上海生科院开发出肿瘤基因组等位基因特异性表达新算法
7月13日，国际学术期刊Bioinformatics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所李亦学研究组的最新研究论文cisASE: A likelihood-based method for detecting putative cis-regulated allele-specific expression in RNA sequencing data。该工作开发了一个针对肿瘤基因组的等位基因特异性表达（ASE）鉴定新算法cisASE。 等位基因特异性表达作为癌症的重要特征之一，在各种癌症中频繁地被观测到。高通量测序的发展使得ASE研究可以在全基因组范围内展开，但是由于癌症基因组的不稳定性和异质性，在正常基因组中适用的等位基因特异性表达鉴定方法并不适用于癌症基因组。 针对此问题，李亦学研究组开发了cisASE软件。cisASE利用DNA-seq数据作为校正，鉴定RNA-seq上的等位基因特异性表达，可以......阅读全文
上海生科院开发出肿瘤基因组等位基因特异性表达新算法
7月13日，国际学术期刊Bioinformatics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所李亦学研究组的最新研究论文cisASE: A likelihood-based method for detecting putative cis-regulated allele-spec
上海生科院开发出肿瘤基因组等位基因特异性表达新算法
7月13日，国际学术期刊Bioinformatics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所李亦学研究组的最新研究论文cisASE: A likelihood-based method for detecting putative cis-regulated allele-spec
基因的组织特异性表达的定义
克隆载体中加入一些与表达调控有关的元件即成为表达载体.组织特异性就是多细胞生物个体,每个组织具有与其它组织相区别的特征,组织特异性的存在是取决于构成该组织主要成分的细胞性质.而组织特异性表达克隆载体就是带有某种组织特殊的启动子,在该组织中才能表达
基因表达过程中哪些因素与基因表达组织特异性有关
基因表达(geneexpression)是指细胞在生命过程中，把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译，转变成具有生物活性的蛋白质分子。生物体内的各种功能蛋白质和酶都是同相应的结构基因编码的。差别基因表达(differentialgeneexpression)指细胞分化过程中，奢侈基因按一定顺序表
组织特异性基因的表达是如何调控的
这个问题如果搞得特别明白足够发一篇CNS了，不同组织的转录组在不同时期表达是不同的，这也是为什么人要研究转录组的原因，但是有一点的是 housekeeping gene在不同组织不同时空还是要表达的，只是差异表达基因会不同而已，你可以参照中科院基因组所 zhu jiang 发表在genome res
真菌细菌如何影响基因表达和肿瘤存活
共聚焦显微镜下可见白色念珠菌生物膜代谢物刺激SCC25细胞 一项由巴西São Paulo州立大学(UNESP)的一组研究人员进行的体外研究显示了真菌和细菌如何激活与头颈部肿瘤相关的基因，由于生物膜的代谢(这些微生物以一种有结构和协调的方式自组织的群落)通过有利于肿瘤发展和抵抗治疗所需的细胞
特定的tRNA基因的表达促进肿瘤转移
