NatMethods：利用TruSPADES方法显著改善宏基因组测序
在一项新的研究中，来自俄罗斯圣彼得堡国立大学的研究人员开发出一种方法极大地改善人们对实验室中不能培养的有机体---如生活在人胃肠道中的微生物，或者生活在海洋深处的细菌---的DNA进行测序的能力。相关研究结果于2016年2月1日在线发表在Nature Methods期刊上，论文标题为“TruSPAdes: barcode assembly of TruSeq synthetic long reads”。 这种被称作TruSPADES的方法通过计算机将来自Illumina公司的机器产生的长300个碱基对的短测序片段(short reads)组装成所谓的合成长测序片段(synthetic long reads)，这些合成长测序片段是基因组中长大约10,000个碱基对的片段。 研究人员说，使用这些合成长测序片段而不是短测序片段组装基因组就好比是使用整个章节而不是单个句子来组装一本书。因此，人们有强烈的动机利用长测序片段改进......阅读全文
基因组印记的方法特点和应用
基因组印记（genomic imprinting）是表观遗传学调节的一种形式。指两个亲本等位基因差异甲基化而导致的一个亲本等位基因沉默而另一个亲本等位基因保持活性的现象。通过对富含CpG岛的印记中心的差异甲基化来作用。
新测序方法解析人体“第二基因组”
来自华盛顿大学圣路易斯分校，耶鲁大学等处的研究人员发表了题为“The Long-Term Stability of the Human Gut Microbiota”的文章，针对被称为人体“第二基因组”的肠道微生物组展开了研究，研究人员利用一种称为LEA-seq的方法，对多个个体粪便中的微生
美研制出高效基因组改编方法
中国科技网讯 据物理学家组织网、《自然》网站等媒体9月23日报道，一个由美国明尼苏达州罗彻斯特市梅奥诊所研究人员领导的国际研究小组，开发出一种高效的基因组改编方法，可对斑马鱼基因组进行精确定位的剪切替换，用于各种研究目的。该研究首次实现了对斑马鱼基因组分的自定义
何宏轩：鼠疫，全是跳蚤惹的祸
7月16日，甘肃省玉门市一人因为接触了死旱獭，感染鼠疫，3日后医治无效死亡。疫情一出，当地立即采取措施，暂时封闭城市，隔离了相关人员。同时，这件事也让这种发病急剧、传染性强、死亡率高的自然疫源性疾病重回公众视线。 在人类历史上，鼠疫曾经夺走不少人的性命。引起鼠疫的鼠疫杆菌直到1894年方被发
张文宏谈乘飞机回国注意事项
居家隔离时吃什么？孩子在学校内不便戴口罩怎么办？坐飞机时能吃东西吗？张文宏对此一一作答。 5月28日下午，中国驻贝尔法斯特总领馆与上海市外办、上海市卫健委联合组织防控新冠肺炎疫情视频讲座，邀请上海新冠肺炎医疗救治专家组组长、复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏教授与在英国北爱尔兰的中资企业、华
张文宏:中国不会盲目地开放和封锁
第五届海南国际健康产业博览会11月12日开幕。复旦大学附属华山医院感染科主任、国家传染病医学中心主任张文宏在博览会的医疗健康产业高峰论坛上做“传染病消除：挑战与未来”演讲。他表示，新冠疫情不会彻底消失，即便疫苗接种达到非常高的水平，还得继续实施非常强大的公共卫生政策。多国经验证明疫苗虽然无法完全
陈宏础：重视血常规的复检工作
目前血细胞分析仪己经普及到县医院或卫生院，这对提高血细胞常规的准确性和重复性，减轻工作人员劳动强度起促进作用。但是我们应该认识到血细胞分析仪还是一个过筛工具，至今最先进的全自动血细胞分析仪还不能完全取代人工检查，仍然有部分标本需要复检。据我所知有的医院有了血细胞分析仪，把人工操作的工具
周宏灏：推行个体化治疗势在必行
“从千人一药、千人一量的对症下药，到量体裁衣的对人下药，这是未来医学的发展趋势。”日前，签约进入重庆医科大学院士专家工作站后，中国工程院院士接受了本报记者专访。 他强调：“未来医生给病人开药，应根据病人的遗传变异情况量体裁衣，推行个体化药物治疗。” 作为我国遗传药理学的开拓者和带头
张文宏又有了一个新身份
