Nature2015最佳评论文章:汤富酬、文路、马晓娅入选

Nature杂志近日展开了一年一度的年终大盘点,评出了2015年的最佳评论文章。本次盘点选入了三名中国学者的两篇文章,他们分别是北京大学的研究员汤富酬和研究员文路,以及云南大学的研究员马晓娅。 汤富酬和文路在这篇文章中重点介绍了Grün等人开发的RaceID的算法,该算法能够在复杂的细胞混合物中有效鉴定稀有细胞类型。 Grün等人从体外培养的小鼠“迷你肠”获得238个细胞,并对它们进行了单细胞转录组测序。然而,标准聚类算法无法鉴别稀有细胞(分泌细胞谱系)中的亚类。他们为此开发了一种聪明的算法,RaceID。 RaceID假定给定细胞类型强力表达一些特异性的“异常值”基因。只要仔细排除技术和生物学噪音,就可以从测序数据中鉴定到这些基因。Grün等人通过RaceID鉴定了新的分泌细胞亚型,并且在体内验证了它们的存在。 汤富酬和文路在文章中指出,通过研究者们的不懈努力下,不久的将来我们将能绘制完整的人体细胞谱系图。(下接:......阅读全文

北京大学Nature发布重要甲基化景观图

  来自北京大学、教育部辅助生殖重点实验室、哈佛大学等机构的研究人员,绘制出了人类早期胚胎全基因组水平的DNA甲基化景观图谱,提出了有别于以往小鼠研究结果的一些新见解。这些研究结果发表在7月23日的《自然》(Nature)杂志上。  北京大学第三医院的乔杰(Jie Qiao)教授以及汤富酬(Fuch

高通量测序技术实现绘制人类视网膜高精度发育细胞图谱

  人类胚胎发育从受精卵开始,经过着床前胚胎发育(胚内和胚外组织的产生),原肠胚产生(三胚层的特化)和器官发生等阶段,最终新生儿出生。人类胚胎发育从单个细胞到上万亿个细胞,历时二百八十天,整个过程的基因表达受到多种因素的精细调控,其中很多机制尚未明确。  为了解析人类胚胎发育各个阶段的基因表达调控网

北大团队发展最新单细胞多重组学测序技术

单细胞三重组学测序技术(scTrio-seq)单细胞中三种组学之间的对应关系癌症中两个细胞亚群的DNA拷贝数差异  2016年2月23日,《细胞研究》(Cell Research)杂志在线发表了北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组、黄岩谊研究组和首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大

《自然—方法学》年度方法:单细胞测序

  2014年1月《自然—方法学》(Nature Methods)上发表年度特别报道,将“单细胞测序”(Singled out for sequencing)的应用列为2013年度最重要的方法学进展。   近几年来,基于单细胞测序技术的科学研究取得了突飞猛进的发展,其成果有望为一些重

单细胞测序揭示了人类胚胎DNA甲基化动态

  2017年12月19日,北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心、生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组和北京大学第三医院乔杰研究组合作在国际知名学术期刊《自然遗传学》上在线发表题为“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimpla

贺福初,裴钢等51人入选最新全球顶尖科学家分子生物学领域榜单

  在科研领域,衡量学者学术成就和影响力的指标众多,而D-index(学科H-index)作为一项重要的学术评价指标,其细分领域排名更是备受瞩目。D-index(学科H-index)学者排名指标,仅包括被调查学科的论文和引用值。根据官网介绍,D-index细分为化学,电脑科学,数学,法律,材料科学等

血消化汤

成分  绞碎猪胃     100g  绞碎猪血块    100g  蒸馏水      1000mL  浓盐酸      10mL制法  1 洗涤猪胃,除去油脂,保留胃粘膜,用绞肉机绞碎。  2 用绞肉机将猪血块绞碎。  3 将蒸馏水加热至55℃,加入猪胃、猪血块和盐酸,置55℃水浴中24h,时常加以

