基因组所小内含子进化机制研究获得新进展
插入删除数目和比值 近日，在中国科学院北京基因组研究所副所长、中国科学院基因组科学与信息重点实验室主任于军研究员的指导下，该重点实验室博士生王大鹏通过对人类千人基因组计划数据的比较分析，进一步证实了两种DNA组分特殊效应在人类基因组中的存在，使该研究组延续十几年的小内含子基本功能和进化机制研究获新进展。相关学术论文在PLoS ONE杂志发表，并且被GenomeWeb网站推荐为“每日精选”。 内含子是真核基因组的重要和必需组成部分，并且它在mRNA的加工、选择性剪接和核外运输等过程中发挥着精确且复杂的作用。在基因组进化研究中，尽管内含子并没有像编码区域一样受到足够的重视，但越来越多证据表明内含子和它们的序列受到潜在功能相关的自然选择作用。 此次博士生王大鹏等的发现：出现在长度范围为88-124nt上的小内含子的删除/插入比值要高于50-86nt；另外，出现在GC含量（鸟嘌呤和胞嘧啶所占的比例）小于65%的小内......阅读全文
线粒体DNA的基本性质
与核基因组相比，线粒体基因组有如下性质：所有的基因都位于一个单一的环状DNA分子上。遗传物质不为核膜所包被。DNA不为蛋白质所压缩。基因组没有包含那么多非编码区域（调控区域或“内含子”）。一些密码子与通用密码子不同。相反，与一些紫色非硫细菌相似。一些碱基为两个不同基因的一部分（重叠基因）：某碱基作为
细胞化学基础线粒体DNA基本性质
与核基因组相比，线粒体基因组有如下性质：所有的基因都位于一个单一的环状DNA分子上。遗传物质不为核膜所包被。DNA不为蛋白质所压缩。基因组没有包含那么多非编码区域（调控区域或“内含子”）。一些密码子与通用密码子不同。相反，与一些紫色非硫细菌相似。一些碱基为两个不同基因的一部分（重叠基因）：某碱基作为
线粒体DNA的基本性质
与核基因组相比，线粒体基因组有如下性质：所有的基因都位于一个单一的环状DNA分子上。遗传物质不为核膜所包被。DNA不为蛋白质所压缩。基因组没有包含那么多非编码区域（调控区域或“内含子”）。一些密码子与通用密码子不同。相反，与一些紫色非硫细菌相似。一些碱基为两个不同基因的一部分（重叠基因）：某碱基作为
线粒体基因组的基本性质
与核基因组相比，线粒体基因组有如下性质：所有的基因都位于一个单一的环状DNA分子上。遗传物质不为核膜所包被。DNA不为蛋白质所压缩。基因组没有包含那么多非编码区域（调控区域或“内含子”）。一些密码子与通用密码子不同。相反，与一些紫色非硫细菌相似。一些碱基为两个不同基因的一部分（重叠基因）：某碱基作为
谁在先？“鸡基因组”和“鸡蛋基因组”
是先有鸡还是先有鸡蛋？这个问题相当恼人，恐怕很难说清楚。现在，研究人员回答了与这个问题一样恼人的问题：是人类基因组中的成千上万的长重复DNA片段中，那个是第一个产生的？那些被复制了？ 这个答案发表在10月7日的《自然·遗传学》杂志上。该研究给出了人类基因组中DNA重复片段复制的第一个进化证据，这种
科学家揭示“中国松”的基因密码
油松基因组扩张的“单程票”和特异的演化风景 北京林业大学供图 内蒙古黑里河油松林 贾黎明摄 钮世辉(左)与研究生正在做实验 北京林业大学供图 “松柏本孤直，难为桃李颜。”“大雪压青松，青松挺且直。”古往今来，人们不乏对松树高直品格的赞美。 作为我国特有的乡土针叶树种，油松的生
线粒体DNA的基本性质介绍
与核基因组相比，线粒体基因组有如下性质： 1、所有的基因都位于一个单一的环状DNA分子上。 2、遗传物质不为核膜所包被。 3、DNA不为蛋白质所压缩。 4、基因组没有包含那么多非编码区域（调控区域或“内含子”）。 5、一些密码子与通用密码子不同。相反，与一些紫色非硫细菌相似。 6、一
关于外显子的表达序列介绍
在反式剪接中,不同mRNA的外显子可以被接合在一起。外显子在剪接（Splicing）后仍会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。术语外显子也指编码相应RNA外
真核基因组的概念介绍
真核生物的基因组一般比较庞大，例如人的单倍体基因组由3×106 bp碱基组成，按1000个碱基编码一种蛋白质计，理论上可有300万个基因。但实际上，人细胞中所含基因总数大概会超过10万个。这就说明在人细胞基因组中有许多DNA序列并不转录成mRNA用于指导蛋白质的合成。DNA的复性动力学研究发现这
