新一代测序在癌症中的临床应用
一提起癌症，人们往往谈虎色变。的确，癌症是全球发病和死亡的主要原因。据WHO统计，2012年有820万例癌症相关的死亡。所幸，DNA测序技术的快速发展正在改变我们对癌症的认识，也在转变癌症的筛查、诊断和治疗。 如今，新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面？美国罕见病基因组研究所的研究人员不久前在《Frontiers in Genetics》杂志上进行了详细介绍。在这篇文章中，他们回顾了新一代测序近期的科研和临床应用，同时，他们强调了100%基因组测序的重要性，也就是测序高度重复的非编码序列。 利用新一代测序（NGS）技术，人们已经完成了多种癌症的外显子组测序和基因组测序，并提出了癌症分型的新标准。以乳腺癌为例，癌症基因组图谱（Cancer Genome Atlas）测序了510个乳腺癌外显子组，将其分为四个亚型：luminal A、 luminal B、HER2-enriched和basal-like。 测序所......阅读全文
新一代测序技术连接古今人类关系
新一代测序（NGS）是一种颠覆性的技术，它的出现使得科研工作者能够以较少的经费，测取数以百万计的短DNA序列数来进行各方面的研究应用，这其中既包括对古生物的全基因组测序。 7月24日，science杂志上的一篇短评“New life for old bones”揭示了新一代基因测序技术在古生
用新一代测序寻找罕见变异－需谨慎
新一代测序引入的误差，使得我们很难检测到罕见变异，而这些罕见变异在癌症等疾病中发挥着重要的作用。在Biotechniques最近的一篇新闻中，Janelle Weaver报道了科学家们在描绘这些误差以及开发策略提高精度方面所取得的进步。 美国国家心脏、肺和血液研究所外显子组测序项目的研究人员，
SOLiD－5500新一代测序仪性能大盘点
2010年12月16日 生命科技公司（Life Technogy Inc.），宣布推出的SOLiD™ 5500和SOLiD™ 5500xl新一代测序仪。 上海伯豪生物技术有限公司作为ABI公司服务供商，将在2011年利用SOLiD™ 5500xl为广大科研工作者提供更为全面的新一代测序服务解决
新一代肿瘤基因测序，数据质量是基石
肿瘤细胞的一个明确特点是其复杂的异质性，存在个体不同细胞间，不同个体间，另根据现有的研究基础，已经发现肿瘤基因层面变异频率普遍较低，各种因素告诉我们，在复杂的背景中确定肿瘤突变，首先测序碱基的准确率必须过关。原始数据的碱基识别准确性越高，使用的信息分析方法越合理标准，对测序深度的要求就会越低。在
期待早日迎来癌症治疗预防拐点
“与全国肿瘤发病的情况相似，云南省肿瘤的发病率呈现逐年上升的趋势。特别是宣威、富源、个旧等仍然是全国肺癌高发地区。不过，近年来随着我国对癌症早诊早治工作的不断推进，肿瘤人群的5年生存率正在稳步提升。” 近日，在由国家癌症中心主办的第十三届胸部肿瘤规范化诊疗高级论坛暨第五届中国胸外科研究者高峰论坛
喝咖啡能预防癌症吗？
咖啡很多人都爱喝，那醇厚的香气，让人不忍放下手中的杯子。而且，现在有很多研究和新闻在说饮用咖啡有很多好处，不但能预防帕金森、保护心脏，甚至可以抗癌……图片来源：微信截图 慢着，去年不是还有“咖啡致癌”的说法吗？那时候，美国加州要求星巴克等咖啡公司贴上“饮用咖啡可能致癌”的标签。究竟是怎么一回事
基因检测能够预防癌症吗？
谈癌色变的年代，如何能躲过癌症的袭击？不仅是科学家们在研究，普通人也在寻觅。随着科技的进步，“基因检测”变成了热门话题。扑面而来的各种信息也让很多人不知所措。家里有多个癌症患者，其他人该不该进行基因检测？ 目前，我国各种疾病及肿瘤的发病率均不断升高，面对该现状，我国的医学研究更多的亦趋向于基因
检测癌症相关DNA修饰新测序方法
牛津Ludwig癌症研究所助理成员Chunxiao Song和Benjamin Schuster-Boeckler领导的这项研究表明，他们开发的新方法，TET辅助吡啶硼烷测序（TET-assisted pyridine borane sequencing，TAPS）是一种比亚硫酸氢盐测序（bis
《癌症预防研究》：西兰花嫩芽有助预防幽门螺杆菌感染