我科学家完成单个卵细胞的高精度全基因组测序

  近日,由北京大学第三医院教授乔杰、北京大学生物动态光学成像中心教授汤富酬和谢晓亮所领导的3个研究小组,共同完成了对单个卵细胞的高精度全基因组测序。成果发表在国际著名学术期刊《细胞》上。  2012年,谢晓亮课题组实现了对单个细胞全基因组的高精度测序,随后该技术被应用到多项研究中。数据显示,我国每

华人学者Nature-Methods发布单细胞测序重要工具

  新一代测序技术(NGS)大大增进了我们对疾病(比如癌症)的理解。不过NGS的研究对象是细胞群体,会掩盖细胞之间的异质性。正因如此,单细胞测序(SCS)技术受到了越来越多的关注。  德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员开发了首个用于单细胞DNA测序的突变检出程序,Monovar。这一重要成果发

北京大学Cell-Res获染色质免疫沉淀测序技术突破

  生物动态光学成像中心黄岩谊课题组与汤富酬课题组合作,发展了一种基于微流控芯片的微量细胞样品处理与核酸俘获方法,成功实现了针对1000个细胞的染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq),大幅减少了这类实验中对样品起始量的要求,并利用这一方法研究了组蛋白H3第4位赖氨酸的3甲基化修饰(H3K4me3)在

习近平视察北大:了解遗传病及癌症早期诊断技术研究进展

        5月4日上午,在纪念五四运动95周年、庆祝北大建校116周年之际,习近平总书记莅临北京大学,视察指导工作。  在北大生物动态光学成像中心,习近平观看多媒体演示,了解胎儿遗传疾病筛查、癌症早期诊断等新技术研究应用的情况,并通过显微镜观看动物卵细胞受精和极体细胞提取过程。北京大学第三医院

科学家开发单细胞全转录组测序新技术

  北京大学生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的论文。该研究利用微流控芯片技术实现了高质量单细胞的全转录组测序样品准备,全面提高了单细胞全

科学家建立植入前胚胎遗传学诊断新方法

  北京大学谢晓亮、乔杰、汤富酬团队在国际上首次建立了一种全新的植入前胚胎遗传学诊断方法MARSALA(高通量测序同时检测突变位点、染色体异常以及连锁分析),可以在早期胚胎阶段对各种单基因遗传疾病和染色体疾病同时进行精确诊断,以避免严重遗传病患儿的出生。相关成果日前发表于美国《国家科学院院刊》。  

漏芦汤的概述

  漏芦汤药名:漏芦别名:野兰、鹿骊、鬼油麻、和尚头、大头翁、独花山牛蒡、祁漏芦、禹漏芦、龙葱根、毛头性味:味苦;性寒归经:归胃;大肠;肝经功效:清热解毒;活血通乳主治:疮疖肿毒;乳痈;肋腺炎;淋马结结核;痔瘘;疥癣痒疹;目赤肿痛;痢疾;蛔早腹痛;风湿痹痛;闪腰岔气;跌打损伤;产后乳汁不下用法用量:

麦门冬汤方证浅析

  《金匮要略·肺痿肺痈咳嗽上气病脉证并治》中麦门冬汤方证条文说:“大逆上气,咽喉不利,止逆下气者,麦门冬汤主之。麦门冬汤方:麦门冬七升,半夏一升,人参二两,甘草二两,粳米三合,大枣十二枚。上六味,以水一斗二升,煮取六升,温服一升,日三夜一服。”条文中“大逆”二字非常重要,《素问·调经论》说:“

漏芦汤的简介

  漏芦汤药名:漏芦别名:野兰、鹿骊、鬼油麻、和尚头、大头翁、独花山牛蒡、祁漏芦、禹漏芦、龙葱根、毛头性味:味苦;性寒归经:归胃;大肠;肝经功效:清热解毒;活血通乳主治:疮疖肿毒;乳痈;肋腺炎;淋马结结核;痔瘘;疥癣痒疹;目赤肿痛;痢疾;蛔早腹痛;风湿痹痛;闪腰岔气;跌打损伤;产后乳汁不下用法用量:

刘光慧研究员Cell发布早衰研究重要发现

  来自中国科学院生物物理研究所、美国国立卫生研究院的研究人员,开发出了一种基于细胞的高通量、高内涵成像小干扰RNA(siRNA)筛选方法,利用这一系统确定了抗氧化NRF2信号通路是早年衰老综合症(HGPS)的一个驱动机制。这项重要的研究发布在6月2日的《细胞》(Cell)杂志上。  中国科学院生物

