微生物所发表中国微生物组数据平台
10月26日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the archiving, standardization and analysisof microbiome data 的研究论文。gcMeta平台是一个微生物基因组及微生物组数据的管理、分析和发布平台，为国内外用户提供一站式的从数据存储、数据分析到数据发布的服务，目前已经整合了来自中科院微生物组计划及国内外多个重要项目的数据。该平台的发布将有效支撑我国微生物组研究并为未来我国国家微生物组计划的实施提供重要的支持。 近年来，美国、欧盟都陆续启动了微生物组相关的研究项目。但微生物组大数据的收集、存储、功能挖掘和开发利用一直是制约微生物组发展的......阅读全文
世界微生物数据中心落户微生物所
在近日召开的第12届国际菌种保藏大会上，经过大会专家委员会评审并经世界菌种保藏联合会理事会审议通过，中国科学院微生物研究所在众多的竞争者中脱颖而出，成为世界微生物数据中心（World Data Center for Microorganisms, WDCM）新的主持单位。 W
微生物所发表中国微生物组数据平台
10月26日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar
全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外，它是全球最大的冰川分布区，现有冰川2万条以上，面积超过2万平方公里，也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器，封存了不同历史时期的微生物。 现在，中国科学家构建的
我国微生物大数据平台建设获进展
近日，中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心团队题为World Data Centre for Microorganisms: an information infrastructure to explore and utilize preserved microbia
首个国际ISO微生物数据标准正式发布
微生物资源是国家的重要战略资源，微生物数据资源则是微生物资源共享和开发的关键环节，数据资源的丰富性、准确性和共享水平，决定着微生物学领域研究和应用的综合能力。 2020年11月9日，国际标准化组织生物技术委员会（ISO/TC 276）正式发布微生物资源中心数据管理和数据发布标准（ISO 217
全球微生物组大数据搜索引擎上线
日前，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心正式发布首个微生物组大数据搜索引擎——MSE（Microbiome Search Engine； http://mse.single-cell.cn），使得以整个微生物组为分析单元的智能搜索和大数据挖掘成为现实。 微生物组，又称“菌群”。
全球最大的海洋微生物组数据库建立
9月4日，《自然》在线发表中外科学家的合作成果，该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库，从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者，助理研究员刘琨为文章共同第一作者。该成果在《自然》报道 山东大学供图微生物已在生物制造、
全球最大的海洋微生物组数据库建立
9月4日，《自然》在线发表中外科学家的合作成果，该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库，从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者，助理研究员刘琨为文章共同第一作者。 微生物已在生物制造、生物医药、生物农业、环境治理等
全球最大数字微生物数据库建成
来自爱尔兰、法国和意大利的科学家携手，成功构建了全球最大的数字微生物库——“阿波罗”（APOLLO）。“阿波罗”囊括了247092个计算模型，其中包含迄今为止最全面的人体微生物组计算模型，有望增进科学家对人体微生物组及其对健康影响的理解。相关论文发表于最新一期《细胞系统》杂志。 研究团队重点关
国际微生物大数据联合研究中心在京挂牌
近日，国家“863”计划“微生物数字化信息系统集成关键技术研发”项目推进会在京举行。其间，由中科院微生物所、中科院上海生命科学研究院、上海生物信息技术研究中心等单位组成的国际微生物大数据联合研究中心挂牌。 随着信息技术的发展，我国微生物大数据研究步入世界前列。据主持“微生物数字化信息系统集成关
世界微生物数据中心与泰国国家微生物资源保藏中心合作
9月11日至15日，世界微生物数据中心（World Data Center for Microorganisms，简称WDCM）主任、中科院微生物研究所信息中心主任马俊才研究员赴泰国国家基因工程及生物技术中心（National Center for Genetic Enginee
微生物所举办第二届世界微生物数据中心研讨会
6月7日至8日，在中科院国际合作局和中科院生物局的支持下，由世界微生物数据中心（WDCM）、世界菌种保藏中心联合会（WFCC）、联合国教科文组织（UNESCO）、中科院应用微生物研究网络（RNAM）、中科院微生物研究所、国际科技数据委员会（CODATA）、亚洲微生物资源保藏和可持
人类肠道微生物基因集－为研究提供精准数据支持
7月7日，由华南理工大学生物科学与工程学院博士研究生李俊桦为第一作者，与深圳华大基因研究院、丹麦哥本哈根大学等单位共同合作完成的《人肠道微生物组参考基因集》研究成果在《自然—生物技术》上发表。这是“华工—华大”基因组科学创新班学子在国际顶级学术期刊上以第一作者身份发表的第二篇文章。 据介绍，人
基于微生物组大数据的疾病检测方法来了
微生物组具有服务疾病诊治与生态监控的巨大潜力，但是其影响因素错综复杂。如何通过菌群检测实现快速精准的疾病诊断呢？中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了基于菌群大数据搜索的疾病检测方法，为此共性问题提供了原创的解决方案。该工作于3月17日在线发表于mSystems（美国微生物学会会刊）
扬州环保局公布上半年微生物监测数据
