两篇Nature遗传：迄今为止最古老的植物基因组
最近，一个国际研究小组首次成功地对铜器时代的大麦基因组进行了测序。这是迄今重建的最古老的植物基因组。这些6000年前的种子是从以色列Judean沙漠Masada要塞南崖靠近死海的Yaram洞穴获得的。从遗传学来说，史前大麦非常类似于目前种植在Levant南部的大麦，从而支持目前“大麦驯化发生在Upper约旦河谷”的假设。点击阅读更多植物起源的研究：中外学者发现种植水稻新起源；基因组测序揭开枣椰树起源谜题；PNAS论文提出葫芦起源新假说。 这个研究团队的成员来自于德国Leibniz植物遗传和作物研究所（IPK）；以色列希伯来大学、巴伊兰大学；耶拿马克斯普朗克类历史研究所；以色列海法大学；英国James Hutton学院，加利福尼亚大学圣克鲁斯分校；美国明尼苏达大学圣保罗分校和德国Tü宾根大学。 所分析的大麦颗粒，连同成千上万种其他植物残体，是在耶路撒冷希伯来大学考古学院Uri Davidovich和Zinman考古研究所、......阅读全文
昆明植物所解析列当科寄生植物基因组演化历史获进展
植物寄生习性的出现并非一蹴而就，自养植物演化而来的寄生植物，从起初仅从寄主获取一些水分和矿物营养作为补充的兼性半寄生植物，成为必须依赖寄主才能完成生活史的专性寄生植物，再逐渐演化到完全丢失光合作用能力的全寄生植物。被子植物中已知有12或13次独立起源的寄生植物支系，其中大部分支系中半寄生物种已灭绝
武汉植物园发现蕨类植物叶绿体基因组进化的过渡形态
目前已知的蕨类植物叶绿体基因组在组织结构上表现为两种基本类型：一是核心型，高等核心薄囊蕨类水龙骨目和树蕨目具此类型;另一是基部型，见于其他蕨类基部类群。与基部型相比，核心型叶绿体基因组的反向重复区和大单拷贝区的rpoB-psbZ区(BZ区)发生过复杂的基因组重排，同时它们还丢失了5个相同的tRN
植物叶绿体基因组可以全部转录的新机制
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能、供给地球上的其它生物能量来源的重要细胞器，对叶绿体的功能和叶绿体基因组转录机制的研究一直以来是全球细胞生物学家、遗传学家和分子生物学家孜孜以求的研究热点。中国科学院昆明植物研究所研究员高立志带领的研究团队，历时五年，通过对三种高等植物（水稻、玉米和拟南芥
植物基因组DNA提取、酶切及电泳分析
一、目的 掌握植物基因组DNA提取的一般方法及注意事项。大分子量DNA分子的酶切分析。 二、原理 十六烷基三乙基溴化胺是一种去污剂，可溶解细胞膜，它能与核酸形成复合物，在高盐溶液中（0.7mol/L NaCl）是可溶的，当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3 mol/L
科研人员建立植物基因组引导编辑技术体系
基因组编辑技术可以定向修饰植物基因组，从而大大加速植物育种的进程，是实现作物精准育种的重要技术突破。然而，作物的许多重要农艺性状是由基因组中的单个或少数核苷酸的改变或突变造成的。基于CRISPR/Cas系统的基因组编辑，可利用外源修复模板通过同源重组介导的修复方式（HDR）实现目标基因特定核苷酸
喀斯特植物基因组大小的进化模式研究获进展
基因组大小即物种单倍体的DNA含量，是一个物种基本的生物学特性，也是进化生物学领域的重要理论问题。物种基因组大小的进化包括适应性和非适应性等多种机制，但不同机制在基因组大小进化过程中的重要性却一直存在争议。 喀斯特地区是我国植物多样性和特有性的热点区域，迄今为止没有开展过该地区植物基因组大
一种植物会为其基因组主动“减肥”
据趣味科学网报道，美国布法罗大学的研究人员经过对一种食肉植物研究后发现，其基因组中不必要的成分被剥离了，这表明，对于正常健康的机体而言，垃圾DNA似乎真的不需要。相关论文发表在近期出版的《自然》杂志上。 科学家早就发现，组成基因组的绝大多数DNA并不编码蛋白质，也不发挥开关基因的功能。这些
科学家获得首个两型结实植物基因组
地上/下两型结实是被子植物中一类独特的结实方式。被子植物中13科24个属存在两型结实现象，两型豆为豆科两型豆属一年生缠绕草本植物，常生于海拔300~1800米的山坡，分布于中国东北、华北等地，在日本、北美亦有分布。其同一植株上能够产生3种类型的花，即地上开放花、地上闭锁花和地下闭锁花，能够分别在
植物基因组DNA提取、酶切及电泳分析
实验概要掌握植物基因组DNA提取的一般方法及注意事项。大分子量DNA分子的酶切分析。实验原理十六烷基三乙基溴化胺（CTAB）是一种去污剂，可溶解细胞膜，它能与核酸形成复合物，在高盐溶液中（0.7mol/L NaCl）是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3 mol/L NaCl)时,从溶液中
