中科大最新Nature子刊发现lncRNA新功能
来自中科大的消息，中国科学技术大学教授单革课题组发现并命名了一个长链非编码RNA――5S-OT，并发现在灵长类中，5S-OT RNA获取了调控多个基因可变剪切的新功能。该研究成果发表在10月3日出版的《自然-结构和分子生物学》上。论文的共同第一作者为课题组的博士生胡珊珊和硕士生王小林。从酵母到人类的各种真核细胞中，基因组DNA上的信息主要是由RNA聚合酶II及RNA聚合酶III读取并转录产生相应的RNA。这些RNA按照其是否会作为蛋白质翻译的模板，可以分为编码RNA（mRNA，即信使RNA）和非编码RNA。非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起着调控作用的RNA分子。而mRNA往往以大的pre-mRNA前体方式产生并随后进行剪切，产生能真正作为翻译蛋白质的mRNA模板。研究人员发现，在高级灵长类和人类当中，5S-OT RNA获取了调控多个基因可变剪切的新功能。在高级灵长类和人类中，5S-OT中插入了一个反义Alu序列，并因......阅读全文
中国科大长非编码RNA调控细胞周期研究取得成果
12月4日，中国科学技术大学教授吴缅研究组的研究成果，以LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA stability in human cells为题，在线发表在e
上海生科院总结多种基因内部来源的非编码RNA生成机制
10月1日，中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所研究员杨力受邀在WIREs RNA 发表了题为Splicing noncoding RNAs from the inside out 的综述论文，系统总结了多种来自于前体RNA内部序列的非编码RNA分子及其产生机制和潜在功能作用。 真核基
第二军医大学Hepatology解析癌症与非编码RNA
来自第二军医大学的研究人员发现，一种癌胚胎非编码RNA通过稳定NOP2促进了肝癌细胞增殖以及获得干细胞样特性。这项研究已被在国际著名肝脏疾病杂志Hepatology（最新影响因子12.003）接受并在线发布。 第二军医大学的孙树汉（Shu-Han Sun）教授、李文（Wen Li）副教授以及李
非编码RNA结合肌细胞增强因子2D调控肌肉发育
近日，农科院特产研究所李光玉研究员带领的研究团队发现了一个新的在肌肉发育过程中发挥重要功能的长非编码RNA，该非编码RNA-Irm通过直接结合肌细胞增强因子2D来调节肌源性基因的转录，进而调节肌生成。该研究结果为动物肌肉生长发育研究提供了新的调节因子和表观调控机制，对深入解析肌肉生长发育的分子调
微生物所揭示CMV非编码卫星RNA的起源和发生
烟草植物感染黄瓜花叶病毒（Cucumber mosaic virus，CMV）以后，随着连续继代和病毒感染，一个长链非编码RNA（long non-coding RNA）神奇地出现并被称为CMV卫星RNA（satellite RNA，satRNA）。satRNA因能够利用CMV编码的复制酶进行复
科学家通过多种方法探究长链非编码RNA
直到今天，针对lncRNA的简洁且合理的分类系统仍遥不可及。长链非编码RNA的概念模型 2013年，一群研究人员决定更加深入地挖掘一种名为H1的人类胚胎干细胞系，并且获得了一些惊喜。H1是最著名的干细胞系之一，但该团队还是成功发现了2000多个此前未被阐明的RNA片段。更重要的是，其中有1
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临挑战 2003年4月人类基因组图谱基本绘制完成，但对基因的调节与功能问题仍未能解读。由于基因的功能主要是通过其编码的蛋白质来实现，蛋白质才是生命活动真正的执行者，所以越来越多的科学家致力于蛋白质的研究，试图找出人类疾病的致病机理，最终解决人类
癌症研究大师Cell惊人发现：致癌的假基因
假基因（Pseudogenes），这一由基因组的2万个蛋白质编码基因衍生而来，现在丧失了蛋白质生成能力的一个长链非编码RNA(lncRNA)子类，长期以来都被视为是基因组的“垃圾”。然而这些在进化过程中保留下的2万个神秘的残余物表明，它们实际上有可能具有一些生物学功能，促进了疾病的形成。 现
