复旦叶丹、熊跃Nature亮点推荐癌症表观遗传重要成果
现任职复旦大学和北卡罗纳大学的熊跃（Yue Xiong）教授主要研究领域为肿瘤和干细胞周期调控、乳腺癌小鼠动物模式和蛋白泛素化。复旦大学的叶丹（Dan Ye）研究员则主要围绕”代谢与人类疾病”，开展”乙酰化调控代谢酶分子机制”和”代谢中间物参与表观遗传调控分子机制”两方面的研究。 8月17日，熊跃教授与叶丹研究员在《自然》（Nature）杂志上发表了一篇题为“Cancer: Suffocation of gene expression”，为我们介绍了本期Nature杂志上发表的一项重要癌症研究成果。 在这篇文章中，VIB-KU Leuven的Diether Lambrechts教授和Bernard Thienpont博士领导研究人员证实，肿瘤细胞中缺氧会改变细胞的基因表达，由此促成癌症生长。研究结果将产生深远的影响，因为该研究还证实了维持肿瘤中适当的氧气供应可抑制这些所谓的“表观遗传失常”。这篇论文的一些见解有可能最终促......阅读全文
什么是基因表达的系列分析？
中文名称基因表达的系列分析英文名称serial analysis of gene expression;SAGE定 义通过构建较短的表达序列标签规模化地检测基因表达种类及其丰度的实验技术。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
基因表达之RTPCR之我见
在论坛上看到不停地有人在问RT-PCR的问题，实际上在以前的帖子中各位香主和eeflying（我为什么总是提他们？因为还是很佩服的哦，生怕自己说错了，被他们指出来哦）都谈到了很多，鄙人也充大头答了一些问题，但是还是有各种问题，由于的基因表达还有点实战经验（但也技止此而），所以想些点东西给大家参考，计
p53基因结构及表达
P53基因在人类、猴、鸡和鼠等动物中相继发现后，对其进行了基因定位，人类 P53基因定位于17P13.1，鼠P53定位于11号染色体，并在14号染色体上发现无功能的假基因，进化程度迥异的动物中，P53有异常相似的基因结构，约20Kb长，都由11个 外显子和10个内含子组成，第1个外显子不编码，外
关于基因表达的转录机制介绍
基因表达的转录过程由RNA聚合酶（RNAP）进行，以DNA为模板，产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动，留下新合成的RNA链。 基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成，每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”（产生RNA转录物的模板）和“编码链”（含有转
Science开发创新基因表达研究方法
来自卡罗林斯卡学院和瑞典皇家理工学院(KTH)的科学家们，开发出了一种高分辨率的新方法来研究组织中活化的基因。这种方法可用于所有的组织类型，对于临床前研究和癌症诊断均具有价值。他们的研究结果发布在7月1日的《科学》（Science）杂志上。 疾病会改变组织中一些RNA分子和蛋白质的表达。在实验
关于基因表达的折叠的介绍
刚从mRNA序列翻译过来的蛋白质都是未折叠或无规卷曲的多肽,没有任何的三维结构。氨基酸彼此相互作用使得多肽从无规卷曲折叠成其特征性和功能性三维结构。氨基酸序列决定l了蛋白质的三维结构,且正确的三维结构对于功能至关重要,尽管功能蛋白的某些部分可能仍未展开。伴侣蛋白的酶有助于新形成的蛋白质获得折叠,
RSV感染的基因表达谱分析
发表在11月12日的PLOS Medicine杂志上的一项研究，采用全血基因表达谱分析估测了儿童RSV感染的发病机制和疾病严重程度，揭示了在儿童中由RSV感染引起的免疫反应的系统学调节异常，表明分子标记能够用来预测疾病的严重程度。 呼吸道合胞体病毒(RSV，Respiratory sy
原核表达之目的基因克隆