5月28日，复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏教授在香港理工大学发表了一场主题演讲，并被聘为该校医疗科技及资讯学系荣誉教授。张文宏教授是国际知名的传染病防控专家，目前还担任上海感染与免疫科技创新中心主任及复旦大学上海医学院内科学系主任。在演讲中，张文宏教授回顾了人类与传染病的漫长“博弈史”，从18
聚光科技财务总监匡志宏辞职
聚光科技(杭州)股份有限公司关于高管辞职的公告 本公司及董事会全体成员保证公告内容真实、准确和完整，没有虚假记载、误导性陈述或重大遗漏。 聚光科技(杭州)股份有限公司(以下简称“公司”)董事会于2012年4月16日收到公司财务总监匡志宏先生的书面辞职申请。匡志宏先生因为个人身体原因，申
许智宏：翩翩江南客－依依草木情
许智宏，1942年10月出生于江苏无锡，植物生理学家，中国科学院院士。现任中国人与生物圈国家委员会专家咨询委员会主席、中国植物园联盟咨询委员会主任、北京大学现代农学院教授；曾任中国科学院副院长、北京大学校长、国际植物组织培养和生物技术协会主席、中国植物生理学会理事长、中国细胞生物学会理事长、北京大学
纪宏斌《自然》发现新抑癌基因
来自美国波士顿和北卡罗莱纳州的研究人员合作发现一种特殊的基因能够抑制小鼠肺癌进程的关键步骤。研究人员将这些发现公布在8月5日的《自然》杂志的网络版上。这种叫做LKB1的基因在小鼠中不但是非小细胞肺癌的一种肿瘤抑制基因，而且其功能还可能比其他已知的抑制因子更加强大。 原文检索：Nature 44
基因组DNA的得率较低或者无基因组DNA原因及解决方法
1 ) 样品材料老化或者反复冻融导致 DNA 含量下降： 应选择新鲜的材料样品，如新鲜血液、新鲜菌液、刚离体的动物组织或幼嫩的植物组织等，不能立即处理的样品应放入液氮或-70℃低温保存，以免DNA降解。 2 ) 样品破壁或者裂解不完全， DNA 未充分释放： 动植物样品应在液氮中充分研磨
PNAS：揭秘微生物暗物质的强大工具
微生物几乎是无所不在的，它们对生态环境和人体健康起到了不容忽视的作用。然而人们对微生物的了解还相当匮乏，因为许多微生物是无法在实验室中培养的。科学家们想了很多方法来探索这些“微生物暗物质”，但还不能同时鉴定微生物的身份和活性。 现在，加州理工（Caltech）和美国能源部联合基因组研究所（DO
北大邓宏魁发现功能成熟细胞在体外长期维持的新方法
2019年4月26日，北京大学邓宏魁研究组、解放军总医院卢实春研究组以及复旦大学袁正宏研究组合作在《科学》（Science）杂志发表了题为《原代人肝脏细胞在体外的长期功能性维持》（Long-term functional maintenance of primary human hepatocy
限制性标记基因组扫描的方法介绍
该方法先用甲基化敏感的稀频限制性内切酶NotⅠ消化基因组DNA，甲基化位点保留，标记末端、切割、行一维电泳，随后再用更高频的甲基化不敏感的内切酶切割，行二维电泳，这样甲基化的部分被切割开并在电泳时显带，得到RLGS图谱与正常对照得出缺失条带即为甲基化的可能部位。
从全血中纯化基因组－DNA－实验方法
试剂、试剂盒 乙醇异丙醇RNA 酶 A全血仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳离心管Wizard 基因组 DNA 纯化试剂盒实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂乙醇，70%，室温异丙醇, 室温RNA 酶 A将 RNA 酶 A 溶解于 DNA 再水合液中至终浓度为 4 mg/ml, 煮沸 10min 以去
从全血中纯化基因组－DNA－实验方法
用于从全血（10 ml) 中分离基因组 DNA 的 Wizard 基因组 DNA 纯化试剂盒建立在一个四步程序基础上的。纯化程序的第一步包括血红细胞的裂解、可溶部分的弃除，随后是白细胞及其细胞核的裂解。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。试剂、试剂盒乙醇异丙醇RNA 酶 A
