英国牛津大学MattiasRantalainen博士访问武汉物数所
3月29日,应中科院武汉物理与数学研究所生物波谱及代谢组学研究组唐惠儒研究员和王玉兰研究员之邀,英国牛津大学Mattias Rantalainen博士到该所进行学术交流,并作了题为Predictive Multivariate Latent Variable Models for Biomarker Discovery in 1H NMR-based Metabonomics 的学术报告。 报告中,Mattias Rantalainen博士详细介绍了在代谢组学数据挖掘的过程中,如何利用多变量模式识别方法来合理地、有效地解释核磁谱图数据,从而发现可能的潜在生物标记物,而有效的建模方法是构建合理预测模型的关键。同时,针对当前常用的多变量模型预测方法只适用于线性关系这一缺点,他提出了一种基于核(kernel)技术的K-OPLS(K-正交化偏最小二乘法分析)方法,引入kernel函数能有效改变自变量与因变量之间的关系,大大提高了该......阅读全文
Cell提出一个新“组学”:蛋白质代谢小分子互动组学
科学家们提出了一个新的“组学”——一个处理蛋白质和小分子之间相互作用的互动组学(protein-metabolite interactomics)。此前系统生物学家专注于基因组学或蛋白质组学,现在他们日益发现了蛋白质-代谢小分子之间相互作用的重要性。 基因组学针对的是生物体基因的系统分析,而蛋
农产品污染物风险评估:代谢组学等新技术、新方法
分析测试百科网讯 2015年9月17日,农产品中混合污染物风险评估技术研讨会在济南召开。中国农科院质标所的邱静研究员和李耘副研究员、中科院动物所的伍一军研究员和沃特世科技与赛默飞世尔科技的两位工程师在代谢组学等新技术、新方法方面带来了精彩的主题报告。中国农科院质标所研究员 邱静 来自
非靶向代谢组学中鉴定代谢产物适宜选用哪些分析方法
据相关科技要闻解读表明非靶向代谢组学已逐步成为研究生命活动的重要基础。它可高清呈现代谢产物的变化规律以及代谢种类,特别是那些评价高的非靶向代谢组学更是揭开了研究集体生命活动发生和发展的本质,现在就非靶向代谢组学中鉴定代谢产物更适宜选用哪些分析方法作简要阐述:1.主成分分析(PCA)非靶向代谢组学中鉴
Agilent与Stemina-宣布代谢组学领域的合作
Agilent与Stemina 生物标记物发现公司宣布共同促进 Stemina 的代谢组学研究 2010 年 5 月 24 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)与 Stemina 生物标记物发现公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布,两家公司
Agilent与Stemina-宣布代谢组学领域的合作
Agilent与Stemina 生物标记物发现公司宣布共同促进 Stemina 的代谢组学研究 2010 年 5 月 24 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)与 Stemina 生物标记物发现公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布,两家公司
LCMS8060助力广泛靶向代谢组学研究
mGWAS (metabolome Genome-Wide Association Study)指基于代谢组学的全基因组关联分析,是将代谢组数据作为表型,与基因型数据进行关联分析的一种方法。由于代谢组数据对表型鉴定更为精细,因此关联分析的精度比传统GWAS分析更高。 海南大学和华中农业大学的罗杰
代谢组学在疾病诊断中的应用
代谢组学 (metabolomics)的出现是生命科学研究的必然。在20世纪90年代中期发展起来的代谢组学,是对某一生物或细胞中相对分子量小于1,000的小分子代谢产物进行定性和定量分析的一门新学科。代谢组作为系统生物学的重要组成部分,在临床医学领域具有广泛的应用前景。 代谢产物是基因表达的最终
大连化物所等肝癌代谢组学研究取得进展
