两篇Nature遗传：迄今为止最古老的植物基因组
最近，一个国际研究小组首次成功地对铜器时代的大麦基因组进行了测序。这是迄今重建的最古老的植物基因组。这些6000年前的种子是从以色列Judean沙漠Masada要塞南崖靠近死海的Yaram洞穴获得的。从遗传学来说，史前大麦非常类似于目前种植在Levant南部的大麦，从而支持目前“大麦驯化发生在Upper约旦河谷”的假设。点击阅读更多植物起源的研究：中外学者发现种植水稻新起源；基因组测序揭开枣椰树起源谜题；PNAS论文提出葫芦起源新假说。 这个研究团队的成员来自于德国Leibniz植物遗传和作物研究所（IPK）；以色列希伯来大学、巴伊兰大学；耶拿马克斯普朗克类历史研究所；以色列海法大学；英国James Hutton学院，加利福尼亚大学圣克鲁斯分校；美国明尼苏达大学圣保罗分校和德国Tü宾根大学。 所分析的大麦颗粒，连同成千上万种其他植物残体，是在耶路撒冷希伯来大学考古学院Uri Davidovich和Zinman考古研究所、......阅读全文
现存最原始种子植物苏铁基因组发布
近日，科学家完成苏铁基因组解析工作，发布苏铁完整基因组图谱，这意味着种子植物基因组演化研究中的最后一块拼图已顺利完成。4月18日，《自然-植物》（Nature Plants）以封面文章发表该研究成果。据悉，该研究成果数据公开共享，全球科学家可免费下载使用。苏铁是地球上现存最古老的种子植物，是著名的“
植物组织制备基因组DNA实验——CTAB法
实验方法原理加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中， 可用玻棒将其取出，而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部， 从而达到提取的目的。实验材料植物组织试剂、试剂盒CTAB液2-疏基乙醇TE高盐TE氯仿异戊醇仪器、耗材研钵离心机培养箱实验步骤1. 在所需量
多个秋海棠属植物基因组被破译
秋海棠属植物叶型与叶斑的多样性 仙湖植物园供图近日，由深圳市仙湖植物园与深圳华大生命科学研究院牵头完成的秋海棠属植物基因组研究成果在植物学领域国际权威刊物《新植物学家》（New Phytologist）正式发表。最新发布的研究成果中，研究团队完成了桑寄生状秋海棠、铁十字秋海棠、黑武士秋海棠、和
买麻藤类植物全基因组破译
近日，由深圳市中国科学院仙湖植物园，中科院中-非联合研究中心、武汉植物园、植物研究所，英国皇家植物园邱园等10余家国内外知名院所联合开展的“裸子植物——买麻藤全基因组计划”取得重要进展。 裸子植物和被子植物的起源、分歧及演化，是现代植物学科的基础热点领域。现存35万余种种子植物被分成苏铁类、松
中国植物叶绿体基因组研究颠覆学界认知
中国科学家一项历时五年的研究成果颠覆了学界对植物叶绿体基因组的认知——科学家发现整个叶绿体基因组都是可以转录的。该研究成果已于近日发表在了《自然》出版集团的《科学报告》上。 《科学报告》的审稿专家一致认为,“这一成果首次发现了我们从来没有想象过的现象,颠覆了传统遗传学上认为的只有叶绿体编码基因
植物基因组总DNA的分离———SDS法
实验方法原理SDS(十二烷基磺酸钠)是一种强去污剂,可使细胞膜及核膜破裂,因此被用来分离DNA。该分离过程的第一步是用热的去污剂(SDS)进行抽提,然后将抽提物置于0℃并加入高摩尔浓度的乙酸钾,离心去除不溶物,以去除蛋白和多糖类杂质。实验材料植物新鲜叶片试剂、试剂盒液氮提取缓冲液(用前加入)20%S
植物基因组总DNA的分离———SDS法
实验方法原理 SDS(十二烷基磺酸钠)是一种强去污剂,可使细胞膜及核膜破裂,因此被用来分离DNA。该分离过程的第一步是用热的去污剂(SDS)进行抽提,然后将抽提物置于0℃并加入高摩尔浓度的乙酸钾,离心去除不溶物,以去除蛋白和多糖类杂质。实验材料 植物新鲜叶片试剂、试剂盒 液氮提取缓冲液(用前加入)2
关于植物叶绿体基因组基因表达调控的研究的介绍
叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控，例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的，而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式
细胞化学基础植物叶绿体基因组基因表达调控的研究
叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控，例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的，而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转
基因组编辑调控植物内源基因翻译效率实验流程发布
上游开放阅读框uORF广泛存在于动植物基因的5’非翻译区，通常能够抑制下游主开放阅读框pORF的翻译。中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组率先利用CRISPR/Cas9技术对uORF进行编辑，发现能够显著提高目标基因的翻译效率，建立了利用基因组编辑调控内源基因蛋白质翻译效率的新方法，相关
基因组编辑调控植物内源基因翻译效率的实验流程
上游开放阅读框uORF广泛存在于动植物基因的5’非翻译区，通常能够抑制下游主开放阅读框pORF的翻译。中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组率先利用CRISPR/Cas9技术对uORF进行编辑，发现能够显着提高目标基因的翻译效率，建立了利用基因组编辑调控内源基因蛋白质翻译效率的新方法，相关成果
上海植物逆境中心建立植物基因组精确定点修饰技术
中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组近日通过模仿和改造微生物中的一种抵御外源侵染的防护机制，成功开发出一种能对植物基因组进行精确定点修饰的技术，从而使高效植物分子改良性状成为可能。这一适用于植物的CRISPR/Cas技术就像一把剪刀可以对基因组任意感兴趣的位置进行编辑，它的成功开发将革命
植物所发现植物细胞器基因组新的演化模式
质体和线粒体是内共生起源的细胞器，在高等植物中有不同的遗传特征，相较于动态复杂的线粒体基因组，质体基因组的结构和序列更保守。在基部维管植物石松类卷柏科植物中，这两种细胞器基因组表现出相似的特征，但是造成二者趋同演化的机制尚不清楚。 中国科学院植物研究所研究员张宪春研究组从事石松类和蕨类植物的
昆明植物所破译稻属植物5个物种全基因组
亚洲栽培稻（一般称为水稻）是世界上最重要的粮食作物之一，是中国第一大粮食作物，养活了80％以上的中国人口。在水稻与其它约23个物种共同组成的稻属植物中，它和7个稻种（普通野生稻、尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展颖野生稻、长雄蕊野生稻和南方野生稻）都是AA基因组类型，这些水稻近缘物种间断分
大麦6号染色体基因测序研究
2013年11月15日，成立于1875年的嘉士伯实验室和华大基因旗下子公司――深圳华大科技服务有限公司（简称“华大科技”）宣布，双方将联合开展大麦6号染色体基因组破译工作，旨在为培育大麦新品种提供具有价值的资源。 基因序列信息是开展快速及现代育种的核心，有助于挖掘有利遗传突变，加速农作物育种改
千种热带植物基因组计划启动
近日，第一届国际热带植物学术会议在海南三亚举行。会上启动的海南大学—贝纳基因等千种热带植物基因组计划与热带作物基因组与分子育种数据库联合平台计划，将进一步加强热带海量植物资源保护与利用基础研究，服务海南热带高效农业发展，同时为热带雨林植物数字化管理提供理论依据及全新方法。 据介绍，我国和全球热
如何使用离心机提取植物基因组DNA
如何使用离心机提取植物基因组DNA植物基因组DNA提取使用什么样的离心机做?具体步骤怎么样？植物组织提取基因组DNA 一、材料www.runwelltac.com 幼嫩叶子。 二、设备 移液器，冷冻高速离心机，台式高速离心机，水浴锅，陶瓷研钵，50ml离心管（有盖）及5ml和1.5ml离心管，
植物基因组提取试剂盒使用说明
试剂盒内容及保存： 试剂盒组成 RTG2404-01（50次） 贮存方式 缓冲液AP1 25 ml 室温 缓冲液AP2 10 ml 室温 缓冲液AP3(浓缩液
植物和哺乳动物线粒体基因组的差异
植物细胞植物细胞的线粒体基因组的大小差别很大，最小的为100kb左右，大部分由非编码的DNA序列组成，且有许多短的同源序列，同源序列之间的DNA重组会产生较小的亚基因组环状DNA，与完整的“主”基因组共存于细胞内，因此植物线粒体基因组的研究更为困难。哺乳动物哺乳动物的线粒体基因DNA没有内含子，几乎
