我国科学家解析真核生物基因表达调控新机制
中科院上海植物逆境生物学研究中心何跃辉课题组发现,染色质修饰与mRNA转录起始及加工有着相互依存关系,两者协同作用,以提高成熟mRNA及基因表达的水平。相关成果2月29日在线发表于《自然—植物学》杂志。 据了解,mRNA前体的转录起始在表观遗传学水平上受到多种转录因子以及染色质修饰与重塑的调控。新合成的5’帽子结构被CBC蛋白复合体(由CBP20和CBP80构成)识别和保护,同时CBC还有助于mRNA加工过程的进行。不过,迄今为止,CBC对转录的调控仍不清楚。染色质修饰与mRNA间是否存在互作关系,也鲜有报道。 研究人员以模式植物拟南芥为研究对象,发现CBC蛋白复合体与COMPASS蛋白复合体以及EFS之间存在直接的相互作用,形成超级蛋白复合体。在复合体中,CBC与这些促进转录的染色质修饰因子相互依存,协同调控基因的转录以及共转录加工过程,从而高效调控mRNA的水平。 相关专家表示,此项研究揭示了染色质修饰因子与RNA......阅读全文
RNA干扰的概念
RNA干扰(RNA interference,RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。基因沉默,主要有转录前水平的基因沉默(TGS)和转录后水平的基因沉默(PTGS)两类:TGS是指由于DNA修
《科学》发表同济大学高亚威团队联合研究成果
摘要:1月17日,同济大学生命科学与技术学院、附属东方医院高亚威教授联合美国芝加哥大学教授何川、中科院北京基因组研究所研究员韩大力合作完成的研究成果“N6-methyladenosine of chromosome-associated regulatory RNA regulates chro
科学家发明少量细胞多层次图谱绘制新方法
解析正常和病态生理过程的有力工具是全基因组分子遗传和表观遗传图谱。其中获得细胞机能完整图谱最主要的挑战之一,就是开发出一种能够描述少量细胞多层次图谱特征的技术。最新一期《自然―方法学》(Nature Methods)发表的两篇文章解决了这个问题。 在过去的15年里,出现了许多研
mRNA的分离
与rRNA和tRNA不同的是,哺乳动物细胞的绝大部分mRNA在其3'端均有一poly(A)尾,因此可以用 oligo(dT)-纤维素亲和层析法从大量的细胞RNA中分离mRNAdmonds等,1971;At Leder,1972)。在构建cDNA文库时, 必须经上述纯化步骤制备mRNA
如何提取mrna
1 细胞总RNA的提取1)、6孔板细胞(CNE-2)汇合度为90-100%时,取出无菌室,去其上清,用PBS洗两次后,每孔加TRIZOL试剂(Gibco公司) 1 ml,摇匀,无菌罩内消化3-5分钟(观察:液体变粘稠,细胞脱壁).2)、将各孔内消化好的细胞裂解液吸到一DEPC处理过的1.5 ml E
mRNA的纯化
实验概要本文介绍了mRNA的纯化方法。实验原理mRNA的分离方法较多,其中以寡聚(dT)-纤维素柱层析法最为有效,已成为常规方法。此法利用mRNA 3‘末端含有Poly(A )的特点,在RNA流经寡聚(dT)纤维素柱时,在高盐缓冲液的作用下,mRNA被特异地结合在柱上,当逐渐降低盐的浓度时或在低
mRNA的分离
与rRNA和tRNA不同的是,哺乳动物细胞的绝大部分mRNA在其3'端均有一poly(A)尾,因此可以用oligo(dT)-纤维素亲和层析法从大量的细胞RNA中分离mRNAdmonds等,1971;At Leder,1972)。在构建cDNA文库时, 必须经上述纯化步骤制备mRNA模板。进行
mRNA的分离
与rRNA和tRNA不同的是,哺乳动物细胞的绝大部分mRNA在其3'端均有一poly(A)尾,因此可以用oligo(dT)-纤维素亲和层析法从大量的细胞RNA中分离mRNAdmonds等,1971;At Leder,1972)。在构建cDNA文库时, 必须经上述纯化步骤制备mRNA模板。进行
陈捷凯课题组发现RNA-m6A修饰调控异染色质形成的新机制
