北京生科院揭示RNA结合蛋白调控网络中功能遗传变异的机制
绝大部分遗传变异（尤其是同义突变）或RNA编辑并不会引起蛋白结构的改变，因此，这些遗传变异或RNA编辑是如何影响生物表型的尚不清楚。RiboSNitches是可以改变RNA结构的单核苷酸变异体（SNVs），它的丢失可能会导致特定RNA结构的改变，这种现象发生在成千上万的区域位点，其中包括3'-UTRs、microRNA的结合位点、RNA结合蛋白（RBPs）的结合位点。因此评估SNVs对转录后调控网络的作用将有助于理解不引起蛋白结构改变的遗传变异或RNA编辑影响生物表型的机制。 近日，中国科学院北京生命科学研究院孙中生课题组开发了一个研究转录后因子互作和调控功能变异的数据库——RBP-Var。RBP-Var提供了一个易于使用的Web界面，它能帮助用户快速判断自己感兴趣的SNVs是否可以改变RNA二级结构，并判断RBPs结合是否随后被破坏。RBP-Var可以评估每个SNV对miRNA-RNA相互作用的影响，因为SNVs可能会破......阅读全文
北京生科院揭示RNA结合蛋白调控网络中功能遗传变异的机制
绝大部分遗传变异（尤其是同义突变）或RNA编辑并不会引起蛋白结构的改变，因此，这些遗传变异或RNA编辑是如何影响生物表型的尚不清楚。RiboSNitches是可以改变RNA结构的单核苷酸变异体（SNVs），它的丢失可能会导致特定RNA结构的改变，这种现象发生在成千上万的区域位点，其中包括3'-U
Cell－Systems：构建RNA结合蛋白的剪接调控作用预测模型
基因组研究结果显示，人体内超过90%的基因存在选择性剪接(alternative splicing)。该过程在不同组织以及不同生理阶段受到严格的调控，其失调会导致多种疾病的发生。选择性剪接的体内调控主要由前体mRNA中的顺式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子（trans-a
环状RNA结合功能蛋白
环状RNA作为研究持续火热的明星分子，不同于对其丰富的表达谱研究，环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制，部分circRNA可竞争性结合miRNA，解除miRNA对靶基因的抑制作用，上调靶基因的表达。其实，环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白，分别在转录前
诱骗RNA结合蛋白不与癌细胞中的天然RNA分子结合
科学家也开始变得“狡猾”，开始用欺骗来对抗癌症。希伯莱大学的研究人员发明了一种诱饵，可以阻止癌症用于转移的RNA结合蛋白。 近年来，RNA结合蛋白在肿瘤生长中起着重要作用已经成为不争的事实。这些蛋白在所有细胞中都很活跃，尤其是在癌细胞中，它们与RNA分子结合，加速癌细胞的生长。不幸的是，目前还
推动癌症发展的RNA结合蛋白
最近，一项关于白血病细胞基因表达的研究，发现了一种RNA结合蛋白，在推动癌症的发展过程中起着重要的作用。该蛋白通常活跃在胎儿组织，在成年人体内是关闭的，但它在一些癌细胞中被再度活化。这种表达模式使它成为抗癌药物的一个有吸引力的靶标，因为阻断它的活动，不太可能造成严重的副作用。 这项新的研究，发
遗传发育所大豆茸毛密度遗传网络调控研究获进展
大豆驯化起源于中国，随后广泛传播于世界各地，为人类提供了主要的植物油和蛋白资源，是世界性的重要粮食经济作物。表皮毛是植物表皮细胞分化形成的一种特殊的细胞形态，广泛分布于植物的叶片、茎秆以及花萼等地上部器官表面。作为植物应对外界环境（生物或者非生物胁迫）的第一道防线，表皮毛在植物的生长发育以及抗逆
生物物理所揭示－RNA－结合蛋白调控急性心肌梗死的机制
心肌梗死是严重危害人类健康的高发性疾病，迄今缺乏有效的防治办法。因此，揭示心肌梗死的分子机制具有重要临床意义。 RNA 结合蛋白 CUGBP1 在心脏发育中起到重要作用，然而 CUGBP1 在心脏疾病中的功能尚未见报道。借助急性心肌梗死（AMI）疾病模型，中国科学院生物物理研究所姬广聚课题组深
GTP结合蛋白的调控作用介绍
G蛋白在信号转导过程中起着分子开关的作用。与GDP（紫色）结合后，G蛋白处于非活性状态。GTP取代GDP后，G蛋白活化并传递信号。G蛋白形式多样，大多数用于信号传递，有些则在诸如蛋白质合成中起重要作用。本文主要介绍异三聚体G蛋白，它由三条不同的链组成，分别为α（棕黄色）β（蓝色）γ（绿色）。红色部分
