Science:首次在体内绘制tRNA基因适应度景观图

假定你正在试图设计一种疫苗来抵抗下一个季度的流感病毒。拥有一种准确地告诉你多种流感病毒毒株如何进化的详细图谱将是非常有益的。 构建这种类型的图谱是研究一种被称作适应度景观(fitness landscape)的概念工具的进化生物学家的目标,其中适应度景观提供一种可视化观察和预测进化的方法。 自从20时间30年代群体遗传学家Sewall Wright首次提出以来,适应度景观的观点就已非常流行。但是绘制详细的适应度景观图是一个严峻的挑战,而且迄今为止创建出的景观图相当粗糙。 如今,在一项新的研究中,来自美国密歇根大学的研究人员报道了一个基因的首个体内适应度景观综合图---大约比之前的大100倍。论文通信作者、密歇根大学生态学与进化生物学系教授Jianzhi "George" Zhang说,这些发现有望令进化生物学家、遗传学家和分子生物学家感兴趣。这一基于面包酵母单个基因(即tRNA基因)的研究于2016年4月14日在线发表......阅读全文

Science:首次在体内绘制tRNA基因适应度景观图

  假定你正在试图设计一种疫苗来抵抗下一个季度的流感病毒。拥有一种准确地告诉你多种流感病毒毒株如何进化的详细图谱将是非常有益的。  构建这种类型的图谱是研究一种被称作适应度景观(fitness landscape)的概念工具的进化生物学家的目标,其中适应度景观提供一种可视化观察和预测进化的方法。  

特定的tRNA基因的表达促进肿瘤转移

Cell重大发现:tRNAs促进肿瘤转移转运RNAs(tRNAs)最初被认为是基因表达的静态参与者,但是6月2号,洛克菲勒大学的H. Goodarzi研究团队在Cell上发表的文章证明,tRNA也是基因表达的动态调节器,可影响疾病进展。接下来让我们一起来看看他们的研究成果吧。H. Goodarzi研

特定的tRNA基因的表达促进肿瘤转移

Cell重大发现:tRNAs促进肿瘤转移转运RNAs(tRNAs)最初被认为是基因表达的静态参与者,但是6月2号,洛克菲勒大学的H. Goodarzi研究团队在Cell上发表的文章证明,tRNA也是基因表达的动态调节器,可影响疾病进展。接下来让我们一起来看看他们的研究成果吧。H. Goodarzi研

Science:新型流感基因

  我可以写下存在于约一百种禽类中的流感病毒全基因组,相比于人类基因包含超过30亿个碱基,它只有1.4万个碱基。然而这一微小的遗传物质却足够杀死成千上万的人。虽然一次又一次地进行测序,对于它我们仍旧有许多的未知之处。   发表在Science杂志上的一项研究极好地说明了我们无知的深度。来自爱丁堡大

Science:学霸基因

真的存在学霸基因吗?全基因组关联研究发现了一些与学业成就有关的遗传变异(genetic variants),不过这些突变每一个单独发挥的影响力都非常有限。   一项全基因组关联研究(genome-wide association study)发现了可能对每个人的学业成就(educational

甲硫氨酸tRNA

中文名称甲硫氨酸tRNA英文名称methionine tRNA定  义真核生物的一种起始tRNA,携带甲硫氨酸进入核糖体,进入新生肽链的N端。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

氨酰tRNA

中文名称氨酰tRNA英文名称aminoacyl tRNA定  义转移核糖核酸的3′端通过酯键与氨基酸连接生成,进入核糖体的A位参与蛋白质生物合成。由氨酰tRNA合成酶催化tRNA与活化氨基酸(即氨酰AMP)反应得到。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

tRNA的结构

1.tRNA结构保守:70-80个碱基。2.二级结构:三叶草。3.五个主要臂:(1)接受臂:携带氨基酸;(2)TΨC臂;(3)反密码子臂;(4)双氢尿嘧啶臂(DHU);(5)附加臂:大小反映了整个tRNA分子的大小,根据其大小,tRNA分为两类:第Ⅰ类tRNA,3/4 tRNA只有3-5个碱基的附加

