Science:绘制“垃圾DNA”的新技术

在很长一段时间内被认作是“垃圾DNA”,我们现在知道了基因间的一些区域也执行着至关重要的功能。这些DNA区域突变可以严重损害人类的发育,有可能在生命后期导致一些严重的疾病。然而直到现在,都难以寻找调控DNA区域。 德国慕尼黑工业大学计算生物学教授Julien Gagneur,马克斯普朗克生物物理化学研究所(MPI) 的Patrick Cramer教授领导科学家们,现在开发出了一种方法来寻找活化和控制基因的调控DNA区域。 我们DNA中的基因包含着详细的蛋白质装配指令,这些蛋白质“工人”执行和控制着我们细胞中几乎所有的过程。为了确保每种蛋白都在适当的时间及我们身体的正确部位完成任务,对应基因的活性必须受到严格控制。基因间的DNA调控区域接管了这一功能,充当了复杂的控制机器。 马克斯普朗克生物物理化学研究所所长Patrick Cramer教授解释说:“一些DNA调控区域对于人类发育、组织保护和免疫应答等至关重要。此外,它们......阅读全文

Cell:新方法加速揭示致病“垃圾”DNA

  由来自德国、美国和挪威等国家的科学家们组成的一个国际研究小组,在1月16日的《细胞》(Cell)杂志上发表论文描述了他们开展的一项新研究,该研究的目的在于更好地了解遗传变异使得某些个体易患诸如2型糖尿病等疾病的机制。结合他们的计算方法和实验,新研究解析并验证了2型糖尿病的潜在遗传病因。大体上,这

科学家揭开“垃圾”DNA的神秘角色!

  生物学家们在很长一段时间里都认为,既然几乎所有具体的生理机能都要由蛋白质来完成,那么不编码蛋白质的DNA应该是没有用的,可以称为“垃圾DNA”;而且人类基因组项目发现人的基因组中仅有1.5%的序列是给蛋白质编码的,其余的98.5%的序列是以前认为的“垃圾”DNA。  此前研究人员进行了一项名为E

基因检测DNA分析

DNA分析主要用于识别单个基因异常引发的遗传性疾病,如亨廷顿病等。DNA分析的细胞来自血液或胎儿细胞。

“垃圾DNA”在脑发育中起重要作用

  最近,美国加利福尼亚大学旧金山分校科学家利用小鼠模型研究发现,过去认为是垃圾的长非编码RNA(lncRNAs)在大脑发育中扮演重要角色,和多种破坏性神经疾病有关,如亨廷顿舞蹈病、老年痴呆症等。研究人员指出,这一发现把lncRNAs和神经细胞类型、发展过程及人类疾病状态联系在一起,会促进人们进一步

冷泉港科学家揭示促癌“垃圾DNA”

  来自冷泉港实验室(CSHL)的一个研究人员小组,确定了在急性髓细胞性白血病(AML)中,一种白血病特异性的增强子元件促进了癌性血细胞增殖。AML是一种毁灭性的癌症,70%的患者无法医治。此外,研究人员还提供了已进入人类临床试验的、一类有前景的新药有效阻止癌细胞生长机制的认识。   在发表于《G

当被“垃圾”DNA堵塞后,癌症就跟着来了

他们的研究表明,非编码DNA是如何阻碍我们基因组的复制和修复的,这可能会导致突变的积累。此前已经发现,DNA的非编码或重复模式——约占我们基因组的一半——可能会破坏基因组的复制。但到目前为止,科学家们还不了解其潜在机制,也不知道它是如何导致癌症发展的。在这项新研究中,伦敦癌症研究所的科学家们在试管中

“垃圾DNA”关乎奶牛产奶量和生育能力

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诺贝尔奖得主Cell揭示重要的“垃圾”DNA

  来自斯坦福大学、犹他大学和清华大学等处的研究人员,发现了一类丰富的非编码DNA可以防止线虫生殖细胞中随机的基因沉默。他们的研究论文发布在6月30日的《细胞》(Cell)杂志上。  美国著名遗传学和分子生物学家、2006年诺贝尔生理学或医学奖得主、斯坦福大学的Andrew Z Fire教授,以及犹

