AACR：“GENIE”呼之欲出，志在共享癌症基因组临床数据
11月6日，Genomeweb报道，美国癌症研究协会（AACR）推出了一项叫做“GENIE”的国际基因组和临床数据共享项目，旨在将不同癌症中心的基因组和结果数据汇总起来。 该项目中的“GENIE”寓意Genomics（基因组学）、Evidence（证据）、Neoplasia（肿瘤）Information（信息）Exchange（交换），是这5个单词的首字母缩写。 “GENIE”项目的启动阶段由来自美国，加拿大和欧洲的七个创始成员和两个信息合作伙伴参与，共享他们拥有的肿瘤患者临床测序数据。 这个联盟的创始成员包括： 荷兰乌德勒支个性化癌症治疗中心（the Center for Personalized Cancer Treatment in Utrecht, the Netherlands）；波士顿Dana-Farber癌症研究所（Dana-Farber Cancer Institute in Boston）；法国维勒瑞......阅读全文
应用癌症基因组学方法，发现与年龄相关的血液疾病
克隆造血是一种生物过程，在这个过程中，血液干细胞(产生多种血细胞类型的细胞群)获得了有利的突变，超过了邻近的细胞。当这种突变出现在一个特定个体2%的血细胞中时，克隆造血就被诊断出来。驱动克隆造血的有利突变处于正选择状态，就像导致细胞恶性化的癌症基因突变一样。在ICREA研究教授Núria López
LIFE－金牌赞助第六届国际基因组学大会
第六届国际基因组学大会（ICG-6）在2011年11月12日至15日在深圳东部华侨城隆重召开。本次会议由华大基因（BGI）主办，召集了世界各地400多名从事基因组学研究的科学家，生物制药业界，学术刊物编辑。来自各方的专家在汇报基因组学领域最新科研进展的同时将会深入讨论农业育种，医疗健
生物芯片在功能基因组学研究中的应用进展
生物芯片技术是伴随人类基因组研究发展起来的，它是指通过微电子、微加工技术，在固体基质（如硅芯片、玻片、瓷片等）表面构建的微型生物化学系统，以实现对细胞、蛋白质、核酸及其它生物组分进行快速、敏感、高效地处理。一般来说，应用芯片进行实验主要包括3个步骤：样品制备、生物化学反应、检测和数据分析处
武汉植物园葡萄基因组学研究取得新进展
葡萄是世界上第二大果树作物，鲜果及用其加工品葡萄酒一直广受消费者喜爱。随着社会对葡萄需求量进一步增加，如何高效快速地培育优良葡萄品种是目前葡萄产业发展的瓶颈。近年来，通过新一代测序技术和生物信息学手段相结合，对植物基因组结构和特点深入解析，将获得的信息应用于分子辅助或基因工程育种
大豆、油菜、花生功能基因组学研究取得阶段性成果
大豆、油菜、花生等作物，不仅是我国人民食用植物油和蛋白质的重要来源，还是发展畜牧养殖业的重要优质蛋白源，在我国国民经济和社会发展中具有十分重要的地位。在国家863计划的资助下，经过两年半努力，“大豆、油菜、花生功能基因组学研究与应用”课题组取得了重要的阶段性成果。2015年6月4日，863计划
默克投资750万加元加入结构基因组学联盟
默克公司近日宣布将投资750万加元(约600万美元)加入结构基因组学联盟(SGC)。 默克公司在声明中表示，投资所支持的研究项目是为开发分子探针以研究基因调控的表观遗传机制，探针的应用也将加深对多个疾病领域的生物学理解，尤其是在癌症和炎症性疾病方面。 默克和SGC表示，支
中国学者葡萄基因组学研究取得新进展
葡萄是世界上第二大果树作物，鲜果及用其加工品葡萄酒一直广受消费者喜爱。随着社会对葡萄需求量进一步增加，如何高效快速地培育优良葡萄品种是目前葡萄产业发展的瓶颈。近年来，通过新一代测序技术和生物信息学手段相结合，对植物基因组结构和特点深入解析，将获得的信息应用于分子辅助或基因工程育种，成为植物品种选
中国科学院开发比较群体基因组学新算法
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510371.shtm随着基因组测序技术的发展，物种和群体水平基因组数据呈指数增长。这些数据为从基因组水平鉴定和解析自然选择机制提供了前所未有的机遇。但是，目前的分析方法面临着一些技术瓶颈和挑战，其中一个
释放基因组学云计算潜力－－Illumina收购再下一城！
分析测试百科网讯 近日Illumina针对收购BlueBee发布公告。BlueBee是一家为研究机构和临床客户提供基因组分析解决方案的云软件公司，其总部位于荷兰，公司开发了符合安全法规的云平台，简化了对数据和工具的访问，使用户能够轻松地访问基因组数据。这种云计算能力有望降低存储、共享和管理来自I
