高产华人教授NatGenet发表lncRNA研究成果

最近,斯坦福大学的研究人员发现,被称为P53的肿瘤抑制基因,可通过一个叫做DINO的调控RNA分子而得以稳定。这种相互作用有助于细胞对DNA损伤做出反应,并可能在癌症的发展和过早老化中发挥作用。该研究结果发表在9月26日的《Nature Genetics》杂志上。 知道什么时候抓牌,什么时候把它们合拢起来,是专业赌博的一种关键技能。但这同样也适用于细胞评估DNA损伤。这对于细胞迅速确定“是修复错误还是为了有机体的好处而自毁”是至关重要的。那是因为具有损坏基因组的细胞,通常开始违背生长的标准规则,并开始癌变。 现在,斯坦福大学医学院的研究人员发现了这个高风险分子游戏中的一个新调节因子,以一种新型调控RNA的形式,被称为DINO。这种RNA分子可结合和并稳定一个众所周知的肿瘤抑制蛋白——p53,它能够调动一个细胞对DNA损伤的反应。当发生突变时,p53就是癌症世界中最臭名昭著的坏蛋。 本文资深作者、皮肤科教授Howard ......阅读全文

长链非编码RNA测序服务助力揭开lncRNA神秘面纱

  2012年12月18日,华大基因科技服务有限公司(简称“华大科技”)在国内推出长链非编码RNA测序(lncRNA-Seq)服务。该技术突破了常规研究方法效率低、研究范围受限的瓶颈,可一次性获得样本中几乎全部的lncRNA序列,不仅可以对已知lncRNA进行定量分析,还可对 novel lnc

外泌体lncRNA介导的淋巴转移机制的揭秘(一)

文章导读外泌体是指包含多种RNA(环状RNA、miRNA、LncRNA和mRNA等)和蛋白质的盘状囊泡(30-200nm)。几乎所有类型的细胞均可分泌外泌体,且外泌体天然存在于各种体液中,包括血液、唾液、尿液、脑脊液和乳汁等。外泌体被视为特异性分泌的膜泡,能够参与细胞间通讯。目前,有关外泌体分泌、摄

外泌体lncRNA介导的淋巴转移机制的揭秘(二)

(5)外泌体LNMAT2上调PROX1的表达有研究报道,PROX1通过调节内皮细胞的分化和转移,对淋巴管系统发育至关重要。因此作者通过qPCR和WB实验发现,HLECs中上调LNMAT2能够促进PROX1的表达;为了探究LNMAT2调控PROX1表达的分子机制,作者进行核质分离PCR,发现LNMAT

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析(一)

近日,南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果,以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinogenesis by epigenetically silencing EphB3 throu

不得了,大牛告诉你lncRNA甲基化如何研究

  lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能,这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能轻松的变废为宝,竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章,你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。   RNA甲基化,作为最新的国

又一国产高分数据库,堪称lncRNA神器

  之前我们介绍了好用的CRN数据库,可以在线分析差异表达lncRNA并绘制与差异mRNA联系的网络图。那么有没有能直接出lncRNA与预后相关的生存曲线图的工具呢?答案当然是有的!这次我们就一起来看一下这个数据库!  lnCAR数据库(https://lncar.renlab.org/)是由中山大

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析(二)

2. GC细胞中FOXD2-AS1富集高的患者预后较差在芯片数据GSE51575基础上,以正常组织作为对照,来评估FOXD2-AS1的诊断效果。ROC曲线下面积为0.919(95%置信区间[CI] 0.809-0.976; P < 0.0001);特异性和敏感性分别为0.885和0.885。

全转录组测序的“一箭三雕”:circRNA,lncRNA,mRNA

1. 文章主题:环状RNA通过靶向miRNA调控的信号传导促进结直肠癌的转移发表期刊:Journal of pathology影响因子:5.942发表时间:201906实验方法:全转录组测序实验样本:结直肠癌组织肝转移是结直肠癌(CRC)患者的主要死亡原因。作者使用全转录组测序在CRC肝转移的小鼠模

lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程

   自然杀伤(NK)细胞是一类先天性免疫淋巴细胞,与体外病毒感染和免疫调节有关。但是,lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术,分析了NK细胞中lncRNA表达模式,发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中,lnc-CD

lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程

   自然杀伤(NK)细胞是一类先天性免疫淋巴细胞,与体外病毒感染和免疫调节有关。但是,lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术,分析了NK细胞中lncRNA表达模式,发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中,lnc-CD

lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程

自然杀伤(NK)细胞是一类先天性免疫淋巴细胞,与体外病毒感染和免疫调节有关。但是,lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术,分析了NK细胞中lncRNA表达模式,发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中,lnc-CD56,