RIP技术（RNA结合蛋白免疫沉淀）
RIP技术（RNA Binding Protein Immunoprecipitation，RNA结合蛋白免疫沉淀），是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术，是了解转录后调控网络动态过程的有力工具，能帮助我们发现miRNA的调节靶点。RIP这种新兴的技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合
RNA编辑：肿瘤和遗传疾病治疗的新选择
2018年，美国FDA和欧洲EMA批准了来自RNA药物制造两大巨头Ionis Pharmaceuticals公司的反义寡核苷酸疗法药物Tegesedi（Inotersen）和Alnylam Pharmaceuticals公司的siRNA疗法药物Onpattro（Patisiran），用于治疗遗传
新的基因编辑领域突破口—表观遗传调控
几十年来，DNA一直被认为是决定生命遗传信息的核心物质，但是近些年不断的研究表明，生命遗传信息从来就不是基因所能完全决定的，比如科学家们发现，可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰，这种改变不仅影响个体的发育，而且还可遗传给后代。如肿瘤等多种疾病并非仅由基因突变而引起，且与DNA和组蛋白
新的基因编辑领域突破口—表观遗传调控
几十年来，DNA一直被认为是决定生命遗传信息的核心物质，但是近些年不断的研究表明，生命遗传信息从来就不是基因所能完全决定的，比如科学家们发现，可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰，这种改变不仅影响个体的发育，而且还可遗传给后代。如肿瘤等多种疾病并非仅由基因突变而引起，且与DNA和组蛋白
新的基因编辑领域突破口——表观遗传调控（二）
2. 神经系统疾病▼ 致病机理：神经细胞中由于遗传缺陷导致的疾病▼ 代表工作：同时另一项突破性的工作则使用一种SunTag（dCas9-10xGCN4）系统融合多个拷贝的转录激活蛋白（p65-HSF1），构建了一种Cre依赖性的SunTag-p65-HSF1（SPH）转基因小鼠模型。使用AAV
新的基因编辑领域突破口——表观遗传调控（一）
几十年来，DNA一直被认为是决定生命遗传信息的核心物质，但是近些年不断的研究表明，生命遗传信息从来就不是基因所能完全决定的，比如科学家们发现，可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰，这种改变不仅影响个体的发育，而且还可遗传给后代。如肿瘤等多种疾病并非仅由基因突变而引起，且与DNA和组蛋白修饰
RNA编辑主要类型
①简单编辑，单碱基转变的转录后调节；②插入编辑，插入单个核苷酸或少量核苷酸的丢失，其机制是转录链的跳格；③泛编辑，插入或缺失多个尿嘧啶核苷酸或转录后插入多个胞嘧啶，其机制是编辑序列由外源反义引导RNA（ gRNA）提供，gRNA在编辑体（editosome）核蛋白颗粒中与前编辑mRNA配对，鉴别作为
什么是RNA编辑？
RNA编辑（RNA editing）是指转录后的RNA在编码区发生碱基的加入、丢失或转换等现象。RNA编辑产生的“基因”可称为隐蔽基因（ cryptogene），其产物的结构不能从基因组DNA序列中推导获得。早在1986年发现锥虫线粒体mRNA转录加工后，其mRNA的多个编码位置上加入或丢失尿苷酸。
物对牡丹花器官数量变异遗传网络调控
花器官作为有花植物的重要繁殖系统，是物种形成与多样化的关键。在人类对植物驯化栽培和育种过程中，花器官数量决定其产量、品质及育种成败。牡丹（Paeonia suffruticosa）属于芍药科芍药属植物，其花形态多样。出于对重瓣花的偏爱，人们在漫长的驯化栽培和选择过程中对花瓣数目进行了持续选择，导
研究表明植物靠遗传网络调控“叶圈”微生物
植物叶片上生存着大量的不同性质的微生物，有益微生物和有害微生物与植物长期共存，植物是如何控制其地上部分的叶、果实、茎这些“叶圈”里的微生物并且维持自身健康的？相关机制尚不明确。 4月8日，《自然》杂志在线发表了题为“A plant genetic network for preventing
噬菌体展示技术研究RNA结合蛋白实验
噬菌体展示技术研究RNA结合蛋白实验 实验方法原理 噬菌体展示技术是将外源基因与噬菌体的表面蛋白基因融合，在融合了外源基因的噬菌体颗粒的表面就会表达相应的外源