“千种动植物基因组计划”一期完成
记者近日从深圳华大基因研究院获悉，由该院发起的“千种动植物基因组计划”一期在重要物种基因组学研究领域和巨型基因组数据库构建上取得阶段性进展。 于2010年1月正式启动的“千种动植物基因组计划”（简称“千种”计划）预计在未来两年内将破译千种具有重要经济和科研价值的动植物物种基因
植物组织制备基因组DNA实验——氯化铯法
利用基因组DNA较长的特性，可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。在提取过程中，染色体会发生机械断裂，产生大小不同的片段，因此分离基因组DNA时应尽量在温和的条件下操作，如尽量减少酚/氯仿抽提、混匀过程要轻缓， 以保证得到较长的DNA。实验方法原理加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即
昆明植物所解析九倍体木本竹基因组
竹子即竹亚科是禾本科的重要分支，广泛分布于亚洲、非洲和拉丁美洲，约有1,700种。作为一类生长快、多年生、可再生的森林资源，木本竹子越来越多被用作木材的替代品，具有重要的经济价值和生态价值。有研究发现，木本竹子均为异源多倍体，具有长时间营养生长、一次性开花等独特的生物学习性。多倍体是植物尤其是竹子进
用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法（二）
2 结果与讨论2.1 PCR模板DNA的快速制备本方法是将少量植物叶片在TE溶液或去离子水中，经钨合金珠在离心管内的振荡破碎，直接获得DNA溶液。用多功能组织细胞研磨器（MTM-60）一次可操作60个样品。琼脂糖凝胶电泳表明，用TE和去离子水都可获得分子量较大的DNA片段（图1A）。用TE制备的DN
研究发现种子植物祖先曾发生全基因组加倍
中国科学院武汉植物园研究员石涛与比利时根特大学教授Yves Van de Peer合作完成的研究成果，1月2日在国际期刊Science Advances上发表。该研究围绕被子植物和种子植物祖先是否发生过全基因组加倍展开。 据介绍，被子植物是种子植物中最为繁盛的类群，其起源与演化长期以来是植物进
植物基因组DNA－快速提取（50－次）说明书
植物基因组DNA 快速提取（50 次）概述：本方法可用于植物细胞DNA 的快速提取，可提取107 细胞，其质量能够满足各种分子生物学要求。组成：1．溶液A 1.2ml RNase A 10mg/ml。-20℃保存2．溶液B 60ml3．溶液C 180ml4．溶液D 3ml Resin 用时充分混匀5
用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法（一）
一种用于PCR的植物基因组DNA快速制备方法 来源：方统科技----------------------------------------------------------------------------------摘要： 本文介绍了一种用于PCR的植物基因组DNA的快速制备方法。该方法
2018年基因组测序盘点——各种新鲜的植物
作为人类的主要食物，植物在我们的生活中扮演着重要角色。然而，由于植物基因组比较大，表现出多种倍性，还存在着大量的重复区域，故植物基因组的测序工作一直进展缓慢。 如今，得益于新型的测序技术，比如PacBio和Oxford Nanopore的长读长测序技术，许多植物在2018年收获了基因组，或者说
基因组与植物进化研讨会在上海辰山植物园召开
10月13日，The Symposium of Genomics and Plant Evolution （基因组与植物进化研讨会）在上海辰山植物园（中国科学院上海辰山植物科学研究中心）报告厅举行。会议旨在促进植物领域基因组学和系统进化研究的交流与合作，从而推动其进一步发展。来自全球25个科研机
昆明植物所山茶属代表植物比较叶绿体基因组学研究获进展
山茶属是山茶科中包含许多举世闻名经济植物的一个重要类群，包括为人类提供天然保健饮料的茶（Camellia sinensis var. assamica 和C. sinensis var. sinensis），健康型高级食用植物油的油茶（C. oleifera）以及观赏花卉云南山茶（C. reti
武汉植物园在裸子植物叶绿体基因组学研究方面获进展
篦子三尖杉(Cephalotaxus oliveri)是我国特有珍稀濒危植物，属裸子植物三尖杉科(Cephalotaxaceae)三尖杉属(Cephalotaxus)。它在三尖杉属中的地位特殊，形态、解剖、胚胎发育、孢粉、核型及分子系统学的研究均支持将其独立成篦子三尖杉组。 松杉类植物
荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合的转基因片段...