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员陈捷凯课题组发现了RNA m6A修饰调控异染色质形成的新机制,阐明了RNA m6A阅读器YTHDC1在这一机制中的关键作用:抑制基因组中广泛分布的ERVK、IAP、LINE1等转座元件限制胚胎干细胞向全能性干细胞转化,相关研究成果以The RNA m
真核生物基因表达的dna水平调控包括什么方式
1、转录起始水平。这一环节是调控的最主要环节,由对基因转录活性的调控来完成,包括基因的空间结构、折叠状态、DNA上的调控序列、与调控因子的相互作用等。a.活化染色质:在真核生物体内,RNApol与启动子的结合受染色质结构的限制,需通过染色质重塑来活化转录。常态下,组蛋白可使DNA链形成核小体结构而抑
异染色质和常染色质的结构差异
染色质可以分为两种类群,异染色质和常染色质。最开始,这两种形式是通过其在染色之后的颜色深浅区分的,常染色质一般着色较浅,而异染色质着色很深,表明其紧密聚集。异染色质通常集中在细胞核的边缘区域。然而,不同于这种早期的二分法,最近的研究表明在动物和植物体内都拥有不止这两种染色体结构,可能会有四到五种,区
常染色质与异染色质的功能差异
常染色质区域的基因可以被转录为信使RNA。常染色质区域非折叠的结构允许基因调控蛋白和RNA聚合酶与其上的DNA序列结合,从而开启转录过程。在转录过程中,并非所有的常染色质都会被转录,但基本上非转录的部分会折叠为异染色质以保护暂时其上不用的基因。因此细胞的活性与细胞核中的常染色质数目有直接关系。常染色
刘默芳组:LARP7介导U6修饰及在生精细胞mRNA精准剪接功能
在较高等的真核生物中,大部分基因都含有内含子,在转录完成后需经过剪接(splicing)从mRNA前体移除内含子,以产生成熟、有翻译活性的mRNA,这个过程由剪接体(spliceosome)催化完成。经典的剪接体包括五种snRNA(small nuclear RNA),即U1、U2、U4、U5和
PEG修饰及其修饰GLP1的意义
PEG修饰是一个使多肽或蛋白质在治疗或生物技术方面的效力得以提高的重要过程。当PEG以适当的方式连接在蛋白质或多肽上时,它能改变许多的特征,而主要的生物活性功能,如酶活性或特异结合位点,可以保留下来。PEG修饰通过如下几种途径改善药物的性能。首先,PEG连接在蛋白质或多肽的表面上,提高了它的分子大小
多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物,受到紫外光或蓝紫光照射时,可激发成为激发态,当从激发态恢复基态时,发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上,利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染,操
多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物,受到紫外光或蓝紫光照射时,可激发成为激发态,当从激发态恢复基态时,发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上,利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染,操
异染色质的主要类型组成性异染色质
组成性异染色质,指除S期以外在整个细胞周期均处于聚缩状态, DNA包装比基本不变,可构成多个染色中心。
异染色质的主要类型兼性异染色质
在一定时期的特种细胞的细胞核内, 原来的常染色质可转变成兼性异染色质。如雄性个体的细胞含有一个瘦小的Y染色体和一个大的X染色体, 由于X和Y染色体上很少有共同的基因, 对于雄性来说, X染色体上的基因就只有一个拷贝。虽然雌性细胞有两条X染色体, 也只有一条具有转录活性, 另外一条X染色体像异染色质一
mRNA-的分离实验
实验方法原理 哺乳动物细胞的绝大部分mRNA在其3‘ 端均有一poly(A)尾,因此可以用oligo(dT)-纤维素亲和层析法从大量的细胞RNA中分离mRNA。实验步骤1. 用0.1 mol/L NaOH悬浮0.5~1.0 goligo(dT)-纤维素。 2. 将悬浮液装入灭菌的一次性层
