中大绘出广东食管鳞状细胞癌遗传变异图谱
由中山大学肿瘤防治中心贾卫华教授领衔，中山大学、美国NIH等多家机构的科研人员组成的国际合作团队，基于新一代测序技术、基因的表达谱分析、体内外实验以及大量临床数据，对食管鳞状细胞癌的全基因组变异进行了历时五年的研究，绘制出广东食管鳞状细胞遗传变异图谱。 广东是食管癌高发大省，人群具有独特的遗传背景及生活习惯。从全基因组水平，全面、系统揭示广东食管鳞癌特有的体细胞遗传变异图谱，进而发现影响预后及靶向治疗的遗传变异，无疑对解析食管癌的发病机理、推动临床治疗方法的研究具有极大价值。由贾卫华教授领衔的该项研究系统地揭示了广东食管鳞癌的癌症基因组学特征，尤其是发现了一系列新的影响癌症转归和生存的基因突变（如VANGL1）、基因异常表达（如miR-4707-5p）和特征性的染色体结构变异，并进行了深入的体内外实验研究和癌症信号通路研究。贾卫华教授团队通过对67个广东食管鳞癌患者的肿瘤及癌旁正常组织进行全基因组或外显子组测序发现，同中国......阅读全文
第二代测序技术（NGS）推动个性化肿瘤学发展
目前，肿瘤学已经上升到基因组分析的前沿，它可以被用于识别驱动突变和其他标记， 临床医生也可以借此设计疗法，监测病人的反应，而突变和标记可以通过NGS技术（第二代测序技术，一个生成gigabases数据的大规模平行测序技术）显现出来。 何为NGS？它面临着哪些问题？ NGS已经成为一个研究平台
湖南基本形成省市县肿瘤防治体系
4月15日，由湖南省卫生健康委健康教育宣传中心主办的全国肿瘤防治宣传周现场宣传活动在长沙市雨花区举行。 湖南省卫生健康委党组成员、副主任陶学永在现场表示，目前湖南省14个市州及部分县区完成了癌症防治中心建设，省-市-县肿瘤防治体系基本形成，肿瘤防治工作取得明显成效。 陶学永强调，癌症防治事关
郝希山：肿瘤防治中国仍有明显差距
9月2日，第十届中国医药企业家科学家投资家大会暨改革开放40年医药行业发展成就展继续火热进行。一场由中国医药生物技术协会理事长、中国科学院院士魏于全，中科院上海有机化学研究所原所长、中国科学院院士林国强，天津药物研究院名誉院长、中国工程院院士刘昌孝，天津市肿瘤研究所所长、中国工程院院士郝希山四位
为恶性肿瘤检测和防治建言献策
昨日获悉，2017首届“国际纳米孔技术检测应用（深圳）学术研讨会”在深圳市龙华区格兰云天国际酒店举办，会议为期两天。 据悉，此次会议邀请到了国际顶尖纳米技术科学家、美国俄亥俄州立大学RNA纳米生物和纳米医学中心主任郭培宣、中科院生物物理所研究员张先恩、俄亥俄州立大学药学院院长Henry J.M
专家：如何利用中医中药防治妇科肿瘤
中国中医科学院广安门医院妇科主任赵瑞华教授 专家简介： 赵瑞华，主任医师、教授、博士生导师。中国中医科学院广安门医院妇科主任，中国中医科学院学科带头人，北京市中医特色诊疗中心学术带头人。国家中医管理局“十二五”妇科重点专科和重点学科负责人，国家级第三批名老中医李光荣教授学
2017年肿瘤防治宣传周在京启动
4月13日，由中国医学科学院肿瘤医院联合人民网共同主办的“我能·我们能·抗击癌症——2017年肿瘤防治宣传周启动会”在北京举行。 中国医学科学院肿瘤医院副院长王明荣，中国医学科学院肿瘤医院党委副书记付凤环，中国医学科学院肿瘤医院胸外科主任高树庚、结直肠外科主任王锡山、肝胆外科主任吴健雄、内科副
新版《中国肿瘤治疗相关呕吐防治指南》发布
化疗带来的恶心、呕吐，令很多恶性肿瘤患者对继续治疗望而却步。中国抗癌协会癌症康复与姑息治疗专业委员会日前在京发布的2014年版《中国肿瘤治疗相关呕吐防治指南》，对此提出预防为主的治疗原则，推荐把“三联方案”——阿瑞匹坦、5-HT3受体拮抗剂、联用地塞米松作为化疗止吐的一线治疗方案。
基因组测序助力肿瘤精密治疗
最近，约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的科学家，在对101例胰腺癌患者的血液和肿瘤进行基因组测序后发现，至少三分之一患者的肿瘤有基因突变，这些突变有朝一日可能帮助指导疾病的精密治疗。他们说，与标准的影像学检查方法相比，血液检测的结果，可以早半年预测到癌症的复发。 约翰斯霍普金斯大学医学院肿
单细胞测序技术在－Immune－Cell－Atlas－数据集中的作用是什么？