昨天，我市环保局环境监测中心站公布了我市上半年度主要河流、重点湖泊、城市饮用水源地和市区空气微生物监测工作，并编制完成《2015年上半年扬州市生物监测报告》（下简称《报告》）。记者昨天了解到，我市上半年空气微生物轻微污染，主要由于湿度较大，今年霉菌总数比去年增加6.5倍。 最新发布 上半
国家微生物科学数据中心：保障主权，推动共享
细菌、病毒、真菌、支原体、衣原体…… 谈及它们，你定会避之不及。但是，你知道吗？在地球生物圈，它们占据着重要位置——环境、食品、医药、健康、工业、农业、化学化工、材料、生物安全，与人类存续相关的所有环节，几乎都与它们有关。其家族成员还包括放线菌、立克次氏体、螺旋体……它们，都是微生物。 微生
中国科学家建立全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外，它是全球最大的冰川分布区，现有冰川2万条以上，面积超过2万平方公里，也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器，封存了不同历史时期的微生物。 现在，中国科学家构建的全球首个青藏高原冰川微生物
中国科学家建立全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外，它是全球最大的冰川分布区，现有冰川2万条以上，面积超过2万平方公里，也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器，封存了不同历史时期的微生物。 现在，中国科学家构建的
WDCM亚洲微生物数据资源管理与应用培训班
5月27日至6月12日，由中科院国际合作局“发展中国家科技培训班”项目支持，世界微生物数据中心（WDCM）、世界菌种保藏中心联合会（WFCC）、联合国教科文组织（UNESCO）、亚洲微生物资源保藏和可持续利用联盟（ACM）、亚洲资源中心研究网络（ANRRC）、中科院应用
科学家如何还原和挖掘海洋微生物基因数据？
·GOMC数据库为未来的研究提供了丰富的资源，包括开发新型生物技术产品、探索微生物的生态功能、研究微生物与环境变化的关系、开发新的疾病治疗方法等。基因是生命的“源代码”，其中不仅蕴藏着自然演化的奥秘，也囊括了数之不尽的生物工程资源。如何获取、分析和应用基因数据，是现代生物学的核心议题之一。近日，一支
微生物领域数据库及其分析系统建设研究取得进展
中国科学院计算机网络信息中心大数据技术与应用发展部与中科院微生物研究所等，在微生物领域数据库及其分析系统建设方面取得新进展，提出了一种利用语义网技术构建知识图谱的方法，可将冠状病毒相关的毒株、基因组、蛋白序列、蛋白结构、抗体、文献和ZL等多源异构数据映射至资源描述框架（RDF），并构建了基于语义网框
青岛能源所微生物组大数据分析工具开发获进展
元基因组是当前微生物组大数据最主要的存在形式之一。由于元基因组数据的复杂性、异质性以及指数级增长的体量，从中深度且快速发掘微生物群落结构和功能上的变化规律，一直是业界的一个重要技术瓶颈。近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心发表了元基因组高性能计算分析软件Parallel-MET
升级换代“加速跑”－走进国家微生物科学数据中心
“人家凭什么给你交数据？”作为国家微生物科学数据中心和中国科学院微生物科学数据中心主任，马俊才时常这样问自己。 “数据中心不是档案库，我们也不是‘官老爷’，一定要给对方提供所需的增值服务。”从事数据库建设多年，这是他的深切体会。 国家微生物科学数据中心和中国科学院微生物科学数据中心的前身可追
解码“基因宝藏”：最全海洋微生物基因数据库出炉
9月4日晚，华大生命科学研究院（简称“华大”）联合山东大学、英国东安格利亚大学、中国海洋大学、厦门大学、丹麦哥本哈根大学等机构，在《自然》上发表研究成果。他们通过对目前已公开的海洋微生物宏基因组数据进行分析和深度挖掘，构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库，并从中发现了大量具有应用潜力的基因资源
微生物数据分析云平台上线，人人都能做生信分析
GeneDock与中国疾病预防控制中心（中国CDC）传染病预防控制所合作开发的微生物数据分析云平台已于今日正式上线开放（https://analysis.mypathogen.org/）。这一项目由中国疾控中心传染病预防控制所发起，主要是为了提升传染病领域大数据的利用效率，实现高通量测序技术在
最大的海洋微生物基因数据库有助于药物发现
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516176.shtm迄今对包括细菌、病毒和真菌在内的海洋微生物基因进行的最全面分析，可为研究人员发现抗生素、追踪气候变化影响和保护濒危物种奠定基础。1月16日，相关成果发表于《科学前沿》。据《自然》报道，
苏晓泉团队开发出基于微生物组大数据的疾病检测方法
微生物组具有服务疾病诊治与生态监控的巨大潜力，但是其影响因素错综复杂。如何通过菌群检测实现快速精准的疾病诊断呢？中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了基于菌群大数据搜索的疾病检测方法，为此共性问题提供了原创的解决方案。该工作于3月17日在线发表于mSystems（美国微生物学会会刊）
若斌生物参展CBIFS：微生物培养中提供可追溯、可视化数据
2023年3月17日，第十五届中国国际食品安全技术论坛（CBIFS 2023）在重庆开幕，来自国内外的100多家知名厂商，在本次论坛上集中展出食品安全分析、微生物和快速检测最新产品与解决方案。第十五届中国国际食品安全技术论坛 本届CBIFS 2023上，分析测试百科网邀请四川若斌生物科技有限责
最大的海洋微生物基因数据库有助于药物发现
迄今对包括细菌、病毒和真菌在内的海洋微生物基因进行的最全面分析，可为研究人员发现抗生素、追踪气候变化影响和保护濒危物种奠定基础。1月16日，相关成果发表于《科学前沿》。据《自然》报道，2021年，研究人员构建了一个目录，其中包含约3亿组陆地微生物和海洋微生物的基因。现在，沙特阿拉伯阿卜杜拉国王科技大
“百万微生态”计划将构建全球最大人体微生物组数据库
2019年10月26日，“百万微生态”国际合作计划（MMHP）在深圳第14届国际基因组学大会（ICG-14）上正式启动，来自中国、瑞典、丹麦、法国、拉托维亚等多国科学家将合作开展微生物宏基因组研究，致力于在未来三至五年内对100万份来自肠道、口腔、皮肤、生殖道等器官的微生物组样品进行测序分析，绘