武汉植物园等长链非编码RNA调控基因转录研究获进展

  长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)一般指长度大于200个核苷酸的非编码RNA,目前已在多种生物中发现了大量lncRNA,然而只有少数lncRNA的精细作用机理被阐明。   中国科学院武汉植物园汪志伟博士在植物种群遗传学科组王艇研究员支持和中国科学院留学

孙树汉:长链非编码RNA在肝癌转移过程中的功能研究

  10月31日,2014(第二届)非编码RNA学术研讨会继续在上海好望角大饭店(中科院上海学术活动中心)如火如荼地进行。  来自第二军医大学遗传学教研室的孙树汉教授介绍了长链非编码RNA在肝癌转移过程中的功能研究。在研究非编码RNA肝炎病毒致癌过程的作用中,该课题组发现在HCV中,miR-155表

SCI文章解析lncRNA-UICLM通过ceRNA机制调控结直肠癌的肝转移

   中山大学附属肿瘤医院院长、主任医师徐瑞华教授长期从事消化道肿瘤个体化治疗领域及抗癌药物研究,在消化道肿瘤的转移与转归、化疗药物耐受及其机制和优化临床治疗方面具有国际领先的创新性成果。近期,该课题组应用Arraystar lncRNA芯片在肝转移的结直肠癌组织中分析了lncRNAs的表达情况。课

Cell子刊最新发表应用Arraystar-LncRNA芯片研究宿主抗病毒

  中科院微生物研究所/福建农林大学的陈吉龙研究员长期从事流感病毒致病机理、抗病毒免疫学、病毒感染诱导肿瘤发生机理、肿瘤免疫学等领域的研究。近期,其实验室利用Arraystar Human LncRNA 芯片研究发现了一种新的调控宿主抗病毒反应的长链非编码RNA——NRAV,通过抑制干扰素刺激基因转

连发3篇Science:浙江大学王宇浩等发现这项新机制

  浙江大学转化医学研究院/浙江大学医学院附属第一医院/国家基础科学中心王宇浩研究员团队联合德克萨斯大学西南医学中心Lora Hooper院士团队,在 Science 期刊发表了题为:The gut microbiota reprograms intestinal lipid metabolism

ncRNA-UICLM通过ceRNA机制调控结直肠癌的肝转移

中山大学附属肿瘤医院院长、主任医师徐瑞华教授长期从事消化道肿瘤个体化治疗领域及抗癌药物研究,在消化道肿瘤的转移与转归、化疗药物耐受及其机制和优化临床治疗方面具有国际领先的创新性成果。近期,该课题组应用Arraystar lncRNA芯片在肝转移的结直肠癌组织中分析了lncRNAs的表达情况。课题组筛

Cell子刊最新发表应用Arraystar-LncRNA芯片研究宿主抗病毒...

Cell子刊最新发表应用Arraystar LncRNA芯片研究宿主抗病毒反应的文章中科院微生物研究所/福建农林大学的陈吉龙研究员长期从事流感病毒致病机理、抗病毒免疫学、病毒感染诱导肿瘤发生机理、肿瘤免疫学等领域的研究。近期,其实验室利用Arraystar Human LncRNA 芯片研究

Cell子刊最新发表Arraystar-LncRNA芯片研究宿主抗病毒反应

  中科院微生物研究所/福建农林大学的陈吉龙研究员长期从事流感病毒致病机理、抗病毒免疫学、病毒感染诱导肿瘤发生机理、肿瘤免疫学等领域的研究。近期,其实验室利用Arraystar Human LncRNA 芯片研究发现了一种新的调控宿主抗病毒反应的长链非编码RNA——NRAV,通过抑制干扰素刺激基因转

第二军医大学Hepatology解析癌症中的非编码RNA

  来自第二军医大学、复旦大学和中科院的研究人员发现,一种叫做DANCR的长链非编码RNA通过解除对CTNNB1的抑制增强了肝癌的干性特征。该研究成果刊登在国际权威杂志Hepatology(影响因子11.665)。  第二军医大学的周伟平(Wei-Ping Zhou)教授、孙树汉(Shuhan Su