比较原核生物和真核生物基因组的结构特征
异：1、原核生物基因组很小，一般只有一条染色体；而真核生物基因组结构庞大。2、原核dna分子的绝大部分是用来编码蛋白质的，只有非常小的一部分不转录，这与真核dna的冗余现象不同。3、原核生物dna序列中功能相关的rna和蛋白质基因，往往丛集在基因组的一个或几个特定部位，形成功能单位或转录单位，它们可
真核生物基因组1
真核生物的基因组比较庞大，并且不同生物种间差异很大，例如人的单倍体基因组由3.16×109 bp组成。在人细胞的整个基因组中实际上只有很少一部份（约占2%~3％）的DNA序列用以编码蛋白质。 第一节 真核生物基因组特点 真核生物体细胞内的基因组分细胞核基因组与细胞质基因组，细胞核基因
染色体级别的银杏参考基因组公开
银杏果实 曹福亮供图 作为裸子植物银杏纲唯一的孑遗物种，银杏不仅具有特殊的科学研究价值，而且具有重要的应用价值。 近日，南京林业大学联合中国农业科学院农业基因组研究所在《自然—植物》在线发表了染色体级别的银杏参考基因组，是目前已发表的组装质量最高的裸子植物参考基因组。 论文共同通讯作者、中国工
基因组测序
如果楼主指的是人类基因组计划，那时用的方法叫做双脱氧终止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中，DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸）来作为原料，但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的，但与普通PCR不同，它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的
叶绿体基因组
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能的重要细胞器，叶绿体中进行的光合作用是严格地受到遗传控制的。早在20世纪初，人们就已知叶绿体的某些性状是呈非孟德尔式遗传的，但直到60年代才发现了叶绿体DNA(chloroplast DNA，ctDNA)。叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子，其大小在1
互补DNA的基本信息
cDNA 是指互补(有时称拷贝)DNA。特指在体外经过逆转录后与RNA互补的DNA链。与平常我们所称谓的基因组DNA不同，cDNA没有内含子而只有外显子的序列。真核生物的mRNA或其他RNA的cDNA，在遗传工程方面广为应用。
关于互补DNA的基本介绍
cDNA 是指互补(有时称拷贝)DNA。特指在体外经过逆转录后与RNA互补的DNA链。与平常我们所称谓的基因组DNA不同,cDNA没有内含子而只有外显子的序列 。真核生物的mRNA或其他RNA的cDNA,在遗传工程方面广为应用。
互补DNA的定义
cDNA是指互补（有时称拷贝）DNA。特指在体外经过逆转录后与RNA互补的DNA链。与平常我们所称谓的基因组DNA不同，cDNA没有内含子而只有外显子的序列。真核生物的mRNA或其他RNA的cDNA，在遗传工程方面广为应用。
互补DNA的概念
cDNA是指互补(有时称拷贝)DNA。特指在体外经过逆转录后与RNA互补的DNA链。与平常我们所称谓的基因组DNA不同，cDNA没有内含子而只有外显子的序列 。真核生物的mRNA或其他RNA的cDNA，在遗传工程方面广为应用。
Nature惊人发现：RNA，修复损伤的模板
能够准确地修复自发的错误、氧化或诱变剂导致的DNA损伤对于细胞生存至关重要。这种修复通常是利用完全相同或同源的完整DNA序列来实现。但科学家们现在证实，在一种常见芽殖酵母细胞内RNA可充当模板用来修复破坏性最大的DNA损伤——DNA双链断裂。 尽管较早的研究表明了将RNA寡核苷酸导入到细胞中可
Science：科学家成功解析人类剪接体关键结构
