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CellRep:无需参考的甲基化分析新方法

分析DNA甲基化的高通量方法大多依赖参考基因组,而许多物种不一定有。最近,奥地利的研究人员就开发出一种方法,在没有参考基因组的情况下分析DNA甲基化。这项成果发表在Cell Reports上。 文章的第一作者是奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Johanna Klughammer。她及其同事将简化甲基化测序(reduced representation bisulfite sequencing,RRBS)与一种名为RefFreeDMA的应用程序相结合。这种程序能从RRBS读取中推断出基因组,并发现样品中差异甲基化的区域。她们开发的这个流程依赖于脊椎动物中DNA甲基化的非随机分布,大多数甲基化都位于CpG位点。 在她们这个方法中,DNA先通过限制性内切酶Mspl和/或Taql消化,这两种酶分别切割C^CGG和T^CGA,并且对甲基化不敏感。之后,这些消化后的序列被用来创建RRBS测序文库。研究人员指出,他们利用九个物种......阅读全文

特异性位点的DNA甲基化的检测方法

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RNA甲基化研究深度剖析

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2018国自然研究热点二: RNA甲基化研究深度剖析

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RNA甲基化研究深度剖析(一)

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