一个国际研究小组进行的小型研究显示，经常食用西兰花嫩芽能在一定程度上抑制幽门螺杆菌感染状况。幽门螺杆菌是一种会导致胃炎、胃溃疡甚至胃癌的细菌。 研究人员在慢性幽门螺杆菌感染高发的日本进行了研究。他们在两个月内让25位幽门螺杆菌感染者每天食用2.5盎司(约71克)富含异硫氰酸酯的西兰花嫩芽，
Life－Technologies新一代Ion－Proton测序仪本月上市
LifeTechnologies公司新一代IonProton测序仪将于本月上市。最先推出的是IonProtonI芯片，适合外显子组测序。而在今年底或明年初，LifeTech将继续推出IonProtonII芯片，用于全基因组测序。 据LifeTech透露，它已经收到了超过100台的订单。一些临床
通过新一代测序来分析拷贝数变异
对于精准医疗而言，理想的情况是测定每位患者的遗传变异，并根据结果及其他因素开出适当的药物。具体到癌症，遗传变异包括单核苷酸替换和插入/缺失、基因拷贝数变异、部分或整个基因缺失、大的染色体区域的重复或缺失，以及染色体易位和其他重排。 HER2基因是癌症精准医疗的首批治疗靶点之一，并且已经改变了H
－新一代测序：影响的不只是医疗行业
从Google风投人士参加行业会议的感受看行业变化 过去三十年，JP Morgan(摩根大通公司，美国现代金融业“教父”)的医疗行业峰会都是传统药企唱绝对主角，生物科技类公司就是过来看有什么能得帮上忙。 而2014年1月16日的这次会议游戏规则有些不同。台上活跃
－牛津基因技术公司推出新一代测序panel
上周，牛津基因技术公司(Oxford Gene Technology，OGT)宣布推出卵巢癌检测试剂盒，这是该公司第一个基于NGS技术的癌症检测panel。去年，该公司曾与南安普敦大学、伯明翰大学以及属于英国分层医疗计划的CIS健康医疗合作，推出了可检测60个基因的实体瘤panel。 目前，该
从STR到新一代测序：法医分析在前进
在很久以前，破案靠的是福尔摩斯。不过，神探毕竟有限，苏格兰场还是需要可靠的技术。从80年代开始，法医实验室就开始利用DNA检测来帮助破解刑事案件，具体技术包括STR和SNP分析以及mtDNA测序。近日，《大西洋月刊》（the Atlantic）指出，调查人员目前已开始采用新型的工具和技术。 文
新一代测序十年记：第一台测序仪的诞生
从454生命科学推出第一台新一代测序仪以来，一晃十年过去了。这十年，正是基因组学高速发展的十年。我们看到了新仪器接踵而至，也看到了新技术不断问世，让人脑洞大开。从当初耗资30亿美元的人类基因组计划，到如今1000美元的人类基因组，测序技术经历了怎样的发展？我们在此作一回顾。 454生命科学（4
这些癌症预防的说法靠谱吗
预防的说法靠谱吗 世界卫生组织曾提出，三分之一的癌症完全可以预防。大量研究证实，改变不良生活方式、远离致癌物、接种疫苗、保持乐观心态等，都能在一定程度上降低癌症风险。不过，网络上有关预防癌症的说法五花八门。“人乳头瘤病毒（HPV）疫苗会导致生育率下降或不孕”“不能染发，染发剂会致癌”“服用富硒产品和
新发现！如何预防癌症转移！
研究人员现已发现这些“休眠细胞”如何保持休眠以及它们醒来后如何形成致命的转移瘤。 即使在明显成功的癌症治疗后数年，也可能发生转移。它们起源于从原始肿瘤迁移到其他器官的癌细胞，并且可以在相当长的时间内处于非活动状态。研究人员现已发现这些“休眠细胞”如何保持休眠以及它们醒来后如何形成致命的转移瘤。
哪些运动有助于预防癌症？
有氧运动：如快走、跑步、游泳、骑自行车等，可以提高心肺功能，增强免疫力，降低患癌症的风险。 力量训练：如举重、俯卧撑、仰卧起坐等，可以增强肌肉力量和骨密度，预防骨质疏松和癌症。 瑜伽：可以帮助减轻压力和焦虑，增强身体柔韧性和平衡能力，降低患癌症的风险。 健身操：可以提高心肺功能，增强肌肉力
Nature子刊：癌症单细胞测序新技术
只有通过近距离观看修拉(Seurat)的绘画，你才能鉴别出点描法背后的复杂性。其在模式中应用了不同的纯色小点，从远处看就形成了一幅图像。与之相似，生物学家们和遗传学长期以来也在寻求在单细胞水平上分析基因的图谱，然而技术局限性使得直到现在也只能在远处遥望。 发布在7月22日《自然生物技术》(
Cell新文章：癌症全基因组测序
