新一代测序在癌症中的临床应用
一提起癌症，人们往往谈虎色变。的确，癌症是全球发病和死亡的主要原因。据WHO统计，2012年有820万例癌症相关的死亡。所幸，DNA测序技术的快速发展正在改变我们对癌症的认识，也在转变癌症的筛查、诊断和治疗。 如今，新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面？美国罕见病基因组研究所的研究人员不久前在《Frontiers in Genetics》杂志上进行了详细介绍。在这篇文章中，他们回顾了新一代测序近期的科研和临床应用，同时，他们强调了100%基因组测序的重要性，也就是测序高度重复的非编码序列。 利用新一代测序（NGS）技术，人们已经完成了多种癌症的外显子组测序和基因组测序，并提出了癌症分型的新标准。以乳腺癌为例，癌症基因组图谱（Cancer Genome Atlas）测序了510个乳腺癌外显子组，将其分为四个亚型：luminal A、 luminal B、HER2-enriched和basal-like。 测序所......阅读全文
新一代测序在癌症中的临床应用
一提起癌症，人们往往谈虎色变。的确，癌症是全球发病和死亡的主要原因。据WHO统计，2012年有820万例癌症相关的死亡。所幸，DNA测序技术的快速发展正在改变我们对癌症的认识，也在转变癌症的筛查、诊断和治疗。如今，新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面？美国罕见病基因组研究所的研究人员不久前
新一代测序在癌症中的临床应用
一提起癌症，人们往往谈虎色变。的确，癌症是全球发病和死亡的主要原因。据WHO统计，2012年有820万例癌症相关的死亡。所幸，DNA测序技术的快速发展正在改变我们对癌症的认识，也在转变癌症的筛查、诊断和治疗。 如今，新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面？美国罕见病基因组研究所的研究人
新一代测序在癌症中的临床应用
一提起癌症，人们往往谈虎色变。的确，癌症是全球发病和死亡的主要原因。据WHO统计，2012年有820万例癌症相关的死亡。所幸，DNA测序技术的快速发展正在改变我们对癌症的认识，也在转变癌症的筛查、诊断和治疗。 如今，新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面？美国罕见病基因组研究所的研究人
基于新一代测序的癌症检测被纳入保险范畴！
11日，医保机构Independence Blue Cross和NantHealth公司宣布，基于全基因组和蛋白质组的分子诊断综合性平台GPS CancerTM成为全美第一个保险报销的临床癌症检测。该平台可用于诊断癌症发生的分子机制，并确定个性化的治疗方案。此举对癌症精准医疗具有里程碑的意义，同
全基因组测序有望改善癌症预防与诊断
美国德州大学（UT）西南医学中心研究人员证明，全基因组测序可识别病人患遗传性癌症的风险，有望改善癌症的预防、诊断和护理。这项研究首次用全基因组测序评估了258个癌症病人的基因组，提高了诊断出有癌变倾向的基因变异的能力。相关论文在线发表于最近的《E生物医学》杂志上。 “全基因组测序是一种新的基因
NCIMATCH新一代测序技术推进癌症个性化治疗
生物通报道：来自美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心生物库和病理研究中心的P. Mickey Williams教授及其同事发表了一篇最新的文章，文章结果表明使用NCI-MATCH新一代测序法检测肿瘤基因突变结果灵敏，特异性和重复性良好。 精准医学的个体化治疗是最有希望攻克癌症研究领域之一。美国国
Illumina与Loxo－Oncology开发基于新一代测序的泛癌症伴随诊断
适用于实体瘤的TruSight™ Tumor 170伴随诊断版本将扩展Illumina的NextSeq™ 550Dx肿瘤学产品 Loxo Oncology将采用TruSight Tumor 170作为larotrectinib（NTRK）和LOXO-292（RET）的伴随诊断 圣迭戈
全新一代测序技术：没有光的测序