Science:花心乃是基因作祟

  来自德克萨斯大学奥斯汀分校的研究人员,发现自然选择驱动了一些雄性草原田鼠完全遵循一夫一妻制,而另一些则会寻求更多的伴侣。这些动物大脑惊人的差别是由于它们的DNA差异所导致。  发表在本周《科学》(Science)杂志上的这项研究,比较了对配偶忠诚的雄性草原田鼠和广泛漫游以寻求交配对象的雄性草原田

锐博生物:特定的tRNA基因的表达促进肿瘤转移

  Cell重大发现:tRNAs促进肿瘤转移   转运RNAs(tRNAs)最初被认为是基因表达的静态参与者,但是6月2号,洛克菲勒大学的H. Goodarzi研究团队在Cell上发表的文章证明,tRNA也是基因表达的动态调节器,可影响疾病进展。接下来让我们一起来看看他们的研究成果吧。   H.

tRNA测序,约吗?

  高通量RNA测序(RNA-seq)技术的使用让我们认识了细胞中无比精彩的RNA世界。然而,目前的方法无法检测高度修饰或大量折叠的RNA,如tRNA。近日,《Nature Methods》上的两种方法通过在文库制备前去除tRNA的修饰,解决了tRNA测序的技术难题。  尽管tRNA被认为是看家RN

tRNA的结构介绍

1.tRNA结构保守:70-80个碱基。2.二级结构:三叶草。3.五个主要臂:(1)接受臂:携带氨基酸;(2)TΨC臂;(3)反密码子臂;(4)双氢尿嘧啶臂(DHU);(5)附加臂:大小反映了整个tRNA分子的大小,根据其大小,tRNA分为两类:第Ⅰ类tRNA,3/4 tRNA只有3-5个碱基的附加

tRNA的结构基础

tRNA的二级结构如图1所示,其在原核生物和真核生物均相对保守。主要结构有D-loop(D环)、T(C)-loop(T环)、Anticodon-loop(反密码子环)、Accepter Arm(受体臂)、3'端CCA保守序列、Discriminator(识别碱基)、Variable-loop

tRNA转录加工过程

主要加工方式是切断和碱基修饰。真核生物tRNA前体一般无生物学特性,需要进行加工修饰。加工过程包括:(1)剪切和拼接tRNA前体在tRNA剪切酶作用下,切成一定大小的分子。大肠杆菌RnaseP特异切割tRNA前体5′旁侧序列,3′-核酸内切酶如RnaseF可将tRNA前体3′端一段序列切下来。Rna

tRNA的功能介绍

作为“搬运工具”的tRNA有很多种,体内20种氨基酸都有其自已特有的tRNA,所以,tRNA的种类不少于20种。tRNA在ATP供应能量和酶的作用下,可分别与特定的氨基酸结合。每个tRNA都有一个由三个核苷酸编成的“反密码”。这个反密码可以根据碱基配对的原则与mRNA上对应的密码配对,而且只有当反密

tRNA的功能特点

作为“搬运工具”的tRNA有很多种,体内20种氨基酸都有其自已特有的tRNA,所以,tRNA的种类不少于20种。tRNA在ATP供应能量和酶的作用下,可分别与特定的氨基酸结合。每个tRNA都有一个由三个核苷酸编成的“反密码”。这个反密码可以根据碱基配对的原则与mRNA上对应的密码配对,而且只有当反密

tRNA的结构特征

tRNA的结构特征之一是含有较多的修饰成分,如上面提到的 D、T、 Ψ等;核酸中大部分修饰成分是在tRNA中发现的。修饰成分在tRNA分子中的分布是有规律的,但其功能不清楚。1974年用X射线晶体衍射法测出第一个tRNA——酵母苯丙氨酸tRNA晶体的三维结构,分子全貌象倒写的英文字母L,呈扁平状,长

Science:跳跃基因如何找到目标?

  为了了解转座子如何形成基因组,极其重要的是,要发现它们定向整合(targeted integration)背后的机制。最近,来自法国国家健康与医学研究院病理学实验室的研究人员,与法国CEA-Saclay和美国一个实验室合作,确定了两种蛋白质之间的相互作用,是一个转座子整合到酵母基因组中一个特定区

Science专访:基因驱动,消除疟疾

  基因驱动,渐成生物界“新宠”  近年来,“基因驱动”成为生物学界的新兴热门研究领域之一,它指的是特定基因有偏向性地遗传给下一代的一种自然现象。借助被誉为“基因剪刀”的CRISPR基因编辑技术,科学家研发出人工“基因驱动”系统,并在酵母、果蝇和蚊子中证实可实现外部引入的基因多代遗传。  作为一种可

