南京农业大学Nature子刊聚焦重要激酶
来自南京农业大学、中国科技大学、德克萨斯大学MD安德森癌症中心等机构的研究人员报告称,他们获得了首个完整ATM/Tel1激酶的冷冻电镜(cryo-EM )结构,他们的研究成果发布在5月27日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 南京农业大学的王伟武(Weiwu Wang)教授及中国科技大学生命科学学院的蔡刚(Gang Cai)教授是这篇论文的共同通讯作者。王伟武教授的主要研究方向为蛋白质三维晶体结构和功能,微生物分子遗传学。蔡刚教授在真核生物转录机器结构生物学 研究领域非常活跃,取得了一系列具有创新性的研究成果。 基因组不断地遭受到环境中的辐射、化学剂、紫外线,以及内源性物质如正常代谢过程中生成的自由基的攻击。DNA双链断裂(DSBs) 是最有害的DNA损伤,如果得不到修复可直接导致细胞死亡。当错误修复时,DSBs可引起突变和染色体重排,在多细胞生物体中导致癌症发生。ATM属于磷 脂酰肌醇......阅读全文
北京大学Nature子刊解析重要激酶
来自北京大学深圳研究生院化学生物学与生物技术学院的研究人员,在新研究中揭示了Polo样激酶1(Polo-like kinase 1,PLK1)抑制的结构基础,相关论文“Structural basis for the inhibition of Polo-like kinase 1”发表
Nature发布基因组测序重要发现
由科隆大学Roman Thomas领导的一个国际研究小组,对110个小细胞肺癌(SCLC)样本进行了测序,发现除了两个样本其余所有的均包含失活的TP53和RB1基因。通过调查这一疾病的基因组景观,他们还发现有不少的肿瘤具有与TP73基因相关的基因组重排或突变,以及激酶基因突变和Notch家族基因
Nature发布基因组研究重要成果
如果歌手Paul Simon给Richard Lenski长期进化实验(LTEE)中的细菌写首歌,那歌名可以是“这么多年以后仍然在改变。” 发表在8月1日《自然》(Nature)杂志上的研究论文中,这位密歇根州立大学的著名微生物学和分子遗传学教授与一个国际研究小组,利用先进的技术研究了数万代的
Science发表基因组研究重要成果
科学家们日前发现,人类基因组的遗传学差异主要来自于拷贝数变异(CNV)。在此之前人们对CNV的了解并不多,因为CNV一直是基因组测序的一大挑战。 华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler领导研究团队克服了这一困难。他们对来自全球125个族群的人进行了深度基因组测序,全面分析了基因组中的SN
GenomeBiology发布基因组测序重要成果
Genome Biology杂志发布了远东豹(Far Eastern Amur leopard)的首个全基因组序列,为人们揭示了肉食对基因多样性和种群规模的影响。“我们将远东豹基因组与其它哺乳动物基因组进行比较,发现肉食似乎是很强的选择压力。这种现象在杂食动物和食草动物中并不明显。举例来说,牛吃肉对
Science发表基因组研究重要成果
科学家们日前发现,人类基因组的遗传学差异主要来自于拷贝数变异(CNV)。在此之前人们对CNV的了解并不多,因为CNV一直是基因组测序的一大挑战。 华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler领导研究团队克服了这一困难。他们对来自全球125个族群的人进行了深度基因组测序,全面分析了基因组中的SN
Science发表CRISPR基因组编辑重要成果
利用两种互补的分析方法,Whitehead研究所和麻省理工学院-哈佛大学Broad研究所的科学家们,第一次在人类基因组中鉴别出了人类细胞系或培养人类细胞生存及增殖必需的基因宇宙。 他们的研究结果和在该研究中开发出的材料,不仅为全球科研团体提供了宝贵的资源,还可应用于发现各种人类癌症药物可靶向的
埃博拉基因组测序发布重要发现
来自巴斯德研究所(Institut Pasteur)、法国国家科学研究中心和悉尼大学的科学家们,通过对在几内亚流行的埃博拉病毒株进行基因组测序,追踪了病毒的传播,并监测了这一国家的病毒进化情况。 研究揭示出有三种不同的病毒变种在几内亚,尤其是首都的城市区域和附近的市镇同时传播,研究人员在发表
Cell:癌症基因组计划再取重要成果
来自德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员称,他们将最致命的皮肤癌类型——黑色素瘤分为了4个不同的基因亚型,这一研究发现有可能会在寻求个体化医疗领域体现它的价值。这项研究是癌症基因组图谱计划(TCGA)的一个组成部分,研究人员将他们的成果发布在6月18日的《细胞》(Cell)杂志上。 研究人
