中科大最新Nature子刊发现lncRNA新功能
来自中科大的消息，中国科学技术大学教授单革课题组发现并命名了一个长链非编码RNA――5S-OT，并发现在灵长类中，5S-OT RNA获取了调控多个基因可变剪切的新功能。该研究成果发表在10月3日出版的《自然-结构和分子生物学》上。论文的共同第一作者为课题组的博士生胡珊珊和硕士生王小林。从酵母到人类的各种真核细胞中，基因组DNA上的信息主要是由RNA聚合酶II及RNA聚合酶III读取并转录产生相应的RNA。这些RNA按照其是否会作为蛋白质翻译的模板，可以分为编码RNA（mRNA，即信使RNA）和非编码RNA。非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起着调控作用的RNA分子。而mRNA往往以大的pre-mRNA前体方式产生并随后进行剪切，产生能真正作为翻译蛋白质的mRNA模板。研究人员发现，在高级灵长类和人类当中，5S-OT RNA获取了调控多个基因可变剪切的新功能。在高级灵长类和人类中，5S-OT中插入了一个反义Alu序列，并因......阅读全文
访陈润生院士：大数据治病时代已来临
生物大数据最核心的部分是组学数据，而组学数据中最基础的数据是基因组数据。有了近年的基因组研究才派生出蛋白质组、代谢组、生物网络。也正是因为基因组的研究，才使得生物大数据实实在在地成为了大数据。近年来，随着互联网与传统医疗的融合，医学界开始在研究大数据的基础上不断探索发现新的生物学规律。如今，这
Science：跳跃基因如何找到目标？
为了了解转座子如何形成基因组，极其重要的是，要发现它们定向整合（targeted integration）背后的机制。最近，来自法国国家健康与医学研究院病理学实验室的研究人员，与法国CEA-Saclay和美国一个实验室合作，确定了两种蛋白质之间的相互作用，是一个转座子整合到酵母基因组中一个特定区
Nature－Methods：高分辨率的测序技术
悉尼Garvan医学研究所的研究人员在Nature Methods杂志上发表文章展示了一种新测序技术的强大实力。文章指出，CaptureSeq（Capture Sequencing）能够大大提高基因组分析的分辨率，为基础研究和癌症诊断带来革命性的启示。 CaptureSeq结合了基因捕获技术和
猪生殖和呼吸系统综合症病毒介绍
猪生殖和呼吸系统综合症病毒(Porcinereproductiveandrespiratorysyndromevirus,PRRSV) 猪生殖和呼吸系统综合症(间称PRRS)是近十年来发现的一种新的猪传染病。该病以母猪发热、厌食和流产、死产、木乃伊胎、弱仔等繁殖障碍以及仔猪的呼吸道症状和高死亡
蛋白质、基因组与人类疾病有了关联图
据《科学》杂志近日发表的一项最新研究，研究人员将人体血液中的数千种蛋白质数据与遗传数据相结合，绘出了蛋白质、基因组与人类疾病的网络关系图，显示了影响这些蛋白质的遗传差异如何将多种多样的相关疾病联系在一起。通过创建基因组蛋白质组图，科学家们发现了不同人类疾病之间的数百种新联系。 蛋白质故障会导
蛋白质组学之逆袭，深度注释基因组
申请课题缺创新点？撰写论文没思路？急着毕业时间紧？别怕，对于吉凯，一切都是套路！更有甚者，对于宇宙终极难题：“屌丝如何逆袭白富美？”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。 从前，在生物学研究领域，有一个白富美叫基因组学（Genomics），她有一项强大的技能：DNA测序，凭借这项技能，她完
蛋白质、基因组与人类疾病有了关联图
据《科学》杂志近日发表的一项最新研究，研究人员将人体血液中的数千种蛋白质数据与遗传数据相结合，绘出了蛋白质、基因组与人类疾病的网络关系图，显示了影响这些蛋白质的遗传差异如何将多种多样的相关疾病联系在一起。 通过创建基因组蛋白质组图，科学家们发现了不同人类疾病之间的数百种新联系。 蛋白质故障会
Nat－Rev－Cancer综述：肿瘤蛋白质基因组学
导 读 肿瘤蛋白质基因组学（Cancer proteogenomics）是将基于质谱（MS）的蛋白质丰度和翻译后修饰（PTM）信息与临床前肿瘤模型和肿瘤样本的基因组、表观基因组和转录组数据相结合的组学技术。基因组学和表观基因组学为解释可能发生的生物过程提供了基础知识，蛋白质组学是对已经发
Nature:科学家成功构建只需61个密码子的大肠杆菌
