健康所在RNA结合蛋白调节信使RNA翻译研究中取得新进展
近日,国际学术期刊Molecular and Cellular Biology在线发表了中科院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康所核酸与分子医学研究组的最新研究进展:AU-Rich Element-Dependent Translation Repression Requires the Cooperation of Tristetraprolin and RCK/P54。 ARE-mRNA是3′-UTR区富含AU序列(AU-rich element, ARE)为特征的一类mRNA,它们在转录后水平受到多蛋白网络多层次的严密调控。Tristetraprolin(TTP)是至今研究最为广泛的ARE结合蛋白,其基因敲除小鼠会导致严重的自身免疫性疾病。已有研究表明,TTP调节ARE-mRNA的降解,但TTP是否通过其它机制调控ARE-mRNA的表达,尚不清楚。 祁美雁博士、研究生王志章等在荆清研究员的指导下,利......阅读全文
RNA编辑的生物学意义
RNA编辑的生物学意义主要有:①校正作用,因4个核苷酸的插入移码,使其肽链的序列和其他生物的相似;②调控翻译,通过编辑可以引入或去除起始密码子或终止密码子;③扩充遗传信息,经编辑后增加了肽链的编码信息量。
科学首次揭示“RNA编辑”生物学功能
栖息在南极冰冷海水中的章鱼并没有给自己的触手带上手套,但它却找到了另一种方式来抵御寒冷。 一项新的研究表明,这种海洋生物利用一种被称为核糖核酸(RNA)编辑的手段来定制在低温下工作的关键神经系统蛋白质。这篇论文同时也第一次揭示了RNA编辑——不仅仅是改变一个特定的基因——能够导致适应。
信使RNA反转录的生物学意义
1.对分子生物学的中心法则进行了修正和补充,修正后的中心法则表示为: 2.在致癌病毒的研究中发现了癌基因,在人类一些癌细胞如膀胱癌、小细胞肺癌等细胞中,也分离出与病毒癌基因相同的碱基序列,称为细胞癌基因或原癌基因。癌基因的发现为肿瘤发病机理的研究提供了很有前途的线索。 3.在实际工作中有助于
Nature聚焦小RNA-破解系统生物学大难题
最新一期的Nature Genetics在线版刊登了三篇文章,三个独立的研究团队解决了系统生物学理论中最重要的理论,三文章释放了一系列的数据解答了系统生物学细胞定向分化的关键调控网络。同期Nature配发了评论文章,FANTOM studies networks in cells。 系统生
“非编码RNA在重大生物学过程中的功能和机制”
会议现场 6月5日至7日,主题为“非编码RNA在重大生物学过程中的功能和机制”的香山科学会议第426次学术研讨会在北京召开,会议邀请了多学科跨领域的专家学者与会,中心议题为非编码RNA系统发现、功能鉴定及进化;非编码 RNA与细胞分化发育与功能调控;非编码RNA与重大疾病
Nature:小RNA生物学里程碑成果-解开piRNA生物合成谜题
PIWI相互作用的RNA,简称piRNAs,是一类小型的调控RNAs ——长度只有22–30个核苷酸的小块核酸。它们可能很小,但是与它们相关的Argonaute蛋白一起,piRNAs就能够“沉默”转座因子,所谓的自私基因,存在于植物、真菌和动物的基因机制。 虽然科学家们很清楚piRNAs是如何
《自然—结构与分子生物学》:发现RNA调控基因新标靶
美国和加拿大科学家近日研究发现,RNA可以与DNA上称为启动子区(promoter region,位于实际基因前的一小段DNA片段)的非基因区相互作用。在基因被开启前,启动子必须先被激活。相关论文7月6日在线发表于《自然—结构与分子生物学》(Nature Structural and Molecul
Nature:小RNA生物学里程碑成果-解开piRNA生物合成谜题
PIWI相互作用的RNA,简称piRNAs,是一类小型的调控RNAs ——长度只有22–30个核苷酸的小块核酸。它们可能很小,但是与它们相关的Argonaute蛋白一起,piRNAs就能够“沉默”转座因子,所谓的自私基因,存在于植物、真菌和动物的基因组中。piRNA介导的沉默可以作用于染色质,以
我国科学家发现有重大生物学意义的全新RNA病毒
我国科学家从蜱中发现一种从未被报道过的分节段RNA病毒,该病毒在分类上可能代表着一个新病毒科。该病毒由中国疾控中心传染病所张永振研究员及其研究团队发现,文章日前发表在《美国科学院院报》杂志上,国际著名学术期刊《Nature Reviews Microbiology》高度评价了该论文的重要意义、《
挑战生物学以往观点-哺乳动物细胞可将RNA序列写入DNA
美国费城托马斯杰斐逊大学的研究人员首次发现,哺乳动物细胞可以将RNA序列转换回DNA,这在病毒中比真核细胞更常见。这一发现可能会挑战生物学长期以来的观点,并可能对生物学的众多领域产生广泛影响。相关研究发表在6月11日的《科学进展》杂志上。 细胞含有一种机制,它可以将DNA复制成一组新的DNA,
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(2)
早期的 RNAi 技术可用在研究与胚胎发育相关基因的功能上,但是由于细胞分裂造成 dsRNA 的稀释,使得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早期 RNAi 技术的不足,Tavernarakis 等将 RNAi 技术做了一些改进及更动,将目的基因之标的序列以反向重复的方式,由
RNA提取时RNA降解原因
1 ) 新鲜细胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织: 某些含有内源性核酸酶的样品,很难避免RNA酶的降解,建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎,并且,匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品: 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放,然后转移到-70℃冰箱存
RNA干扰技术(RNA-interference,RNAi)
1995年,康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫(C. elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达,而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA(sense RNA)以期观察到基因表达的增强。但得到的结果
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(1)