Nature重要成果:深入解析狗基因组
通过比较狗和狼的全基因组,来自乌普萨拉大学的研究人员揭示,在野生犬进化为人类最好的朋友这一过程中发生了许多的改变。不出所料的是,这些差异性区域有许多都影响了大脑,这或许可以解释狼与狗之间的性情差异。此外,这一比较研究还指出了几个与消化相关的区域,包括帮助分解淀粉的基因。研究论文发表在《自然》(N
南京农业大学Nature子刊聚焦重要激酶
来自南京农业大学、中国科技大学、德克萨斯大学MD安德森癌症中心等机构的研究人员报告称,他们获得了首个完整ATM/Tel1激酶的冷冻电镜(cryo-EM )结构,他们的研究成果发布在5月27日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 南京农业大学的王伟武(Weiwu
Nature发布单细胞基因组研究重要成果
在第一个基因组范围的这类实验中,研究人员获得了对于小鼠胚胎如何首先从一个结构松散的细胞球开始转变为小的结构化实体的新认识。这项由欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)和维康信托基金会-MRC剑桥干细胞研究所领导的单细胞基因组学研究发布在《自然》(Nature)杂志上。 原肠胚形成(Gastr
中科院周兆才研究组JBC解析重要的激酶
生发中心的激酶OSR1(oxidative stress-responsive 1)是SLK(STE20-like)激酶家族的成员。OSR1被WNK激酶活化之后,能使偶联阳离子的氯离子共转运蛋白磷酸化,由此调节哺乳动物细胞的离子内稳态和细胞体积。不过,由于OSR1的基础活性很低,人们并不清楚OS
“被低估”的激酶在肿瘤细胞进程方面发挥重要作用
近日,东北大学盛韧教授课题组在肿瘤细胞周期调控和临床转化领域实现重要突破,相关成果发表于国际生物医学期刊The Journal of Clinical Investigation上。研究发现了一种功能一直被低估的丝氨酸/苏氨酸激酶CDKL3,它在快速驱动肿瘤细胞周期进程和细胞生长中发挥着重要作用。基
“基因组规模系统代谢育种”项目取得重要进展
微生物制造技术在降低环境污染、促进可再生资源替代化石资源方面有着良好的发展前景。而我国微生物制造产业水平与国际差距明显,主要原因在于工业菌种水平低下,某些重要的氨基酸、化工醇等产品长期依赖进口。发展微生物的基因组规模系统代谢育种技术改造工业菌种,是加速我国工业菌种性能提升的重要前提。 由安徽
Nature发布比较基因组学研究重要发现
来自杜克大学医学院、Brigham妇女医院和哈佛医学院的研究人员,发现了一个机制可以解释:一些遗传突变在一种基因组中会致病,而在另一种基因组中则为良性的原因。 在发表于6月29日《自然》(Nature)杂志上的研究论文中,研究人员比较了成千上万的人类致病突变与大约100个动物物种的相似序列。
解决基因组学重要挑战的新工具
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术,可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多,但是,仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列,从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前,去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列,还是一个手动和耗时的过程,为了去除污染
解决基因组学重要挑战的新工具
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术,可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多,但是,仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列,从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前,去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列,还是一个手动和耗时的过程,为了去除污染
中国科学家PNAS发布重要基因组草图
小豆(Vigna angularis)是一种重要的豆类作物,在全球三十多个国家都有种植。小豆种子是人类的重要食物来源,能为人体提供淀粉、可消化蛋白、矿物元素和维生素。 北京农学院、中科院遗传与发育生物学研究所、华大基因等机构的研究团队通过全基因组鸟枪测序,获得了高质量的小豆基因组草图。这项研究
