PNAS:跟踪癌症进展的新方法

最近,一个科学家小组开发了一种计算方法来映射癌症的进展,这一研究成果对于促发这种疾病的因,素以及选择有效疗法的新方法,提供了新的见解。 本文共同作者、纽约大学教授Bud Mishra 解释说:“我们的工作重点是探索,随着肿瘤环境响应变化——如缺氧、细胞迁移或免疫反应,驱动癌症进展的几个基因及其突变之间有什么‘因果’关系。然后使用模型来预测,肿瘤的基因组随着时间推移将如何变化。”相关研究结果发表在《PNAS》杂志。 本文共同作者、爱丁堡大学神经计算和自适应计算研究所的研究助理Giulio Caravagna指出:“我们提出了一种生物信息学程序,来检测肿瘤起源和发展中的常见‘规律’。这可能是在不同患者中理解这类疾病的一个关键步骤,这类疾病的特点是有一些常见的基因组病变。” 在这项研究中,研究人员专注于结直肠癌,并考虑到最近我们对于该疾病的理解。以前,癌症被认为是从一个“叛变的细胞”开始,在某种程度上,通过一对细胞自发性的遗......阅读全文

Nat-Commun:癌症——基因突变的起源

  DNA的复制是细胞分裂的前提。但是,在存在某些破坏性成分的情况下,细胞将无法很好地执行相关操作,复制过程将变得更加缓慢且效率较低,这种现象称为“复制压力”。虽然已知“复制压力”与遗传突变的增加有关,但至今仍不清楚起作用的确切机制。  最近,日内瓦大学(UNIGE)的研究人员阐明了在“复制压力”下

《科学》重点文章:癌症与基因突变

生物通报道:来自霍德华休斯医学院,Ludwig癌症遗传与治疗中心(the Ludwig Center for Cancer Genetics and Therapeutics)以及约翰霍普金斯凯门综合癌症中心(Johns Hopkins Kimmel Comprehensive Cancer Cen

基因突变检测指导癌症靶向治疗

  肺癌和结直肠癌近年来已成为大多数国家癌症死亡的主要原因。由于个体遗传基因存在差异性,不同类型的癌症患者选择适合的靶向治疗药物或能取得预期的疗效,基因突变检测为医生提供了重要参考信息。中国国家食品药品监督管理局日前批准由瑞士罗氏诊断研发的cobas EGFR/KRAS基因突变检测技术用于临床基因突

基因突变让端粒失控 促发癌症

  近日,来自威斯达研究所的研究人员揭示了保护端粒(我们染色体末端结构)的部分蛋白复合物的结构,相关研究成果发表在 Nature Communications 上,该研究解释了与这个蛋白复合物相关的一组基因突变如何促进一系列癌症。  端粒是染色体末端的保护性结构,对人体基因组的复制和保护至关重要。端

NCCN增加女性癌症新基因突变检测

据医脉通报道,第21届美国国家综合癌症网络(National Comprehensive Cancer Network,NCCN)年会近日在好莱坞召开,会议增加了几个针对乳腺癌和卵巢癌遗传风险管理的新基因突变检测。 最近的研究发现PALB2基因突变与乳腺癌侵袭性相关,而RAD51C、RAD

这种基因突变导致1/4的人罹患癌症,并且还助力癌症生长

  癌症的发生与原癌基因的突变有关。研究表明,原癌基因例如Ras基因发生突变,会导致25%的人类癌症的发生。  近日弗兰西斯克里克研究所的Matthew Coelho博士做了相关实验后发现,Ras基因发生突变还可以抑制免疫系统的抗癌反应。相关研究成果以题为《Oncogenic RAS Signali

超过8%的儿童癌症患者携带癌症易感基因突变研究概要

 《 New England Journal of Medicine》期刊公布的一项研究显示,超过8%的儿童癌症患者携带癌症易感基因突变。    研究者对1120例儿童癌症患者的肿瘤样本和正常组织进行了DNA测序,发现8.5%的患者的正常组织携带生殖细胞系致病或可能致病突变,这些突变会导致癌症风

《科学》:多数癌症基因突变或因“坏运气”

  美国约翰斯·霍普金斯大学研究人员曾在两年前发表论文说,多数癌症发病要怪“坏运气”,遗传和环境因素影响相对较小。这一结论在科学界引起巨大争议。如今,该校研究人员经进一步分析再次报告说,多数癌症发病确实是因为运气不好。  干细胞分裂时  出现错误  这项于23日发表在美国《科学》杂志上的新研究称,近