实验材料核苷酸 试剂、试剂盒冰水 8-羟基喹啉
荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合转基因片段实验
实验材料核苷酸试剂、试剂盒冰水8-羟基喹啉秋水仙素固定剂酶解缓冲液仪器、耗材载玻片玻璃盖玻片解剖针及镊子实验步骤原位杂交的基本操作方法（图 14 .2 ) 演化自 Southern 杂交：标底是玻片上的染色体和细胞核，探针是带标记的待测 DNA 序列 [ 本书中即是转基因和对照，图 14.3(a)
最新Nature完成四个基因组测序成果
高通量低成本测序技术令物种基因组测序研究一日千里，在最新公布的Nature杂志(11月29日)上，就接连公布了四种生物的基因组，它们分别是小麦和大麦，以及两种小型藻类：Bigelowellia natans 和Guillardia theta。 根据来自世界粮农组织的信息，小麦与大麦在
线粒体基因组的植物细胞和哺乳动物相关介绍
植物细胞 植物细胞的线粒体基因组的大小差别很大，最小的为100kb左右，大部分由非编码的DNA序列组成，且有许多短的同源序列，同源序列之间的DNA重组会产生较小的亚基因组环状DNA，与完整的“主”基因组共存于细胞内，因此植物线粒体基因组的研究更为困难。 哺乳动物 哺乳动物的线粒体基因DNA
全基因组测序揭示喀斯特植物适应性进化机制
中国南方喀斯特起源古老、分布广泛，被认为是生态与进化研究的“天然实验室”。中国科学院华南植物园研究员康明团队等完成了首个喀斯特植物怀集报春苣苔的全基因组测序。相关研究近日在线发表于《新植物学家》。 喀斯特植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部分，但迄今为止对喀斯特植物的多样性起源和适应性进
基因组学研究重建苔类植物演化历程获突破
深圳市仙湖植物园研究团队与合作者使用转录组数据，首次对苔类目级系统框架进行了重建，得到了高支持的系统发育树。相关研究9月8日在线发表于Annals of Botany。该论文第一作者为深圳市仙湖植物园董珊珊副研究员，通讯作者为刘阳研究员。深圳市仙湖植物园张力研究员，深圳华大生命科学研究院联合培养研究
利用植物表型组学挖掘基因组学的成果
到2050年，全球人口将达到97亿，预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标，作物产量需每年增长2.4%，但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素，但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。为了确保粮食安全、生态系统的可
研究揭示南岭山地特殊土壤生境植物基因组分化机制
南岭山地是我国植物多样性和特有性中心之一。该地区喀斯特地貌和丹霞地貌等特殊土壤生境丰富多样，较强的土壤、地质异质性孕育了南岭丰富的生物多样性，但关于该地区生物多样性起源和演化机制尚缺乏深入研究。 报春苣苔属（Primulina）是典型的特殊土壤生境植物类群，广泛分布于我国南方喀斯特和丹霞地貌，
海南大学团队定义植物基因组学“终极参考图谱”
近日，记者从海南大学获悉，该校三亚南繁研究院陈飞教授团队首次构建了“分型端粒到端粒超级泛基因组”理论体系，实现了植物基因组从个体单倍型完整到群体遗传多样性全覆盖的技术跨越。相关成果发表在国际期刊《植物科学趋势》。植物基因组研究长期受制于参考基因组的局限——传统组装难以解析着丝粒、端粒等复杂区域，且无
遗传发育所在植物基因组编辑方法研究中取得进展
基因组编辑技术是最新发展起来的植物基因功能研究及定向育种的重要手段。在植物中实现基因组编辑的常规方法是将序列特异性核酸酶（如CRISPR/Cas9）的编码DNA转化植物细胞，稳定表达进而实现对目的基因的定点编辑。这种情况下，CRISPR载体整合在植物染色体中，需通过后代分离获得不含CRISPR/