北京基因组所开发出比较群体基因组学新算法
随着基因组测序技术的发展，物种和群体水平基因组数据呈指数增长。这些数据为在基因组水平鉴定和解析自然选择机制提供了机遇。然而，目前的分析方法面临着技术瓶颈和挑战。其中，关键问题是如何高效准确地检测作用于非编码区的自然选择效应。同时，能够高效、高性能地分析多物种大样本数据，成为方法学方面的迫切要求。 中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）陈华团队在多物种联合等位基因频谱理论以及HKA（Hudson-Kreitman -Aguadé）检验的框架上，构建了CEGA（Comparative Evolutionary Genomic Analysis）方法。CEGA整合微进化过程与宏观进化过程模型，刻画了自然选择和群体历史在非编码区形成的遗传多态性“印记”，可高效、准确地检测作用于非编码区上的正向选择及平衡选择信号。CEGA同时分析物种间的分歧位点和物种内的多态位点信息。当两物种分化时间比较短时，多态位点蕴含的信息有助于准确推......阅读全文
新算法提升基因融合检测效率
近日，华大基因公开一种基因融合检测算法SOAPfuse。模拟数据和真实验证数据的综合测评表明，该算法具有准确率高、敏感性强、精度高、资源消耗少等优点。该算法主要采用局部穷举算法和一系列精细的过滤策略，从而对基因融合进行快速、精确的检测。相关研究成果在《基因组生物学》（Genome
新算法让监控复杂系统变简单
在一个复杂系统中，如包含了2万个互相联系的基因的人类基因组，要想一次监控整个系统几乎是不可能的。据物理学家组织网近日报道，来自美国东北大学、麻省理工大学等单位的研究人员开发出一种新算法，能识别出复杂系统的子单位或必要结点，使监控大型复杂系统成为可能。相关论文发表在最近出版
拥有－“嗅觉”－的新神经算法芯片介绍
前言： 人类除视觉、听觉之外，在嗅觉研究上有新突破，带来新想象空间和应用空间，人类对大脑的认知以及类脑芯片、AI芯片又跨上新台阶，未来的芯片发展之路又有可能另辟蹊径。类似人类大脑的神经拟态芯片神经拟态计算一直被寄予厚望。就算摩尔定律终结，它仍能继续带领信息时代向前。神经拟态计算可以大幅度提升
国际团队提出一种新量子算法
一个国际研究小组近日在美国《科学进展》杂志上介绍，他们设计了一种新型量子算法，有望推动量子计算在物理、化学等多个领域的应用。 据介绍，在复杂量子系统中存在能量较小的基态，还有能量较高的激发态。过去的量子算法只能对基态问题进行有效且精确求解。针对这个问题，英国布里斯托尔大学、美国微软公司、
预测小分子抗癌活性有了新算法
记者从中科院昆明动物研究所获悉，该所李功华博士在研究员黄京飞的指导下，开发了一个新的基于分子药效团的小分子比对算法，并成功应用于预测小分子的抗癌活性。近日，该研究发表在顶级计算生物学杂志《生物信息学》上。 据李功华介绍，开发新的抗癌药物是科学界和医学界的热点和难点。直接采用实验的方法筛选抗
新算法可大幅提高图像边界识别效率
美国麻省理工学院的研究人员日前称，他们开发出了一种新的图像分割算法，可将传统分割算法的效率提高上万倍。该研究将有助于改善医疗成像系统的识别精度并实现对特定3D物体的连续跟踪识别。 当我们推开窗户向外张望时，马上就能看到汽车、人行道、行人或者远处高大的建筑。这在计算机领域中被称为视觉识别，对人类
新算法可模拟人脑整体神经电路
下一代超级计算机利用新算法，可模拟人脑整体神经电路。图片来自网络 科技日报东京3月28日电 （记者陈超）日本理化学研究所日前宣布，他们的一个国际联合研究小组成功开发出模拟人脑整体神经电路的算法，可在下一代超级计算机上应用。新算法不仅节省内存，也能大幅提高现有超级计算机上的脑模拟速度。 神经
AI新算法测寿命－或能助人类更长寿
据英国每日邮报报道，一项新的研究表明，利用AI技术可以检测人的细胞年龄，并依此制定出个性化医疗方案，从而帮助人们实现长寿的愿望。 据悉，科学家开发的这种AI算法被称为“Aging.AI”，根据人们的血液样本可以计算出生理年龄，并验证某些生活方式的改变和药物是否能提高人们长寿和健康的几率。目
新计算机算法可辨别声音环境方向