Nature--NEJM:癌症种类由基因突变模式决定

纪念斯隆-凯特琳癌症中心的道格拉斯·莱文博士是子宫内膜癌研究的研究负责人。   科学家发现,最危险的子宫内膜癌,与最糟糕的卵巢癌和乳腺癌相当类似,这提供了迄今为止最有力的证据,显示出癌症越来越被视为一种主要是由其基因图谱定义的疾病,而不是由其发病器官。   周三,《自然》杂志(Nature)上发

新算法比较分析可搜索癌症基因突变

  桑福德伯翰医学研究所(Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute,SBP)承担了前所未有的对一个新兴算法类别的比较分析,该算法通过聚焦内部基因结构,在癌症数据库中挖掘遗传信息(即亚基因像素算法),这与专注于基因视其为单个单元的经典方法形成

-利用肿瘤细胞的基因突变制备癌症疫苗

  个性化疫苗为治疗多对基因突变引发的癌症提供新的选择。  在一个小型临床试验中,利用在肿瘤细胞中的突变蛋白所制备的疫苗成功地引发了机体对癌细胞的免疫应答反应。  该结果是目前致力于研发个性化癌症治疗所得出的最新成果,并公布于4月2日的科学(Science)杂志中。在此次试验中,三位恶性黑色素瘤患者

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ATRX

该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域,因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化,它调节其核基质和染色质的结合,并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞(XLMR)综合征有关,通常伴有α-地中海贫血(ATR

癌症相关的基因突变类型及临床解释ACTB

这个基因编码六种不同的肌动蛋白中的一种。肌动蛋白是高度保守的蛋白质,参与细胞运动、结构、完整性和细胞间信号传导。编码蛋白是收缩装置的主要组成部分,也是两种广泛表达的非肌肉细胞骨架肌动蛋白之一。该基因突变导致Baraitser-Winter综合征1,其特征是人类患者的智力残疾和独特的面部外观。在整个人

癌症相关的基因突变类型及临床解释-APOE

这个基因编码的蛋白质是乳糜微粒的一个主要的凋亡蛋白。它与特定的肝脏和外周细胞受体结合,对富含甘油三酯的脂蛋白成分的正常分解代谢至关重要。该基因与载脂蛋白C1和C2基因簇中的19号染色体定位该基因突变导致家族性β-脂蛋白血症或Ⅲ型高脂蛋白血症(HLP-Ⅲ),其中血浆胆固醇和甘油三酯升高是乳糜微粒和极低

癌症相关的基因突变类型及临床解释AFDN

该基因编码一个多域蛋白,参与胚胎发育过程中细胞连接的信号和组织该基因与t(6;11)(q27;q23)易位的急性髓系白血病(americ myeloid leukemia,all-1)基因融合。另外,编码不同亚型的剪接转录变体已经被描述用于该基因,然而,并不是所有的都已经被完全描述出来了。

癌症相关的基因突变类型及临床解释ASPM

该基因是果蝇“纺锤体异常”基因(asp)的人类同源基因,对胚胎神经母细胞的正常有丝分裂纺锤体功能至关重要在小鼠中的研究也表明该基因在有丝分裂纺锤体调控中的作用,在调节神经发生中具有优先作用。该基因突变与小头畸形原发性5型相关。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ATIC

该基因编码一种双功能蛋白,对从头嘌呤生物合成途径的最后两个步骤进行催化。N-末端结构域具有磷酸核糖氨基咪唑甲酰胺甲酰转移酶活性,C-末端结构域具有IMP环水解酶活性。该基因突变导致AICA核糖尿症。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ATR

该基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,与ATM(一种在共济失调性毛细血管扩张症中突变的基因编码的蛋白激酶)关系最为密切。这种蛋白和atm与pombe-rad3裂殖酵母菌(schizosaccharomyces pombe rad3)具有相似性,后者是细胞周期停滞和DNA损伤修复反应中所需的细胞

癌症相关的基因突变类型及临床解释-AURKA

该基因编码的蛋白是一种细胞周期调节激酶,在染色体分离过程中似乎与纺锤体极的微管形成和/或稳定有关。编码蛋白存在于有丝分裂的间期细胞的中心体和纺锤体两极。该基因可能在肿瘤的发展和进展中起作用。在1号染色体上发现一个经过加工的假基因,在10号染色体上发现一个未经加工的假基因。已发现该基因的多个编码相同蛋

癌症相关的基因突变类型及临床解释-AADAC

微粒体芳酰胺脱乙酰酶与细胞溶质芳胺N-乙酰转移酶的活性竞争,该酶催化芳胺和杂环胺致癌物的初始生物转化途径之一。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-APLNR

