如何测人体最大微生态库?下一代测序来帮忙

在人体中最大的微生态库是生活在人体消化道微生物复合群落组成的肠道菌群,别看人体肠道所占体积不大,但是人体肠道内寄生着10万亿个细菌,它们能影响体重和消化能力、抵御感染和自体免疫疾病的患病风险,还能控制人体对癌症治疗药物的反应。 人体肠道的正常微生物,如双歧杆菌,乳酸杆菌等能合成多种人体生长发育必须的维生素,如B族维生素(维生素B1、B2、B6、B12),维生素K,烟酸、泛酸等,还能利用蛋白质残渣合成必需氨基酸,如天冬门氨酸、苯丙氨酸、缬氨酸和苏氨酸等,并参与糖类和蛋白质的代谢,同时还能促进铁、镁、锌等矿物元素的吸收。这些营养物质对人类的健康有着重要作用,一旦缺少会引起多种疾病。 最新研究表明慢性疾病,如肥胖症,炎性肠病(IBD),糖尿病,代谢综合征,症状性动脉粥样硬化和非酒精性脂肪肝疾病,都与肠道菌群密切相关。许多国内外的相关研究由此开展,像欧盟的胃肠道元基因组计划(MetaHIT),该计划的目标是建立肠道菌群基因与人类......阅读全文

如何测人体最大微生态库?下一代测序来帮忙

  在人体中最大的微生态库是生活在人体消化道微生物复合群落组成的肠道菌群,别看人体肠道所占体积不大,但是人体肠道内寄生着10万亿个细菌,它们能影响体重和消化能力、抵御感染和自体免疫疾病的患病风险,还能控制人体对癌症治疗药物的反应。  人体肠道的正常微生物,如双歧杆菌,乳酸杆菌等能合成多种人体生长发育

无需建库,直接测序的测序新技术

  来自英国老牌测序研究机构Sanger研究院,以及英国剑桥巴布拉汉研究所的研究人员发表了题为“Direct sequencing of small genomes on the Pacific Biosciences RS without library preparation”的文章,首

FDA批准下一代测序基因检测技术

  2月19日,美国药品管理局(FDA)批准了"23 and me"公司发明的,对引起"布鲁姆综合征"(一种可能导致身材矮小并伴随高发性癌症的疾病)的主效基因进行检测手段。  这一检测手段主要针对准备生育的人群。如果双亲这一基因都具有"BLMAsh"表型的话,子女就会出现这一症状。一般情况下发生的几

2015-cifsq-Jorgen-Schlund下一代测序和全基因组测序

  分析测试百科网讯 2015年11月4-5日,中国国际食品安全与质量控制会议暨展览(2015 cifsq)在京召开。会议由国际食品保护协会(iafp)主办,北京讯息展信息技术有限公司承办。新加坡南洋理工大学教授 Jorgen Schlundt  新加坡南洋理工大学教授Jorgen Sch

宏基因组下一代测序技术问世

  据12日发表于《自然·医学》杂志的论文,美国加州大学旧金山分校科研团队成功研发了一种宏基因组下一代测序(mNGS)技术,该技术能够在短时间内检测出包括病毒、细菌、真菌及寄生虫在内的多种病原体。这项历时10年的研究成果,预示着其在诊断由脑膜炎和脑炎等疾病引起的神经系统感染方面有着巨大潜力,并有望加

中国有望翘楚下一代基因测序技术

  北京——2012年8月24日,当世界首例胚胎移植前接受全基因组筛查的试管婴儿(IVF)在中国湖南省诞生之时,喜悦之情洋溢在中国基因组学者和医学专家心中。  中国属于出生缺陷率较高的国家,高达5.6%,即100例新生儿中出生缺陷婴儿超过5例。总体上,约有8,000种单基因突变导致的缺陷疾病,这给家

-下一代测序:癌症个性化治疗的核心

  毫无疑问,未来的癌症治疗将会根据患者特异性的生物标志物变得越来越个性化。在实现癌症个性化治疗的道路上,下一代测序(NGS)技术发挥着不可取代的作用。在过去的几年里,NGS变得更加精确,它帮助研究人员和病理学家实现了从单基因检测到多基因检测的完美转换。  NGS 通过广泛的基因筛查,预测癌症的发病

下一代测序(NGS)技术市场潜力巨大

  尽管下一代测序(NGS)技术的应用还处于早期阶段,事实上它已获得研究者和临床医生们的倍加青睐。研究者和临床医生们采用下一代测序(NGS)技术对复杂疾病进行分子水平的深度研究,以揭示患者的基因组信息与疾病间的相关性。  下一代测序(NGS)技术是一项颠覆性的生物技术,它产生了海量的基因序列数据,需