“看”得更清！RNA结构解析新技术孕育新发现
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516890.shtm“结构决定功能”是物质科学界的基本共识。目前，非编码RNA的结构解析难题是开展其调控功能和作用机制研究的一大瓶颈。与编码蛋白质的信使RNA（mRNA）不同，非编码RNA往往需要先形成二
什么是CDS编码序列？
CDS是编码序列（Coding sequence）的缩写。DNA转录成mRNA，mRNA经剪接等加工后翻译出蛋白质，所谓CDS就是与蛋白质序列一 一对应的DNA序列，且该序列中间不含其它非该蛋白质对应的序列，不考虑mRNA加工等过程中的序列变化，总之，就是与蛋白质的密码子完全对应。CDS是编码一段蛋
2顶级实验室《Science》“垃圾”DNA是宝
一类非编码(Non-coding)的DNA分子(不表达蛋白质)，曾经被认为是“垃圾”的DNA目前正成为遗传研究的新热点，“垃圾”DNA的真实含义早已变更，它仅仅是一个历史遗留的名称，实际上，“垃圾”DNA具有无与伦比的表达调控功能，2所顶级学府的2个独立团队在Science上发表关于垃圾DNA的
关于转录的特点介绍
转录时，细胞通过碱基互补的原则来生成一条带有互补碱基的mRNA，通过它携带密码子到核糖体中可以实现蛋白质的合成。与DNA的复制相比，转录有很多相同或相似之处，亦有其自己的特点。 转录中，一个基因会被读取并复制为mRNA。就是说，以特定的DNA片段作为模板，以DNA依赖的RNA聚合酶作为催化剂，
转录的特点
转录时,细胞通过碱基互补的原则来生成一条带有互补碱基的mRNA,通过它携带密码子到核糖体中可以实现蛋白质的合成。与DNA的复制相比,转录有很多相同或相似之处,亦有其自己的特点。转录中,一个基因会被读取并复制为mRNA。就是说,以特定的DNA片段作为模板,以DNA依赖的RNA聚合酶作为催化剂,合成前体
RNA转录的技术特点
转录时，细胞通过碱基互补的原则来生成一条带有互补碱基的mRNA，通过它携带密码子到核糖体中可以实现蛋白质的合成。与DNA的复制相比，转录有很多相同或相似之处，亦有其自己的特点。转录中，一个基因会被读取并复制为mRNA。就是说，以特定的DNA片段作为模板，以DNA依赖的RNA聚合酶作为催化剂，合成前体
李晓江博士：探讨用CRISPR/Cas9实现大型动物基因组编辑
6月2日，来自中国科学院遗传与发育生物学研究所的李晓江（Xiao-Jiang Li）研究员在《细胞研究》（Cell Research）杂志上发表了题为“Targeted genome editing in primate embryos”的文章。 在这篇文章中他概述了近期在灵长类动物胚胎中应用
割裂基因的基本信息介绍
真核生物的基因组十分复杂，DNA的含量也比原核生物的大得多。噬菌体由于基因组很小，但又要编码一些必不可少的蛋白，碱基显然不够用，这样不仅几乎所有的碱基都参加编码，而且在进化中还出现了“重叠基因”，以有限的基因编码更多的遗传信息。真核基因组正好相反，DNA十分富余，这样不仅无需“重叠基因”，而且很
挑战传统假设，研究揭示细胞有非基因组信息系统
美国莫菲特癌症中心科学家一项新研究提出，细胞拥有一个此前未知的、独立于基因组的信息处理系统，使它们能够对环境变化迅速作出反应。相关论文发表于最近的《交叉科学》（iScience）杂志。图片来源：《交叉科学》杂志几十年来，科学家们一直将DNA视为细胞信息的唯一来源。这个DNA蓝图指导细胞构建蛋白质并控
分子杂交的分类
分子杂交基因探针根据标记方法不同可粗分为放射性探针和非放射性探针两大类，根据探针的核酸性质不同又可分为DNA探针，RNA探针，cDNA探针，cRNA探针及寡核苷酸探针等几类，DNA探针还有单链和双链之分。下面分别介绍这几种探针。DNA探针DNA探针是最常用的核酸探针，指长度在几百碱基对以上的双链DN
南通大学研发高效筛选平台－助力肿瘤精准诊疗
基因组水平的改变是肿瘤发生、发展的重要始动因素，对此，南通大学医学院本科生团队近日自主研发了一款高效的DNA调控元件及超增强子筛选平台——SPACE，有助于发现新的DNA调控元件，进而调控肿瘤的分子机制，为肿瘤的精准诊疗提供潜在的新方法。该成果近期发表在《中国免疫学杂志》（英文版）上。 研究发