Nature新论文再次证实“垃圾”DNA的重要性

  来自加州大学旧金山分校,麻省哈佛Broad研究院,以及耶鲁大学医学院的研究人员研发出了一种新型运算工具,能深入挖掘已有DNA数据库资料。利用这一方法,他们发现了某些DNA突变如何通过遗传传递疾病的。  这一研究成果公布在10月29日Nature杂志上。  文章通讯作者,加州大学旧金山分校Sand

Nature里程碑式成果:“垃圾”DNA的起源

  来自宾州大学的研究人员取得了一项里程碑式的研究新发现:他们发现了转录起始的精确位点,从而为解析基因组“暗物质”的起源迈出了重要的一步。这一研究成果公布在9月18日的《Nature》杂志上,这将有助于分析复杂疾病特征所在的确切位置。   所谓基因组“暗物质”,其实就是基因组中的非编码RNA——不

干细胞牛人Cell子刊探讨癌症与“垃圾”DNA

  来自Whitehead生物医学研究所、Dana-Farber癌症研究所的研究人员,在一项研究中揭示出了称作为超级增强子(super-enhancers)的基因控制元件是如何作为功能部件将多个信号通路集中于一些关键基因处以及调节转录活性的。  这项研究工作表明,这些基因控制元件为一些信号通路提供了

研究发现“垃圾DNA”或会影响机体患癌风险

  近日,一项刊登在国际杂志British Journal of Cancer上的研究报告中,来自哈佛大学陈曾熙公共卫生学院等机构的科学家们通过研究发现,一个人患癌的风险或会受到垃圾DNA区域的遗传改变的影响,这些区域并不会编码产生蛋白质。  图片来源:CC0 Public Domain  研究者指

Nature子刊再证“垃圾”DNA的重要性

  首次在全基因组范围内分析短串联重复序列(short tandem repeats,STRs)的特征,来自哥伦比亚大学工程学院及纽约基因组中心的研究人员领导的一个计算遗传学家小组,证实了过去被视作为是中性或“垃圾”的STRs实际上在调控基因表达中发挥了重要的作用。这项研究工作揭示出了调节基因表达的

“垃圾基因”或可治疗心脏病

   美国加州大学洛杉矶分校和霍华德休斯医学研究所的科学家近日发现,LeXis这个“垃圾DNA”并不是一无是处,或许可以使用它来治疗心脏病。研究成果日前发表在Circulation杂志上。  研究人员成功地使用了一种抑制胆固醇水平的基因作为治疗方法,目的是减少家族性高胆固醇血症引起的血小板增多。在临

惊喜!Cell:沉默“垃圾”基因,阻止肿瘤生长

  12月14日,《Cell》期刊最新发表一篇题为“Oncogenic Role of THOR, a Conserved Cancer/Testis Long Non-coding RNA”的文章揭示了一个长非编码RNA——THOR,虽然不编码蛋白质,但是却对癌细胞有“直接影响”。科学家们最新发现

DNA发现之前的基因

  三一学院地处都柏林的中心,它那灰色的三层新古典主义建筑环绕在草坪和运动场周围。校园的最东头是另一栋灰色建筑,落成于1905年,则是另一种截然不同的风格。那是菲尔兹杰拉德大楼,或者依据其门楣上刻的字叫物理实验楼。这栋楼的最顶层是一个演讲厅,1943年2月第一个周五的傍晚,约有400余人聚集在这里,

DNA(基因)检测-Southern-Blot

DNA(基因)检测-Southern BlotDNA吸印转移1.室温下将电泳后的琼脂糖凝胶浸入500ml溶液A中,摇动30分钟后换500ml新鲜溶液A再摇30分钟,使DNA双链碱变性。溶液A:5M NaCl     300.0ml10M NaOH    50.0mlH2O         650.0

纯化DNA实验_基因组DNA的快速纯化

试剂、试剂盒尾部缓冲液蛋白酶 K仪器、耗材离心管玻璃棒实验步骤第 1 天1. 大约 1.5 cm 长的尾部活检样品放在一个 1.5 ml 盛有 0.7 ml 尾部缓冲液的小离心管中,加 35 ul 10 mg/ml 蛋白酶 K,在 55℃ 振摇温育过夜。尾部缓冲液(配 25 ml)50 mmol/L

科学家找到胰腺发育不全病因-源于“垃圾DNA”