至今，新一代测序技术已经遍布全球上百个基因组测序中心 ――明斯特大学Dag Harmsen 在去年召开的美国微生物学会上，来自明斯特大学的医学微生物学家Dag Harmsen开始听到了有关德国大肠杆菌疫情爆发的传言，这场疫情首先在德国北部地区爆发，感染了至少4000人，夺去了超过
全基因组测序可识别癌症相关变异－有助预防护理
美国德州大学(UT)西南医学中心研究人员证明，全基因组测序可识别病人患遗传性癌症的风险，有望改善癌症的预防、诊断和护理。这项研究首次用全基因组测序评估了258个癌症病人的基因组，提高了诊断出有癌变倾向的基因变异的能力。相关论文在线发表于最近的《E生物医学》杂志上。 “全基因组测序是一种新的基因
如何预防癌症？
健康饮食：保持健康的饮食习惯，减少高脂肪、高胆固醇、高盐和高糖的食物摄入。建议多食用蔬菜、水果、全谷类食物、鱼类和瘦肉等健康食品。 适量运动：适量的运动可以增强身体免疫力，降低患癌症的风险。建议每周进行至少150分钟的中等强度有氧运动。 避免吸烟和饮酒：吸烟和饮酒是导致多种癌症的主要危险因素
如何预防各类“癌症”？
国际抗癌联盟认为，1/3的癌症是可以预防的，1/3的癌症如能早期诊断是可以治愈的，1/3的癌症可以减轻痛苦，延长生命。据此提出了恶性肿瘤的三级预防概念： 一级预防是消除或减少可能致癌的因素，防止癌症的发生。约80%的癌症与环境和生活习惯有关，改善生活习惯，如戒烟，注意环境保护较为重要。近年来的免
【综述】2016年新一代测序技术
新一代测序几乎影响了生物学领域的每一个角落，科学家们用这一技术测序基因组、评估遗传学变异、定量基因表达、研究表观遗传学调控和探索微观生命。新一代测序市场如今异常繁荣，但开发者们并没有停下自己的脚步。在最近的基因组生物学技术进展年会（AGBT）上，各大公司纷纷推出了自己的新产品。这些创新旨在推动新
Ion－Torrent新一代测序仪介绍
引言 整个或部分基因组测序的研究问题已解决，研究者的研究重点向着遗传密码如何编码调控细胞功能方向转移。同样，在分子水平了解人类健康状况，基因序列数据则显得更加重要。大多数的测序都是针对部分基因序列或是一段目标区域，提供必需的数据来解释给定假说。利用PCR技术很容易从基因组中扩增得
新一代测序技术（下）SOLiD－(ABI)
【摘要】 2005年454公司首推划时代的新一代测序仪，从而引发了测序市场上454、Illumina、ABI等公司在新一代测序技术上的比拼高潮。也正是这种你追我赶，让绘制人类全基因组图谱由过去的耗费4.37亿美元和13年时间，骤然缩短到如今SOLiD 3运行一次即获得50GB可定位测序数据。新一代
我国成功研发新一代基因测序仪
中国自主研发的新一代基因测序仪获得成功，日前在长春首次展示样机。它已达到和部分超越国际主流设备技术指标，填补了中国在该领域的空白。 由中国科学院北京基因组研究所与吉林中科紫鑫科技有限公司联合研制的新一代基因测序仪，与国外第二代高通量测序系统相比，成功解决了“读长较短”这一关键技术难题。
－新一代测序面临六大挑战
当年，Solexa品牌还在的时候，MassGenomics的Dan Koboldt就提出了新一代测序（NGS）面临的一些挑战，包括生物信息学算法的问题，以及读长太短，工具太贵，经验太少。如今，这些问题中的大部分都已解决。不过，别高兴得太早。Koboldt认为，我们面临更新、更难的挑战。 首先，
2013新一代测序仪将走向何方
尽管今年的摩根大通保健大会没有出现去年的新品频发的盛况，但新一代测序仪仍在不断进步。读长、准确性、通量、软件，无一不在变化，让测序更高、更快、更强。 Illumina公司在2012年第三季度推出了HiSeq 2000的升级版――HiSeq 2500。它是Illumina第一台特有两种运
新一代高通量测序技术SOLiD简介
目前市场上有四种高通量测序仪，分别是Solexa，454 (GS-FLX)，SOLiD和Polonator。根据测序原理，它们可以被分为两大类：使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454，及使用连接法测序(Sequencing by Ligation
Biotechniques：新一代测序中的缺口填补
在完成的基因组的复兴时代，科学家使用由第三代测序技术提供的长读取，来填补基因组装配中的缺口（gap）。新一代测序能赶得上吗？ 新一代测序，可让科学家们以比Sanger测序更快的速度和更低的价格，进行基因组测序，为1000美元基因组测序铺平了道路。但是这种方法牺牲了长读取速度，将平均读长减少至大