单细胞测序技术在 Immune Cell Atlas 数据集中起到了关键作用，包括以下几个方面： 1. 揭示细胞异质性：能够检测到单个免疫细胞之间基因表达的细微差异，从而发现不同的免疫细胞亚型和细胞状态，这对于全面了解免疫系统的复杂性至关重要。 2. 精准定义细胞类型：通过分析单个细胞的基因表达
推荐一些解读时空分辨单细胞测序技术数据的资源
有助于解读时空分辨单细胞测序技术数据的资源：在线课程和教程Coursera 上的生物信息学相关课程。EdX 上关于单细胞分析和测序数据解读的课程。学术论坛和社区Biostars：一个活跃的生物信息学交流论坛，研究人员可以在这里提问和分享经验。ResearchGate：科学家交流平台，能找到关于单细胞
测序牛人发布蛋白单分子测序技术
人类生命的蓝图是三十亿碱基对组成的人类基因组。而DNA编码的蛋白质是几乎所有生命过程的主要执行者。 现在，美国亚利桑纳州立大学Biodesign研究所的Stuart Lindsay及其同事，在纳米孔DNA测序技术的基础上，开发了能够精确鉴定氨基酸的蛋白单分子测序技术。这一技术不仅可以用
DNA测序技术的测序反应的介绍
1. 对于每组测序反应，标记四个0.5ml eppendorf管(G、A、T、C)。每管加入2ml适当的d/ddNTP混合物(d/ddNTP Mix)。各加入1滴(约20ml)矿物油，盖上盖子保存于冰上或4℃备用。 2. 对于每组四个测序反应,在一个eppendorf管中混合以下试剂： （1
DNA测序技术自动测序法介绍
自动测序法基因分析仪(即DNA测序仪)，采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳，应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法)，因此通过单引物PCR测序反应，生成的PCR产物则是相差1个碱基的3'末端为4种不同荧光染料的单链DNA混合物，使得四种荧光染料的测序PCR产物
单细胞测序基准数据集如何选择？
选择单细胞测序基准数据集时，可以考虑以下几个关键因素： 1. 研究目的和问题 - 明确您的具体研究目标，例如是关注特定细胞类型的分类、细胞发育轨迹分析还是差异表达基因检测等，选择与研究问题相关的数据集。 2. 细胞类型和组织 - 确保数据集包含您感兴趣的细胞类型和组织来源。如果您
单细胞测序基准数据集的概念
单细胞测序基准数据集是一组经过精心挑选和整理、具有高质量和代表性的单细胞测序数据集合。这些基准数据集通常具有以下特点和作用：特点：高质量：数据经过严格的质量控制和处理，具有低噪声、高准确性和完整性。多样性：涵盖多种细胞类型、组织、疾病状态、实验条件等，以全面反映单细胞测序的各种情况。详细标注：对细胞
DNA测序技术的技术原理
化学修饰法测序原理化学试剂处理末段DNA片段，造成碱基的特异性切割，产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物，经凝胶电泳分离。化学切割反应：包括碱基的修饰，修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。Sanger法测序的原理就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物
加大仪器研发投入－精准医学实现“弯道超车”
我国属于出生缺陷高发国，出生缺陷总发生率达4%-6%，每年大约有80万-120万缺陷患儿出生，每年仅因神经管畸形造成的经济损失就达2亿元。 “精准医学的干预有望降低高危目标新生儿死亡率。如新生儿单基因疾病单例模式全外显子测序(singletonWES)作为一线分子检测技术，已经开始应用于新生儿
基因测序技术原理
基因测序技术能锁定个人病变基因，提前预防和治疗。 自上世纪90年代初，学界开始涉足“人类基因组计划”。而传统的测序方式是利用光学测序技术。用不同颜色的荧光标记四种不同的碱基，然后用激光光源去捕捉荧光信号从而获得待测基因的序列信息。 虽然这种方法检测可靠，但是价格不菲也是有目共睹的，一台仪器的
DNA测序技术综述
1977年，Sanger团队完成人类历史上第一个基因组序列噬菌体X174测序，并在3年后，成为“两度”获得诺贝尔化学奖的人（前一次是1958年）。Sanger测序技术诞生，让DNA片段的测序成为现实，此后这一技术独领风骚20多年。再后来的20年里，二代测序走向成熟、三代测序崭露头角，DNA测序技术以
