研究揭示水稻基因组“垃圾DNA”的真相

对于动植物的DNA来说,仅有不到5%能够翻译成蛋白质,进行生命活动。而大部分DNA转录成RNA之后,便不再继续翻译,这些非编码RNA一度被认为是转录中的“噪音”“暗物质”, 甚至有人认为这是“垃圾DNA”。 近十年来,随着探索未知的技术的进步,这些所谓“垃圾DNA”的重要性才开始为人们所了解。 近日,来自中国农业科学院作物科学研究所(以下简称农科院作科所),水稻优异种质资源发掘与创新利用团队等研究人员利用全基因组分析的手段,对水稻及其近缘野生种基因组中的“垃圾DNA”进行注释。结果发现,有些被称做“垃圾DNA”的变异与水稻淀粉含量、籽粒大小等重要农艺性状的多样性相关。其研究结果发表在《科学进展》上。 “垃圾DNA”绝非垃圾 分子生物学的中心法则描述了遗传信息的传递方向,即DNA转录产生mRNA,mRNA利用所携带的遗传信息指导蛋白质的合成。中心法则认为,蛋白质是生命活动的主要承担者。 随着大量生物全基因组测序的完成......阅读全文

研究揭示水稻基因组-“垃圾-DNA”-的真相

  对于动植物的 DNA 来说,仅有不到 5% 能够翻译成蛋白质,进行生命活动。而大部分 DNA 转录成 RNA 之后,便不再继续翻译,这些非编码 RNA 一度被认为是转录中的 “噪音”“暗物质”, 甚至有人认为这是 “垃圾 DNA”。  近十年来,随着探索未知的技术的进步,这些所谓 “垃圾 DNA

研究揭示水稻基因组“垃圾DNA”的真相

  对于动植物的DNA来说,仅有不到5%能够翻译成蛋白质,进行生命活动。而大部分DNA转录成RNA之后,便不再继续翻译,这些非编码RNA一度被认为是转录中的“噪音”“暗物质”, 甚至有人认为这是“垃圾DNA”。  近十年来,随着探索未知的技术的进步,这些所谓“垃圾DNA”的重要性才开始为人们所了解。

“垃圾DNA”不“垃圾”

   就像从电影中删掉的片段一样,生物基因中的一些序列最终也会被剪掉,细胞不会利用它们制造蛋白质。现在,两项研究发现,这些被称为内含子的片段有助于酵母在艰难时期存活。这项研究揭示了DNA的另一种可能的功能,科学家曾认为这种功能是无用的。  未参与该研究的美国加州旧金山州立大学进化分子生物学家Scot

利用CRISPR筛查人类基因组“垃圾”DNA

  在几个研究小组正致力将CRISPR/Cas9系统应用于临床的同时,另一些研究团队则在利用这一工具来解决有关生物学的基础问题。近期,荷兰癌症研究所遗传学教授Reuven Agami与和同事们应用CRISPR搜寻了整个基因组中的调控增强子元件。  他们将Cas9核酸酶靶向了从前鉴别出的两个转录因子p

75%DNA是垃圾

  你距离“上帝的完美作品”还很远。近日,一项新研究显示,人体内75%的DNA是“垃圾”。  数十年来,生物学家一直认为人类大多数基因都有某些作用。但该研究却驳斥了这一观点,指出人类大部分DNA毫无用处。实际上,早在2012年该研究组就猜测人类基因大多无用。  早在上世纪50年代,研究人员发现了DN

“垃圾DNA”或是编码DNA的“保镖”

"垃圾DNA"的概念源自上世纪70年代,用来形容基因组中不是编码蛋白质的DNA序列,在学术上被称为非编码DNA序列。 非编码DNA"开关说"究竟是个啥? 科学家们发现,人类基因组中包含多达400万个基因开关和功能调节因子,它们的载体便是"垃圾DNA"。这强烈地冲击了"DNA序列=生物性

“垃圾DNA”或是编码DNA的“卫士”

   “垃圾DNA”的概念是在上世纪70年代提出来的,用来形容那些基因组中不是编码蛋白质的DNA序列,而在学术上被称为非编码DNA序列。  由于当时的科学家普遍认为有生物学意义的蛋白质才是决定生物性状的关键,而且也没有一种好的理论和技术手段来解释这些“垃圾”存在的原因,于是“垃圾DNA”这一观念便形