近日,中科院大连化学物理研究所许国旺研究员领导的高分辨分离分析及代谢组学研究团队(1808组)与上海东方肝胆医院王红阳院士课题组合作,将基于液相色谱-质谱用于肝癌组织非靶标代谢组学研究并取得了重要进展,相关研究成果已经在线发表在Cancer Research杂志上。 原发性肝癌是全球最
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息
Science:逆转传统认知,代谢组学揭示重要机制
来自Weill Cornell医学眼的研究人员在新研究证实氨基水杨酸(PAS)一种常用于治疗结核病(TB)的药物,通过在叶酸合成中的一种关键酶加工分解成不同的产物,干扰了随后在这条信号通路中起作用的酶。这一发表在11月1日《科学》(Science)杂志上的研究与从前认为其只与酶结合,而并未参
当代谢组学技术遇到单细胞测序技术
代谢组的状态是对遗传因素、外部环境和治疗干预等信息的综合反映,因此是一个跟踪和了解上述因素对表型影响的理想研究目标。代谢组可做多种样品类型、结果富含各种信息、可作为连接其他组学数据与表型之间的桥梁。过去20年,组学研究飞速发展,处于中心法则末端的代谢组学虽然起步较晚但是发展很快。很多组学研究目前已进
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息。如
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息
武汉物数所在嗅觉神经生物学研究方面取得重要进展
感觉系统的基本功能是准确地把瞬息万变的环境信息提供给大脑,而大脑的一个基本功能是在不断变化的内环境下,准确地感知外部世界。这样的正常功能,对于日常生活、生存以及高级脑功能如在适当的情形下做出正确的判断、计划以及最终决定等至关重要。然而,感觉系统如何在不同的生理状态下完成高保真的输入
武汉物数所蛋白质动态学新技术助力重要蛋白结构解析
近日,中国科学院武汉物理与数学研究所研究员唐淳课题组利用基于973重大科学研究计划“蛋白质动态学研究的新技术新方法”建立的研究技术,协助华中农业大学教授殷平课题组首次解析了N6腺嘌呤甲基转移酶METTL3-METTL14蛋白复合体结构,该研究成果发表于《自然》杂志。 该工作揭示了RNA N6腺
大熊猫乳汁蛋白质组学和代谢组学国际合作获进展
国家国际科技合作专项项目“大熊猫乳蛋白的分析及人工乳的研制”承担单位成都大熊猫繁育研究基地联合英国格拉斯哥大学首次对大熊猫乳汁展开了蛋白质组学和代谢组学研究,取得了阶段性进展。双方研究人员通过非麻醉的方式采集驯化后的大熊猫母乳,连续采集至幼仔出生后180天,并对乳汁进行了蛋白组学和代谢组学的研
第一届全国代谢组学及蛋白质组学双星峰会
继测序之后,基于质谱技术的代谢组学及蛋白组学于生命科学研究领域发展迅速。应用质谱技术从分子层面对生命体进行动态、精准的检测,可以了解生命体内代谢与蛋白整体水平的变化,为基础科学研究提供新方向。 为了贯彻 “两城一中心”的战略,江北新区继基因测序平台后,又重磅打造了质谱检测平台,旨在服务生命
J-Proteome-Res:-代谢组学应用于微囊藻毒素代谢研究
微囊藻毒素(MCLR),作为一种肝毒素,正在威胁着人类的公共卫生安全。在体内,肝脏是MCLR主要攻击的器官,然而具体代谢变化目前任然未知。近日,中国科学院水生生物研究所谢平等研究人员在与上海敏芯信息科技公司的合作下,通过对灌服MCLR的大鼠模型进行代谢组学的研究,向我们揭示了MCLR扰乱肝脏代谢
日Masatoshi-Kajita博士访问武汉物数所
3月3日至4日,应中科院武汉物理与数学研究所囚禁离子研究组之邀,日本通讯信息技术研究所(NICT)Masatoshi Kajita博士来所交流访问,并作了两场题为Precise measurement of vibrational transition frequencies of mo
武汉物数所证明“宇宙可以自发产生”