Cell重大发现：tRNAs促进肿瘤转移转运RNAs（tRNAs）最初被认为是基因表达的静态参与者，但是6月2号，洛克菲勒大学的H. Goodarzi研究团队在Cell上发表的文章证明，tRNA也是基因表达的动态调节器，可影响疾病进展。接下来让我们一起来看看他们的研究成果吧。H. Goodarzi研
特定的tRNA基因的表达促进肿瘤转移
Cell重大发现：tRNAs促进肿瘤转移转运RNAs（tRNAs）最初被认为是基因表达的静态参与者，但是6月2号，洛克菲勒大学的H. Goodarzi研究团队在Cell上发表的文章证明，tRNA也是基因表达的动态调节器，可影响疾病进展。接下来让我们一起来看看他们的研究成果吧。H. Goodarzi研
猪等位基因特异性表达的时空特异性首获系统研究
近日，我国学者首次系统研究了猪等位基因特异性表达（ASE）的时空特异性，揭示了在不同发育时期、不同组织中的亲本决定型和等位基因型决定型两种ASE类型。相关成果在线发表于《自然-通讯》杂志。现代养猪产业普遍采用专门化品系选育和配套系杂交，其目的是充分利用杂种优势。基因表达调控是将基因型转化为表型的关键
关于位点特异性重组的基因的表达调控介绍
如果一个DNA分子上两个特异位点之间发生重组，其后果有两种可能性：两个位点之间的节段或被丢失，或被颠倒。有些生物能够利用这种重组倒置来控制基因的表达。因为DNA的一正一倒两种排列法可以相应地表达两种不同的蛋白质，细胞就可根据需要作出选择。奇怪的是，利用这种机制所调节的蛋白质往往都位于生物的体表。
如何检测肿瘤抑制基因的表达或功能状态？
检测肿瘤抑制基因的表达或功能状态可以采用以下几种方法：免疫组织化学（IHC）：利用特异性抗体检测肿瘤组织切片中肿瘤抑制基因所编码蛋白的表达水平和定位。实时定量 PCR（qPCR）：通过检测肿瘤抑制基因的 mRNA 水平来评估其表达情况。基因测序：包括 Sanger 测序和新一代测序技术（NGS），可
什么是组织特异性表达载体
在较高等的真核生物中，有一类特殊的调控序列（启动子等）可以调控基因只能在一定的组织中才进行有效的表达。选用这样的调控序列可以构建一系列组织特异性表达载体，为研究动植物发育和人类基因治疗等提供了有效的手段。目前已构建的组织特异性表达载体有乳腺组织特异性表达载体、肿瘤细胞特异性表达载体、神经组织特异性表
研究揭示苹果转座子调控等位基因特异性表达机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/8/484573.shtm 苹果花瓣颜色与MYB10和MYB110a的表达量相关。中国农科院果树所供图 近日，中国农业科学院果树研究所苹果资源与育种创新团队联合国内外科研机构，从全基因组层面上阐
用两种抗癌药物同时治疗乳腺肿瘤－改变肿瘤基因的表达
伊利诺伊大学Zeynep Madak-Erdogan教授及其研究团队在一项新的研究中发现，同时用两种抗癌药物治疗乳腺肿瘤可以通过两条不同的基因通阻止肿瘤细胞产生内分泌抵抗。 ERα（+）乳腺癌肿瘤患者中大多数病人的死亡是由于其肿瘤细胞对内分泌治疗产生了抗性进而导致肿瘤转移的发生。因此，我们迫
科学家研制出肿瘤基因表达高效评估芯片
本报讯(记者潘希)日前，中科院深圳先进技术研究院医工所陈艳带领研究团队，研制了用于肿瘤细胞基因表达水平评估的高通量微流控芯片，这一技术可发展成为癌症的早期诊断和分析的新型技术。相关研究成果在线发表于该领域知名期刊《芯片实验室》上。 微流控技术是在微米级结构中操控纳升至皮升体积流体的技术与科
锐博生物：特定的tRNA基因的表达促进肿瘤转移
Cell重大发现：tRNAs促进肿瘤转移 转运RNAs（tRNAs）最初被认为是基因表达的静态参与者，但是6月2号，洛克菲勒大学的H. Goodarzi研究团队在Cell上发表的文章证明，tRNA也是基因表达的动态调节器，可影响疾病进展。接下来让我们一起来看看他们的研究成果吧。 H.
