中科大最新Nature子刊发现lncRNA新功能

来自中科大的消息,中国科学技术大学教授单革课题组发现并命名了一个长链非编码RNA――5S-OT,并发现在灵长类中,5S-OT RNA获取了调控多个基因可变剪切的新功能。该研究成果发表在10月3日出版的《自然-结构和分子生物学》上。论文的共同第一作者为课题组的博士生胡珊珊和硕士生王小林。从酵母到人类的各种真核细胞中,基因组DNA上的信息主要是由RNA聚合酶II及RNA聚合酶III读取并转录产生相应的RNA。这些RNA按照其是否会作为蛋白质翻译的模板,可以分为编码RNA(mRNA,即信使RNA)和非编码RNA。非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起着调控作用的RNA分子。而mRNA往往以大的pre-mRNA前体方式产生并随后进行剪切,产生能真正作为翻译蛋白质的mRNA模板。研究人员发现,在高级灵长类和人类当中,5S-OT RNA获取了调控多个基因可变剪切的新功能。在高级灵长类和人类中,5S-OT中插入了一个反义Alu序列,并因......阅读全文

非编码small-RNA参与缺氧下的血管生成(二)

     接下来,Northern blot实验也验证了其中上调的tRNAVal(CAC)和tRNAGly(GCC)来源片段。此外,qPCR分析也表明,这些small RNAs在缺血后24hr,48hr和72hr时都显著提高。为了进一步探究胁迫诱导的tRNAs剪切过程,研究人员在缺血条件下对不同时间

非编码DNA可用于开发癌症特异性疫苗

  癌症疫苗,是科学家们五十多年来一直潜心研究的疑难课题,但直到最近的一项研究才得以证明这种疫苗是有效的。  近日,加拿大蒙特利尔大学免疫和癌症研究所(IRIC)的一个研究团队证明了癌症疫苗可以起作用。不仅如此,它还可以成为一种非常有效、非侵入性以及低成本的抗癌工具。这项研究刚发表在《Science

酵母双杂交系统简介

酵母双杂交系统酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母中进行的,研究活细胞内蛋白质相互作用,对蛋白质之间微弱的、瞬间的作用也能够通过报告基因的表达产物敏感地检测得到,它是一种具有很高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术。大量的研究文献表明,酵母双杂交技术既可以用来研究哺乳动物基因组编码的蛋白质之间的互作,也可

人体内75%基因是垃圾?-“垃圾DNA”吐露人与猩猩差异

  已经有大量科学家对“垃圾DNA”进行了研究,而这些研究结果不断地表明,“垃圾DNA”绝不是我们体内“无用”的角色,相反,其可能在多方面发挥着重要作用。  ◎本报记者 吴纯新 通讯员 程 毓  提到垃圾,我们的第一反应通常是无用的东西。而在我们的体内,有一些DNA,也被称为“垃圾”。那么,这些被称

从心脏病到癌症——长非编码RNA到底发挥了什么作用?

  直到近几年才发现人类基因的70%是非编码RNA,非编码RNA不能翻译为蛋白质,但仍在人体中发挥重要作用。Stefanie Dimmeler是首批发现一个microRNA亚群在血管再生中发挥重要作用的研究人员之一,她最近获得了欧洲研究委员会(ERC)的ERC高级研究员资助,这使她能够对另一群非编码

核糖核酸调节子的分类

一些核糖核酸调节子通过与其他RNA简单的反义相互作用发挥功能。依据基因组来源,内源的反义RNA大致可以分为两类:①反式反义RNA(trans-antisenseRNA),该反义RNA转录自推测的靶特定位点;②顺式反义RNA(cis-antisenseRNA),该反义RNA由靶RNA同一基因组区的互补

科学家认为生物体内的基因至少有50%无用

科技日报2007年12月20日讯 人类基因组测序工作的最终完成,花费了全球6个国家的顶尖科学家们10年多的时间和精力以及30亿美元的财力。虽然不断有科学家报道他们关于治病基因的发现成果,但含有30亿碱基对的人类基因组数量太庞大,基因疗法距离实际运用还需要很长时间的等待。几十年来,不断有科学家认为,基

