访陈润生院士:大数据治病时代已来临
生物大数据最核心的部分是组学数据,而组学数据中最基础的数据是基因组数据。有了近年的基因组研究才派生出蛋白质组、代谢组、生物网络。也正是因为基因组的研究,才使得生物大数据实实在在地成为了大数据。近年来,随着互联网与传统医疗的融合,医学界开始在研究大数据的基础上不断探索发现新的生物学规律。如今,这些数据能为工业生产、医疗实践提供哪些更好的服务呢?对此,记者近日专访了中国科学院院士陈润生。 “我可以很肯定地回答,利用大数据治疗疾病,这样的时代已经来临……非编码核酸为科研的创新提供了非常广阔的空间,是生物大数据研究的重要源泉。” ■人物名片 陈润生 中国科学院院士,中国科学院生物物理研究所非编码核酸重点实验室研究员。是中国最早从事理论生物学和生物信息学研究的科研人员之一,曾参加中国第一个完整基因组泉生热袍菌B4基因组序列的组装和基因标识,以及人类基因组1%和水稻基因组工作草图的研究。 大数据治病时代已来临 分析非编码可抑......阅读全文
访陈润生院士:大数据治病时代已来临
生物大数据最核心的部分是组学数据,而组学数据中最基础的数据是基因组数据。有了近年的基因组研究才派生出蛋白质组、代谢组、生物网络。也正是因为基因组的研究,才使得生物大数据实实在在地成为了大数据。近年来,随着互联网与传统医疗的融合,医学界开始在研究大数据的基础上不断探索发现新的生物学规律。如今,这
陈润生院士组:miRNA参与调控蜜蜂级型分化
蜜蜂是典型的社会性昆虫,蜂群通常由两种性别,三种类型的个体组成,即雄蜂、工蜂和蜂王。雄蜂为单倍体,由未受精卵发育而来,而蜂王和工蜂都是二倍体,由受精卵发育而来,均为雌性蜂。作为两种不同的级型,蜂王和工蜂虽具有相同的遗传背景,但二者不仅外部形态有显著不同,在生理和行为上也存在巨大差异。这种级型的决
陈润生:精准医学刚刚上路
在精准医学的概念下,我们目前依然存在着巨大的挑战。 现在,精准医学已成为大众热词,但我个人的观点是,精准医学虽然从本质上可能带来变革,引导新产业发展,并且也许产业规模是巨大的,但现在它才刚刚上路。在精准医学的概念下,我们目前依然存在着巨大的挑战。 为什么说精准医学才刚刚上路呢?我们的创新机遇
陈润生院士等获颁中国生物信息学终身成就奖
9月27日,第九届全国生物信息学与系统生物学学术大会在上海开幕。在为期2天半的会议期间,来自全国各地的700余名专家学者代表,将围绕“新冠病毒研究与转化医学信息学”“单细胞组学分析方法与应用”“人工智能与生物信息学”和“脑科学与生物信息学”等生物信息学诸多传统与新兴领域进行研讨与交流。 中国科
中国BIGD跻身国际生物组学数据库
测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代,海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究,基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究,组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出,搭建组学数据库,实现海量信息的存储、整合及
陈润生院士:精准医学可能促进四大相关产业发展
陈润生院士 当前,精准医学研究已成为新一轮国家科技竞争与引领国际战略的制高点。那么精准医学可能在哪些方面促使产业的变革和发展呢?我个人认为,至少有以下四个方面。 第一,精准医学可以促使海量的生物样本库和数据库的发展。大家知道,由于精准医学的推动,那么需要测量百万人量级的这些人的组学信息,首先就要
陈润生:-当选院士意味承担更大责任
