,从太平洋鳕鱼提取的一种肽或蛋白可抑制前列腺癌和其他癌症的扩散。此项临床前研究成果发表在美国《国家科学院学报》网络版上。 马里兰大学生物化学与分子生物学副教授哈菲兹·艾哈迈德博士表示,具有抗肿瘤活性的天然营养产品是一个新的重要研究
如何靶向降解促癌症蛋白?
癌症研究越来越关注于靶向作用引发疾病蛋白的疗法开发,其中研究者们对发生早期降解的蛋白进行了标记,近日发表于国际杂志Nature上的研究论文中,来自瑞士巴塞尔弗雷德里希米歇尔研究所的科学家就揭示了特殊化合物如何拦截遍在蛋白连接酶来靶向作用特殊的蛋白进行降解,该机制或为靶向降解特殊的癌症蛋白提供思路
鱼蛋白可抑制癌症转移
据物理学家组织网近日报道,美国马里兰大学医学院的研究人员发现,从太平洋鳕鱼提取的一种肽或蛋白可抑制前列腺癌和其他癌症的扩散。此项临床前研究成果发表在美国《国家科学院学报》网络版上。 马里兰大学生物化学与分子生物学副教授哈菲兹·艾哈迈德博士表示,具有抗肿瘤活性的天然营养产品是一个新的重要研究
Nature揭示新型癌症蛋白家族
来自英国癌症研究院的科学家们在发表于12月1日《自然》(Nature)杂志上的一篇新研究论文中,描述了一个似乎在癌症中发挥重要作用的新型蛋白质家族——谷氨酸膜内蛋白酶(glutamate intramembrane proteases),并着手解析了这一新家族的结构,该家族的基础成员在将健康
Blood:诱发癌症的罕见蛋白
来自辛辛那提大学Hoxworth血液研究中心,哈佛医学院等处的研究人员发表了题为“Vav3 collaborates with p190-BCR-ABL in lymphoid progenitor leukemogenesis, proliferation and survival”的
PNAS:癌症发展的刹车蛋白
邓迪大学科学家开展的一项研究中,研究人员发现一种抑癌基因的重要作用,可以帮助科学家更好地理解该抑癌基因是如何对抗致癌基因突变(致癌基因推动癌症发展)的影响。这项研究发表在PNAS杂志上,揭示了酶——双特异性磷酸酶5(DUSP5)如何通过'关闭'另一种酶ERK(参与推动细胞增殖)抑制肿瘤的形成和生
锁住“叛徒蛋白” 攻克“柑橘癌症”
柑橘是世界第一大水果,我国柑橘栽培面积和产量均居世界首位。然而,黄龙病却如同一颗毒瘤,威胁着全球柑橘产业发展。 近日,中国科学院微生物所和西南大学的科学家找到了柑橘黄龙病的抗性基因,“柑橘癌症”有了破解方法。相关研究以封面论文的形式发表在《科学》上。 柑橘黄龙病肆虐全球 在柑橘园中,一棵柑
找到癌症干细胞标志蛋白可对癌症“斩草除根”
治疗癌症如果不把癌症干细胞彻底清除,癌症很容易复发和转移。日本京都大学的研究人员说,他们找到了癌症干细胞含有的一种标志蛋白,有望对癌细胞做到“斩草除根”。 京都大学消化内科教授千叶勉领导的研究小组在研究中注意到消化道中的一种蛋白质Dclk1,他们分析了罹患大肠癌的实验鼠,发现含这种蛋白质的
ACSDBC:科学家阐明埃博拉病毒复制关键蛋白的晶体结构
当前西非等国爆发的埃博拉病毒感染已经夺去了2000多人的生命,这就急需科学家们早日阐明该病毒的分子生物学特性来帮助开发出保护性的疫苗或者抗病毒药物来抑制疫情的发展。 近日,刊登在国际杂志Acta Crystallographica Section D Biological Crystallog
科学家解析了小G蛋白家族成员Rbj的晶体结构
小G(small GTPases)蛋白作为信号转导中重要的分子开关,与许多不同的调控因子和效应器分子相互作用,产生细胞功能的多样性。在人类中,目前共发现超过150个家族成员。在果蝇、秀丽隐杆线虫、酿酒酵母、粟酒裂殖酵母和植物中也都发现了家族中保守的同源物。Ras癌基因蛋白是该家族的创始成员,基于
生物物理所解析出植物光保护蛋白PsbS的晶体结构
植物与太阳光的关系是“爱恨交加”,一方面光能对于植物进行光合作用是必需的,但另一方面过量的光能又会导致植物光合作用装置的氧化性损伤,于是植物逐渐进化出了一种保护机制。在高光照条件下,植物类囊体腔侧的pH会由正常条件下的6.5降低至5.5–5.8,从而激活嵌在类囊体膜上的光保护蛋白PsbS,并进而
简述晶体结构的信息
晶体结构即晶体的微观结构,是指晶体中实际质点(原子、离子或分子)的具体排列情况。自然界存在的固态物质可分为晶体和非晶体两大类,固态的金属与合金大都是晶体。晶体与非晶体的最本质差别在于组成晶体的原子、离子、分子等质点是规则排列的(长程序),而非晶体中这些质点除与其最相近外,基本上无规则地堆积在一起
原子晶体的晶体结构
结构特征:空间立体网状结构(如金刚石、晶体硅、二氧化硅等)。原子晶体的结构特点:①由原子直接构成晶体,所有原子间只靠共价键连接成一个整体。②由基本结构单元向空间伸展形成空间网状结构。③破坏共价键需要较高的能量。在原子晶体的晶格结点上排列着中性原子,原子间以坚强的共价键相结合,如单质硅(Si)、金刚石
晶体结构的固定熔点
实验表明:从气态、液态或非晶态过渡到晶体时都要放热,反之,从晶态转变为非晶态、液态或气态时都有要吸热。表明:在相同的热力学条件下,与同种化学成分的气体、液体或非晶体相比,晶体的内能最小。即在相同的热力学条件下,以具有相同化学成分的晶体与非晶体相比,晶体是稳定的,非晶体是不稳定的,后者有自发转变为晶体
日本找到癌症干细胞标志蛋白
据新华社东京12月3日电治疗癌症如果不把癌症干细胞彻底清除,癌症很容易复发和转移。日本京都大学的研究人员说,他们找到了癌症干细胞含有的一种标志蛋白,有望对癌细胞做到“斩草除根”。 京都大学消化内科教授千叶勉领导的研究小组在研究中注意到消化道中的一种蛋白质Dclk1,他们分析了罹患大肠癌的实
诱导癌症转移的蛋白质
胰腺癌是一种恶性程度很高,诊断和治疗都很困难的消化道恶性肿瘤,约90%为起源于腺管上皮的导管腺癌。其发病率和死亡率近年来明显上升。5年生存率
揭示细胞蛋白如何控制癌症扩散
对控制癌症生长和迁移的细胞信号的新见解可能有助于寻找有效的抗癌药物。麦吉尔(McGill)领导的一项研究揭示了关键的生化过程,这些过程促进了我们对大肠癌的认识,大肠癌是加拿大人中第三大常见癌症。利用萨斯喀彻温大学加拿大光源(CLS)的CMCF光束线,来自麦吉尔大学和日本大阪大学的科学家能够揭示一种参