基因组学探究沙棘放线菌固氮生物学机制
沙棘是胡颓子科沙棘属落叶性灌木，其根部与放线菌共生固氮，适应缺水少肥的华北及西北贫瘠地区，是防风固沙功臣；其果实富含维生素C及黄酮等活性物质，是健康饮品的原料供给者；具有重要的生态和经济价值。 近日，《新植物学家》（New Phytologist）在线发表了来自中科院植物分子科学卓越创新中心
比较分子生理基因组学－—cDNA阵列的异种杂交实验
近几年来， DNA 微阵列已经被公认是分子生物学研究的一种标准方法。特别是在生物医学研究方面，常用物种的微阵列一面世就得到广泛应用。但是对于非模式生物来说 ，微阵列的应用尚未得到充分开展，而这些物种往往表现出一些很有趣的生理表型。对大多数比较生物学的研究者来说，制备一个新物种的 D N A 阵列或微
新一代测序将如何改变法医基因组学
Bruce Budowle博士是北德克萨斯大学健康科学中心(UNTHSC)应用遗传学研究所的执行主任。自2009年成立以来，该研究所集中了一大批致力于完善遗传学方法的知名科学家，以增强几个研究领域，包括法医DNA。在UNTHSC的法医科学项目(全美只有14个)
胡伟：用基因组学技术，绘制热作遗传改良蓝图
近年来，海南省坚定不移地加快建设中国特色自由贸易港，大力发展“四大主导产业”，精心培育“三大未来产业”，不断夯实实体经济基础，形成结构更合理、支撑更稳固、竞争力更强、效益更好的现代产业体系。 未来，海南将立足国家战略，发挥资源优势，聚焦“专精特新”，以超常规的努力打一场科技创新攻坚战，全面推进创新
宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组
来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。 由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。 宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术，并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增
《自然》：管轶等对新流感起源的基因组学研究
H1N1流感病毒由2种猪流感病毒的基因重组而形成 据生物通报道，香港大学医学院、爱丁堡大学、亚利桑那大学以及牛津大学合作的新型流感研究成果Origins and evolutionary genomics of the 2009 swine-origin H1N1 influenza A
比较分子生理基因组学－—cDNA阵列的异种杂交实验
实验步骤 一、材料 这里用到的所有化学试剂都为分子生物学等级，或者用它们最高纯度的等效物。所有的塑料和玻璃制品，包括瓶子和移液器吸头都要高压灭菌，在核酸实验操作过程中必须始终戴手套。 cDNA A T L A S阵列从Clo
蛋白质结构在结构基因组学中的应用介绍
已经测定了酿酒酵母（Saccharomyces cereuisiae）、线虫（Caenorhabditis elegans）、果蝇（Drosophilamelanogaster）、拟南芥（Arabidopsis thaliana）等模式生物的基因组序列.。特别值得一提的是，随着人类基因310福建
买买买！罗氏收购CAPP－Medical拓展肿瘤基因组学领域实力
近两年来，随着数以十亿计美元的投入，新的肿瘤治疗疗法不断涌现出来。基因疗法、RNAi疗法以及现在火得一塌糊涂的肿瘤免疫疗法都为人类最终解决癌症这一生死大敌做出了重大贡献。然而，面对如此多的新型疗法，医生该如何选择适合患者的疗法？在临床研究中，科学家该如何确定一种新型肿瘤疗法适用人群？随着研究的深
北大特聘教授探讨破解癌症耐药性的基因组学方法
近日，北京大学的张泽民教授在Trends in Genetics杂志上发表文章，探讨了破解癌症耐药性机制的基因组学方法。 癌症精确医疗面临的主要障碍是，靶向性治疗总是会遇到抵抗。因此了解和克服癌症耐药性，成为研究的焦点。 癌症耐药性背后的生化和遗传机制非常复杂。为了克服这一巨大的挑战，近年来人
比较分子生理基因组学－—cDNA阵列的异种杂交实验（一）
