赵可吉博士Nature发布重要测序技术

DNase I超敏感位点(DHS)是对DNaseⅠ高度敏感的活性染色质区域。哺乳动物细胞的DHS定位,能够提供转录调控元件和染色质状态的重要信息,一直是科学家们的研究热点。DNase测序(DNase-seq)是进行全基因组DHS分析的常用方法,不过DNase-seq需要数百万细胞,大大限制了该技术的应用范围。 美国NIH的研究团队为此开发了在单细胞中检测全基因组DHS的超灵敏策略,并将其命名为单细胞DNase测序(scDNase-seq)。这一成果发表在十一月二十五日的Nature杂志上,文章的通讯作者是NIH旗下心脏、肺和血液研究所的赵可吉博士。赵可吉博士1980年毕业于昌潍师范学院,1985年获得东北师范大学硕士学位,1996年获得日内瓦大学博士学位。在斯坦福大学接受博士后训练后在NIH任研究员,2007年至今任高级研究员。曾在Cell、Nature、PNAS等权威杂志发表多篇研究性文章。 研究显示,细胞之间的DHS......阅读全文

北大汤富酬课题组发表单细胞表观多组学测序技术新成果

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

通过全基因组关联分析-科学家鉴定出多动症遗传信号

  英国《自然·遗传学》杂志26日在线发表的一项医学研究称,美国和欧洲科学家联合团队鉴定了与注意缺陷多动障碍(ADHD)有关的遗传变异。这是人类首次发现这一疾病的遗传信号。图片来源于网络   此次,美国纽约州立大学上州医科大学的斯蒂芬·法拉那和丹麦精神病学综合研究中心(iPSYCH)的安德·博格鲁姆

二倍体棉花雷蒙德氏棉全基因组图绘制完成

  记者从9月7日召开的“二倍体棉花-雷蒙德氏棉全基因组图绘制完成”新闻发布会上获悉,由该中国农业科学院棉花研究所主持,深圳华大基因研究院、北京大学、美国农部南方平原研究中心、荷兰瓦赫宁根大学等单位共同合作完成了二倍体棉花-雷蒙德氏棉的全基因组草图,研究成果以“二倍体棉花-雷蒙德氏棉的基因组草图”为

全基因组测序,把你身体里的疾病都扼杀在摇篮里

  下午三点多,我刚上班,就接了好几个电话。最近体检人数较多,他们大多数咨询的都是肿瘤标志物。其中一个体检者语气尤其焦急:“医生,我不会得癌症了吧?肿瘤标志物有几项都高。”我问了她的姓名,然后从电脑调出她的结果:AFP:5.3(参考值0-10)CEA:9.6(参考值0-6)CA19-9:4

刘建全小组破译胡杨基因组-为树木耐盐机制提供依据

  兰州大学生命科学学院教授刘建全领导的研究团队日前成功破译胡杨基因组。这是世界上首次报道耐盐树木基因组获破译,为深入理解树木耐盐的遗传学机制提供了基因组学方面的依据。相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。   胡杨是沙漠中唯一的乔木树种,也是研究耐盐、抗旱等机制的代表性树种。来自兰州大学、深圳华

全基因组测序解密慢性高原病为千万高原居民添福音

  2013年8月16日,由加利福尼亚大学圣地亚哥分校、深圳华大基因研究院等多家单位共同完成了安第斯高地人慢性高原病全基因组测序及相关研究,研究成果在《美国人类遗传学杂志》(American Journal of Human Genetics)上发表。这项研究为探索高原适应性的遗传机制提供了

昆明动物所马普小组为新基因起源绘制全基因组蓝图

新基因的不断出现是生物进化的重要基础。昆明动物所马普青年科学家小组在王文研究员的领导下与国际一些研究小组合作,已陆续报道了包括 “sphinx”、“猴王”、“Hun”、BSC4等等一系列新近产生的新基因。这些研究成果表明新基因的起源是一个重要的生物学现象。但在全基因组水平,具体有哪些重要的新基因起源

PNAS:美科学家绘出头皮屑真菌全基因组图谱

美国宝洁公司科学家在最新一期美国《国家科学院院刊》(PNAS)电子版上发表报告说,他们已成功绘制完成球形马拉色菌的全基因组图谱。球形马拉色菌是一种导致头皮屑以及脂溢性皮炎等皮肤疾病的真菌。 科学家的测序和分析结果显示,球形马拉色菌总共才有4285个基因,它的全基因组碱基对数量仅相当于人类基因组碱基对