假如把你蒙住眼睛放在一个陌生房间里，你打个响指听听动静，能否听出房间是什么形状格局?蝙蝠和海豚能用这种回声定位法在环境中辨别方向，有些盲人也能做到这一点。而据物理学家组织网6月18日报道，瑞士联邦理工学院视听通讯实验室(LCAV)科学家设计出一种计算机算法，通过分析来自4个麦克的声音，同样能完成
机器学习新算法加速药物研发进程
据物理学家组织网2月6日报道，加拿大多伦多大学的科研人员最新研制出了一套新的机器学习算法，能生成微小蛋白质分子的3D结构。研究人员指出，新算法有望彻底变革药物的研发进程以及我们对生命的理解。 研发人员之一、多伦多大学的博士生阿里·普勒贾尼解释称，确定蛋白质分子的3D原子结构对于理解它们的工作原
新算法比较分析可搜索癌症基因突变
桑福德伯翰医学研究所(Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute,SBP)承担了前所未有的对一个新兴算法类别的比较分析，该算法通过聚焦内部基因结构，在癌症数据库中挖掘遗传信息（即亚基因像素算法），这与专注于基因视其为单个单元的经典方法形成
AI新算法测寿命－或能助人类更长寿
据英国每日邮报报道，一项新的研究表明，利用AI技术可以检测人的细胞年龄，并依此制定出个性化医疗方案，从而帮助人们实现长寿的愿望。 据悉，科学家开发的这种AI算法被称为“Aging.AI”，根据人们的血液样本可以计算出生理年龄，并验证某些生活方式的改变和药物是否能提高人们长寿和健康的几率。目
空间细胞类型组分解析新算法被提出！
8月7日，中国科学院动物研究所翟巍巍/马亮团队在《自然-通讯》（Nature Communications）上，发表了题为SONAR enables cell type deconvolution with spatially weighted Poisson-Gamma model for s
研究提出空间细胞类型组分解析新算法
中国科学院动物研究所翟巍巍/马亮团队在《自然-通讯》（Nature Communications）上，发表了题为SONAR enables cell type deconvolution with spatially weighted Poisson-Gamma model for spatia
新算法将更好组装DNA序列－检测特殊遗传突变
刊登在国际杂志Bioinformatics上的一项研究论文中，来自杨百翰大学(Brigham Young University)的研究人员开发了一种新方法来进行人类基因组的装配，而且这或许可以帮助鉴别引发常见遗传障碍的新型突变。 这种新方法依赖于一种新算法，其可以非常敏感地检测DNA序列的特异
美国开发高效法医指纹识别技术新算法
在美国，涉及指纹证据的第一大案是1911年芝加哥的托马斯·詹宁斯谋杀案，因其在犯罪现场留下的指纹而被定罪。在后来的近乎一个世纪里，指纹同时被法庭和公众认为是一个可靠识别方法，然而，最近的研究表明，指纹检查也可能导致错误的结果。如2009年美国科学院的研究报告表明，即使是经验丰富的探员在后来重复检
抑制瞬时射频干扰新算法助力脉冲星观测
脉冲星是一种周期性发射微弱脉冲信号的中子星，长期以来都是天文和物理的前沿研究领域，涉及引力波探测、精确验证广义相对论、限制极端物理条件下的物态方程、高精度时空基准建立等重要问题。但随着近及时年来通讯及数字技术快速发展，人为的射频信号对来自遥远深空的天文信号造成严重干扰，导致射电天文“干净”的观测
美国开发高效法医指纹识别技术新算法
在美国，涉及指纹证据的第一大案是1911年芝加哥的托马斯•詹宁斯谋杀案，因其在犯罪现场留下的指纹而被定罪。在后来的近乎一个世纪里，指纹同时被法庭和公众认为是一个可靠识别方法，然而，最近的研究表明，指纹检查也可能导致错误的结果。如2009年美国科学院的研究报告表明，即使是经验丰富的探员在后来重复检
中科院声学所发现新的频率追踪算法
近期，中国科学院声学研究所噪声与振动重点实验室研究员杨军、孙红灵领导的有源降噪团队提出一种新的基于并型陷波器的多频估计算法，该算法复杂度低、估计结果准确，可以有效地追踪多个变化的噪声频率。相关研究成果已在线发表于国际学术期刊《信号处理》。 噪声通常指不需要的声音，它对人类身心均会构成损害。常规
Science：新算法有望加快艾滋病疫苗研发