在大自然中，生物的基因组可利用64个密码子编码蛋白质的合成，并能从多达6个同义编码子中选择1个有义密码子来编码每个氨基酸。同义密码子具有多样性特点，并可能在基因组的不同位置具有不同的作用。已有研究发现，许多同义替换是有害的，同义密码子的改变会影响mRNA的折叠，蛋白的表达和共翻译蛋白折叠。 5
人类基因全测序完成！最后的Y染色体的组装和分析完成
《自然》23日发表的两篇论文公布了人类Y染色体的组装和分析，Y染色体也是最后完成全测序的人类染色体。这项全球100多名科学家参与的研究填补了当前Y染色体参考的诸多空白，带来了对不同人群演化和变异的见解。人类Y染色体由于结构复杂一直很难测序和组装。超过一半的Y染色体在当前的人类参考基因组组装中缺失，导
生物信息学在人类基因组计划中的应用
生物信息学是当前生物学领域的研究热点，预计在未来的若干年它将变得越来越重要、越来越引起人们的重视。近期任务由于未来几年蛋白质和核酸的测序数据将以指数方式增加，近期生物信息学将在以下几方面迅速发展：大规模基因组测序中的信息分析大规模测序是基因组研究的最基本任务，它的每一个环节都与信息分析紧密相关。目前
Science探索癌症的未知世界
由耶鲁大学领导的一个研究小组，通过对人类自然遗传变异和癌肿瘤变异进行海量数据分析，揭示了数十个乳腺癌和前列腺癌形成过程中的突变。研究结果发表在10月4日的《科学》(Science)杂志上。 新发现的这些突变均位于不编码蛋白质但却能影响其他基因活性的DNA区域。科学家们认为，这些区域代表了一
POLG基因的结构特点和主要作用
线粒体dna聚合酶是异三聚体，由一个副亚单位的同二聚体和一个催化亚单位组成。该基因编码的蛋白质是线粒体dna聚合酶的催化亚单位。编码的蛋白质在其n-末端附近含有一个可能是多态性的聚谷氨酸束。该基因的缺陷是渐进性外眼肌麻痹的原因，线粒体DNA缺失1（PUA1），感觉性共济失调神经病变构音障碍和眼肌麻痹
新发现！非编码DNA突变也可引发癌症－|－Nature子刊
基因与癌症的关系远比人类已了解的更加复杂。近日，美国科学家在一项新研究中鉴定出了近200个在不同的癌症中发挥作用的非编码DNA突变。 image.png 图片来源：Nature Genetics（doi:10.1038/s41588-018-0091-2） 在人类基因组中，有9
Cell：遗传性疾病的惊人发现
最近的研究表明，我们人类和其他哺乳动物的基因组被划分为大的功能单位，称为拓扑相关结构域（TAD）。TAD是非常长的DNA片段，包含一个或多个基因及其调控元件。TAD的一个重要功能是形成基因调控的独立区域，同时，将它们与邻近区域隔离开来。最近，根据三种人类罕见疾病，德国马克斯普朗克分子遗传学研究所
基因表达的转录调控的介绍
可分为三种主要途径： 1）遗传调控（转录因子与靶标基因的直接相互作用）； 2）调控转录因子与转录机制相互作用； 3）表观遗传调控（影响转录的DNA结构的非序列变化）。 通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合
关于基因表达的转录调控介绍
基因表达的转录调控可分为三种主要途径：1）遗传调控（转录因子与靶标基因的直接相互作用）；2）调控转录因子与转录机制相互作用，3）表观遗传调控（影响转录的DNA结构的非序列变化）。 通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白
Nat－Genet.:非编码蛋白DNA在二型糖尿病中或起重要作用
近日发表在Nature Genetics杂志上的文章称，基因组非编码蛋白质序列在二型糖尿病中或起重要作用。 不编码蛋白质的DNA序列一度被认为是"垃圾DNA"，但是近日越来越多的实验结果表明这些序列与基因的表达调控相关。 遗传因素被认为与二型糖尿病有很大的相关性，除此之外还有体重，饮
全球合作项目！揭示大脑灰质遗传结构
大脑外层相对较薄、折叠的“灰质”层，对思考、信息处理、记忆和注意力至关重要。此前科学家怀疑大脑皮层表面积和厚度的遗传基础与精神分裂症、双相情感障碍、抑郁症、注意缺陷多动障碍（ADHD）和孤独症等多种精神特征有关，但目前还未得到太多证据。 十年前，为寻找200多个基因组区域和300多个影响大脑皮
Science：有比CRISPRCas更安全的技术吗？基于retroelement的基因组编辑工具