禽类全血基因组DNA-提取试剂盒(50-次)使用说明

禽类全血基因组DNA 提取试剂盒(50 次)试剂盒组成:溶液A: 30ml溶液B: 0.6ml RNase A溶液C: 50ml溶液D: 2ml Resin(用时充分混匀)溶液E: 30ml 洗液(注:用时加入35ml 无水酒精)溶液F: 10ml TE 缓冲液实验步骤:1. 取300μl 抗凝血,

我国绘制完成世界首个蒙古族人全基因组序列图谱

  我国科学家绘制完成了全世界首个蒙古族人全基因组序列图谱。这是记者12月18日在内蒙古自治区呼和浩特市召开的“世界首例蒙古族人全基因组序列图谱绘制完成成果发布会”上获得的消息。   据项目总负责人、内蒙古农业大学生命科学学院动物生物技术重点实验室主任周欢敏介绍,这一研究成果是我国科学家首次独立完

我国科学家对桃进行全基因组重测序-绘制进化路线

  我们平时吃的桃是如何进化而来的?近日,一项针对桃的全基因组重测序研究揭开了这一谜底。该研究对84份桃种质进行重测序,在全基因组水平上绘制了从光核桃到普通桃的进化路线,并鉴定了与人工选择相关的候选基因,揭示了桃的进化历史及人类活动对果树的影响。  这项研究由中国农业科学院郑州果树研究所王力荣研究团

利用454技术进行结核杆菌全基因组测序有效追踪疫情传播

  众所周知,肺结核多数是由结核分枝杆菌感染肺部引起的肺部感染性疾病,已成为一个严重威胁人类健康的疾病。世界卫生组织(WHO)统计表明,全世界每年发生结核病800~1000万,每年约有300万人死于结核病,是造成死亡人数最多的单一传染病。1993年WHO宣布“全球结核病紧急状态”, 认为结核病已

MSI全基因组强度关系PD1免疫治疗产生反应效果

  具有错配修复缺陷(MMR-d)的肿瘤可出现多重序列改变并且可累积数千个基因突变。这种高突变负荷使肿瘤具有免疫原性并对程序性细胞死亡-1(PD-1)免疫检查点抑制剂敏感。然而,尽管这些患者的肿瘤具有免疫原性,MMR缺陷肿瘤患者对现有免疫治疗的反应变化很大,大约一半的患者难以治疗。  隶属于约翰斯·

全基因组分析方法创新,人类百万年前的群体秘密被发现!

  9月1日,《科学》(Science)在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所李海鹏研究组与华东师范大学脑功能基因组学研究所潘逸萱研究组合作撰写的题为Genomic inference of a severe human bottleneck during the Early to Middle

中国学者解析甜瓜全基因组变异图谱及进化机制

   近日,Nature Genetics线发表了中国农科院与其它机构合作完成的两篇重量级文章,文章分别构建了甜瓜全基因组变异图谱和解析了西瓜果实品质性状进化分子机制。  鉴于该两项研究的重要性,Nature Genetics杂志还同期发表了题为“Sweet genes in melon and w

全血基因组DNA提取试剂盒的作用原理是怎样的

保证核酸一级结构的完整性,核酸样品中不应存在对酶有抑制作用的有机溶剂和过高浓度的金属离子,其他生物大分子如蛋白质、多糖和脂类分子的污染应降低到最低程度,其他核酸分子,如RNA,也应尽量去除。全血基因组DNA提取试剂盒(离心柱型)作用原来具体是这样的:独特的结合液,蛋白酶K迅速裂解细胞和灭活细胞内核酸

生物与梅奥医学-合作推动整合全基因组测序和临床治疗

  1月9日,位于开发区的杭州奕真生物宣布与梅奥医学中心签署合作协议,共同为健康人群提供全基因组测序服务。   奕真生物,技术源于哈佛大学医学院,由哈佛大学医学院基因组学专家于2014年创立,其科学创始人乔治邱其教授(George Church)为哈佛大学“个人基因组计划”首席负责人,公司通过北美

全基因组与外显子组测序在临床诊断中的应用

  全基因组或外显子组测序的临床应用,称为临床基因组和外显子测序( Clinical genome and exome sequencing,CGES)。由于该技术检测范围广,可以同时检测2000多个基因的变异,对于临床罕见病、疑难疾病、复杂疾病,特别是孟德尔遗传病的诊断是一种强大而有效的方法。  