  据物理学家组织网11月10日报道,最近,科学家首次利用一种新技术分析了以往被称为“垃圾DNA”的全部基因组,以寻找某些遗传病的成因。埃克塞特大学医学院和伦敦帝国学院合作领导的一个研究小组发现,一种叫做胰腺发育不全的疾病正是由位于染色体隐蔽部位的调控基因变异造成的。相关论文发表在11 月10日

2顶级实验室《Science》“垃圾”DNA是宝

  一类非编码(Non-coding)的DNA分子(不表达蛋白质),曾经被认为是“垃圾”的DNA目前正成为遗传研究的新热点,“垃圾”DNA的真实含义早已变更,它仅仅是一个历史遗留的名称,实际上,“垃圾”DNA具有无与伦比的表达调控功能,2所顶级学府的2个独立团队在Science上发表关于垃圾DNA的

DNA之父”说:奥巴马的“抗癌登月计划”是垃圾

  James Watson,对,就是他,1953年与Francis Crick共同发现DNA双螺旋结构并开创了分子生物学的革命的那个人。  近日,“DNA之父”沃森在参加一个朋友的生日宴会上大肆批评,公开宣称奥巴马的“抗癌登月计划”是垃圾。获得了诺贝尔奖就可以随便攻击政治吗?他为什么要这么说?是脑

韩敬东研究员Cell子刊探讨“垃圾”DNA

  人类基因组上含有大量的反转录元件,其中Alu序列的拷贝数最多,在灵长类基因组上有超过100万份拷贝,约占到人类基因组总长度的10%,仍然目前对于Alu元件的功能仍知之甚少。来自中科院上海生命科学研究院的研究人员在新研究中证实,一些Alu元件朝着增强子方向发生了演化。这一研究发现发表在《Cell

“垃圾基因”,治疗心脏病的新未来

  来自UCLA和Howard Hughes Medical Institute的科学家成功利用抑制基因来控制小鼠的胆固醇水平,家族性高胆固醇血症会引起血小板增多,抑制胆固醇水平是控制血小板的增多治疗的一部分。在预临床实验中,研究者发现LeXis基因可以降低胆固醇水平、减少动脉阻塞,该治疗方法可以减

基因组DNA的提取

基因组DNA的提取概 述   基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分

外源DNA的基因特点

基因有两个特点,一是能忠实地复制自己,以保持生物的基本特征;二是基因能够“突变”,突变绝大多数会导致疾病,另外的一小部分是非致病突变。非致病突变给自然选择带来了原始材料,使生物可以在自然选择中被选择出最适合自然的个体。含特定遗传信息的核苷酸序列,是遗传物质的最小功能单位。除某些病毒的基因由核糖核酸(

基因组DNA的定义

中文名称基因组DNA英文名称genomic DNA定  义组成生物基因组的所有DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

基因重组和DNA重组区别

基因重组是由于不同DNA链的断裂和连接而产生DNA片段的交换和重新组合,形成新DNA分子的过程。 在人类的生殖细胞中发现的46条染色体发生在生物体内基因的交换或重新组合。基因重组是生物遗传变异的一种机制,包括同源重组、位点特异重组、转座作用和异常重组四大类。DNA重组指DNA分子内或分子间发生的遗传

DNA基因突变的类别

按照基因结构改变分类小规模突变小规模突变影响基因中的一个或几个核苷酸 (只影响到一个核苷酸的突变称为点突变)。小规模突变包括:插入:将一个或多个额外的核苷酸添加到DNA中。它们通常由转座因子引起,或由重复元件错误复制所致。位于基因编码区的插入可改变mRNA的剪接(剪接位点突变)或引起阅读框架的移位(

基因组DNA的提取

第一节 概 述DNA的提取通常用于构建文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中,可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部,

癌基因转化细胞:基因组DNA转染法

实验概要 癌基因转化细胞实验步骤1.提取基因DNA(含癌基因)。2.DNA准备:取供体DNA50~100微克,加3M NaCl或醋酸钠使最终浓度至0.3M混匀。3.再加2倍体积无水乙醇,3000转/分离心10分钟,去上清。4.加入转染缓冲液,待DNA充分融解后,再加入2.5M CaCl2,令最终浓度