基因组系统解析工具开发研究取得重要进展
近日,中国工程院院士、南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)教授包振民团队开发国际首个整合宏观/微观进化基因组和功能基因组的综合分析工具(PanSyn,https://github.com/yhw320/PanSyn)。相关成果发表于《自然-实验手册》。该成果是包振民团队长期积累的丰富基因组学分析方
Nature重要发现:基因组印记的“擦除器”
来自波士顿儿童医院的研究人员在一项新研究中揭示,一种叫做Tet1的蛋白在原始生殖细胞发育为精子和卵细胞之前清理了它们的表观遗传记录。这一研究发现有可能帮助提供一些关于某些新生儿生长缺陷病因的线索,或许还可帮助推动开发出疾病的干细胞模型。 这一研究小组由波士顿儿童医院细胞和分子医学项目张毅(Yi
全基因组测序解读重要甲基化机制
DNA看起来只是AGTC四种碱基的简单排列,可一旦它与组蛋白包装形成染色质,情况就复杂得多了。组蛋白主要有四种,分别是H2A、H2B、H3和H4。这些组蛋白要么令DNA盘绕起来保持沉默,要么将DNA解开允许基因表达。组蛋白上的化学修饰(如甲基化),能够影响它对基因的控制。 H3K4me3是
中国科学家NatureGenetics发布重要基因组草图
来自国家人类基因组南方研究中心、新疆医科大学第一附属医院和复旦大学等处的研究人员,成功绘制出了细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus)的基因组序列草图。这一研究提供了关于这种寄生虫与宿主的相互作用、养分吸收、节裂(strobilization)、生殖、免疫逃避和成熟机制
诺奖得主Nature发布基因组研究重要成果
一个国际科学家小组完成了对章鱼(octopus)的基因组测序,发现了与章鱼不同寻常的生物学,包括它能够改变皮肤的颜色和纹理,及分散的大脑使得它的8条手臂能够独立移动相关的一些基因。 该研究小组测序并注释了常见的加州两斑章鱼(California two-spot octopus)。这项研究是由
基因组所参与的人类全基因组关联分析合作研究获重要进展
与血小板数量相关的GWAS SNP与222 kb 以外的JAK2基因相关联 日前,中科院北京基因组研究所重大疾病基因组与个体化医疗实验室“百人计划”方向东研究员项目组助理研究员渠鸿竹博士等参与开展的国际合作研究“人类疾病全基因组关联分析研究”获得重大进展。相关研究成果Systema
中国科学家Nature-Genetics发布重要基因组草图
来自国家人类基因组南方研究中心、新疆医科大学第一附属医院和复旦大学等处的研究人员,成功绘制出了细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus)的基因组序列草图。这一研究提供了关于这种寄生虫与宿主的相互作用、养分吸收、节裂(strobilization)、生殖、免疫逃避和成熟机制
国际团队完成蜈蚣基因组测序-具有重要研究价值
一个国际研究小组日前宣布完成了对第一种蜈蚣基因组的测序工作。研究发现蜈蚣基因组大小只有人类基因组的十分之一,其中含有的基因数量共有15000个,只有人类的约三分之二。来自12个国家的106名研究人员参与了该项目。相关论文在线发表在美国《科学公共图书馆·生物卷》上。 节肢动物是科学研究中一个非常
张亚平院士CellResearch发表基因组研究重要成果
来自中科院昆明动物研究所、云南大学、瑞典皇家理工学院等机构的研究人员,报告称他们通过收集来自世界各地58个犬科动物的基因组序列,揭示出了家犬的自然史。这一重要的研究成果发布在12月15日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。 中科院昆明动物研究所的张亚平(Ya-Ping Zhan
高质量黑麦基因组揭示重要的农艺基因
Nature Genetics 2021年3月18日,由河南农业大学王道文研究员团队联合多个单位共同破译黑麦基因组。相关研究成果“A high-quality genome assembly highlights rye genomic characteristics and agronomi
国家基因库研发线粒体基因组重要新应用
继启动万种动物线粒体基因组计划(MT10K, https://www.mt10k.org)之后,深圳国家基因库成功研发出一套应用线粒体基因组监测生物多样性的宏线粒体基因组重测序方法(mitochondrial metagenomics,以下简称“全线粒体混合多样性分析法”)。此方法高效、准确且可