根据华盛顿大学医学院的一项新研究，具有吸烟史的肺癌患者相比于不吸烟的肺癌患者肿瘤中的遗传突变要多10倍。这一研究在线发表在9月13日的《细胞》(Cell)杂志上。 论文的资深作者、华盛顿大学基因组研究所主任Richard K. Wilson 说：“吸烟者基因组具有比不吸烟的肺癌患者基因
基因测序：开辟预防优于治疗的新时代
基因组测序：一切开始的地方 曾经，完成人类全基因组测序需要30亿美元，而今天，这个数字下降到了几千美元且还会继续下滑。基因组测序揭开了未知的基因秘密。那么它是如何做到的？从收集不到一茶匙的病人血液或唾液开始，应用化学物质将细胞膜打开并收集DNA，经过2-3个月的精密仪器分析，最后发现一些疾病本
Cell发布新一代癌症免疫疗法：新型CRISPR系统
基于CRISPR的新系统将为新一代靶向免疫疗法打开大门，大规模扩展免疫系统的抗癌作用 生物通报道：免疫疗法可以治愈一些癌症，科学家们希望除了能开发提高免疫系统抗癌能力的药物以外，还可以操纵患者自身免疫细胞，将它们变成抑癌的军队。但癌症有躲避攻击的技巧，要提高免疫细胞治疗的效果并不容易。 来自
新一代HPV疫苗有望预防99％宫颈癌
中国科研人员近日在对抗宫颈癌方面取得重大进展。他们研发的新一代宫颈癌疫苗有望抵御所有可致癌的高危型人乳头瘤病毒。图片来源于网络 人乳头瘤病毒（以下简称HPV）主要通过性接触传播。目前已经鉴定出的HPV型别超过200种，分为高危型和低危型。其中至少有18种高危型HPV是与99％的宫颈癌的发生相
新一代HPV疫苗有望预防99％宫颈癌
中国科研人员近日在对抗宫颈癌方面取得重大进展。他们研发的新一代宫颈癌疫苗有望抵御所有可致癌的高危型人乳头瘤病毒。图片来源于网络 人乳头瘤病毒（以下简称HPV）主要通过性接触传播。目前已经鉴定出的HPV型别超过200种，分为高危型和低危型。其中至少有18种高危型HPV是与99％的宫颈癌的发生相
新一代测序技术为生物制药开启新路径
新一代测序技术现在越来越多使用在新兴生物药的开发和疫苗生产上。目前药物研发部门使用的各种高通量技术，例如基因芯片、代谢组学建模、酵母双杂、蛋白质组学、高通量化学筛选、电子杂交定位，有望被新一代测序技术替代或作为补充。 随着微生物基因组信息逐渐增多，新一代测序技术在抗细菌和抗病毒药物
默克与Illumina即将开发新一代肿瘤测序技术
癌症的诊断的目的一直以来被定义为给患者提供“个性化”和“精准”的医疗服务。但鉴于企业努力追求一种基于基因组数据就能给予最好的个体治疗方案的无所不包的测试，当下的流行词语似乎更倾向于“全面”。 Illumina和默克的生物药公司-默克雪兰诺已经达成合作开发一项全面的新一代肿瘤测序技术，但该协议的
大型遗传学研究投入新一代测序的怀抱
了解自然发生的遗传变异如何影响基因表达水平是在分子水平了解复杂性状的第一步。表达数量性状基因座(eQTL)定位研究试图通过基因分型和测定个体的全基因组表达水平，对影响/关联基因表达水平的所有基因组区域进行定位。 在目前的小型和中型基因表达研究中，RNA-seq技术几乎取代了芯片技术。然而，
新一代测序市场2020年将达到87亿美元
美国市场调查与咨询公司MarketsandMarkets近日发布了一份有关新一代测序（NGS）市场的分析报告，深度分析了北美、欧洲、亚洲及世界其他地区的市场主要推动力、限制因素和机遇。这份分析报告指出，2014年全球NGS市场的规模将达到25亿美元，而2020年有望达到87亿美元，复合年均增长率
安捷伦推出独有新一代测序型OnePGT解决方案
今日，安捷伦科技公司（纽约证交所：A）日前推出 Agilent OnePGT 全基因组新一代测序 (NGS) 解决方案，用于胚胎植入前基因检测 (PGT)。OnePGT 可在一次组织活检中完成多种单基因疾病 (PGT-M)、易位 (PGT-SR) 和非整倍体 (PGT-A) 的同时检测。安捷伦已
安捷伦科技公司推出－4200－TapeStation－系统用于新一代测序
新产品具有全自动质量控制功能 2015 年 10 月 21日，北京 —— 安捷伦科技公司（纽约证交所：A）近日宣布推出4200 TapeStation 系统，这台全自动仪器使科学家能够同时实现最多 96 个 DNA 样品的快速分析。 “作为倍受青睐的 2200 TapeSta