面对新当选中国科学院院士的耀眼头衔,中国科学院生物物理研究所研究员陈润生并没有想象中的激动,而是心态平和地接受了《科学时报》记者的采访。 “我想我这次能够当选院士主要是评审专家对我两方面工作的肯定。”陈润生谦和地告诉记者,“一是我长期坚持在生物信息学方面进行研究,对基因组的研究作出了一定的贡献;二是
陈润生院士:精准医学才刚刚上路
自从精准医学成为大众热词以后,大家认为我们现在什么都可以精准,医学很容易精准了,但是我个人的观点是,精准医学虽然从本质上可能带来变革,可能引导新的产业的发展,也许产业规模是巨大的,但是现在才刚刚上路,才刚刚开始。因为在精准医学的概念下,我们目前依然存在着巨大的挑战,依然存在着巨大的困难。 为
穿越蛋白组学数据丛林
数据处理,验证,标准和蛋白质定量都是2007年10月在韩国举行的第六届人类蛋白质组组织(HUPO)世界年度会议的主题讨论内容。 HUPO成立于2001年2月,即人类基因组首张草图公布的同一周。现在,该组织的委员会有来自19个国家的48名成员,总部位于加拿大的麦吉尔大学以及蒙特利尔的基因组魁北克创新
陈润生院士:精准医学-市场巨大困难同样巨大
“虽然有很好的概念,虽然给我们展示了医疗体系未来的美好前景,但不论是组学检测还是大数据分析,都存在着一些巨大的障碍,所以我认为精准医学目前才刚刚起步,我们还有太多的事情要做。”12月8日,在北京举行的2016中国大数据技术大会上,中国科学院院士陈润生再三强调了这一点。 2015年1月20日,
陈润生:人类遗传密码的“暗能量”备受关注
在自然科学中,没有一个领域受到如此强烈的关注。 “物理当中我们尚未解的、最重要的部分是暗能量,它大约占整个物质世界的70%,非编码序列在整个人类遗传密码中实际上也是这个数量级的。”6月23日,在中国第一届分子诊断技术大会上,生物信息学家、中国科学院院士陈润生说。
陈润生:精准医学促使医疗产业变革和发展
精准医疗(Precision Medicine)是近几年兴起的疾病治疗方案,其最早来源于2011年美国国家科学院《迈向精准医疗:构建生物医学研究和知识网络及新的疾病分类体系》的报告中,在2015年1月20日,美国总统奥巴马在国情咨文中提出“精准医学计划”一词后,“精准医疗”便成为全球热门话题,并
代谢组学常使用的数据库
代谢组主要是对小分子代谢物(一般50-1500 Da)进行高通量定性和定量分析,代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据,方便后续的代谢组学数据分析,揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。 目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD
中国科学院:生物组学数据库获国际认可
记者12月20日从中国科学院北京基因组研究所获悉,该所生命与健康大数据中心(BIGD)建成的生物组学数据库首次获得国际认可。 BIGD团队近日在国际学术期刊《核酸研究》上发表研究论文《北京基因组研究所生命与健康大数据中心:从存储到整合、再到转化》,这是中国首次以数据中心的模式,整体发布中国生物
植物生物学研究数据库
实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
融智生物发布全球首个商用化生物组学微生物质谱数据库
近日,融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。 传统上,基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异,对核糖体蛋白组的质谱测试,可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TO
生物信息中心组学原始数据归档库数据汇交量突破10PB!
