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干细胞先驱发表单细胞RNA测序新成果

人多能干细胞是研究人类胚胎发育的理想模型,可以揭示谱系分化背后的细胞和分子机制。不过,人们还不清楚单个干细胞如何退出多能状态并转化为相应的前体细胞。 Morgridge研究院的科学家们使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,对来自人胚胎干细胞的谱系特异性前体细胞进行了转录组分析,揭示了人胚胎干细胞分化到定形内胚层(DE)的新调控子。这项研究最近发表在Genome Biology杂志上,文章通讯作者是著名干细胞先驱James Thomson。 James Thomson博士是干细胞领域的风云人物、莫格里奇研究院再生生物学主任、国际细胞动力学公司创始人兼首席科学家。Thomson的主要贡献包括 1998年首次分离出人体胚胎干细胞,2007年成功诱导人体多能干细胞。《时代》杂志因他在人体胚胎干细胞方面的贡献把他作为2001年美国医学封面人 物,2008年又把他评为全球最有影响力的百人之一。2011年,他与山中伸弥共同获......阅读全文

计算小RNA分子的单细胞测序新法

最近,卡罗林斯卡学院的研究人员开发出了一种单细胞程序,测量了单个胚胎干细胞中短的非编码RNA序列的绝对数量。这种新方法可以加深我们对于“基因是如何被调节、不同的细胞类型如何发展”的理解。相关研究结果发表在10月31日的《Nature Biotechnology》。当我们基因中的信息被使用时――例如构

单细胞RNA测序,众多研究都pick它

  多细胞测序和单细胞测序,你pick谁?如今,大多数研究人员也许会选择后者,因为不一样的角度,会带来不一样的见解。  多细胞测序和单细胞测序,你pick谁?如今,大多数研究人员也许会选择后者,因为不一样的角度,会带来不一样的见解。单细胞测序的最初动力来自癌症研究,可帮助人们了解肿瘤异质性和肿瘤微环

单细胞RNA测序发现新的免疫细胞

  最近在《Nature Immunology》发表的一项新研究,详细检测了一组新发现的免疫细胞(被称为ILC)。通过对单个扁桃体细胞的基因表达进行分析,瑞典卡罗林斯卡学院的科学家们,发现了三个以前未知的ILC子群,并揭示了关于“这些细胞在人体中如何发挥功能”的更多信息。  先天淋巴细胞(ILC)是

更便宜、更全面的单细胞RNA测序技术

康奈尔大学生物医学工程学院助理教授Iwijn De Vlaminck课题组开发了一款更健全的、低成本的方法解决了这个问题,不仅推动了单细胞基因组学发展,而且为感染和免疫生物学研究提供了一条新途径。这篇题为“Simultaneous Multiplexed Amplicon Sequencing

单细胞测序,解密小RNA分子的未知功能

随着科研人员对各种遗传疾病和癌症的深入挖掘,单细胞基因组方法捕获的信息变得越来越重要。卡罗林斯卡学院( Karolinska Institute)的研究人员近日公布了一种新方法,这种方法可以读取个体胚胎干细胞中短的、非编码RNA序列,有助于人们更好地理解基因如何调控不同细胞类型的发展。相关结

浅谈单细胞RNA测序的技术与分析难点

如今,单细胞生物学是一个热门话题。而在这一领域中,最前沿的则是单细胞RNA测序(scRNA-seq)。传统“批量的”RNA测序方法(RNA-seq)可以一次处理成千上万个细胞,并得到变异的平均水平。但是没有两个细胞是完全相同的,而scRNA-seq则可以揭示出每个细胞独特的微妙变化,甚至可以揭示全新

干细胞先驱发表单细胞RNA测序新成果

  人多能干细胞是研究人类胚胎发育的理想模型,可以揭示谱系分化背后的细胞和分子机制。不过,人们还不清楚单个干细胞如何退出多能状态并转化为相应的前体细胞。  Morgridge研究院的科学家们使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,对来自人胚胎干细胞的谱系特异性前体细胞进行了转录组分析,揭示了

浙大80后教授发表单细胞RNA测序研究

  基因表达变异是小鼠胚胎干细胞(ESC)的一个重要特征,但人们还不清楚这背后的具体原因。  浙江大学和哈佛大学的研究人员对小鼠胚胎干细胞进行了单细胞mRNA-seq分析。他们发现,这些细胞表现出的异质性是血清培养造成的。这项研究发表在一月二十一日的Cell Reports杂志上,文章的通讯作者是浙

《Nature Methods》更便宜、更全面的单细胞RNA测序技术

  微流控技术革新促进了单细胞RNA测序发展,它为单细胞基因组学提供了一种低成本、高通量的方法。然而,这种方法捕获完整RNA转录信息的能力有限。(图片来源:Cornell)  康奈尔大学生物医学工程学院助理教授Iwijn De Vlaminck课题组开发了一款更健全的、低成本的方法解决了这个问题,不

Nature重磅!利用单细胞RNA测序构建人类肝脏细胞图谱

  肝脏是人体最大、功能最多的器官之一,在人体的新陈代谢及免疫过程中发挥着关键作用。更值得关注的是,肝脏还是人体唯一一种仅需原体积的25%,就能够完全再生的内脏器官。另外,包括脂肪肝、肝癌及肝炎在内的各类肝病是当今世界最大的健康问题之一,也是导致死亡的主要原因。  尽管肝脏对人类健康极为重要,但健康