垃圾DNA不再垃圾有重要作用

  今天公布的一项研究表明,阻断一种被称为“垃圾DNA”所产生的RNA,可以阻止中风后一部分重要神经的破坏。该研究指出了中风后遗症的一种可能疗法,这种后遗症往往比最初血液到大脑的流动被暂时关闭所造成的破坏更为广泛。  这项研究还将2个谜团联系在一起:为什么大多数的损伤是在血液供应恢复之后?人类基因组

种子DNA提取仪研究水稻

   过去,生物技术还不成熟,比如要想提取种子的DNA就比较难,得到的DNA不纯,含杂质较多。而现在随着种子DNA提取仪的应用就能很快完成实验。该仪器又叫中通量组织研磨仪,是实验室中常用的样品制备工具,通过它研磨得到的样品就能提取较高纯度的DNA。在很多种子检验中都会用到它。   随着水稻研究的深入

Nature解析癌症与“垃圾”DNA

  癌症是由多次遗传改变(或突变)而引起的一类疾病。我们从父母那里继承了或强或弱的形成某些癌症类型的遗传易感性;此外,在我们的一生中我们的细胞内也会不断地累积新的突变。尽管已开展了很长一段时间的癌症遗传起源研究,直到现在研究人员仍无法估量基因组一些非编码区域的作用。  来自日内瓦大学(UNIGE)的

“垃圾DNA”决定人脸长相

有的人相貌堂堂,有的人看上去不尽如人意。美国研究人员的最新研究表明,人类基因组中的“垃圾DNA”,可能是每个人都长得与众不同的最终决定因素。   所谓“垃圾DNA”,是指人类基因组中曾被认为毫无用处的部分,它们在基因组中所占比例高达98%。但美国伯克利劳伦斯国家实验所的研究人员10月24日在《

Nature:被丢失的“垃圾”DNA

  在人类基因组中,基因只占据2%的序列,其余的均是由称作非编码DNA的遗传物质构成。科学家们多年来一直试图解开这一谜团:为何基因组中会存在如此庞大数量的这种遗传物质?  现在,一项新研究带来了出乎意料的新发现:绝大多数的非编码DNA也许确实并非复杂生命所需。这一研究发表在 5月12日的《自然》(N

Science:新基因来自“垃圾”DNA

  “新基因从何而来?”是遗传学和进化生物学中长期存在的一个问题。来自加州大学戴维斯分校的研究人员证实,一些新基因是由非编码DNA以比预想更快的速度生成。这一研究发现发表在1月23日的《科学》(Science)杂志上。   论文的资深作者、加州大学进化和生态学教授David Begun说:“研究清

引导大脑发育的“垃圾DNA”

荧光染料追踪的lncRNA   引导大脑发育的“垃圾DNA”   近日,加州大学旧金山分校(University of California, San Francisco)的研究人员发现,曾被当做是“垃圾”的一种特异性DNA在大脑发育中发挥了重要的作用,并有可能与几种毁灭性的神经系统疾病相关

癌症与某些“垃圾DNA”有关

  英国研究人员日前报告说,人类基因组中一些“垃圾DNA”产生的物质与乳腺癌等癌症存在相关性,这项发现有助于研发新的癌症治疗方法。   英国诺丁汉大学等机构研究人员在美国《基因组学》(Genomics)杂志上报告说,他们发现人类基因组中名为L1的DNA序列会导致生成一些反常产物,而这些产物多见于乳

烟草和水稻叶绿体cpDNA基因组成特点

1.基因组由两个反向重复序列(IR)和一个短单拷贝序列(short single copy sequence, SSC)及一个长单拷贝序列(long single copy sequence, LSC)组成;2.IRA和IRB长各10-24Kb,编码相同,方向相反。3.cpDNA启动子和原核生物的相

烟草和水稻cpDNA基因组成及特点

烟草和水稻(Oryza sativa)叶绿体全序列分析表明cpDNA基因组成有以下特点:1.基因组由两个反向重复序列(IR)和一个短单拷贝序列(short single copy sequence, SSC)及一个长单拷贝序列(long single copy sequence, LSC)组成;2.