全基因组测序揭示CRISPR-/-Cas9在葡萄上的脱靶效应

  近日,Horticulture Research在线发表了西北农林科技大学葡萄种质资源与育种团队王西平课题组题为“Whole genome sequencing reveals rare off-target mutations in CRISPR/Cas9-edited grapevine”的

低深度高通量全基因组测序在产前诊断中的意义

  胎儿染色体核型分析常被用于高危妊娠的产前检查中,随着技术的发展,染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)在产前诊断中的应用也逐步推进,并成为检测高危妊娠中显微和亚显微水平染色体结构变异的一线技术。高深度全基因组测序(whole genome se

中科院“细菌全基因组测序及分析”取得阶段性成果

中科院北京基因组研究所的胡松年研究员和浙江大学医学院附属二院的胡讯教授合作研究的项目“细菌Phenylobacterium zucineum全基因组测序及分析”取得阶段性成果,相关论文发表在今年第9期的BMC Genomics上。 P.zucineum是合作方从K562细胞系中分离到的兼性细菌。系

华大基因等Cell子刊首次全基因组水平解析等级表观遗传

  来自华大基因,纽约大学医学院,宾州大学医学院等多处研究机构组成的研究小组发表了题为“Genome-wide and Caste-Specific DNA Methylomes of the Ants Camponotus floridanus and Harpegnathos salta

在玉米全基因组水平上解析玉米籽粒淀粉含量的遗传基础

  近期,中国农业大学国家玉米改良中心杨小红团队在国际学术期刊Plant Biotechnology Journal上在线发表了题为“Genetic basis of kernel starch content decoded in a maize multi-parent population”的

CG、GP开放共享至今最大实验单体型定相全基因组测序成果

  2016年10月11日,美国加州山景城——华大基因子公司Complete Genomics(简称CG)与个人基因组计划项目(简称PGP)共同发布了过百人的实验单体型定相全基因组测序结果。这组数据采用长片段阅读技术(简称LFR)读取,是目前最大的有全面实验确认单体型的高覆盖度全基因组组装。“绝大多

Science:全基因组遗传筛选揭示了人类色素沉着的决定因素

  斯坦福大学Joanna Wysocka团队在Science 在线发表题为“A genome-wide genetic screen uncovers determinants of human pigmentation”的研究论文,该研究利用黑色素的光散射特性对黑色素形成的调节因子进行了全基因组

我国科研团队在玉米全基因组选择育种上获重大突破

14日,记者从四川农业大学获悉,该校玉米研究所兰海教授团队利用全基因组选择技术构建了西南玉米区域新的杂优模式,并运用该技术在国内首次选育出玉米新品种。相关成果近日发表在《植物科学前沿》上。兰海介绍,该团队利用360份代表性自交系随机构建了2077个杂交组合,对产量相关性状进行了精准鉴定,并利用自主研

Science:发布首个全分辨率的人类基因组遗传图谱

  在一项新的研究中,来自冰岛基因解码公司(deCODE genetics)、冰岛大学和雷克雅未克大学的研究人员发布了首个使用全基因组序列数据开发出来的全分辨率人类基因组遗传图谱。  该图谱提供了迄今为止关于人类进化的两个关键驱动因素之间的位置、速率和关联性的最详细观察:重组(recombinati

2015-cifsq-Jorgen-Schlund下一代测序和全基因组测序

  分析测试百科网讯 2015年11月4-5日,中国国际食品安全与质量控制会议暨展览(2015 cifsq)在京召开。会议由国际食品保护协会(iafp)主办,北京讯息展信息技术有限公司承办。新加坡南洋理工大学教授 Jorgen Schlundt  新加坡南洋理工大学教授Jorgen Sch

德国硬颈蒜内生细菌全基因组测序助力大蒜种植研究

2022 年 8 月,从纽约拉什的比绍平农场获得成熟的田间种植德国硬颈蒜鳞茎(经度:?77.6374368;纬度:43.01495449999999)。用无菌手术刀无菌切除带有花茎的大蒜植株顶部,使用带无菌吸头的微量移液器无菌收集切面上积聚的茎汁,将收集到的汁液转移到无菌离心管中。然后将汁液置于胰蛋

全基因组测序的人工智能快速诊断技术可与时间赛跑

  遗传病是新生儿的头号杀手,也是五岁以下儿童死亡的主要原因之一。在中国,新生儿出生缺陷的发生率约为6%,遗传病占总出生缺陷的30%。北美约有4%的新生儿患有遗传病,约15%的儿童医院住院患者患有罕见病。对于重症患者来说,时间就是生命,在治疗患有遗传病的重症儿童时,时间更是至关重要。快速的全基因组测