看看任何一个真核细胞基因组内的蛋白编码基因，不管是动物，植物，真菌还是原生生物，我们都会发现由于内含子的存在，编码基因被隔断成几个片段。当一个基因发生转录，这些内含子会在蛋白质合成之前从mRNA前体中被移除，虽然关于这些内含子的移除过程已经得到了几十年的深入研究，但是在一些三维动态结构研究技术出
《自然》：年轻蛋白质让核糖核酸展现活力
据美国物理学家组织网10月14日（北京时间）报道，耶鲁大学和韦恩州立大学的科学研究显示，一种复杂的RNA（核糖核酸）与蛋白质共同作用，在蛋白质的帮助下能经过整形，重新塑造成合适的形状。这些存在已久的古老RNA通过不断进化，在年轻的蛋白质中寻找合适的搭档，辅助自己完成功能使命。这项
年轻蛋白质让核糖核酸展现活力
据美国物理学家组织网10月14日（北京时间）报道，耶鲁大学和韦恩州立大学的科学研究显示，一种复杂的RNA（核糖核酸）与蛋白质共同作用，在蛋白质的帮助下能经过整形，重新塑造成合适的形状。这些存在已久的古老RNA通过不断进化，在年轻的蛋白质中寻找合适的搭档，辅助自己完成功能使命。这项研
基因数据分析的主流软件
在过去的几年中，许多生物的基因组完成了测序工作，如何对如此庞大的原始序列信息进行分析和应用，正是现在最为棘手的问题。大量的基因预测软件和在线工具应运而生。如何广泛而深入地了解并能有的放矢地利用这些工具，已经成为21世纪分子生物学家的必修课。随着大规模EST和cDNA序列信息的获取，那些基于表达序列同
基因组的分类
病毒基因组病毒基因组可以由RNA或DNA组成。 RNA病毒的基因组包含单链或双链RNA，也包含一种或多种单独的RNA分子。 DNA病毒基因组可以是单链或双链DNA。大多数DNA病毒基因组由单个线性DNA分子组成，但有些由DNA病毒基因组由环状DNA分子组成 。原核基因组原核生物和真核生物基因组由D
GenomeResearch发表基因组研究新发现基因组
多伦多大学的科学家们发现，作为基因组看门人的C2H2-锌指蛋白（C2H2-ZF）实际上肩负着更加多样化的职责。这项发表在Genome Research杂志上的研究，有助于我们更准确地解读个人基因组。C2H2-ZF有大约七百个成员，是规模最大的一种人类蛋白。然而，人们对这些蛋白一直知之甚少。C2H2-
全基因组的比较基因组杂交技术介绍
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
核酸扩增引物设计的要求
1、避免重复碱基，尤其是G。 2、引物退火温度Tm控制在58～60℃。 3、G+C为30%～80%。 4、3'端最后5个碱基内不能有多于2个的G或C。 5、正向引物与探针离得越近越好，但不能重叠。 6、扩增产物长度不能太大，一般在80～250 bp，80～150bp最为合适。
关于叶绿体基因组的基本特点的介绍
叶绿体基因组在很多方面与线粒体基因组的结构是相似的。叶绿体DNA（cpDNA）是双链环状，缺乏组蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量与核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度离心来分离cpDNA。 每个叶绿体中cpDNA的拷贝数随着物种的不同而不同。但都是多拷贝的。这些拷贝
叶绿体基因组－－cpDNA的相关介绍
叶绿体基因组在很多方面与线粒体基因组的结构是相似的。叶绿体DNA（cpDNA）是双链环状，缺乏组蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量与核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度离心来分离cpDNA。 每个叶绿体中cpDNA的拷贝数随着物种的不同而不同。但都是多拷贝的。这些拷贝
细胞化学基础叶绿体基因组－－cpDNA
叶绿体基因组在很多方面与线粒体基因组的结构是相似的。叶绿体DNA（cpDNA）是双链环状，缺乏组蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量与核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度离心来分离cpDNA。每个叶绿体中cpDNA的拷贝数随着物种的不同而不同。但都是多拷贝的。这些拷贝位于类核