如何研究lncRNA?三位科学家现身说法

  人生如戏,相信长链非编码RNA(lncRNA)也体会到了。之前一直遭冷遇,如今却是万人迷。其实,人类及其他哺乳动物的基因组转录了数万条lncRNA。根据GenCode数据库中最新版本的数据,人类基因组中包含16,000条lncRNA,产生了近28,000条转录本。再加上其他数据库的数据,目前已知

新疆生地所等在白桦抗逆分子机制研究中获进展

  全球干旱化程度日益加重,因此,研究植物对干旱胁迫的响应机制和找到抗旱关键基因具有重要意义。中国科学院新疆生态与地理研究所荒漠与绿洲生态国家重点实验室研究员张道远团队与东北林业大学教授王玉成团队合作,发现BpHOX2调控白桦抗渗透胁迫的分子机制。  研究发现,BpHOX2能够诱导脯氨酸合成酶△1-

CRISPR新成果:-针对长链非编码RNA的完全敲除高通量筛选

  之前的方法在效率、质量(假阳性、假阴性)上各有欠缺:比如CRISPRi的方法只能实现基因表达抑制而不是完全敲除,CRISPRa的方法只能上调基因表达,无法对基因不可或缺的作用实施筛选评估。大片段删除的策略由于步骤的繁琐,也限制了其在更大规模上得到应用。  作为强大的基因编辑工具,CRISPR/C

复旦权威期刊发表乳腺癌新成果

  乳腺癌是女性中最常见、也最严重的恶性肿瘤之一。40-60岁之间、绝经期前后的妇女发病率较高,仅约1-2%的乳腺患者是男性。这种恶性肿瘤通常发生在乳腺上皮组织,会严重影响女性的身心健康乃至危及生命。三阴乳腺癌是乳腺癌中最凶险的一种,大约占乳腺癌的16%。  复旦大学附属肿瘤医院的研究团队对三阴乳腺

釜底抽薪,华人学者的抗癌新策略

  Wistar研究所的一项新研究,解析了癌基因诱导衰老背后的分子机制。研究显示,当癌基因活跃时细胞会抑制自身的核苷酸合成能力,进入衰老状态从而阻止癌症的发展。尽管这些衰老状态的细胞依然存活,但它们无法增值。文章提前发表在Cell Reports杂志的网站上。  研究人员对痔和黑素瘤进行了研究,发现

华人学者:“惩恶扬善”的抗癌分子

   最近,研究人员发现一种新的分子,能够杀死癌细胞,同时保护健康的细胞,可用于治疗多种不同的癌症。这项研究阐明了细胞在癌变时刻发生了什么。  这项研究及临床前试验结果,本月发表在开放获取期刊《EBioMedicine》――Elsevier两大领导品牌《Cell》和《The Lancet》联合推出的

华人学者癌症研究获重要突破

  最近,美国佛罗里达州立大学(FSU)的研究人员,在与癌症的斗争过程中迈出了一大步,他们的研究结果,可能为新的研究和治疗选择打开了大门。  FSU癌症研究教授Fanxiu Zhu和他的研究小组发现,细胞中的一种病毒蛋白,可抑制主要的DNA传感器,从而抑制身体对病毒感染的反应,从而表明,我们可以通过

华人研究,大肠癌有效预后基因

  由脂肪细胞分泌的胶原样蛋白质即脂联素,脂联素由ADIPOQ基因生成。ADIPOQ基因的变异可能会2型糖尿病,心血管疾病,以及各种癌症的风险增加相关。  一项新的研究发现 ADIPOQ基因特定的变异与大肠癌风险或高或低相关,相关研究发表在Genetic Testing and Molecular

年轻华人博士Science发现特殊蛋白功能

来自德州大学西南医学中心的研究人员发现一种特殊的蛋白会导致中风过程中脑细胞的最终死亡,这一发现将有助于研发针对大脑损伤的新治疗方法。这一研究成果公布在10月6日的Science杂志在线版上,文章的第一作者与通讯作者是来自德州大学西南医学中心的王英飞(Yingfei Wang,音译)博士(见下图)

著名华人院士PNAS发文填补重要空白

  水杨酸(SA)是一种重要的免疫信号,能够启动植物的抗病防御。水杨酸生物合成一般是病原体诱导的,但人们并不清楚这一过程受到怎样的调控。  杜克大学的研究团队通过研究拟南芥填补了这方面的空白,揭示了水杨酸生物合成在时间和空间上的调控机制。这项研究发表在七月二日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上,文章