Science:绘制“垃圾DNA”的新技术

  在很长一段时间内被认作是“垃圾DNA”,我们现在知道了基因间的一些区域也执行着至关重要的功能。这些DNA区域突变可以严重损害人类的发育,有可能在生命后期导致一些严重的疾病。然而直到现在,都难以寻找调控DNA区域。  德国慕尼黑工业大学计算生物学教授Julien Gagneur,马克斯普朗克生物物

垃圾DNA是诱发癌症的动力

  根据“人类卫星二”,人类基因组认为是“垃圾DNA”的异常高拷贝但未被探索的序列具有令人惊讶的能力,影响我们基因组的主要监管者。放松管制时,这些重复核苷酸序列的大片段将主要调节蛋白结合并分解成癌细胞中的大核体。这可能导致表观遗传学不稳定  -基因调控的变化  -这是许多癌症进展的动力。  神经学教

中国生物产业:不是“垃圾DNA”

  曾几何时,生物专业一直占据中国十大垃圾专业排行榜前列,国内生物医药行业犹如死水,毫无涟漪,低下的研发能力、短缺的专业人才使中国生物产业犹如人类基因组中的“垃圾DNA”饱受诟病和白眼。中国的生物产业真的停滞不前了吗?   根据BioSpectrum杂志撰写的2013年亚太生物科技产业调研报告来看

《Cell》探讨“垃圾”DNA的新功能

  美国国立卫生研究院下属国家关节肌肉骨骼及皮肤病研究所(NIAMS)的科学家们在新研究中证实,过去被认为是“垃圾”的DNA在免疫系统反应中发挥了关键性的作用。研究结果发表在近期的《细胞》(Cell)杂志上,有可能促成发现治疗免疫相关疾病的新靶点。   人类基因组中有32亿DNA碱基对,但只有2%

-“垃圾DNA”中发现潜在癌症病源

  人类基因组中仅有1%~2%是负责蛋白质编码的基因,其余非编码区域早先被认为是毫无用处的“垃圾DNA”。但是,美、英等国研究人员最近在这个“垃圾”区域中找到近百个乳腺癌与前列腺癌的潜在“导火索”,提示研究“垃圾DNA”对了解癌症的重要性。   美国耶鲁大学、英国韦尔科姆基金会桑格研究所等机构的研

基因组DNA的提取

基因组DNA的提取概 述   基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分

基因组DNA的定义

中文名称基因组DNA英文名称genomic DNA定  义组成生物基因组的所有DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

基因组DNA的提取

第一节 概 述DNA的提取通常用于构建文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中,可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部,

纯化DNA实验_基因组DNA的快速纯化

试剂、试剂盒尾部缓冲液蛋白酶 K仪器、耗材离心管玻璃棒实验步骤第 1 天1. 大约 1.5 cm 长的尾部活检样品放在一个 1.5 ml 盛有 0.7 ml 尾部缓冲液的小离心管中,加 35 ul 10 mg/ml 蛋白酶 K,在 55℃ 振摇温育过夜。尾部缓冲液(配 25 ml)50 mmol/L

基因组研究让水稻育种走向精准设计

  由中国主导的国际间科研大协作项目“3000份水稻基因组研究”26日结出硕果——北京时间当日凌晨1时,国际顶级学术期刊《自然》正式发表《3010份亚洲栽培稻基因组研究》。该研究针对水稻起源、分类和驯化规律进行了深入探讨,揭示了亚洲栽培稻的起源和群体基因组变异结构,剖析了水稻核心种质资源的基因组遗传

无缺口组装!水稻完整参考基因组发布

  近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合海南崖州湾实验室、中国水稻研究所、中国农科院作物科学研究所和扬州大学等多个单位发布完整的水稻参考基因组,实现了全基因组所有染色体端粒到端粒无缺口组装,为水稻育种研究提供了新的有力工具和重要大数据基础。相关研究成果发表在《分子植物》(Molecular

我国科研团队发布水稻完整参考基因组

水稻是重要的粮食作物,其基因组组装对水稻育种意义重大。23日,记者从中国农业科学院深圳农业基因组研究所获悉,该所联合崖州湾实验室、中国水稻研究所、中国农科院作物科学研究所和扬州大学等多个单位发布完整的水稻参考基因组,实现了全基因组所有染色体端粒到端粒无缺口组装,为水稻育种研究提供了新的有力工具和重要

水稻LEA基因组规模的鉴定与分析

实验概要本实验鉴定了OsLEA基因,将基因定位到水稻染色上,进行了序列对比和基因转变分析,LEA基因的表达分析及启动子基序分析。实验材料基因组及蛋白质序列的来源:分别从TIGR (http://www.tigr.org)和BGI (http://rise.genomics.org.cn/rice