9月28日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心(CNCB-NGDC)组学原始数据归档库(Genome Sequence Archive,简称GSA)的用户汇交数据量突破10 PB(1 PB=1024 TB)。 为存好、管好、用好我国生命组学大数据,解决国内重要
研究发布大豆多维组学数据库SoyOmics
大豆(Glycine max (L.) Merr.)是重要的粮油作物之一,其产量提升、品质改进关乎全球人口的需求和利益。高通量测序技术的发展促使大豆组学研究不断深入。实现大豆多维组学数据的整合分析,将会为大豆遗传育种提供有力支持。 近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜团队联合北京基因组
北京基因组所生命组学数据资源建设获进展
近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为The BIG Data Center: from deposition to integration to translation 的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。该研究成
GCMS-HRAM-代谢组学数据库-探索代谢组学的奥秘
盐城4公分厚外墙岩棉板报价 岩棉制品是以精选的优质玄武岩为主要原料、经冲天炉熔化后,采用的四辊离心制棉工序,将玄武岩高温熔体甩扭成4-7μm的非连续性纤维,再在岩棉纤维中加入一定量的粘结剂、防尘油、憎水剂,经过沉降、固化、切割等工艺,根据不同用途制成棉毡、半硬板、保温带、管壳等系列产品。
陈润生院士:精准医学或可改变医疗健康基本概念
2005年1月,美国总统奥巴马公开表示,美国要开展精准医学研究。从此以后,精准医学在全世界得到普遍的重视。当前,精准医学研究已成为新一轮国家科技竞争与引领国际战略的制高点。除了美国,欧盟在积极推动所谓精准医学的研究,日本也在进行精准医学相关的投入和计划。我们国家领导人也多次对于精准医学的发展都有
陈润生院士:精准医学或可改变医疗健康基本概念
2005年1月,美国总统奥巴马公开表示,美国要开展精准医学研究。从此以后,精准医学在全世界得到普遍的重视。当前,精准医学研究已成为新一轮国家科技竞争与引领国际战略的制高点。除了美国,欧盟在积极推动所谓精准医学的研究,日本也在进行精准医学相关的投入和计划。我们国家领导人也多次对于精准医学的
超4000种-融智生物发布商用化生物组学微生物质谱数据库
近日,融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。 传统上,基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异,对核糖体蛋白组的质谱测试,可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TO
Geneformics联手明码生物科技为全球基因组学大数据“瘦身”
美国加州森尼韦尔市,2017年2月14日——Geneformics数据系统有限公司(以下简称“Geneformics”)宣布携手药明康德集团企业明码(上海)生物科技有限公司(以下简称“明码生物科技”),正式将Geneformics世界领先的基因测序数据技术融入到明码生物科技的工作流程。Genef
亚马逊推出新业务,不送快递改送组学数据
近日,亚马逊发布了最新的业务模块——亚马逊组学分析平台Amazon Omics。Amazon Omics 是一项亚马逊网络服务 AWS 服务,可帮助生物信息学家、研究人员和科学家等用户存储、查询、分析基因组学和其他生物数据并从中生成见解。 它简化并加速了研究和临床组织存储和分析基因组信息的过程,并加
非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库?
据相关介绍表明非靶向代谢组学的研究成果为众多的药物靶学、疾病机理研究以及疾病诊断提供有力依据。它还推动了免疫组化以及免疫荧光等技术的发展,事实上长期供应非靶向代谢组学更是由此迅速推进了研究步伐,现在就非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库作简要阐述:1.HMDB非靶向代谢组学的代谢通路必须借
微生物所发表中国微生物组数据平台
10月26日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar
简述邻氯苯甲酸的生物学数据
该物质对环境有危害,对水体和大气可造成污染,有机酸易在大气化学和大气物理变化中形成酸雨。因而当PH值降到 5以下时,会给动、植物造成严重危害,鱼的繁殖和发育会受到严重影响,流域土壤和水体底泥中的金属可被溶解进入水中毒害鱼类。水体酸化还会导致水生生物的组成结构发生变化,耐酸的藻类、真菌增多,而有根
陈润生院士:长非编码核糖核酸需更多关注
核糖核酸(RNA)是一类重要的遗传物质,经编码转录成蛋白质则是它的重要功能之一。不过,研究发现,非编码RNA占人类基因组转录产物的90%以上。由于不参与编码,这类RNA曾被认为是人类基因组的“暗物质”或者“垃圾”。 近年来,大量新研究成果表明非编码RNA是许多生命过程中富有活力的参与者。2
陈润生院士:距读懂自己身体密码还有97%的路
如果在出生时关于你的身体基因、相关分子的大数据可被记录在案,那么你不仅可以照镜子了解自我,还能翻看属于自己的“遗传密码百科全书”…… 也许若干年后,上述的想象会实现。届时,我们对医疗的概念将完全刷新:医疗机构主要面向的不再是病人,而是每个人。你会定期来到医院分析自己的大数据,医生通过大数据全面