噬菌体展示技术研究RNA结合蛋白实验
实验方法原理噬菌体展示技术是将外源基因与噬菌体的表面蛋白基因融合，在融合了外源基因的噬菌体颗粒的表面就会表达相应的外源蛋白，即外源基因编码的蛋白被展示在噬菌体颗粒的表面。实验材料载体tRNA抗体寡核苷酸试剂、试剂盒抗生素储存液BCIP葡萄糖储存液X-Gal磁珠洗液蛋白酶抑制剂RNase 抑制剂TEN
天然RNA文库筛选与蛋白特异性结合的RNA序列实验
实验方法原理 细胞中，蛋白质与 RNA 结合参与多种生理调控和发育过程。在 mRNA 的加帽，多聚腺苷酸化，剪切，核外运，翻译起始及降解等过程中都存在着蛋白质与 RNA 的直接相互作用。在发育的各个阶段，RNA 结合蛋白可以通过与 mRNA 的相互作用调控基因的表达。实验材料 mRNA寡核苷酸试剂、
天然RNA文库筛选与蛋白特异性结合的RNA序列实验
细胞中，蛋白质与 RNA 结合参与多种生理调控和发育过程。在 mRNA 的加帽，多聚腺苷酸化，剪切，核外运，翻译起始及降解等过程中都存在着蛋白质与 RNA 的直接相互作用。在发育的各个阶段，RNA 结合蛋白可以通过与 mRNA 的相互作用调控基因的表达。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞
天然RNA文库筛选与蛋白特异性结合的RNA序列实验
实验方法原理 细胞中，蛋白质与 RNA 结合参与多种生理调控和发育过程。在 mRNA 的加帽，多聚腺苷酸化，剪切，核外运，翻译起始及降解等过程中都存在着蛋白质与 RNA 的直接相互作用。在发育的各个阶段，RNA 结合蛋白可以通过与 m
曹雪涛团队再发Nature——揭示新型非编码RNA调控网络
先天性免疫反应可保护宿主免受病原体感染，并向病原体施加进化压力，以减弱这些反应并确保其存活和复制的策略。这些不断变化的压力导致了跨宿主-病原体相互作用的先天性免疫稳态的复杂机制，但尚未得到全面了解。尤其是，更好地了解控制宿主与病原体相互作用并促进入侵病原体清除或逃逸的调节剂，可以确定传染病和慢性
分子遗传学词汇TATA结合蛋白质
中文名称：TATA结合蛋白质英文名称：TATA-binding protein;TBP定 义：转录因子TFⅡD的组分之一，特异地与TATA框结合并指导起始复合体的形成，也可以是与RNA聚合酶Ⅲ或RNA聚合酶Ⅰ共同发挥作用的转录因子之一。即使基因无TATA框，也能通过与TBP结合因子间相互作用而起调
分子遗传学词汇单链DNA结合蛋白
中文名称：单链DNA结合蛋白外文名称：Single-stranded DNA-binding protein定义：单链DNA结合蛋白（Single-stranded DNA-binding protein，缩写SSB或SSBP）又称单链结合蛋白，是专门负责与DNA单链区域结合的一种蛋白质，为DNA复
研究揭示真菌中RNA编辑的酶复合体和调控机制
近日，西北农林科技大学植保学院作物病原真菌功能基因组学研究团队刘慧泉教授课题组揭示了真菌中A-to-I mRNA编辑的酶复合体，并明确了其起源、进化和调控机制，为真菌病害防控和基因编辑工具开发提供了重要的新思路，相关研究成果发表在《自然-通讯》上。A-to-I mRNA编辑是一种关键的遗传信息修饰机
健康所在RNA结合蛋白调节信使RNA翻译研究中取得新进展
近日，国际学术期刊Molecular and Cellular Biology在线发表了中科院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康所核酸与分子医学研究组的最新研究进展：AU-Rich Element-Dependent Translation Repression Requires the
Cell子刊：mRNA编辑的全局调控子
转录成为mRNA的基因组遗传信息，需要先经过加工，然后再翻译成为生物所需的蛋白质。现在，加州大学和印第安纳大学的研究人员，发现了一个能够广泛调控mRNA编辑的重要蛋白。这项研究于二月六日发表在Cell旗下的Cell Reports杂志上。 这一调控机制有助于解释，为何在从海葵到人类的细
抑制细菌转录终止检测技术筛选RNA结合蛋白实验
实验方法原理 一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。 实验材料 N-表达质粒 E.coi