中大绘出广东食管鳞状细胞癌遗传变异图谱
由中山大学肿瘤防治中心贾卫华教授领衔,中山大学、美国NIH等多家机构的科研人员组成的国际合作团队,基于新一代测序技术、基因的表达谱分析、体内外实验以及大量临床数据,对食管鳞状细胞癌的全基因组变异进行了历时五年的研究,绘制出广东食管鳞状细胞遗传变异图谱。 广东是食管癌高发大省,人群具有独特的遗传背景及生活习惯。从全基因组水平,全面、系统揭示广东食管鳞癌特有的体细胞遗传变异图谱,进而发现影响预后及靶向治疗的遗传变异,无疑对解析食管癌的发病机理、推动临床治疗方法的研究具有极大价值。由贾卫华教授领衔的该项研究系统地揭示了广东食管鳞癌的癌症基因组学特征,尤其是发现了一系列新的影响癌症转归和生存的基因突变(如VANGL1)、基因异常表达(如miR-4707-5p)和特征性的染色体结构变异,并进行了深入的体内外实验研究和癌症信号通路研究。贾卫华教授团队通过对67个广东食管鳞癌患者的肿瘤及癌旁正常组织进行全基因组或外显子组测序发现,同中国......阅读全文
高通量测序数据分析
1. 是不是一定要用大型计算机? 除了序列拼接组装以外,其它分析不是一定要大型计算机,在普通的PC上也可以进行一些处理,当然,买一台或几台高性能的工作站电脑,能显著加快数据处理的速度。 2. 是不是一定要用Linux系统? 也不一定非用Linux不可,在Window下可以完成部分数据处理。
三代测序数据漫谈
三代明星:PacBio及其序列数据再来看看江湖呼声渐涨的三代测序技术。目前三代测序市场上,表现最为抢眼的莫过于以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies为代表的纳米孔单分子测序技术。与前两代相比,三代测序最为核心的特点就是单分子测序,测序过程无需进
探索肿瘤防治的三级模式
尽管首都北京医疗资源丰富,顶尖的医疗机构林立,但似乎并没有遏制恶性肿瘤的发病率攀升的趋势。 《北京市居民恶性肿瘤发病及生存报告》显示,2013年,北京市癌症新发病例达到4.13万人,平均每天新增113人。恶性肿瘤从2007年开始一直位居北京居民死因首位,平均每死亡4人中就有1人死于癌
探索肿瘤防治的三级模式
尽管首都北京医疗资源丰富,顶尖的医疗机构林立,但似乎并没有遏制恶性肿瘤的发病率攀升的趋势。 《北京市居民恶性肿瘤发病及生存报告》显示,2013年,北京市癌症新发病例达到4.13万人,平均每天新增113人。恶性肿瘤从2007年开始一直位居北京居民死因首位,平均每死亡4人中就有1人死于癌症。 在
肿瘤防治需警惕三大“夺命杀手”
4月15日至21日是第29个全国肿瘤防治宣传周。近年来,与癌症相关的健康问题受到公众广泛关注。肺癌新发和死亡高居前列,何种情况需要警惕?国家癌症中心2022年发布数据显示,在我国406.4万人的新发癌症患者中,肺癌发病人数为82.8万,在241.4万因癌症死亡的人群中,有65.7万人罹患肺癌。无论是
VOCs防治技术之组合技术
1)沸石转轮+热力焚烧技术 2)沸石转轮+蓄热式燃烧 3)冷凝+吸附技术 4)吸附+蓄热催化燃烧技术 5)滤筒除尘+蓄热催化燃烧 6)吸附+高级氧化
VOCs防治技术之销毁技术
1)催化燃烧技术 原理:发生一系列的分解、聚合及自由基反应,通过氧化和热裂解、热分解,最终产物是水、二氧化碳等无毒无害物质。 适用范围:可应用于高浓度和低浓度的有机废气的处理。 优点:应用广泛、设备简单、投资少、操作方便、净化彻底。 缺点:设备成分和运行成本相对较高。 2)生物降解技术
VOCs防治技术之回收技术
1)吸附技术 原理:利用吸附剂与污染物质(VOCs)进行物理结合或化学反应并将污染成分去除。 适用范围:中低浓度的VOCs的净化。 优点:去除效率高,易于自动化控制。 缺点:不适用于高浓度、高温的有机废气,且吸附材料需定期更换。 2)吸收技术 原理:由废气和洗涤液接触将VOCs从废气
首个国产PD1免疫治疗儿童肿瘤临床数据出炉
中山大学肿瘤防治中心张翼鷟教授团队在 Signal Transduction and Targeted Therapy 期刊发表了题为:Safety and clinical efficacy of sintilimab (anti-PD-1) in pediatric patients wit