最近,中国科学院武汉物理与数学研究所蔡庆宇研究小组通过深入研究惠勒-德威特方程并结合量子轨道理论,首次证明宇宙可以通过量子机制自发产生。该研究成果发表于美国《物理评论D》2014年第4期(Phys.Rev. D 89,083510)。 探寻宇宙起源是人类社会的永恒追求。上世纪20年代
武汉物数所在蛋白质动态学研究的新技术方面获进展
近日,中国科学院武汉物理与数学研究所生物大分子动态学研究组在蛋白质动态学研究的新技术新方法发展方面取得新进展,相关研究成果发表在《德国应用化学》(Angew. Chem. Int. Ed,DOI: 10.1002/anie.201609830View)上。 “生命在于运动”是法国著名思想家伏尔
安捷伦举办芯片液相色谱及蛋白质组学/代谢组学用户交流会
疾病蛋白质组学重庆市市级重点实验室第二届学术委员会研讨会 暨安捷伦第一届芯片液相色谱及蛋白质组学/代谢组学用户交流会成功举办 2007年秋,为了开发建立一套全新理念的,与临床研究紧密联结的整体化蛋白质组学研究平台,以实现科研及早期临床诊断、新药开发及个体化医疗的需求,安捷伦科技和西南
抗代谢物与病因学的研究
应用抗代谢物的理论研究病因学已成为一个重要的发展方向,从已有查料证实在这方面的研究是有意义的,例如通过杭组织胺药物可以说明组织胺与过敏反应有一定的因果关系。虽然这个尚题仍有争论,但抗组织胺类药物在临床应用,确可以为过敏反应的病学提出有价值的查料。在临床上常用的抗组织胺类药物种类很多,常用的有苯海拉明
2015-年代谢组学技术高级培训班通知
代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科,是系统 生物学的重要组成部分。已在疾病诊断、医药研发、精准医学、营养食品科学、 毒理学、环境学,植物学等领域得到广泛应用。 中国的代谢组学与国际在同步发展,到目前为止,中国人发表的代谢组学相 关的文章数量已在国际上排第
岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究
靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。 岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan s
功能代谢组学用于胶质瘤研究获进展
近日,中国科学院大连化学物理研究所与美国NIH、哈尔滨医科大学附属第一医院合作将功能代谢组学用于胶质瘤研究取得新进展:利用毛细管电泳-质谱技术,发现瘤组织中的亚牛磺酸含量显著高于癌旁对照组织中的亚牛磺酸,并且与胶质瘤分级即恶性程度呈正相关。经过分子对接计算机模拟,科研人员发现亚牛磺酸能够与α-酮
代谢组学与临床医学的研究进展
人体是一个复杂的系统,存在于这一系统中的生物分子相互关联、互相依赖。近年来,人们已经意识到生物学的整体复杂性以及基因构成与环境因素之间的复杂交互作用,而对这些交互作用的理解已经不能单单从基因组学、蛋白质组学或转录组学水平去揭示。关注生物分子之间途径及网络的动态变化和关系的系统生物学(
细胞衰老的溶酶体代谢组学研究的新突破
溶酶体对细胞代谢至关重要,并异质地参与各种细胞过程。测量溶酶体代谢异质性的能力对于理解它们的生理作用至关重要。 2021年6月14日,中国科学技术大学熊伟与仓春蕾共同通讯在Nature Methods 在线发表题为“Metabolomic profiling of single enlarge
高深度空间代谢组学助力肿瘤微环境研究
肿瘤的发展除了与癌细胞自身基因突变导致的恶性增殖有关以外,还与肿瘤微环境息息相关。在癌症中,正常组织中和谐的细胞相互作用关系被破坏,原本保护正常细胞生存的微环境在肿瘤细胞的影响下,逐渐演变成适应肿瘤生长的条件。针对肿瘤微环境的检测和表征研究也可为癌症治疗提供新的思路。目前空间多组学技术已用于研究几种
布鲁克发布全新空间单细胞代谢组学研究策略
摘要 * 创新的无偏原位空间单细胞代谢组学(SSCM)能够以单细胞分辨率实现高通量代谢组织样本表征; * 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技术可在大视场内提供几乎无伪影的小分子图像; * 创新的 4D-代谢组学可通过 CCS-Predict