基因组的分类

病毒基因组病毒基因组可以由RNA或DNA组成。 RNA病毒的基因组包含单链或双链RNA,也包含一种或多种单独的RNA分子。 DNA病毒基因组可以是单链或双链DNA。大多数DNA病毒基因组由单个线性DNA分子组成,但有些由DNA病毒基因组由环状DNA分子组成  。原核基因组原核生物和真核生物基因组由D

美评估非人灵长类研究政策

   美国国立卫生研究院(NIH)将仔细审查由联邦资助的实验室中非人灵长类动物的使用情况。作为对一项国会命令的回应,该机构今年夏季将召开一场研讨会,回顾围绕猴子、狒狒以及其他相关动物研究的伦理政策和程序。在此之前,NIH已决定结束其下属一家实验室存在争议性的猴子实验,并终止了对黑猩猩侵入性实验的经费

关于真核基因组的基本信息介绍

  真核基因组由一条或多条线性DNA染色体组成。组成真核生物基因组的染色体的数量差异很大,杰克跳线蚂蚁和无性线虫的基因组每个只有一对染色体 [6],而蕨类物种有720对染色体 [7]。人类细胞具有22对常染色体和1对性染色体。  除了细胞核中的染色体外,真核生物的细胞器如叶绿体和线粒体都有自己的DN

关于脱氧核糖核酸DNA的基因组结构介绍

  真核生物基因组DNA位于细胞核内,线粒体和叶绿体内也有DNA。原核生物DNA被包裹在细胞质中不含细胞膜的不规则细胞器类核中。 遗传信息包含在基因中,基因是能够影响生物体表型的遗传单位。每个基因含有开放阅读框(能够转录成RNA的区域)和由启动子和增强子组成的调节区。 在许多物种中,只有一小部分基因

脱氧核糖核酸的基因组结构

真核生物基因组DNA位于细胞核内,线粒体和叶绿体内也有DNA。原核生物DNA被包裹在细胞质中不含细胞膜的不规则细胞器类核中 。 遗传信息包含在基因中,基因是能够影响生物体表型的遗传单位。每个基因含有开放阅读框(能够转录成RNA的区域)和由启动子和增强子组成的调节区。 在许多物种中,只有一小部分基因组

研究揭示水稻基因组-“垃圾-DNA”-的真相

  对于动植物的 DNA 来说,仅有不到 5% 能够翻译成蛋白质,进行生命活动。而大部分 DNA 转录成 RNA 之后,便不再继续翻译,这些非编码 RNA 一度被认为是转录中的 “噪音”“暗物质”, 甚至有人认为这是 “垃圾 DNA”。  近十年来,随着探索未知的技术的进步,这些所谓 “垃圾 DNA

研究揭示水稻基因组“垃圾DNA”的真相

  对于动植物的DNA来说,仅有不到5%能够翻译成蛋白质,进行生命活动。而大部分DNA转录成RNA之后,便不再继续翻译,这些非编码RNA一度被认为是转录中的“噪音”“暗物质”, 甚至有人认为这是“垃圾DNA”。  近十年来,随着探索未知的技术的进步,这些所谓“垃圾DNA”的重要性才开始为人们所了解。

假基因的代表基因介绍

加工假基因有一类假基因除了一般的特征之外,还有一些其他的特征暗示着它们的形成与mRNA有关:①在假基因中完全缺少在相应的正常基因中存在的内含子顺序;②在假基因的3'末端有一段连贯的脱氧腺嘌呤核苷酸;③有些假基因与相应的正常基因在顺序组成上的相似性只限于相应的mRNA的3'末端之前的部

假基因的种类和典型基因

加工假基因有一类假基因除了一般的特征之外,还有一些其他的特征暗示着它们的形成与mRNA有关:①在假基因中完全缺少在相应的正常基因中存在的内含子顺序;②在假基因的3'末端有一段连贯的脱氧腺嘌呤核苷酸;③有些假基因与相应的正常基因在顺序组成上的相似性只限于相应的mRNA的3'末端之前的部

非蛋白质新标签可追踪细胞过程

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504716.shtm 图片来源:俄罗斯卫星通讯社科技日报莫斯科7月13日电 (记者董映璧)俄罗斯研究人员使用一种新开发的非蛋白质光学标签,可在不改变基因组的情况下标记单个细胞。使用该项技术能在任何

