华大基因再发Science进行基因组比对
来自深圳华大基因研究院，丹麦哥本哈根大学，澳洲科学院等处的研究人员利用Illumina的 HiSeq 系统，完成了两种蝙蝠的高通量全基因组测序分析，并进行了基因比对，为解析蝙蝠的飞行起源，以及蝙蝠为何会携带多种致病性强的病毒，提出了新的观点。相关成果公布在Science杂志上。 文章的通讯作者分别是深圳华大基因王俊研究员，张国捷博士，以及澳洲科学院(CSIRO)王林发教授。 蝙蝠属于翼手目(Order CHIROPTERA)，翼手目是哺乳动物中仅次于啮齿目动物的第二大类群。作为世界上唯一能够持续飞行的哺乳动物，蝙蝠的名声并不好，常携带一些致病性最强的病毒，比如Nipah病毒，Ebola病毒，还有当年令世人闻之变色的SARS病毒。 由于蝙蝠化石时至今日保存的不多，因此科学家们对于这类动物的家族和进化树了解的并不多，05年一组研究人员通过DNA测序分析了来自所有蝙蝠家族的17个核基因，解析了其进化历史，......阅读全文
哺乳动物中制备基因组DNA实验
实验材料 动物组织试剂、试剂盒 PBS乙酸铵乙醇酚氯仿异戊醇TE仪器、耗材 离心机摇床研钵实验步骤 1. 切下组织并立即剪成小块，置于液氮中冻结。 2. 将200 mg~1 g 的组织用预冷的研钵和研杵研碎，或用锤子将其捣为细粉末，每100 mg 组织用1. 2 ml 消化缓冲液悬浮。 3.
哺乳动物中制备基因组DNA实验
制备DNA 实验材料 动物组织 试剂、试剂盒
哺乳动物“共同祖先”基因组重建完成
从鸭嘴兽到蓝鲸，每一种现代哺乳动物都是生活在大约1.8亿年前的“共同祖先”的后裔。人们对“共同祖先”知之甚少，现在，一个国际研究小组通过计算重建了其基因组。该成果将发表在《美国国家科学院院刊》上，对理解哺乳动物的进化和保护工作具有重要意义。 研究人员利用了来自32个活物种的高质量基因组序列，这
植物和哺乳动物线粒体基因组的差异
植物细胞植物细胞的线粒体基因组的大小差别很大，最小的为100kb左右，大部分由非编码的DNA序列组成，且有许多短的同源序列，同源序列之间的DNA重组会产生较小的亚基因组环状DNA，与完整的“主”基因组共存于细胞内，因此植物线粒体基因组的研究更为困难。哺乳动物哺乳动物的线粒体基因DNA没有内含子，几乎
研究人员绘出苹果基因组草图
一个国际科研小组8月29日在英国《自然—遗传学》（Nature Genetics）杂志上报告说，他们绘出了苹果的基因组草图，这将有助于从基因水平上分析苹果性状，培育更多苹果新品种。 意大利、美国、新西兰等国研究人员报告说，他们绘出的是广受人们喜爱的“金冠苹果”的基因组草图。结果
哺乳动物中制备基因组DNA实验——制备DNA
在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素，以保证DNA的完整性，为后续的实验打下基础。一般真核细胞基因组DNA有107-9bp，可以从新鲜组织、培养细胞或低温保存的组织细胞中提取，常是采用在EDTA以及SDS等试剂存在下用蛋白酶K消化细胞，随后用酚抽提而实现的。实验材料动物组织试剂、
哺乳动物基因组三维结构首次确定
英国医学研究理事会网站日前报道称，英国科学家从单个细胞中确定出完整保存的哺乳动物基因组的首个3D结构，显示了细胞核内所有染色体中的DNA是如何复杂地折叠在一起的。该项研究成果发表在近日出版的《自然》杂志上。 很多人对于呈现“X”形状的染色体十分熟悉，但事实上，染色体仅在细胞分裂时呈现这种形态。
哺乳动物基因组三维结构首次确定
英国医学研究理事会网站日前报道称，英国科学家从单个细胞中确定出完整保存的哺乳动物基因组的首个3D结构，显示了细胞核内所有染色体中的DNA是如何复杂地折叠在一起的。该项研究成果发表在近日出版的《自然》杂志上。 很多人对于呈现“X”形状的染色体十分熟悉，但事实上，染色体仅在细胞分裂时呈现这种形态。
华大基因再发Science进行基因组比对
来自深圳华大基因研究院，丹麦哥本哈根大学，澳洲科学院等处的研究人员利用Illumina的 HiSeq 系统，完成了两种蝙蝠的高通量全基因组测序分析，并进行了基因比对，为解析蝙蝠的飞行起源，以及蝙蝠为何会携带多种致病性强的病毒，提出了新的观点。相关成果公布在Science杂志上。 文章的
北京鸭基因组研究或助力抗击“禽流感”