MCTASeq检测DNA甲基化实现胃癌早期无创诊断

  北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)汤富酬教授/文路副研究员团队与北京大学第三医院普外科付卫教授团队合作,利用团队之前开发的甲基化CpG短串联扩增与测序技术(MCTA-Seq),通过对患者血浆游离DNA中异常高甲基化CpG岛进行基因组规模的高灵敏

单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

单细胞测序这样的高通量技术的优势

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

《细胞》:世界首个女性个人遗传图谱绘制完成

对人类卵子的两个极体进行高通量测序 第一个人类女性个人遗传图谱 极体基因组测序结果指导异常胚胎筛选   2013年12月20日,著名学术期刊《细胞》杂志发布世界上首个人类女性个人遗传谱图。   在这篇题为“Genome Analyses of single human oocytes”

单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

上海生化细胞所发现受精卵DNA去甲基化重要机制

        近日,中科院上海生科院生化与细胞所一项最新研究发现,小鼠早期胚胎中母源和父源基因组在单细胞的受精卵阶段,均会发生大规模的DNA主动和被动去甲基化,DNA双加氧酶Tet3介导了主动去甲基化的发生,而糖苷酶TDG并不参与该过程。相关研究成果在线发表于学术期刊

研究揭示受精卵DNA去甲基化重要机制

  近日,中科院上海生科院生化与细胞所一项最新研究发现,小鼠早期胚胎中母源和父源基因组在单细胞的受精卵阶段,均会发生大规模的DNA主动和被动去甲基化,DNA双加氧酶Tet3介导了主动去甲基化的发生,而糖苷酶TDG并不参与该过程。相关研究成果在线发表于学术期刊《细胞—干细胞》。  该研究由中科院上海生

广西新发现大面积富硒富锗土壤

   近日,在广西崇左市龙州镇百农村,负责该片区项目点的广西地质调查院技术员正在进行取土采样工作。他们告诉记者,为全面获取精准数据,在完成表层土壤采样化学分析之后,技术人员还将开展灌溉用水、专项化肥及大气干湿沉降等调查检测,根据得出的异常数据对部分区域开展农作物及根系土等项目的调查,全方位“把脉”土

单细胞RNA测序发现新的免疫细胞

  最近在《Nature Immunology》发表的一项新研究,详细检测了一组新发现的免疫细胞(被称为ILC)。通过对单个扁桃体细胞的基因表达进行分析,瑞典卡罗林斯卡学院的科学家们,发现了三个以前未知的ILC子群,并揭示了关于“这些细胞在人体中如何发挥功能”的更多信息。  先天淋巴细胞(ILC)是

-北京大学团队发布肝癌无创早期诊断新技术

   DNA甲基化是指DNA的胞嘧啶(C)被加上一个甲基而形成甲基胞嘧啶的表观遗传修饰,主要发生于CpG二核苷酸。CpG二核苷酸高度聚集于被称为CpG岛的基因组区域,这些区域主要位于基因转录起始处,具有重要的转录调控功能。CpG岛在正常细胞中大多处于去甲基化状态,但在肿瘤细胞中,大量CpG岛会发生异

高校“双肩挑”人员兼职取酬行为是否违纪?

1月12日,中央纪委国家监委网站发布一则关于高校“双肩挑”人员兼职取酬行为是否构成违纪的案例分析。案件中,某省属高校副校长张某在原任职高校退休后,到某民办高校兼任副院长,两高校无业务往来、合作办学事宜等。文章分析认为,对高校“双肩挑”人员的兼职取酬,不能简单套用党政机关领导干部的规定。张某退休后利用

非洲猪瘟病毒感染的全景式细胞转录图谱合作构建

  中国科学院微生物研究所高福院士团队、中国农业科学院哈尔滨兽医研究所仇华吉研究员团队、北京大学汤富酬教授团队合作,在PNAS上在线发表了题为 Transcriptome Profiling in Swine Macrophages Infectedwith African Swine Fever