1. 了解实验课题对目的蛋白的要求包括：目的蛋白分子量有多大，表达目的（是蛋白结晶、药剂结合还是制备抗体，不同目的对蛋白要求不同）；是否要其可溶；是胞内表达还是分泌表达，是组成型表达还是诱导型表达；另外，还要了解蛋白表达后需要采用什么样的方式进行纯化，纯化标签有多大，蛋白纯化后是否需要将标签去除（即
原核表达——基因克隆技术
原核表达可以用于检测（1）发生在原核生物内的基因表达。（2）通过基因克隆技术，将外源目的基因，通过构建表达载体并导入表达菌株的方法，使其在特定原核生物或细胞内表达。实验方法原理一个完整的表达系统通常包括配套的表达载体和表达菌株。如果是特殊的诱导表达还包括诱导剂，如果是融合表达还包括纯化系统或者Tag
基因表达的转录调控的介绍
可分为三种主要途径： 1）遗传调控（转录因子与靶标基因的直接相互作用）； 2）调控转录因子与转录机制相互作用； 3）表观遗传调控（影响转录的DNA结构的非序列变化）。 通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合
关于基因表达调控的技术简介
基因调控是现代分子生物学研究的中心课题之一。因为要了解动植物生长发育规律。形态结构特征及生物学功能，就必须搞清楚基因表达调控的时间和空间概念，掌握了基因调控机制，就等于掌握了一把揭示生物学奥秘的钥匙。基因表达调控主要表现在以下几个方面： ①转录水平上的调控； ②mRNA加工、成熟水平
多药抗药基因的表达实验
多药抗药基因的表达实验是通过反转录和PCR的方法来检测特定基因的过度表达。一、细胞总RNA提取1. 收集约5×107个细胞，冷PBS洗涤。2. 加入400 ul RNA提取液（含6 mol/l 的异硫氰酸肽，0.5%十二烷基肌酸钠，0.025 mol/l 构橼酸钠pH7.0，0.25 mol/
基因表达的翻译调控的介绍
翻译调控的效果不如转录调控或调控mRNA的稳定性,但也偶尔得到使用。抑制蛋白质翻译是毒素和抗生素的主要作用目标,因此它们可以通过超越其正常的基因表达控制来杀死细胞。蛋白质合成抑制剂包括抗生素新霉素和毒素蓖麻毒素。
多药抗药基因的表达实验
PCR扩增法 实验方法原理 大多MDR细胞膜上出现MDR-1基因及其基因产物P-糖蛋白过度表达。 多药抗药基因的表达实验是通过反转录和PCR的方法来检测这些特
真核基因表达载体的构建
提高目的基因在哺乳动物细胞中表达的策略：1、DNA水平：增加基因拷贝数(1)高拷贝载体；（2）基因共扩增；2、转录水平：利用强启动子、增强子，可诱导启动子，如CMV、Tet；3、翻译水平：优化翻译起始序列和非编码区序列。本篇文章来源于网络，如有异议请联系我们，我们将在3个工作日内作出处理。
痘苗病毒系统基因表达实验（二）
实验方法原理含有 pT7 控制的外源基因（本实验「重组痘苗病毒（VTF7-3）感染后的脂质体转染」）的重组质粒，通过同源重组可整合到痘苗病毒中,并制备重组病毒储液。将此病毒储液与 vTF7-3 共同感染贴壁或悬浮细胞，在培养过程中，外源基因被高效的 T7 RNA 聚合酶转录，并在感染细胞的细胞质完成
单纯物理力就能激活基因表达
美国伊利诺伊大学的一项新研究发现，生物学相关力——相当于通过呼吸、运动或发声施加在人体细胞上的力就能激活基因表达蛋白质。 “力可以激活基因，不需要中间产物，也不需要细胞质中的酶或信号分子，”领导这项研究的机械科学与工程教授Ning Wang说。“我们还发现了为什么有些基因可以被‘武力’激活，而
痘苗病毒系统基因表达实验（一）
本节介绍依赖于在哺乳动物细胞质合成噬菌体 T7 RNA 聚合酶的瞬时细胞质表达系统。首先，将感兴趣的基因插入质粒中，使其位于 T7 RNA 聚合酶启动子（PT7）的控制下。应用脂质体转染，重组质粒进入感染了 vTF7-3 的细胞质中，而 vTF7-3 是一种能编码噬菌体T7 RNA聚合酶的重组痘苗病
基因表达转录调控的主要途径
基因表达转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。
药物使沉默基因恢复表达