在一篇展望文章中，Stephen Tang和Samuel Sternberg讨论了基于retroelement的基因编辑作为CRISPR-Cas方法的一种更安全的替代方法。 精确的基因组编辑技术改变了现代生物学。可编程DNA靶向的能力已经迅速提高，这主要是由于细菌RNA引导的CRISPR-Ca
micrornas基因的结构及作用
micrornas（micrornas）是短的（20-24nt）非编码RNAs，通过影响mRNas的稳定性和翻译，参与多细胞生物中基因表达的转录后调控。小RNA被RNA聚合酶II转录，作为可编码蛋白质或不编码的有帽和多聚腺苷酸化的初级转录物（pri-mirnas）的一部分。初级转录物被Drosha核
与结直肠癌相关的基因突变类型MIR2181基因
micrornas（micrornas）是短的（20-24nt）非编码RNAs，通过影响mRNas的稳定性和翻译，参与多细胞生物中基因表达的转录后调控。小RNA被RNA聚合酶II转录，作为可编码蛋白质或不编码的有帽和多聚腺苷酸化的初级转录物（pri-mirnas）的一部分。初级转录物被Drosha核
PKD1L2基因的结构特点和主要作用
这个基因编码多囊蛋白家族的一个成员。编码的蛋白质包含11个跨膜结构域，即一个脂蛋白/ Cl 1-GPCR蛋白水解位点（GPS）结构域，和一个多囊蛋白-1，脂氧合酶，α毒素（PLAT）结构域。这种蛋白质可能是阳离子通道孔的组成部分这个基因在人类看来是一个多态性假基因，参考基因组编码一个非功能性等位基因
Cell子刊：超保守lncRNA的重要功能
谈到遗传物质，我们往往指的是从父母那儿继承到的DNA（脱氧核糖核酸）。这些DNA会转录成为RNA，进而指导各种蛋白质的合成，例如血红蛋白或胰岛素。除了这些RNA之外，细胞中还存在着大量神秘的非编码RNA。 MicroRNA是最广为人知的一种非编码RNA，这种微小的分子控制着众多基因的启动和关闭
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临挑战 2003年4月人类基因组图谱基本绘制完成，但对基因的调节与功能问题仍未能解读。由于基因的功能主要是通过其编码的蛋白质来实现，蛋白质才是生命活动真正的执行者，所以越来越多的科学家致力于蛋白质的研究，试图找出人类疾病的致病机理，最终解决人类
科研人员开发内源基因非编码区定向进化新技术
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517501.shtm近日，中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队开发了核酸酶LbCas12a介导的内源基因非编码区定向进化技术。相关研究成果发表在《植物通讯 (Plant Comm
非编码MiRNA双重调控作用的全新分子机制研究获系列进展
根据印尼肥料生产协会（APPI）公布的数据，今年前四个月印尼农业生产共消耗化学肥料310万吨。其中，尿素消耗量最大，达130万吨,氮磷钾肥料（NPK）次之，达110万吨，而同期有机肥使用量仅22万吨。 印尼科学院研究人员表示，土壤需要源源不断的有机物质来提供碳资源，如果土壤失去了碳，肥力将会降
李培峰教授Cell、Nature子刊非编码RNA研究重要发现
青岛大学转化医学研究院院长李培峰（Pei-Feng Li）教授曾在国际上首先提出“抗氧化酶自身被氧化”的新理论，是国际上少数几个最早将细胞凋亡引入心血管研究的科学家之一。近日李培峰教授领导的研究小组连接在非编码RNA研究领域取得重要研究发现，相关论文发表在《分子细胞》（Molecular Cel
中国科大长非编码RNA调控细胞周期研究取得新成果
12月4日，中国科学技术大学教授吴缅研究组的研究成果，以LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA stability in human cells为题，在线发表在e
中科大揭示长片段非编码RNA促进肿瘤生长机制
记者从中国科学技术大学获悉，该校生命科学学院吴缅和梅一德教授研究组，揭示了长片段非编码RNA通过调控肿瘤细胞瓦伯格效应促进肿瘤生长的机制。相关研究近日在线发表在国际著名学术期刊《细胞》子刊《分子细胞》。 肿瘤细胞即使在有氧状态下也优先进行糖酵解，而不是通过产能效率更高的氧化磷酸化途径为细胞生长