Science:美味西红柿的关键基因

  对于许多的杂货店购物者来说,那些来自商店的看似完美的红彤彤的西红柿却远不如自家宅园里的美味。近日来自康奈尔大学鲍依斯•汤普森植物研究所、美国农业部和加州大学戴维斯分校的研究人员破译了一个可增加西红柿中糖、碳水化合物和类胡萝卜素水平的基因GLK2。相关论文发布在6月29日的《科学》(Science

Science发现全新基因沉默机制

  科学家在研究脆性X综合症的过程中,发现了一种基因沉默的全新机制,文章于二月二十七日发表在Science杂志上。研究显示,阻断这一沉默机制的药物可以防止脆性X综合症的发生。   脆性X综合症是遗传性智力障碍和孤独症最常见的原因,这种疾病在男孩中的发病率更高。二十多年以来人们一直知道,脆性X综合症

Science:重要的癌症基因开关

  来自瑞典Karolinska研究所和芬兰赫尔辛基大学的科学家们证实了一些调控基因表达的“开关”在癌症的形成中起重大作用。在发表于《科学》(Science)杂志上的这项研究中,他们研究了一个基因区域,该区域包含了某个与结直肠癌和前列腺癌风险增高相关的特异单核苷酸变异,发现移除这一区域可显著抵制肿瘤

Science:新基因来自“垃圾”DNA

  “新基因从何而来?”是遗传学和进化生物学中长期存在的一个问题。来自加州大学戴维斯分校的研究人员证实,一些新基因是由非编码DNA以比预想更快的速度生成。这一研究发现发表在1月23日的《科学》(Science)杂志上。   论文的资深作者、加州大学进化和生态学教授David Begun说:“研究清

Science:揭示抗真菌新基因

  近期出现的一种叫做秆锈菌(stem rust fungus)的真菌菌株正威胁着全世界90%的驯化小麦品种。根据发表在6月27日《科学》(Science)杂志上的两篇新研究论文报道,研究人员从对抗这一真菌的小麦近缘种中发现了两个新基因,有可能使得这一真菌威胁很快得到遏制。   堪萨斯州立大学

华大基因再发Science进行基因组比对

  来自深圳华大基因研究院,丹麦哥本哈根大学,澳洲科学院等处的研究人员利用Illumina的 HiSeq 系统,完成了两种蝙蝠的高通量全基因组测序分析,并进行了基因比对,为解析蝙蝠的飞行起源,以及蝙蝠为何会携带多种致病性强的病毒,提出了新的观点。相关成果公布在Science杂志上。   文章的

tRNA相关研究背景介绍

A. 概述转运RNA(Transfer Ribonucleic Acid,tRNA)是生物体内含量最为丰富的短链非编码RNA分子。它携带并转运氨基酸,参与蛋白翻译,是连接mRNA与蛋白质的重要桥梁。尽管tRNA广泛存在于生物体内,但不同机体基因组对于特定密码子的偏好性不同,从而导致tRNA谱的差

关联tRNA的结构特点

中文名称关联tRNA英文名称cognate tRNA定  义由同一特异氨酰tRNA合成酶识别的所有tRNA。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

细胞化学词汇起始tRNA

起始tRNA initiation tRNA是指能特异性地认别mRNA上的起始密码子,是使蛋白质合成开始的tRNA。在细胞中有两种甲硫氨酸tRNA分子,其中的一种就起这种作用。在大肠杆菌中,已接受甲硫氨酸的tRNAfMet在被甲酰化之后,以其30S核糖体亚基与mRNA共同结合,使蛋白质合成开始。即使

tRNA相关研究背景介绍

  A. 概述   转运RNA(Transfer Ribonucleic Acid,tRNA)是生物体内含量最为丰富的短链非编码RNA分子。它携带并转运氨基酸,参与蛋白翻译,是连接mRNA与蛋白质的重要桥梁。尽管tRNA广泛存在于生物体内,但不同机体基因组对于特定密码子的偏好性不同,从而导致tRN

同工tRNA的结构特点

同工tRNA(cognate tRNA):指几个代表相同氨基酸、能够被一个特殊的氨酰-tRNA合成酶识别的tRNA。