除了基因检测，还有哪些方法可以检测肿瘤抑制基因的表达或功能状态？
除了基因检测，以下方法也可用于检测肿瘤抑制基因的表达或功能状态：免疫荧光法（IF）：类似于免疫组织化学，但是在荧光显微镜下观察荧光标记的抗体与目标蛋白的结合情况，能更清晰地显示蛋白的定位和表达。酶联免疫吸附测定（ELISA）：定量检测体液（如血液、脑脊液等）中肿瘤抑制基因编码的蛋白含量。转录组分析：
昆明动物所成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式
挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而，肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题，而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感，容易产生假阴性结果。针对此，中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法
昆明动物所成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式
挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而，肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题，而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感，容易产生假阴性结果。针对此，中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法
连接非编码突变和肿瘤基因表达的转录组全网络
肿瘤基因组中充满了非编码突变，这些突变对肿瘤的影响研究还不是很清晰。加州大学圣地亚戈分校的科学家Wei Zhang and Ana Bojorquez-Gomez，Trey Ideker，在最近国际顶级期刊Nature Genetics发表文章 A global transcriptiona
肿瘤特异性抗原的简介
此类抗原可存在于不同个体同一组织类型的肿瘤中，如人恶性黑色素瘤基因编码的黑色素瘤特异性抗原可存在于不同个体的黑色素瘤细胞，但正常黑色素细胞不表达。TSA也可为不同组织学类型的肿瘤所共有，如突变的ras癌基因产物可见于消化道、肺癌等，但由于其氨基酸顺序与正常原癌基因ras表达产物存在差异，可被机体
肿瘤特异性抗原的定义
肿瘤特异性抗原(TSA)指仅表达于肿瘤组织，而不存在于正常组织的肿瘤抗原。
肿瘤特异性抗原的概念
肿瘤特异性抗原（tumor specific antigen）指仅表达于某种肿瘤细胞表面而不存在于正常细胞上的新抗原，故又称独特肿瘤抗原（unique tumor antigen）。
什么是基因表达调控？基因表达调控有什么意义
意义：1.适应环境、维持生长和增殖：生物体赖以生存的外环境是在不断变化的，为了生存，所有活细胞都必须对外环境变化作出适当反应，调节代谢，以适应环境变化。生物体适应环境、调节代谢的能力与蛋白质分子的生物学功能有关。而蛋白质的水平又受基因表达的调控。2.维持个体发育与分化：多细胞生物调节基因的表达除为适
AVTBGCre/GOI在小鼠肝脏特异性基因表达敲除应用与分析
AAV-TBG-Cre/GOI系统简介： l AAV-TBG-Cre系统是整合了肝脏特异性TBG启动子和Cre重组酶的腺相关病毒载体。 Ø TBG启动子是一种基于人甲状腺结合球蛋白(TBG)启动子和微球蛋白增强子的混合型启动子，用于肝脏特异性转外源基因表达。 Ø Cre重组酶是
肿瘤抗原根据肿瘤抗原特异性的分类介绍
（一）肿瘤特异性抗原 肿瘤特异性抗原（tumor specific antigen,TSA)是肿瘤细胞特有的或只存在于某种肿瘤细胞而不存在于正常细胞的新抗原。 此类抗原乃通过肿瘤在同种系动物间的移植而被证实，故也称为肿瘤特异性移植抗原（tumor specific transplantati
－环境影响基因表达
日复一日、年复一年，我们的基因不断地和我们所生活的环境、邻居、家人，以及我们自己的心态“对话”。这些社会性互动的结果会进入我们细胞的控制室，改变基因的强弱表达，从而影响我们的习性、行为、生理、心理与健康。美国知名科学作家戴维·多布斯日前撰写了《基因的社会生活——改变你的分子组成》一文，介绍了科学
人脑基因表达图集
小鼠的全基因组基因表达的高分辨率图已经问世几年时间了，但是，对于人脑而言，此前只发表过相对来说比较粗糙的分布图。这是由于与小鼠相比，人脑规模增大了1000倍，以及死后组织供应有限和质量较差等因素所导致的。现在，Michael Hawrylycz及其在“艾伦脑科学研究
电流激活基因表达
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/505925.shtm
基因的表达过程
基因的表达过程是将DNA上的遗传信息传递给mRNA,然后再经过翻译将其传递给蛋白质。在翻译过程中tRNA负责与特定氨基酸结合，并将它们运送到核糖体，这些氨基酸在那里相互连接形成蛋白质。这一过程由tRNA合成酶介导，一旦出现问题就会生成错误的蛋白质，进而造成灾难性的后果。值得庆幸的是，tRNA分子与氨