DNA测序技术的测序的规律
生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等,因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物,这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。在可以区分长度仅差一个核苷酸
测序技术及测序仪器的比较
自sanger测序技术发明以来,经人类基因组计划的促进,测序技术有了跨越式的发展,以实验方法与实验仪器的改进为标志,测序技术经历了三代的发展,同时测序技术向着高通量测序,单分子测序,低价格测序的方向发展,目前测序技术已成为分子生物学实验中的重要的实验手段。本文主要简单回溯了测序技术的发展历史,介绍了
测序技术临床应用持续火热--Illumina布局中国市场
【背景阅读】近年来,随着第二代测序技术的发明与推广,基因序列测序速度极大提升、成本大幅下降,使得基因组测序的大规模应用成为可能。作为新兴产业,其发展趋势极为迅猛。为规范测序应用于临床市场,2014年2月中国CFDA和卫计委联合联合出台了"叫停令"。此举对基因测序市场影响深刻,一方面暂时限制了测序
高通量测序技术——第二代测序技术
高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(de
加大仪器研发投入-精准医学实现“弯道超车”
我国属于出生缺陷高发国,出生缺陷总发生率达4%-6%,每年大约有80万-120万缺陷患儿出生,每年仅因神经管畸形造成的经济损失就达2亿元。 “精准医学的干预有望降低高危目标新生儿死亡率。如新生儿单基因疾病单例模式全外显子测序(singletonWES)作为一线分子检测技术,已经开始应用于新生儿
第二届P4-China2017大会
【精准医疗2.0时代】第二届P4 China 2017大会再现全新精彩! 聚中美精英,话世界“医”流 从2016年中国精准医疗计划实施至今,已近两年。我们越来越清地认识到未来通往精准医疗的核心,在于 “精准”二字。要想达到精准的目标1. 检测技术,极度依赖于以DNA测序为代表的体外
基因组测序助力肿瘤精密治疗
最近,约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的科学家,在对101例胰腺癌患者的血液和肿瘤进行基因组测序后发现,至少三分之一患者的肿瘤有基因突变,这些突变有朝一日可能帮助指导疾病的精密治疗。他们说,与标准的影像学检查方法相比,血液检测的结果,可以早半年预测到癌症的复发。 约翰斯霍普金斯大学医学院肿
2017年肿瘤防治宣传周在京启动
4月13日,由中国医学科学院肿瘤医院联合人民网共同主办的“我能·我们能·抗击癌症——2017年肿瘤防治宣传周启动会”在北京举行。 中国医学科学院肿瘤医院副院长王明荣,中国医学科学院肿瘤医院党委副书记付凤环,中国医学科学院肿瘤医院胸外科主任高树庚、结直肠外科主任王锡山、肝胆外科主任吴健雄、
郝希山:肿瘤防治中国仍有明显差距
9月2日,第十届中国医药企业家科学家投资家大会暨改革开放40年医药行业发展成就展继续火热进行。一场由中国医药生物技术协会理事长、中国科学院院士魏于全,中科院上海有机化学研究所原所长、中国科学院院士林国强,天津药物研究院名誉院长、中国工程院院士刘昌孝,天津市肿瘤研究所所长、中国工程院院士郝希山四位
为恶性肿瘤检测和防治建言献策
昨日获悉,2017首届“国际纳米孔技术检测应用(深圳)学术研讨会”在深圳市龙华区格兰云天国际酒店举办,会议为期两天。 据悉,此次会议邀请到了国际顶尖纳米技术科学家、美国俄亥俄州立大学RNA纳米生物和纳米医学中心主任郭培宣、中科院生物物理所研究员张先恩、俄亥俄州立大学药学院院长Henry J.M
专家:如何利用中医中药防治妇科肿瘤
中国中医科学院广安门医院妇科主任赵瑞华教授 专家简介: 赵瑞华,主任医师、教授、博士生导师。中国中医科学院广安门医院妇科主任,中国中医科学院学科带头人,北京市中医特色诊疗中心学术带头人。国家中医管理局“十二五”妇科重点专科和重点学科负责人,国家级第三批名老中医李光荣教授学