密歇根大学综合性癌症中心研究人员报道，利用药物将一个与癌细胞发育有关基因打开，为治疗癌症带来新的希望。研究结果刊登于在线版《Oncogene》杂志。 Herceptin和Gleevec等流行新药的靶标是引发癌症的遗传突变，但因为控制生长的基因被关闭了，癌症还会复发。即便研究人员可以利用这些关闭的基
基因表达系列分析实验（SAGE）（三）
58. 用 1：10 000 的 SYBR Green I 染 15 min。在 UV 盒上观察，分出感兴趣的区带。59. 把每一块凝胶放入底部有约 0.5 mm 小洞的 0.5 ml 微量离心管中（用 21-G 针头刺的）。60. 把 0.5 离心管连同凝胶块放入 2.0 ml 的硅烷化的离心管里
基因表达调控的基本规律
过表达，即表达过度，当基因表达（转录）的严格控制被打乱时，基因可能不恰当被“关闭”，或以高速度进行转录。高速转录导致大量mRNA产生，大量蛋白质（protein）产物出现。在RNA聚合酶的催化下，以DNA为模板合成mRNA的过程称为转录。在双链DNA中，作为转录模板的链称为模板链或反义链；而不作为转
优化基因表达的关键因素
在基因表达研究中，研究者比较注意选择合适的表达载体和宿主系统，而往往忽视基因本身是否与载体和宿主系统为最佳匹配这样一个实质性问题。基因的最佳化表达可以通过对基因的重新设计和合成来实现，如消除稀有密码子而利用最佳化密码子，二级结构最小化，调整GC含量等。以下就密码子最佳化、翻译终止效率和真核细胞中异
陈鹏博士PNAS基因的表达调控
魔法师的学徒开启了一个输水系统，但是却不能够停止它，很快水浸没到了他的脖子，他陷入到困境中。不同于这个无能的学徒，活细胞具有更好的设计：当它们激活一种基因时，它们就会将一种系统留作备用来关闭基因。细胞不想浪费能源来生成它们不再需要的蛋白。康奈尔大学的研究人员在新研究中确定了细胞利用的两种机制，并
基因表达系列分析实验（SAGE）（一）
实验方法原理 实验材料 感兴趣的细胞或组织试剂、试剂盒 糖原EDTA缓冲液SDSBSATween 20连接子T4 DNA 连接酶BsmFIPC8SeeDNA乙酸钠乙醇DMSOPCR引物乙酸铵DNA ladder 聚丙烯酰胺 TBE凝胶DNA参照pZErO-1 质粒TE缓冲SOC培养液Tris · C
Nature揭示多变的基因表达模式
脊椎动物早期胚胎发育受到一些基因以及它们的“语法”控制。解译这一语法或许有助于了解畸形或癌症的形成，并开发出一些新的治疗药物。第一次，一项研究发现在斑马鱼的不同发育阶段基因表达过程中存在各种将DNA转录为RNA的机制。研究人员将这项研究发表在《自然》（Nature）杂志上。 在对几个基因组进
SeqScope剖析所有基因表达
研究潜在疾病基因的研究人员一直受到限制，因为传统的成像技术一次只能研究少数几个基因。 图片来自于论文 组成人类基因组的大约30,000 个基因中包含了对生命至关重要的指令。然而，我们的每个细胞在其日常功能中仅表达这些基因的一部分。例如，心脏细胞和肝细胞之间的差异取决于表达哪些基因——基因
可怕，汞能引起基因表达改变
即使水中的汞浓度极低也可以随着食物链富集，从藻类到浮游动物到小鱼，再到大鱼，最后被人类食用，食用汞富集的鱼后会引起严重的不可逆的神经失调。虽然目前我们已经知道了重金属对人类的危害，但是对于处于食物链底端的生物有什么危害吗？比如说像藻类这样的初始生产者。日内瓦大学的研究者们使用分子生物学工具第一次
基因表达调控的方式有哪些
基因表达调控分为很多水平：1.DNA、染色体水平调控：基因丢失、基因修饰、基因重排、基因扩增、染色体结构变化。2.转录水平调控（主要调控方式）：转录起始、延伸、终止均有影响。原核生物借助于操纵子，真核生物通过顺式作用元件和反式作用因子相互作用进行调控。3.转录后水平调控：主要指真核生物原初转录产物经
优化基因表达的关键因素
在基因表达研究中，研究者比较注意选择合适的表达载体和宿主系统，而往往忽视基因本身是否与载体和宿主系统为最佳匹配这样一个实质性问题。基因的最佳化表达可以通过对基因的重新设计和合成来实现，如消除稀有密码子而利用最佳化密码子，二级结构最小化，调整GC含量等。以下就密码子最佳化、翻译终止效率和真核细胞