新一代测序技术的先锋SOLiD系统
2008年12月 作为上世纪生命科学领域最重要的技术发明之一，测序技术深刻地改变了我们对生命本质的理解和掌控能力。假如没有测序技术，基因序列就无法确定，酶切、克隆、反转录、cDNA、PCR、SNP、RNAi等等研究技术也就根本无从谈起，生命科学领域也不会有今日的蓬勃发展。无人不晓的GenBank；
新一代测序离临床应用还有多远？
随着新一代测序变得更快速、更廉价、也更可靠，它有望带来疾病的重要线索，让医生挑选更精准的药物。然而，面对临床应用，新一代测序真的准备好了吗?Wellcome Trust 人类遗传学中心的Danny Ulahannan给出了否定的答案。他们在《British Journal of Canc
QIAGEN推出新一代测序仪GeneReader
千呼万唤始出来，在上周举行的美国分子病理学会年会上，QIAGEN的新一代测序仪GeneReader终于和大家见面了。这台仪器最初计划在2014年推出，但后来因故推迟到2015年。 QIAGEN在2012年通过收购Intelligent Biosystems（IBS），跻身新一代测序市场。IBS
新一代高通量测序技术SOLiD简介
目前市场上有四种高通量测序仪，分别是Solexa，454 (GS-FLX)，SOLiD和Polonator。根据测序原理，它们可以被分为两大类：使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454，及使用连接法测序(Sequencing by Ligation
每个癌症患者都应进行DNA测序
英国首席医疗官萨利·戴维斯女士近日发布了一份年度报告，主旨是建议每个癌症患者接受DNA测序，以防止误诊、不必要的反复确诊和无效的化疗。 目前，英国每年有超过35万人被诊断患有癌症，每年约有16.3万人因此死亡。萨利表示，是时候结束“诊断性恶性肿瘤”了，这类患者一般要咨询5位以上医生，在确诊前平
PNAS：新测序方法助力癌症研究
在去年圣诞节期间的加拿大落基山脉冰攀之旅中，两位来自华盛顿大学的年轻研究人员：Michael Schmitt和Jesse Salk突发奇想，谈到了一个简单但功能强大，可用于检测癌细胞，获得更好结果的新方法――如果他们能降低DNA测序中的错误率，那么就可以更好的检测出这些细胞中的变异，这种改进
Science转化医学：新一代癌症免疫疗法
神经胶质瘤（Gliomas）起源于神经上皮细胞，是人类中枢神经系统最常见的原发性癌症。目前的治疗方式以手术为主，辅以放疗和化疗。然而，这些疗法的效果主要取决于神经胶质瘤的恶性程度。高级别神经胶质瘤是最具侵袭性的一种，其生存率近三十年来几乎没有得到改善，只有不到10%的患者能活五年以上。 鲁汶大
新一代癌症早筛手段——液体活检
Kathy Lim怀孕11周，一次例行的血液样本检查显示，她体内存在多个DNA片段异常。进一步分析发现，这些异常并非来自胎儿，而是来自于她自身的白细胞——两年半前被她战胜的滤泡性淋巴瘤的癌细胞，已悄然卷土重来。在众多癌症患者中，Kathy是幸运的。一次阴差阳错的检查，帮助她在疾病复发的早期就发现
三款热门新一代测序仪的比较
生物通报道 来自英国Wellcome Trust Sanger研究院的研究人员对市场上三款热门测序仪(Ion PGM、PacBio RS、MiSeq)的性能进行了比较。该成果发表在7月24日的《BMC Genomics》上。 蓬勃发展的新一代测序(NGS)技术彻底改变了基因组学和遗传学
针对单细胞的最全面新一代测序
Bio-Rad Laboratories公司和Illumina公司宣布了一项独家合作，以开发针对单细胞分析的最全面新一代测序（NGS）流程。这个端对端的商业化方案将实现针对数以千计的单细胞的高通量测序，这在过去是一个充满挑战、耗时又昂贵的过程。 大多数科学研究依赖于对大块组织样本的分析。这些样本
新一代测序在农业领域大放光彩
普通农夫的谷仓里肯定没有最新款的HiSeq测序系统。不过，这并不意味着新一代测序（NGS）在农业领域就不如医学领域那么重要。 乔治亚大学的特聘教授Andrew Paterson就利用NGS来捕获群体的多样性，他将基因型与参考基因组进行比较。他领导的植物基因组作图实验室也利用NGS从不同个体中获