Human-FastTrack-mRNA-Isolation
Preparation of Cells1.Prepare or collect between 2x107 cells for each mRNA prep (will yield about 10-20µg of mRNA). If PBMCs from a whole blood sample
细胞凋亡mRNA检测
研究者们发现了很多在细胞凋亡时表达异常的基因,检测这些特异基因的表达水平也成为检测细胞凋亡的一种常用方法。据报道,Fas 蛋白结合受体后能诱导癌细胞中的细胞毒性T细胞(cytotoxic T cells)等靶细胞。Bcl-2 和bcl-X (长) 作为抗凋亡(bcl-2 和bcl-X)的调节物,它们
隐蔽mRNA的定义
与专一性蛋白质结合不能被核糖体识别的mRNA,在受精前储存并不起始翻译。因为卵细胞核和精细胞核在融合时,无法转录出mRNA以进行必要的蛋白合成,所以隐蔽mRNA由起着母源性短暂提供蛋白合成模板的作用。
组织mRNA提取方法
(一)总RNA提取-Trizol法Trizol法适用于人类、动物、植物、微生物的组织或培养细菌,样品量从几十毫克至几克。用Trizol法提取的总RNA绝无蛋白和DNA污染。RNA可直接用于Northern斑点分析,斑点杂交, Poly(A)+分离,体外翻译,RNase封阻分析和分子克隆。1、将组织在
mRNA降解途径分析
涉及到许多细胞内因子和复合物, 如Dcp1p、Pat1p、Rap55和staufen等.同时, 也有报导认为, 细胞质处理小体是体内mRNA 降解的主要位点 .因此, 明确细胞质处理小体(P-body)在mRNA 降解过程的功能以及各种酶和复合物调节mRNA 降解所经历的途径是本领域研究的主要内容.
mRNA如何变成RNA
1、mRNA携带遗传信息,在蛋白质合成时充当模板的RNA。 信使RNA从脱氧核糖核酸(DNA)转录合成的带有遗传信息的一类单链核糖核酸(RNA)。它在核糖体上作为蛋白质合成的模板,决定肽链的氨基酸排列顺序。2、cDNA就是相对于mRNA而言的单链DNA。能与rna配对的单链dna3、内含子:基因包含
mRNA提取、分离纯化
从真核生物的组织或细胞中提取mRNA,通过酶促反应逆转录合成cDNA的第一链和第二链,将双链cDNA和载体连接,然后转化扩增, 即可获得cDNA文库,构建的cDNA文库可用于真核生物基因的结构、表达和调控的分析;比较cDNA和相应基因组DNA序列差异可确定内含子存在和了解转录后加工等一系列问题。总之
mRNA原料酶概述
mRNA 相关酶是 mRNA 疫苗和药物生产过程中的关键原料。mRNA 药物的生产研发流程包括:1)测序及分析确认关键蛋白;2)构建质粒转化至大肠杆菌中并使其增殖以达到质粒扩增的目的,抽提质粒并纯化;3)酶切线性化;4)体外转录,加帽加尾;5)脂质体包裹并纯化。该过程涉及到限制性核酸内切酶、RNA
mRNA的结构基础
mRNA是翻译的模板。在原核生物和真核生物细胞内,mRNA的化学基础有所差异。原核生物mRNA在原核细胞内,参与翻译的mRNA具有以下特点:(1)具有多个开放阅读框(ORF),即多顺反子,意味着同一条mRNA可以编码多个蛋白。特别注意可读框之间不重叠(除移码翻译涉及终止密码子和起始密码子的2个碱基重
mRNA转录加工过程
加帽即在mRNA的5'-端加上m7GTP的结构。此过程发生在细胞核内,即对HnRNA进行加帽。加工过程首先是在磷酸酶的作用下,将5'-端的磷酸基水解,然后再加上鸟苷三磷酸,形成GpppN的结构,再对G进行甲基化。加尾这一过程也是细胞核内完成,首先由核酸外切酶切去3'-端一些过
mRNA的功能特点
mRNA含A、U、G、C四种核苷酸,每三个相联而成一个三联体,即密码,代表一个氨基酸的信息,故按数学中排列组合法则计算,可形成43=64个不同的密码。根据实验结果,推得64个密码与氨基酸的对应关系如下表。 mRNA密码与氨基酸的对应关系64个密码中,61个密码分别代表各种氨基酸。每种氨基酸少的只有一