基因沉默(gene silencing)是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面,基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物(genetically modified organisms)的障碍,另一方面,它又是植物抵抗外来核酸入侵(如病毒)的一种反应,为植物抗病毒的遗传育
RNA提取心得(组织RNA提取和培养细胞的RNA提取)
一.组织RNA提取 1.最好新鲜组织,这样RNA提取的效果比较好,这是肯定的。 2. 如果不是新鲜的(最好在半年之内,-80℃或者液氮中冻存的)组织,注意不要反复冻融,从冰冻状态拿到0-4℃,注意不要拿到常温,待组织解冻后,用 DEPC泡过的剪刀剪一小块组织,称重后,放到预冷的匀浆器中,然后
反义技术——RNA干扰(RNA-interference,RNAi)
最近由于RNA干扰(RNA interference,RNAi)的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的(1),是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在RNAi领域取得的进步,已经有许多这方面的综述发表(2-4)。RNA干扰是由长的双链 RNA
RNA干扰相关知识RNARITS)
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing(RITS):是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质,通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。
RNA分离与分析实验_分离RNA
实验材料标记细胞试剂、试剂盒乙酸缓冲液仪器、耗材漩涡器实验步骤1. 收获标记细胞。2. 小心处置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸缓冲液悬浮细胞沉淀,每 1 ml 压积细胞用 10 ml 缓冲液。3. 于室温用漩涡器振荡裂解细胞。4. 加等体积的水饱和酚,充分混匀,于 60
RNA干扰相关知识RNARISC
RNA-induced silencing complex(RISC):一种RNA-蛋白质复合物,通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC,miRNA组装miRISC。RISCs(无论siRISC还是miRISC)包括两种类型:切割型和不切割型。
RNA降解
新鲜细胞:如果试剂没有问题,且外源性污染也可以排除,那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如 果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞,一定要使裂解液能覆盖住细胞。 2. 新鲜组织:某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏,胸腺等),即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是:在液氮条件下将组织
RNA电泳
RNA Gel (Crawford Lab)Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis.Northern Gel and TransferUsing glyoxal
RNA提取
RNA提取(主要内容如下)Tips for Handing RNA Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum Basic Procedures for Handing
Quantitating-RNA
RNA quantitation is an important and necessary step prior to most RNA analysis methods. Here we discuss three common methods used to quantitate RNA an
RNA标记
RNA labeling (Amersham Pharmacia)For the generation of radiolabelled, single stranded RNA for use as hybridization probes 32P-pCp 3' End-labeling
RNA标记
RNA标记是将标记物(如放射性同位素、荧光素或酶)共价地连接到RNA,通过检测标记物,进而实现对RNA鉴别和检测的目的。RNA标记在分子探针领域应用广泛,在疾病诊断方面也很有前景。 理想的RNA标记方法应符合以下要求: 1. 操作简单,灵敏度高 2. 不影响碱基配对的特异性 3. 不影响RN
RNA-电泳
①电泳RNA 所用器械如制胶的模具、梳子、电泳槽等用肥皂粉洗干净后用双蒸水冲洗二遍后在室温晾干备用。②用新的1XTBE 配制1. 2 %琼脂糖凝胶,倒胶时溴化乙锭(E直接加入凝胶中。③制备好的琼脂糖凝胶板放入电泳槽后再加入经高压灭菌过的1XTBE ,液面只能刚好同胶面平齐,缓冲液不要淹过胶面。④点样
RNA-Electrophoresis
Electrophoresis through agarose or polyacrylamide gels is the standard way to separate, identify and purify nucleic acid fragments. The location of th
指导RNA
中文名称指导RNA英文名称guide RNA;gRNA定 义一种小分子RNA,约含60~80个核苷酸,在RNA编辑中起模板作用。其功能是提供核苷酸插入或删除的信息。由小环DNA及大环DNA编码的指导RNA均带有编辑区的序列信息,可介导编辑过程。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调
RNA电泳
· RNA Gel (Crawford Lab)· Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis. · Northern
RNA-剪接
中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定 义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子,连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)