关于癌症全基因组－我们有了全新的认识
今日，最新一期《自然》杂志如约上线，而登上封面的“癌症全基因组”则是本期的主题：在本期《自然》杂志上，一共发表了6篇相关的论文。而在Nature Genetics、Nature Biotechnology、以及Nature Communications等子刊上，也有系列论文发表。 那么，是什么
人类“垃圾RNA”有重要作用——促进翻译
过去十年的基因组研究中，最大的惊喜之一是科学家们发现，与以前的信念相反，大多数的基因组并不用于生产蛋白质。最初，许多科学家认为这些长非编码RNAs是非功能的“噪音”，但在最近的研究中，有越来越多的研究发现，这些lncRNAs具有调节功能。延伸阅读：上海生科院发现调控乙酰胆碱酯酶表达的自然存在的反
Nature：科学家发布人类蛋白质组草图里程碑成果
两个独立研究小组绘制了人体组织和细胞系质谱分析图谱，公布了近乎完整的人类蛋白质组草图。 日前，两个国际小组均在《自然》杂志上公布了人类蛋白质组第一张草图，这些在大部分非患病人体组织和器官中表达的精选蛋白，为更好的理解疾病状态下发生的机体变化，奠定了坚实的基础。这两项最新研究揭示了人类基因组的更多复
基因编辑进展梳理－Part－II－基于CRISPRCas9的技术应用篇(下)
上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。 一、大规模基因功能的筛选 尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展，但是解析复杂的基因型-表型关系仍
揭示人类特有基因起源新机制
北京大学科研人员近日发现43例人特有的蛋白编码基因，并提出了新功能蛋白的长非编码核糖核酸起源机制。相关成果发表于美国《公共科学图书馆·遗传学》。 认识人之所以为人的分子机制，特别是探究人类特有基因的起源规律，是当代前沿科学问题。北京大学李川昀课题组长期运用恒河猴作为人类近缘模式动物的优势，以
Science新遗传研究引发科学界争议
在早期胚胎中非整倍体（细胞染色体数目异常）极为常见，是导致妊娠终止的一个主要原因。发表在4月9日《科学》（Science）杂志上的一篇研究报告揭示，导致这种非整倍体的原因与母亲携带的一种遗传突变有关联。令人惊讶的是，结果表明这种突变非常常见，似乎在人类进化过程中经历了正选择。 加州大学圣克鲁斯
Nature：被丢失的“垃圾”DNA
在人类基因组中，基因只占据2%的序列，其余的均是由称作非编码DNA的遗传物质构成。科学家们多年来一直试图解开这一谜团：为何基因组中会存在如此庞大数量的这种遗传物质？ 现在，一项新研究带来了出乎意料的新发现：绝大多数的非编码DNA也许确实并非复杂生命所需。这一研究发表在 5月12日的《自然》（N
我国发现首例人类感染猴B病毒致死病例
《中国疾病预防控制中心周报（英文）》7月16日报告了我国发现的首例人类感染猴B病毒病例具体情况。患者为一名53岁男性兽医，他在北京一家专门从事非人灵长类动物繁殖和实验研究的机构工作。他在2021年3月4日和6日解剖了两只死猴子，一个月后出现了恶心和呕吐的症状，随后发烧并出现神经系统方面的症状。
新基因筛选工具能绘制“垃圾DNA”
据英国《每日邮报》官网报道，美国科学家近日开发了一种新的基因筛选工具，能绘制引起癌症、糖尿病和痴呆症的基因突变，或有助于开发新疗法，进而拯救每年因此丧生的数百万人。新成果发表在《公共科学图书馆》杂志上。 领导这次研究的哥伦比亚大学教授大卫·戈尔茨坦说，现在的基因测序只能在不超过三分之一的遗传病
南京医科大学最新文章：癌细胞中的RNA表达模式
系统生物学认为, 生命体是一个复杂的动态变化网络, 对于生命的研究需要从整体出发, 研究生命网络中的这些复杂的相互作用和调控关系, 而不是仅孤立地研究各个网络中的节点。近期针对非编码RNA，来自南京医科大学的研究人员进行了深入探索，旨在构建全基因组水平编码-非编码 RNA调控网络, 探讨 ncR
细胞表面RNA分子由细胞核内的基因组编码产生
人类细胞的外表面上有很多不同的蛋白质、脂质、糖蛋白。然而除了这些已知类型的分子，近日科学家们发现，人类细胞的外表面还稳定附着了一类过去鲜有人知的RNA分子。 加州大学圣地亚哥分校（UCSD）钟声教授与其合作者张良方教授、陈真教授共同的研究团队，利用专门开发的检测和测序技术鉴定出，这类细