生成式AI设计出非天然蛋白质

  加拿大多伦多大学研究人员开发了一种人工智能系统,可以使用生成扩散来创建自然界中不存在的蛋白质。该系统有望使治疗蛋白的设计和测试更加高效和灵活,从而加速人类药物开发。研究发表在最新一期《自然·计算科学》杂志上。  蛋白质由氨基酸链组成,氨基酸链折叠成的三维形状反过来又决定了蛋白质的功能。这些折叠的

关于真核基因组的基本信息介绍

  真核基因组:由真核基因编码的以及感染真核生物的DNA和RNA病毒编码的基因组。  真核生物的基因组一般比较庞大,例如人的单倍体基因组由3×106 bp碱基组成,按1000个碱基编码一种蛋白质计,理论上可有300万个基因。但实际上,人细胞中所含基因总数大概会超过10万个。这就说明在人细胞基因组中有

揭示人线粒体苏氨酸tRNA上致病点突变的分子机理

  4月10日,国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组的最新研究成果:A natural non-Watson-Crick base pair in hmtRNAThr causes structural a

植物中独特双链RNA合成机制获解析

  中科院分子植物科学卓越创新中心研究员张余团队和研究员王佳伟团队与浙江大学教授冯钰团队合作,首次解析了Pol IV-RDR2蛋白复合物的三维结构,并提出了Pol IV-RDR2以双链DNA为模板合成双链RNA的独特分子机制。该研究成果12月24日在线发表于《科学》。Pol IV-RDR2复合物三维

华中科技大学PNAS文章:首个不需引物的DNA聚合酶

  长久以来公认DNA聚合酶不能仅以核苷酸底物从头合成DNA,必须要在一段特定长度的DNA或RNA引物末端开始聚合DNA。而来自华中科技大学,哈佛大学,日本地球海洋科技局的研究人员近期发现了自然界已知的第一个不需要引物的DNA聚合酶,这不仅在聚合酶进化研究中有重要意义,而且还蕴藏了在核酸合成和测序技

中国科学家成功破译树鼩基因组

  2013年2月6日,中科院昆明动物所、深圳华大基因研究院等单位对树进行了全基因组测序,并对其分类地位和相关生物学特征进行了深度解析。树基因组的完成,将为其在生物医学研究中用作动物模型奠定重要的遗传学基础,进而使其更好的应用于生物医药研究。研究成果在《自然•通讯》(Nature Communi

蛋白质截短试验_非放射性蛋白质截短试验

实验材料患者和正常人的保存于乙醇中的 RNA 或 DNA 样品试剂、试剂盒乙酸钠随机引物反转录试剂盒二硫苏糖醇4dNTP 混合液RNase 抑制剂特异性的 PCR 引物RNase H10 X PCR 缓冲液Taq 酶丙烯酰胺 双丙烯酰胺SDSTris • Cl过硫酸铵运行缓冲液电转缓冲液(冰预冷)甲

蛋白质氨基酸和非蛋白质氨基酸的区别

蛋白质氨基酸:即标准氨基酸,在蛋白质生物合成中,由专门的tRNA携带,直接参入到蛋白质分子之中,包括20种常见氨基酸以及2种不常见氨基酸。常见的20种氨基酸有:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸(蛋氨酸)、脯氨酸、色氨酸、丝氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、苯丙氨酸、天门冬酰胺、谷氨酰胺、苏氨

几种基因克隆的常用方法介绍(二)

3.2 Differential display PCR(DD-PCR) DD-PCR是在AP-PCR基础上发明的一种RT-PCR方法,主要用于 2种或多种类似生物个体在基因表达上的差异分析。其基本原理是:所有真核生物的成熟mRNA都含有不同长度的poly+(A)尾部序列,根据poly+ (

科学家揭示RNA聚合酶III转录起始动态过程

复旦大学研究员徐彦辉、青年研究员陈曦子团队,重建了人源RNA聚合酶Pol III转录起始的完整动态过程,揭示了转录因子与聚合酶催化活性协同驱动Pol III由转录起始向延伸过渡的分子机制,为理解真核短链非编码RNA合成的调控提供了关键结构基础。6月4日,相关研究发表于《自然》。RNA聚合酶(RNAP

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

  叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式

细胞化学基础植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转