植物线粒体基因组组装新工具研发成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494540.shtm近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所绿色轻简超级稻遗传解析与分子育种创新团队开发出一套新型植物线粒体基因组组装工具GSAT。该工具能够快速组装图形化植物线粒体基因组，更好地评估其泛
李家洋等提出植物基因组编辑监管框架
CRISPR/Cas9是靶向基因变化的一种新方法。与其他方法一起，构成了所谓的基因组编辑工具箱的一部分。目前，基因组编辑主要讨论的是医学应用，相继有使用基因组编辑治疗人类疾病的研究出现，例如：CRISPR基因编辑助力肺癌治疗；华人女学者用CRISPR技术改善遗传性失明；我科学家用CRISPR纠正
植物基因组DNA及总RNA提取技术1
幼嫩组织的细胞处于旺盛的分裂阶段，核较大而胞质较少，核酸浓度高，且内含物少、次生代谢产物少，蛋白质及多糖类物质相对较少，在SDS或 CTAB物质存在时，经机械研磨，使细胞破裂并释放出内含物，提取的DNA、RNA的产量高，纯度好。 提取DNA所用的提取液、吸头、离心管等需要高压灭菌以灭活DNase。R
植物基因组DNA的RFLP多态性分析
一、原理DNA多态性是指DNA碱基顺序的差异性。这种差异性不仅存在于不同的植物之间，也存在于同一种植物的不同个体之间。RFLP多态性是指DNA限制性内切酶酶切片段长度的多态性(restniction fragment length olymophorphism)。由于碱基顺序的差异，在不同的
昆明植物所等首次成功破译茶树基因组
茶是世界上最为古老也是最为广泛饮用的含咖啡因软饮料，目前全球160多个国家的30亿人喝茶爱茶。普遍认为，茶树起源于中国的云南、四川等地；作为传播中国文化的使者，在茶从中国起身向世界各地传播的数千年的漫长历程里，与全球100多个国家多元的文化邂逅交融，发展形成了地球上复杂而美妙的茶文化。除了因为迷
如何使用离心机提取植物基因组DNA
就那植物来说吧!原理是一致的.方法不同. 1植物组织提取基因组DNA 一、材料 幼嫩叶子. 二、设备 移液器,冷冻高速离心机,台式高速离心机,水浴锅,陶瓷研钵,50ml离心管（有盖）及5ml和1.5ml离心管,弯成钩状的小玻棒. 三、试剂 1、提取缓冲液Ⅰ：100mmol/L Tris·Cl,pH8
植物基因组DNA及总RNA提取技术2
（二）植物总RNA提取 （1）65°C水浴中预热15 mL CTAB提取液。 （2）液氮中研磨2～3 g新鲜或-70°C冷冻的材料。 （3）转移样品至有CTAB提取液的离心管中，立即激烈涡旋30s，短时放回 65°C水浴中（4～5 min）。 （4）加入等体积的氯仿/异戊醇并涡旋混合，10000 r
版纳植物园揭示壳斗科植物的基因组大小进化
物种的基因组大小是物种形成和多样化中最近处的性状。通过测定物种的基因组大小，有助于了解物种的染色体倍性和基因组进化，为全基因组测序提供基础数据，提高基因组多样性的生物信息学研究的效率。前人对植物基因组大小进化的研究多集中于温带草本类群，并且未与系统发育和地理分布相关联，对热带木本植物的基因组大小
基因组编辑调控植物内源基因翻译效率的实验流程公布
上游开放阅读框uORF广泛存在于动植物基因的5’非翻译区，通常能够抑制下游主开放阅读框pORF的翻译。中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组率先利用CRISPR/Cas9技术对uORF进行编辑，发现能够显着提高目标基因的翻译效率，建立了利用基因组编辑调控内源基因蛋白质翻译效率的新方法，相关
能源植物小桐子基因组中发现3个开花抑制基因
开花是高等植物由营养生长进入生殖生长的重要标志，受促进或抑制开花基因的双重调控。FT/TFL1基因家族在植物的成花过程中起着重要的作用，其中TFL1（TERMINAL FLOWER 1）类基因发挥着抑制开花的功能。 中国科学院西双版纳热带植物园能源植物分子育种研究组的博士研究生李超琼与科研人员
科学家发现决定大麦“睡”多久的基因
气候变化给现代农业带来了新的挑战。近日，中国科学院青藏高原研究所等研究团队，破解了大麦种子“睡”多久由什么决定的问题。种子休眠，是指种子在适宜发芽的条件下仍“按兵不动”，直到环境真正安全才“启动”发芽，这是农作物在驯化过程中被深刻改造的关键性状之一。然而，种子休眠是一把“双刃剑”，即休眠时间太短，成