生物信息中心组学原始数据归档库数据汇交量突破10PB！
9月28日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（CNCB-NGDC）组学原始数据归档库（Genome Sequence Archive，简称GSA）的用户汇交数据量突破10 PB（1 PB=1024 TB）。 为存好、管好、用好我国生命组学大数据，解决国内重要数据资源流失和生命组学数据孤岛等问题，提高数据共享率和利用率，北京基因组所于2015年10月建立了国内首个组学原始数据汇交、存储、管理与共享系统GSA，为国家重点研发计划、国家自然科学基金、中科院战略先导专项等国家重大、重点研究计划及任务的科学数据安全管理和归档共享提供了重要支撑。 GSA自上线以来，持续为全球生命科学研究人员提供数据汇交和共享服务，尤其为我国科研人员提供了极大便利。截止2021年9月28日，GSA数据库体系已接收国内外437家研究机构1829名用户的数据递交，支撑科研人员在250种期刊发表研究论文760余篇，为全球......阅读全文
原始数据管理体系（GSA－Family）研发取得进展
8月14日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（CNCB-NGDC）在Genomics，Proteomics & Bioinformatics上，在线发表研究论文The Genome Sequence Archive Family: Toward Explosi
GSA数据库获得国际出版社Springer－Nature认可
8月4日，国际著名出版社Springer Nature在其官网中将北京基因组所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（CNCB-NGDC）开发并运行的组学数据归档库，即GSA和GSA-Human，列为其推荐使用的数据存储和共享系统，Springer Nature旗下的3000多个期刊都将认可
生物信息中心组学原始数据归档库数据汇交量突破10PB！
9月28日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（CNCB-NGDC）组学原始数据归档库（Genome Sequence Archive，简称GSA）的用户汇交数据量突破10 PB（1 PB=1024 TB）。 为存好、管好、用好我国生命组学大数据，解决国内重要
国家基因组科学数据中心公布数据资源整合挖掘体系
近日，国家基因组科学数据中心在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表题为Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020 的文章，以整体形式介绍基因组数据资源整合与挖掘体系建设
黏粒文库的扩增和贮存(在液体培养基内扩增)
不要过度扩增黏粒文库，因为这样会不可避免地引起原基因组的失真。生长较快的克隆会过度呈现，不稳定的克隆会发生重排，而生长慢的克隆可能会从文库中完全消失。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理不要过度扩增黏粒文库，因为这样会不可避免地引起原基因组的失真。生长较快的克隆会过度呈现，不
整合中国组学资源，在国际舞台奏出“共享乐章”
2018年、2019年连续两年，组学数据库权威杂志《核酸研究》对前一年的全球基因组数据库建设进行总结，鲜见地在美英两个老牌的数据库以外，提到了中国的GSA（组学原始数据归档库）。 “美国国立生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Informati
家犬基因组联盟发表dog10K计划白皮书
2016年，来自世界各地的20多位科学家成立家犬基因组联盟，全面深度探讨家犬起源与驯化、人工选择、疾病机制、医学模型等重大科学问题。自成立后，科研工作积极有序进行，近期研究联盟在国际刊物National Science Review上发表dog10K计划白皮书。 研究联盟指出，家犬是行为和表型
黏粒文库的扩增和贮存(在液体培养基内扩增)
实验方法原理 不要过度扩增黏粒文库，因为这样会不可避免地引起原基因组的失真。生长较快的克隆会过度呈现，不稳定的克隆会发生重排，而生长慢的克隆可能会从文库中完全消失。 实验材料
黏粒文库的扩增和贮存(在液体培养基内扩增)
实验方法原理 不要过度扩增黏粒文库，因为这样会不可避免地引起原基因组的失真。生长较快的克隆会过度呈现，不稳定的克隆会发生重排，而生长慢的克隆可能会从文库中完全消失。实验材料 λ 噬菌体包装反应大肠杆菌接种菌株试剂、试剂盒 甘油仪器、耗材 卡那霉素的琼脂平板TB 培养基Sorvall GSA 转头或同
大脑前动脉巨大蛇形动脉瘤病例报告2
2.讨论 蛇形动脉瘤是较为罕见的颅内动脉瘤类型，约占所有颅内动脉瘤的0.1%，其中17.6%为GSA。目前，尚无有关于GSA的流行病学研究，但有关文献指出：GSA大多数病人为男性，发病高峰年龄为30~60岁。本例病人即为男性，43岁。GSA发生部位：大脑中动脉或其分支血管约占50%，大脑后动脉占18
南京土壤所在铵影响拟南芥主根向地性研究中获进展
根系构型对于植物适应不同水分养分及土壤物理结构的生长环境至关重要。根长，侧根数量与根的向地性是决定植物根系空间构型的主要因素。铵作为主要的土壤环境因子之一，对植物根系伸长与侧根形成的调控机制已有广泛研究，但其对根系向地性的影响却少有报道。 中国科学院南京土壤研究所施卫明课题组研究发现铵离子
我国建成全球第四个综合基因组权威数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为“The BIG Data Center： from deposition to integration to translation”（北京基因组研究所生命与健康大数据中心：从存储到整合、再到转化）的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》
数字示波器特点分析
数字示波器固纬GDS-2104特点 数字示波器固纬GDS-2104 100MHz 频宽 4输入通道 1GSa/s 即时取样率以及 25GSa/s 等效取样率 25000点之记忆体长度 5.6 吋 TFT 彩色 LCD 荧幕 数字示波器固纬GDS-21
北京基因组所开发系列特色科学数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心（BIG Data Center，BIGD）有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志在线发表，并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas
北京基因组所开发系列特色科学数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心（BIG Data Center，BIGD）有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志在线发表，并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas
北京基因组所生命与健康大数据研究获进展
与健康大数据研究成果，包括生命组学数据资源建设成果（D14-20）、实时定量PCR内参基因知识库——ICG（Internal Control Genes；D121-126），甲基化数据库Methbank升级版（D288-295）以及基因组序列变异库——GVM（Genome Variation M
北京基因组所生命组学数据资源建设获进展
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为The BIG Data Center: from deposition to integration to translation 的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表。该研究成
谁在先？“鸡基因组”和“鸡蛋基因组”
是先有鸡还是先有鸡蛋？这个问题相当恼人，恐怕很难说清楚。现在，研究人员回答了与这个问题一样恼人的问题：是人类基因组中的成千上万的长重复DNA片段中，那个是第一个产生的？那些被复制了？ 这个答案发表在10月7日的《自然·遗传学》杂志上。该研究给出了人类基因组中DNA重复片段复制的第一个进化证据，这种
北京基因组所资源建设取得阶段性进展
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队以Database Resources of the BIG Data Center in 2018为题的研究论文，在线发表Nucleic Acids Research上。这是继去年首次在该期刊发布我国生命组学数据资源建设成果The BIG
叶绿体基因组
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能的重要细胞器，叶绿体中进行的光合作用是严格地受到遗传控制的。早在20世纪初，人们就已知叶绿体的某些性状是呈非孟德尔式遗传的，但直到60年代才发现了叶绿体DNA(chloroplast DNA，ctDNA)。叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子，其大小在1
基因组测序
如果楼主指的是人类基因组计划，那时用的方法叫做双脱氧终止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中，DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸）来作为原料，但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的，但与普通PCR不同，它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的
全基因组的比较基因组杂交技术介绍
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
GenomeResearch发表基因组研究新发现基因组
多伦多大学的科学家们发现，作为基因组看门人的C2H2-锌指蛋白（C2H2-ZF）实际上肩负着更加多样化的职责。这项发表在Genome Research杂志上的研究，有助于我们更准确地解读个人基因组。C2H2-ZF有大约七百个成员，是规模最大的一种人类蛋白。然而，人们对这些蛋白一直知之甚少。C2H2-
泰克－TDS7404B数字示波器
Tektronix泰克TDS7404B数字荧光示波器泰克Tektronix TDS7404B示波器参数说明：·采样率：20GSa/s (1Ch), 10GSa/s (2ch), 5GSa/s (3-4ch)·记录长度：4Mb (1ch), 2Mb (2ch), 1Mb (4ch)·垂直灵敏度：2mV
中国新生儿基因组、胚胎基因组计划启动
为从根本上实现新生儿遗传病的早发现、早诊断、早干预，7日，中国遗传学会遗传咨询分会联合复旦大学附属儿科医院在上海发起中国新生儿基因组计划。 中国新生儿基因组计划将在未来的5年内开展10万例样本的新生儿基因检测，旨在构建中国新生儿基因组数据库，建立新生儿遗传病基因检测标准，促进新生儿遗传病基因检
《基因组研究》：首张猫基因组草图绘就
猫是研究人类失明和艾滋病模型之一，因此测序结果大有用处 一只名为“肉桂”（Cinnamon）的4岁雌性阿比西尼亚猫有幸成为第一只完成基因组测序草图的猫。它也因此加入了包括狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在内的基因组“俱乐部”。相关论文11月1日在线发表于《基因组研究》（Genome Research）杂
从大规模裂解物中制备λ噬菌体颗粒
材料：缓冲液和溶液：氯仿NaCl（固体）聚乙二醇（PEG 8000）SM酶和缓冲液：胰Dnase I (1mg/ml)胰Dnase I (1mg/ml)于TE中（ph7.6）离心机和转子：Sorvall GSA 转子或相当型号专用设备：量筒（2L）载体和菌株：大肠杆菌培养物，经λ噬菌体感染和裂解方
打破“数据孤岛”，推动组学资源管理自立自强
今年1月，依托中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）（以下简称基因组所）的国家基因组科学数据中心（NGDC）有10篇论文集中亮相国际生物数据库期刊《核酸研究》。对于这样一本顶级期刊来说，这种情况并不多见。一个刚6岁的数据中心何以取得这样的成绩？近日，《中国科学报》走进基因组所了解NGDC成长
大量培养物中分离－BAC－DNA
实验方法原理 BAC 重组子的精细分析，包括详细的限制酶切图谱、DNA 测序或亚克隆，所需 DNA 量都超过小量制备所能提供的量。本方案的制备流程适用于重组 BAC 的大规模培养物。500 ml BAC 转化菌的平均产量为 20~25 μg BAC DNA。还可用柱层析对 DNA 产物进一步
大量培养物中分离－BAC－DNA
实验方法原理 BAC 重组子的精细分析，包括详细的限制酶切图谱、DNA 测序或亚克隆，所需 DNA 量都超过小量制备所能提供的量。本方案的制备流程适用于重组 BAC 的大规模培养物。500 ml BAC 转化菌的平均产量为 20~25 μ