双RNA测序技术
在发表于《自然》（Nature）杂志上的一篇研究论文中， 由来自德国、奥地利和美国的研究人员组成的一个研究小组发现，采用一种允许在感染过程中同时研究细菌与宿主小RNA的新技术，可以揭示出两者转录谱的改变。该研究小组描绘了他们的技术、该技术如何更多地帮助了解细菌感染机制，以及在研究中获得的重要发现
基因测序技术展望
DNA测序技术从最开始的简单检测逐渐演变到今天的高通量测序，在过去的30年里，数据生成呈指数增长，而过去10年里，由于高通量测序，数据产生量呈超指数增长。并且，基因测序产生的数据已经在基础生物学等诸多领域产生了革命性的影响，应用范围渗透到考古学、刑事调查和产前诊断等多个行业。那么，未来基因测序会取得
关注前沿测序技术
而在蛋白质测序方面，《The Scientists》杂志回顾了一下研究进展，文中提到，上个世纪70年代的生化学家在钻研细胞信号传递、循环和粘附的蛋白化学特征时遇到两个难题：高精度纯化蛋白和提纯低分子量蛋白。 比如，在人类破译干扰素结构之前的20多年中，很难对其进行纯化；血管紧缩素II（angi
基因测序技术（一）
什么是基因测序 基因组携带了个体的全部遗传信息，基因测序能够加深对疾病尤其是恶性肿瘤的分子机制理解，在诊断与治疗方面都发挥着重要作用。从1953年沃森和克里克发现DNA分子双螺旋结构到2001年首个人类基因组图谱的绘制完成，越来越多的人们意识到基因测序在生物医学中的重要作用。 所谓基因测
高通量测序技术
没有测序的癌症诊断是不完整的，完整的癌症诊断应该包括一系列基于细胞遗传学技术、荧光原位杂交技术、标准分子技术以及NGS的预后与预测性分析。对于早期癌症患者来说，NGS序列分析在多种癌症的筛查技术中具有不容忽视的代表性;而对于晚期癌症患者，大量的侵入性测试往往只能筛查出少数几个药物靶点。 随
纳米孔测序技术
测序长度和准确率的快速提升使得纳米孔测序有望颠覆DNA测序市场。纽约威尔康奈尔医学院的计算生物学家Christopher Mason喜欢在会议上表演一个“绝活”：他和同事先从志愿者手机上收集DNA样本，然后就能在一个小时内现场进行谱系分析，甚至叙述志愿者一天的生活细节。“我们能从留在手机上的DNA信
基因测序技术原理
基因测序技术能锁定个人病变基因，提前预防和治疗。[2] 自上世纪90年代初，学界开始涉足“人类基因组计划”。而传统的测序方式是利用光学测序技术。用不同颜色的荧光标记四种不同的碱基，然后用激光光源去捕捉荧光信号从而获得待测基因的序列信息。[2] 虽然这种方法检测可靠，但是价格不菲也是有目共睹的，一台仪
第二届P4－China2017大会
【精准医疗2.0时代】第二届P4 China 2017大会再现全新精彩！ 聚中美精英，话世界“医”流 从2016年中国精准医疗计划实施至今，已近两年。我们越来越清地认识到未来通往精准医疗的核心，在于 “精准”二字。要想达到精准的目标1. 检测技术，极度依赖于以DNA测序为代表的体外诊断技术的
不同二代测序平台用于临床肿瘤样本体细胞突变检测的...
使用二代测序技术检测肿瘤组织FFPE样品中的DNA体细胞突变用于临床分子诊断存在的问题是，DNA质量和数量的变异较大，以及检测到的低频突变难以用二代测序以外的其他技术予以验证。以下实验测评了MiSeq和Ion Proton两个平台检测体细胞突变的表现，分别选用了 TruSeq Amplicon
Predica与华大智造携手开启肿瘤精准医疗新纪元：高通量测序平台赋能靶向RNA测序技术
7月11日，肿瘤诊断领域的领先创新者Predica Diagnostics与华大智造宣布达成合作，共同在华大智造高通量测序平台上开发Predica的靶向RNA测序技术，助力精准医疗。 此次合作旨在通过实现早期癌症检测和促进个性化靶向治疗策略，通过将Predica Diagnostics的先进测
二代测序技术在临床诊疗中的应用（一）
Sanger测序在过去的二十年间是基因组研究的主流方法，取得了包括人类基因组计划(human genome project, HGP)等一系列重大成就，这使得单基因遗传病的鉴定和靶向治疗成为可能1,2。随着基因组大数据时代的到来，尽管Sanger测序是基因检测的金标准，但是NGS）技术应运而