湖南基本形成省市县肿瘤防治体系
4月15日,由湖南省卫生健康委健康教育宣传中心主办的全国肿瘤防治宣传周现场宣传活动在长沙市雨花区举行。 湖南省卫生健康委党组成员、副主任陶学永在现场表示,目前湖南省14个市州及部分县区完成了癌症防治中心建设,省-市-县肿瘤防治体系基本形成,肿瘤防治工作取得明显成效。 陶学永强调,癌症防治事关
新版《中国肿瘤治疗相关呕吐防治指南》发布
化疗带来的恶心、呕吐,令很多恶性肿瘤患者对继续治疗望而却步。中国抗癌协会癌症康复与姑息治疗专业委员会日前在京发布的2014年版《中国肿瘤治疗相关呕吐防治指南》,对此提出预防为主的治疗原则,推荐把“三联方案”——阿瑞匹坦、5-HT3受体拮抗剂、联用地塞米松作为化疗止吐的一线治疗方案。
一周资讯回顾:他用DNA测序技术,让百年肿瘤“变废为宝”
国内资讯 重磅!《“十三五”生物技术创新专项规划》发布,基因测序、免疫疗法、AI等“被点名” 5月10日,据科技部官网消息,按照《中华人民共和国国民经济和社会发展第十三个五年规划纲要》、《国家创新驱动发展战略纲要》、《“十三五”国家科技创新规划》等的总体部署,为加快推进生物技术与生物技术产业
最具潜力的液体活检技术,ctDNA-甲基化测序助力肿瘤筛查
癌症对每个人和家庭来说都是一场灾难,对国家来说是一笔极大的公共卫生项目支出,根据2019年国家癌症中心发布的中国恶性肿瘤流行情况分析报告显示,随着恶性肿瘤发病数持续上升,我国每年所需的相关医疗花费超过2200亿元。面对这一现状,唯有进行肿瘤早筛,在肿瘤发生发展的源头,将其扼杀,才能逆转这个局面。肿瘤
第二代测序技术(NGS)推动个性化肿瘤学发展
目前,肿瘤学已经上升到基因组分析的前沿,它可以被用于识别驱动突变和其他标记, 临床医生也可以借此设计疗法,监测病人的反应,而突变和标记可以通过NGS技术(第二代测序技术,一个生成gigabases数据的大规模平行测序技术)显现出来。 何为NGS?它面临着哪些问题? NGS已经成为一个研究平台
测序牛人发布蛋白单分子测序技术
人类生命的蓝图是三十亿碱基对组成的人类基因组。而DNA编码的蛋白质是几乎所有生命过程的主要执行者。 现在,美国亚利桑纳州立大学Biodesign研究所的Stuart Lindsay及其同事,在纳米孔DNA测序技术的基础上,开发了能够精确鉴定氨基酸的蛋白单分子测序技术。这一技术不仅可以用
DNA测序技术的测序反应的介绍
1. 对于每组测序反应,标记四个0.5ml eppendorf管(G、A、T、C)。每管加入2ml适当的d/ddNTP混合物(d/ddNTP Mix)。各加入1滴(约20ml)矿物油,盖上盖子保存于冰上或4℃备用。 2. 对于每组四个测序反应,在一个eppendorf管中混合以下试剂: (1
DNA测序技术自动测序法介绍
自动测序法基因分析仪(即DNA测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法),因此通过单引物PCR测序反应,生成的PCR产物则是相差1个碱基的3'末端为4种不同荧光染料的单链DNA混合物,使得四种荧光染料的测序PCR产物
DNA测序技术的技术原理
化学修饰法测序原理化学试剂处理末段DNA片段,造成碱基的特异性切割,产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物,经凝胶电泳分离。化学切割反应:包括碱基的修饰,修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。Sanger法测序的原理就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物
基因测序技术原理
基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。[2] 自上世纪90年代初,学界开始涉足“人类基因组计划”。而传统的测序方式是利用光学测序技术。用不同颜色的荧光标记四种不同的碱基,然后用激光光源去捕捉荧光信号从而获得待测基因的序列信息。[2] 虽然这种方法检测可靠,但是价格不菲也是有目共睹的,一台仪