美国研究人员9日在学术期刊《科学》上报告说，他们开发出一种新计算方法，可以更快地发现抵御艾滋病病毒的强力抗体，这一成果有望加快艾滋病疫苗研发。 开发艾滋病疫苗是全球面临的重要任务和挑战。尽管艾滋病病毒已发现30多年，但由于其多变和多样性，迄今还没有一种针对该病的疫苗能离开实验室并大量应用。
心血管疾病风险评估新算法再引争议
美国心脏病学会（ACC）和美国心脏协会（AHA）发布《2013ACC/AHA心血管疾病评估指南》。2013美国心脏协会科学会议（AHA2013）上提出的评估动脉粥样硬化性心血管疾病（ASCVD）10年风险的新算法遭到质疑，两位研究人员认为可能存在缺陷。 美国波士顿Brigham妇女医院的Pau
刘小乐教授：CRISPR高通量筛选的新算法
高通量的CRISPR筛选，已在功能基因组学研究中显示出巨大的潜力。12月16日，华人女学者、哈佛大学公共卫生学院Dana-Farber癌症研究所的刘小乐教授，在国际著名学术期刊《Genome Biology》发表题为“Quality control, modeling, and visualiz
我国科学家提出DNA数字存储纠错新算法
近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所农业基因组学技术研发与应用创新团队提出DNA数字存储纠错新算法，成功突破了冗余对纠错能力的限制，将大幅提升DNA存储纠错能力。相关研究成果发表在《国家科学评论》（National Science Review）上。 DNA数字存储以其存储密度高、存储寿命
刘小乐教授：CRISPR高通量筛选的新算法
高通量的CRISPR筛选，已在功能基因组学研究中显示出巨大的潜力。12月16日，华人女学者、哈佛大学公共卫生学院Dana-Farber癌症研究所的刘小乐教授，在国际著名学术期刊《Genome Biology》发表题为“Quality control, modeling, and visualiz
注水算法
迭代注水算法是由Wei Yu提出的，它是一种多用户功率分配算法。这是一种自私算法，当接收端和发送端没有共享信道信息时，它的实现非常简单，复杂度低。但是，当信道上有共享信 息，需要共享信道，这是网络拓扑就会出现远近效应，这就产生了非平衡状态，引起用户间信号干扰，信息传输效率下降。 迭代注水
双向扫描算法和电梯调度算法区别
双向扫描算法和电梯调度算法区别：1、双向扫描(SCAN)算法不仅考虑到欲访问的磁道与当前磁道间的距离，更优先考虑的是磁头，当前的移动方向。例如，当磁头正在自里向外移动时，SCAN算法所考虑的下一个访问对象应足其欲访问的磁道既在当前磁道之外，又是距离最近的。这样自里向外地访问直至再无更外的磁道需要访问
新算法将助科学家生成首张黑洞图像
作为宇宙间的当红“大咖”，黑洞可谓声名赫赫，但迄今人们都未曾见过其真面目。而今，据美国麻省理工学院（MIT）官网消息，一种新算法可将多台射电望远镜提供的数据集成在一起，为黑洞的事件视界（指黑洞最外层的边界范围）生成首张图像。研究人员表示，首张照片最早于2017年“亮相”。 新算法名为“使用补丁
基因组算法立功！发现膀胱癌新靶点
膀胱癌是美国第六常见的癌症，根据美国癌症学会（ACS）的统计，2017年美国约有79000人被诊断为膀胱癌，将近17000人死于这种疾病。在过去几年中，逐渐形成了根据基因表达模式对膀胱癌进行分类的趋势。已知一种称为p53样膀胱癌（p53-like bladder cancer）的基因表达模式与侵
基因组算法立功！发现膀胱癌新靶点
膀胱癌是美国第六常见的癌症，根据美国癌症学会（ACS）的统计，2017年美国约有79000人被诊断为膀胱癌，将近17000人死于这种疾病。在过去几年中，逐渐形成了根据基因表达模式对膀胱癌进行分类的趋势。已知一种称为p53样膀胱癌（p53-like bladder cancer）的基因表达模式与侵
用新算法实现原子力显微镜精确粒子识别
图像分析是原子力显微镜成像的重要一环。《科学报告》在2018年1月17日发表了一篇名为The Hessian Blob Algorithm: Precise Particle Detection in Atomic Force Microscopy Imagery的文章，采用新算法提高了原子力显微图