该基因编码G蛋白偶联受体基因家族的一个成员编码蛋白与血管紧张素受体有关,但实际上是一种抑制腺苷酸环化酶活性的apelin受体,通过发挥高血压作用,对血管紧张素ii的压力作用起反调节作用。它在心血管和中枢神经系统、葡萄糖代谢、胚胎和肿瘤血管生成以及作为人类免疫缺陷病毒(HIV-1)受体发挥作用由选择性

癌症相关的基因突变类型及临床解释BPTF

该基因通过其编码蛋白与针对阿尔茨海默病患者脑匀浆制备的单克隆抗体的反应性进行鉴定。对原蛋白(胎儿alz-50活性克隆1,fac1)的分析表明,该蛋白可能参与转录调控,是一种含有dna结合区和锌指基序的810a a蛋白。胎儿脑和神经退行性疾病患者中检测到高水平的FAC1这个基因编码的蛋白质实际上比最初

同日两篇《自然》:基因突变可能抑制癌症?

  今日,《自然》杂志在线发表了两篇来自日本科研团队的最新研究论文。研究中,科学家们使用一系列遗传学的手段,找到了溃疡性结肠炎背后的常见突变基因。令人意外的是,其中一些基因突变,看起来似乎有抑制癌症的效果!  溃疡性结肠炎是一种常见的慢性炎症性疾病,病情常为带血的腹泻。如果患者的病情无法得到长期控制

癌症相关的基因突变类型及临床解释-BTK

Bruton的酪氨酸激酶(缩写为Btk或BTK)也称为酪氨酸 - 蛋白激酶BTK,是人类中由BTK基因编码的酶。 BTK是一种在B细胞发育中起关键作用的激酶。 BTK通过高亲和力IgE受体在B细胞成熟以及肥大细胞活化中起关键作用。 Btk含有结合磷脂酰肌醇(3,4,5) - 三磷酸(PIP3)的PH

癌症相关的基因突变类型及临床解释--APC

APC为抑癌基因,所编码的蛋白在Wnt信号通路中起负调控作用,也参与到细胞迁移、粘附、转录激活和凋亡中。这个基因缺陷导致家族性腺瘤性息肉(FAP),这是一种常染色体显性遗传疾病,通常易发生癌变,主要机制为突变的APC基因缺失了与Axin的结合序列,因而不能与Axin、CK1和GSK-3β形成β-ca

癌症相关的基因突变类型及临床解释ALDOC

该基因编码一类果糖二磷酸醛缩酶基因家族成员编码蛋白在大脑海马和浦肯野细胞中特异表达,是一种糖酵解酶,催化果糖-1,6-二磷酸和果糖1-磷酸分别可逆地切割为二羟基丙酮磷酸和甘油醛-3-磷酸或甘油醛。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ARAF

丝氨酸/苏氨酸 - 蛋白激酶A-Raf或简称A-Raf是人类中由ARAF基因编码的酶。[5] A-Raf是丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白激酶的Raf激酶家族的成员。 与该家族的其他成员(Raf-1和B-Raf)相比,对A-Raf知之甚少。它似乎具有其他同种型的许多特性,但其生物学功能尚未得到彻底研究。所有

癌症相关的基因突变类型及临床解释BLK

该基因编码src原癌基因家族的一个非受体酪氨酸激酶,典型地参与细胞增殖和分化该蛋白在b细胞受体信号传导和b细胞发育中起作用。该蛋白还刺激胰岛素的合成和分泌,对葡萄糖作出反应,并增强一些胰腺β细胞转录因子的表达。

癌症相关的基因突变类型及临床解释ASMTL

该基因编码的蛋白有一个N-末端,与枯草芽孢杆菌的多拷贝相关丝状(maf)蛋白和大肠杆菌的orfE相似,而C-末端与N-乙酰5-羟色胺O-甲基转移酶相似该基因位于X染色体和Y染色体的假常染色体区1(PAR1)。已经发现了三个编码不同亚型的转录变体。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-BAD

这个基因编码的蛋白质是bcl-2家族的一员。bcl-2家族成员是细胞程序性死亡的调节者。该蛋白通过与bcl-xl和bcl-2形成异二聚体,并逆转其死亡抑制活性,从而对细胞凋亡起到积极的调节作用。这种蛋白的促凋亡活性是通过磷酸化调节的。蛋白激酶akt和map激酶以及蛋白磷酸酶钙调磷酸酶参与了该蛋白的调