作物基因组单碱基编辑方法研究取得进展
单核苷酸点突变是作物许多重要农艺性状发生变异的遗传基础。单碱基的变异会导致氨基酸替换或蛋白质翻译终止，使基因功能发生改变，从而有可能产生优良的等位基因与优异性状。传统诱变及单碱基突变筛选技术（如TILLING）需要进行基因组规模的筛选，耗时、耗力且鉴定到的点突变数目和种类有限。基因组编辑技术，特
方法三：酵母菌基因组DNA的提取
方法三：酵母菌基因组DNA的提取一：仪器：同方法一二：试剂：SE缓冲液（1M山梨醇，0.1MEDTA pH7.5）；溶菌酶（50mg/ml）；20％PVP；蛋白酶K缓冲液（10mM Tris pH7.6 0.5% SDS 1mM EDTA）；其余同前三：操作 1.5ml 对数生长期细菌细胞
从全血中纯化基因组－DNA－实验方法
试剂、试剂盒 乙醇 异丙醇 RNA 酶 A 全血 仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳
新方法：超低细胞数表观基因组研究
日本九州大学和东京理工学院的科学家们研发了一种使用非常少量的细胞，范围从100到1000的细胞，来分析DNA-蛋白质相互作用的新技术。他们的方法可以捕获前所未有的细胞内表观遗传组信息，该技术奖促进生物标记的发现并为精准医学开辟新道路。 这项被称为染色质整合标记测序（Chromatin Inte
方法二：细菌基因组DNA的微量提取法
本方法通过SDS裂解细胞，蛋白酶降解蛋白，CTAB去除多糖成分一：仪器：同方法一 二：试剂：TE、TAE缓冲液；10%SDS；５ＭNaCL；20mg/ml蛋白酶Ｋ；CTAB/NaCL溶液(10% CTAB，0.7M NaCL 4.1gNaCL 溶于80ml水中，缓慢加入10gCTAB，加热溶解)；
还要不要打疫苗？张文宏最新回应
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500936.shtm
张文宏：我们要落实强化基层卫生体系建设
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495255.shtm
JBC：张宏研究组解析细胞自噬基因
来自北京生命科学研究所等处的研究人员发表了题为“Differential function of the two Atg4 homologues in the aggrephagy pathway in C. elegans”的文章，发现了线虫中的Atg4的两个同源基因在细胞自噬过程中表
赵宏委员：实现精准医疗须加强数据利用
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495234.shtm
张文宏：疫苗有望终止新冠疫情大流行
张文宏：疫苗有望终止新冠疫情大流行 要继续完成大规模疫苗接种 复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏24日在2021财新夏季峰会上表示，目前要继续完成大规模疫苗接种，这是中国以及世界其他国家阻止此次疫情流行的不二选择。 张文宏说，过去一年，中国采取了非常强有力的非药物干预措施，迅速有效地控制了
本人回应！张文宏否认在上海被居家隔离
1月12日，关于国家传染病医学中心主任、复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏在上海静安被居家隔离的信息在网上流传。 网传截图显示，1月11日17时左右，一网友发布的微信聊天记录称，“今天说静安有个人国外回来14+7，之前都阴性，最后一次检测，没等结果就出去浪了，结果偏偏最后一次是阳性。她逛了水
曹宏斌：为工业增添一点“绿”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503612.shtm当前，我国正在经历跨越式发展，重化工业在相当长的时间内仍然是国家经济发展的支柱产业之一。“减污降碳、提质增效，这一八字方针将是未来一段时间我国工业领域绿色转型的必然选择。”近日，中国科