下一代测序技术将改变生物学现状

  新一代非基于“桑格技术”的基因测序法以空前的快速测序速度问世了,它为人类带来了重大的科学成果和先进的生物学应用软件。然而,要研发出新一代基因测序法,必须克服30年来以桑格技术为基础的惯性思维。    1977年,Fred Sanger 和Alan R. Coulson发表了两篇关于快速测序技

GEN:下一代测序——精准医疗的“先行者”

  古代打仗时,军事家常言“兵马未动、粮草先行”;在以4P医学为主导的年代,“认知医学遗传学”上也有一句名言——“疾病未现,诊断先行”。近日,GEN网站深度解析了奥巴马的精准医疗项目中应用到的下一代测序(NGS)技术,后者在精准医疗中的地位不可或缺,可谓是精准医疗的“先行者”。  医疗改革一直是美国

评论:生态文明建设亟需建设资料库

  生态文明建设是当代中国崭新的先进理念和思想。生态文明建设正在成为中国社会绿色转型的一种巨大动力。   从现实情况看,生态文明的建设,亟需加强理论信息图书资料库的建设。也就是说,需要加强建立生态文明的信息库、资料库、图书库,以此达到加强生态文明宣传教育,丰富生态文明理论研究,推进生态文明施政建设

下一代测序技术将改变生物学现状(二)

最新的新一代测序仪操作只需一个人,24小时内可产生与几百台桑格毛细管测序仪同样多的序列数据。此外,样品中DNA损伤与常温贮藏的状态以及新一代测序误差等因素往往超过了序列变异,因此很难确定样品来源于现代人类还是古穴人。相比较而言,断言长毛象的某一特定顺序是来源于古代标本,而不是现代污染物更容易,因为现

CMAJ:下一代测序与新生儿罕见病诊断

  今年年初,英国“十万人基因组计划”宣布了首次确诊两例儿童罕见病。研究人员通过全基因组测序确诊了多年来无法确诊的两个病例,这对罕见病的治疗无疑带来了福音。5月30日,《加拿大医学协会期刊》的最新研究表明,使用下一代测序可提高新生儿罕见病诊断效率并能更快地将结果告知家长。  本文的共同作者,East

下一代测序技术临床应用现状和发展趋势

  自DNA双螺旋结构解析开始,人们在探究健康与疾病基因组复杂性与差异性上付出巨大努力,测序通量限制和高昂成本成为人们深入分析基因组的首要障碍,2005年推出高通量测序技术初步解决了这个问题,人类基因组测序成本迅速下降,由此产生一个新名词:下一代测序(next-generation sequenci

CMAJ:下一代测序与新生儿罕见病诊断

  今年年初,英国“十万人基因组计划”宣布了首次确诊两例儿童罕见病。研究人员通过全基因组测序确诊了多年来无法确诊的两个病例,这对罕见病的治疗无疑带来了福音。5月30日,《加拿大医学协会期刊》的最新研究表明,使用下一代测序可提高新生儿罕见病诊断效率并能更快地将结果告知家长。  本文的共同作者,East

病毒的DNA测序,以期开发下一代癌症疫苗

  通常,98%的宫颈癌是由人乳头瘤病毒(human papillomavirus, HPV)引起,而HPV疫苗可以预防HPV感染,使宫颈癌发病率降低约71%。此外,研究表明约20%-40%的人类癌症由细菌和病毒引起,了解并鉴定哪些细菌和病毒会导致癌症,这对预防癌症意义深远。来源于:pixabay 

赛默飞基于下一代测序测试获得FDA批准

赛默飞世尔科技近日表示,其下一代基于测序的Oncomine Dx Target Test已被美国食品和药物管理局(FDA)批准作为伴随诊断 (CDx),用于识别可能患有晚期 RET 驱动的肺癌和甲状腺癌的患者。有资格获得礼来的 Retevmo(selpercatinib)。这是 Oncomine D

下一代测序技术将改变生物学现状(一)

新一代非基于“桑格技术”的基因测序法以空前的快速测序速度问世了,它为人类带来了重大的科学成果和先进的生物学应用软件。然而,要研发出新一代基因测序法,必须克服30年来以桑格技术为基础的惯性思维。1977年,Fred Sanger 和Alan R. Coulson发表了两篇关于快速测序技术的论文[1

PNAS:下一代测序助力张启发研究“转基因水稻”

  水稻是世界上最重要的粮食作物之一,与玉米、小麦、土豆被称为“世界四大主粮”。在过去的50年里水稻尤其是籼稻(indica )的改良取得了一些里程碑式的成果。其中一项重大的突破是在上世纪的五六十年代中国及国际水稻研究所(IRRI)开发出了一系列半矮杆水稻品种,促成了水稻的“绿色革命”。  此后,半

下一代测序干货:如何选择NGS自动化系统?