2013年6月10日，由中国农业大学、深圳华大基因研究院和英国爱丁堡大学等多家单位合作完成的北京鸭基因组研究成果在《自然·遗传学》(Nature Genetics)杂志上在线发表。这项研究鉴定了鸭子对禽流感产生免疫反应的相关遗传基因，将有助于进一步了解鸟类的免疫机制，同时为深入解析禽流感病毒
研究人员系统鉴定出哺乳动物生精细胞RNA结合蛋白
南京医科大学教授郑科、郭雪江和副教授林明焰与中南大学教授、中信湘雅生殖与遗传专科医院副院长谭跃球等课题组合作，系统鉴定了哺乳动物生精细胞RNA结合蛋白、RNA结合结构域和非结构域元件，构建其男性不育相关基因突变图谱，并揭示一非结构域元件增强RNA结合和调节精子发生的功能机制。近日，该成果在线发表于S
线粒体基因组的植物细胞和哺乳动物相关介绍
植物细胞 植物细胞的线粒体基因组的大小差别很大，最小的为100kb左右，大部分由非编码的DNA序列组成，且有许多短的同源序列，同源序列之间的DNA重组会产生较小的亚基因组环状DNA，与完整的“主”基因组共存于细胞内，因此植物线粒体基因组的研究更为困难。 哺乳动物 哺乳动物的线粒体基因DNA
癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据
研究人员希望，数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。 这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望：“让我们测序你的肿瘤，或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过，现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些
迄今最大哺乳动物基因组库为进化提供新见解
当21世纪初，小鼠、人类、大鼠和黑猩猩的完整基因组首次发表后，遗传学家通过比较基因序列为了解哺乳动物进化打开了大门。为什么一些哺乳动物嗅觉特别灵敏？为什么有些哺乳动物要冬眠？为什么一些哺乳动物的大脑发更大？20年后的今天，由美国麻省理工学院、哈佛大学等单位的科学家牵头的大型国际研究项目——“Zoon
研究人员破译香蕉“美食蕉”品种香蕉基因组
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512730.shtm广东省农业科学院研究员易干军领衔的香蕉遗传改良团队与广西大学教授陈玲玲团队合作，破译了香蕉“美食蕉”品种香蕉基因组，首次在国际上组装染色体级别的异源三倍体香蕉栽培种（AAB）参考基因
研究人员成功构建首个圭亚那柱花草基因组
在国家自然科学基金等项目的资助下，华南农业大学副教授陈曙团队成功完成首个圭亚那柱花草染色体水平基因组组装，从基因组、转录组及表观遗传组多维度解析其抗逆分子机制，为热带牧草分子育种与抗逆研究提供关键理论支撑与基因资源。相关成果近日发表于《植物杂志》（The Plant Journal）。圭亚那柱花草比
任兵教授最新Cell文章点评CRISPR重要成果
细胞的染色质结构控制着基因的表达，决定着细胞的生理状态。在人类基因组中，结构变异是很常见的。不过，人们一直难以确定这些变异在人类疾病中起到了什么样的作用。 日前，科学家们在CRISPR技术的帮助下发现，一些结构变异会干扰染色质拓扑结构，使增强子-启动子互作发生异常，基因表达的时空模式发生改变，
Nature－Genetics－：发现鸭对禽流感产生免疫反应的基因
近日，《自然—遗传学》期刊发表了鸭基因组的全序列，并找出令鸭子对禽流感产生免疫反应的遗传基因。此一发现将有助科学家进一步了解水禽的免疫保护机制。 最近出现的H5N1亚型禽流感病毒已在家禽中广泛散布，而鸭子更被视为此病毒的天然宿主。早期的研究显示，鸭子能在毫无症状的情况下传播流感病毒。
研究人员发现：霍乱正改变人类基因组
生命演化到今天，人类似乎已经进入最完美的状态。我们的基因组是否已经稳定?改变是否还在发生?科学家们一直在寻找答案。一项新研究表明，当代人类也在进化，而引发这种进化的，竟然是霍乱。研究人员发现的证据证明：在霍乱流行的孟加拉国，人们的基因已经找到了对抗霍乱的办法。这是发生在当代的人类进化案
研究人员首次破译艾滋病病毒完整基因组