实验步骤 一、材料这里用到的所有化学试剂都为分子生物学等级，或者用它们最高纯度的等效物。所有的塑料和玻璃制品，包括瓶子和移液器吸头都要高压灭菌，在核酸实验操作过程中必须始终戴手套。 cDNA A T L A S阵列从Clontech购得。人 19K cDNA 阵列从Ontario 癌症研究所购得
精神分裂症功能基因组学研究中取得进展
精神分裂症是一种以阳性症状、阴性症状和认知障碍为主要特征的严重精神疾病，目前影响了全球约1%的人口。由于病因复杂，反复发作以及大多在青壮年发病，精神分裂症严重影响患者生活，同时也给患者家属和社会带来了沉重的经济和精神负担。精神分裂症的遗传力高达80%左右，表明遗传因素在精神分裂症的发生中有重要作
Illumina副总裁：基因组学如何影响肿瘤学未来的发展？
专访Illumina肿瘤业务营销副总裁John Leite 基因组学正在改变肿瘤研究，其最终目标是推进癌症的诊断、治疗、监控及最终的筛查方式。Illumina的肿瘤业务营销副总裁John Leite介绍了这一领域的最新进展，以及随着今天的研究转化为临床，他对未来的期望。 基因组学如何影响肿瘤
成都生物所在系统发育基因组学研究方法中获进展
系统发育基因组学研究，主要是利用基因组/转录组数据和基因组学方法解决重要类群的进化关系，从而揭示物种起源与分化以及多样性形成机制等重要问题。与传统的系统发育研究相比，系统发育基因组学具有信息量大、结果可靠的优点。但是在这个新兴的领域，研究方法的发展严重滞后于数据量的爆炸式增长。传统的方法在处理成
PerkinElmer以0.28美元/股现金收购单细胞基因组学公司RHS
分析测试百科网讯 近日，据外媒报道，PerkinElmer同意支付约1980万美元现金(每股0.28美元)收购澳大利亚细胞基因组学公司RHS Ltd，这项决议得到了RHS公司全体董事会的支持。 RHS董事长David Brookes说：“PKI提案受到了董事会的欢迎，作为奖励股东忠诚度并在重要
科学家开发比较基因组学进化分析新方法
比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据，解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一，如PAML等方法，都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展，众多物种的基因组
第七届国际基因组学大会在香港成功召开
2012年11月29日至12月1日，为期三天的第七届国际基因组学大会暨2012年亚太区生物信息学峰会在香港九龙成功召开。本次会议由华大基因主办，《GigaScience》杂志协办。来自全球300多名专家学者云集香港，共同探讨了基因组学、生物信息学、云计算、生物伦理等研究领域内的最新进展，并深入探
科学家开发比较基因组学进化分析新方法
比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据，解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一，如PAML等方法，都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展，众多物种的基因组
英基因组学研究所否认欺凌和性别歧视指控
在一名独立律师进行调查之后，全球最大的基因组学研究中心之一否认了有关其负责人欺侮、歧视员工和滥用资金的指控。 这些指控涉及英国辛克斯顿惠康桑格研究所的管理层。该研究所在10月30日发表的一份声明中说，调查澄清了该研究所所长、遗传学家Mike Stratton关于欺凌和性别歧视的说法。“调查已经
基因组学研究揭示龙纹敖虾在全球入侵成功的秘密
这听上去像一个糟糕的怪兽电影情节：可无性繁殖的10条腿变异生物从在德国的囚禁中逃出来，并且悄悄地开始了全球入侵。在20年的时间里，这种贪婪动物的克隆品散布在欧洲和非洲，给当地生态系统带来灾难并且威胁到本地物种。龙纹敖虾的基因组解释了它的历史和成功入侵的秘密。图片来源：picture allian
北京基因组所开发出比较群体基因组学新算法
随着基因组测序技术的发展，物种和群体水平基因组数据呈指数增长。这些数据为在基因组水平鉴定和解析自然选择机制提供了机遇。然而，目前的分析方法面临着技术瓶颈和挑战。其中，关键问题是如何高效准确地检测作用于非编码区的自然选择效应。同时，能够高效、高性能地分析多物种大样本数据，成为方法学方面的迫切要求。