  大规模NGS应用带来不仅仅是技术上的革新,相对传统更加复杂和精细操作,注定了这一技术将会更多地依赖自动化设备来完成。作为临检机构和近期崛起的众多第三方检测公司,在将NGS设备收入囊中之后,必然要考虑开始自动化样品制备系统的投入。只有将整个样品准备流程通过可靠的系统来完成,才能真正配得上是高质量的

基因测序表明生态因素影响蝙蝠视觉

  蝙蝠是夜间环境里最大以及最引人注目的哺乳动物之一。最新对蝙蝠视觉分子基础的研究表明,蝙蝠视觉进化与蝙蝠生态之间存在联系,但这种视觉能力的具体性质和程度尚未确定。  此次,加拿大多伦多大学科学家贝琳达·张(音译)及同事在《英国皇家学会学报B》上发表文章称,他们为更好地捕捉蝙蝠视蛋白基因中的生态多样

Vitae-120-NGSSA建库仪在单细胞测序建库中的应用

为什么要进行单细胞测序?传统的测序是以组织为单位进行的测序,所得的测序结果是多个细胞的平均值,无法精确到单个细胞的遗传信息;而实际上,细胞与细胞之间由于存在异质性,即便在肿瘤组织中,肿瘤组织中心的细胞、周围的细胞、以及出现远端转移的细胞,在基因组和转录组水平上的遗传信息也是有差异的。而单细胞测序是在

-Biotechniques:如何降低下一代测序1%的碱基错误识别?

  为什么复杂疾病的全基因组关联研究都是失败的?  下一代测序带来的误差,使得我们很难检测到罕见变异,而这些罕见变异在癌症等疾病中发挥着重要的作用。  在Biotechniques最近的一篇新闻中,Janelle Weaver报道了科学家们在描绘这些误差以及开发策略提高精度方面所取得的进步。  美国

2015下一代测序发展论坛:行业探讨与临床应用

  主办方:生物谷  会议形式:嘉宾演讲、主题报告  时间:12月3-4日  地点:上海斯波特大酒店  大会官网:http://www.bioon.com/z/2015ngs/  大会背景:  在整个生物产业板块中,基因产业是炙手可热的领域。随着基因测序成本下降,测序技术迅猛发展,基因检测

5大玩家竞逐下一代基因测序数据游戏

  【导语】美国化学学会(ACS)出版的新闻周刊C&EN以基因测序为主题发表了封面文章“下一代基因测序是一场数据游戏”,文中指出:2013年基因测序市场规模为13亿美元,其中Illumina市场占有率为71%;被赛默飞世尔收购的Life Tech居第二;罗氏排名第三;另外文中还公布了影响用户购买测线

Life-Tech整合顺利-赛默飞进军下一代测序技术

   2015年1月12日-15日,第33届JP摩根健康投融资大会在美国旧金山举行。大会上,各家公司都派出重量级阵营,公布上年度经营业绩,发布最新产品。  赛默飞世尔科技收购Life Tech的大约一年后,公司总裁兼首席执行官 Marc Casper在大会上重申,Life Tech的整合工

固态纳米孔:下一代DNA测序技术原理、工艺与挑战

  科学通报,中国科学C辑:生命科学,这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英国的SA,日本的《科技文献

政协委员:大力推进下一代测序技术临床应用

“下一代测序技术(NGS)包括全外显子组测序、全转录组测序、全基因组测序以及靶向高通量测序等方法。”全国政协委员、中国工程院院士、上海交通大学转化医学研究院院长陈赛娟对《中国科学报》说,“NGS以通量高、速度快、精度高、成本低等优势在临床疾病分子诊断方面发挥着独特作用。” 陈赛娟举例说,上海交通

NGS测序中DNA质量对建库结果的影响

NGS测序中的常规类文库主要针对全基因组测序,广泛应用于各类物种的重测序、遗传变异检测、BSA性状定位、遗传图谱构建、群体进化、全基因组关联分析、质粒&线粒体&叶绿体测序、宏基因组测序、小片段测序等领域。NGS测序涉及提取、建库、上机多个环节,每一步都会影响最终的数据质量。很多老师在收到质检报告后,

华大智造发布“桌面”测序仪等3款产品-构建测序“生态”

2019年10月25日于深圳召开的第十四届国际基因组学大会(ICG-14)上,华大智造发布三款新产品,分别是其自主研发的新型“桌面”一站式测序解决方案、便携式单细胞组学产品及CoolMPS高通量测序试剂套装。新产品聚焦便携式、智能化、自动化等未来发展方向,打破传统测序的时间、空间、人员限制,进一步满