新华网华盛顿8月6日电 美国北卡罗来纳大学6日报告说，该校的一个科研小组成功破译了艾滋病病毒的完整基因组。这对于人类理解艾滋病病毒感染人体的机制，寻找抗“艾”新疗法提供了有力帮助。 相关论文发表在6日出版的英国《自然》杂志上。研究小组负责人凯文·威克斯介绍说，艾滋病病毒的遗传信息由单链核糖
研究人员构建人类阴道微生物基因组库
6月21日，深圳市宝安中医院（集团）副院长黄链莎、转化医学中心助理研究员孙文与大连医科大学副教授鄢秋龙等课题组的最新合作成果发表于《自然—微生物学》。人类女性阴道是一个包括细菌、真菌和病毒在内的复杂微生态系统，各微生物之间是相互制约、相互作用、相互依赖、对立统一的关系，其间的平衡关乎女性生殖健康及胎
研究人员发布最新版树鼩基因组注释
树鼩是一种与实验大鼠差不多大小的小型哺乳动物，是灵长类的近亲。由于其繁殖周期短（约6周），饲养成本低，单胎产仔数较高（每胎2-5只）等特点，在某些方面有望替代非人灵长类用于生物医学研究和应用。目前，树鼩已被用于多种感染性疾病模型创建，是研究视觉系统与功能的很好的动物。中国科学院昆明动物研究所研究
研究发现H5N1病毒在牛群中获得增强哺乳动物致病性的关键突变
高致病性禽流感H5N1病毒在跨宿主传播过程中，其聚合酶蛋白适应性突变是影响病毒复制的关键因素，但学界对牛源H5N1病毒聚合酶发生哪些宿主适应性突变及其生物学功能尚不明晰。近期，中国科学院微生物研究所研究团队，系统鉴定了H5N1病毒从禽向牛跨种传播过程中，其聚合酶PB2蛋白发生的哺乳动物适应性关键突变
安捷伦授予临床基因组研究人员Peter－Robinson“思想领袖奖”
分析测试百科网讯 2016年11月29日，安捷伦科技宣布将安捷伦思想领袖奖授予给Peter Robinson, M.D., MSC，以表彰其对临床基因组学和计算生物学的贡献。在今年早些时候，中国中医科学院中药研究所所长陈士林（详见本网报道：中药研究所所长陈士林获得“安捷伦思想领袖奖”）和癌症研究
日本研究人员首次成功绘制日本人基因组图谱
据日本共同社报道，日本理化学研究所基因组医科学研究中心日前通过新一代DNA测序仪成功绘制出首份日本人基因组图谱。该成果10月24日发表在美国《自然—遗传学》杂志网络版上。 DNA一共有4种碱基排列组合，人类大约有30亿对碱基对。新一代测序仪可将DNA进行极其精细的切片，对大量切片同时
研究人员完成枣和酸枣单倍型基因组组装
近日，西北农林科技大学林学院红枣团队黄建研究员课题组以我国制干枣主栽品种‘骏枣’和著名“秦药”代表清涧酸枣为研究材料，整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多种先进测序技术以及多种组装策略完成了枣和酸枣T2T gap-free和T2T gap-free单倍型基因组的组
研究人员成功测序蒙特莫朗西酸樱桃基因组
密歇根州的酸樱桃产量在全美名列前茅，密歇根州立大学的一个研究小组启动了一个项目，旨在确定与酸樱桃树晚开有关的基因，以满足不断变化的气候的需要。他们首先将晚开的樱桃树的DNA序列与一个相关物种--桃子的基因组测序进行了比较。他们首先将开花迟缓的酸樱桃树的DNA序列与它们的亲戚桃子的基因组序列进行比较。
哺乳动物调控DNA复制起始以维持基因组稳定性的机理
DNA是主要的遗传物质，也是中心法则的源头。DNA代谢包括DNA复制、转录及DNA修复等。其中，DNA复制保证了遗传信息精确完整地传递，而转录则是细胞身份维持和功能调控的关键。DNA复制发生在整个染色质上，而转录则只发生在染色质上的转录区。如果这两个关键的细胞过程碰撞，犹如独木桥上狮虎相遇，会发
研究人员观测到人类基因组新的“暗物质”
人类对基因组变异的认识又向前推进一大步：西安交通大学日前传出消息，该校叶凯青年科学家工作室团队与荷兰、美国、德国的20个科研机构，通过开发新的计算机算法和分析处理流程，分析并报道了在250个健康家庭的基因组中的所有类型变异，其中包括以前从未观测到的大量复杂型变异，即基因组中的“暗物质”。 据介
研究人员解析人类基因组计划的赢利奥秘
人类基因组计划(genome project)为美带来1万亿美元经济增长。 美国巴特尔纪念研究所6月12日发布的一份颇具争议的报告指出，解码人类基因组项目的经济收益持续增长。该项目结束10年后，目前其带来的收益已接近1万亿美元。 1988~2003 年进行的人类基因组计划(genom