婴儿鼻、肺细胞的RNA表达模式显著相似

根据罗切斯特大学医学中心(URMC)最新的研究发现婴儿鼻细胞与肺部细胞非常类似,这一发现可使呼吸道合胞体病毒(RSV)和其他婴儿肺部疾病的诊断更精确。 患呼吸道疾病的婴儿十分脆弱,因此试图获取肺部样本是不安全的,该研究发表在科学报告上,为多年来受到挑战的医生提供了一条潜在诊断途径。然而,鼻细胞可以从鼻孔通过一支简单棉签获取,而且它们与肺细胞在RNA水平的相似性将使医生不需要更多侵入性测试就可获知肺在疾病状态是如何正确的反应和表达。 “可对潜在的RSV患婴进行鼻细胞检测,以确定它们是否已在将发生严重反应需进行住院治疗的小组中,”URMC儿科教授Thomas Mariani博士说。“另外,我们可以使用这种方法来检查其他高危婴儿,如那些早产儿在生活中面临更大肺部患病风险——并识别这其中的哪些孩子应该进行更积极地治疗。” 该研究也为将来的研究带来极大希望。在过去的几十年里虽然科学家在更好地认知成人肺部疾病方面已经取得显著进展......阅读全文

lncRNA表达与RNA的延伸

LncRNA的火热研究已经有几年的时间了,关于lncRNA总归是有说不完的话题。目前对lncRNA的基础分析都已形成了一定的模式。然后,今年来lncRNA的相关文章依然如雨后春笋。  长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RN

Tornado表达系统实现RNA高水平表达和功能活性

  RNA适配体是一种短RNA,可通过结合细胞内的分子或蛋白质调节细胞内进程。尽管RNA适配体具有潜在的应用价值,但它并没有其他RNA技术广泛应用,主要问题是它们不能高浓度表达,从而不能有效调节蛋白质功能,同时也阻碍了RNA装置,例如RNA代谢物生物传感器在哺乳动物细胞中的应用。通常,基于RNA的生

基因表达RNA加工的机制介绍

  原核蛋白编码基因的转录产生的是可以翻译成蛋白质的信使RNA(mRNA),但真核基因的转录会产生RNA的初级转录本(pre-mRNA),必须经过一系列加工才能成为成熟RNA(mRNA)。RNA的加工包括5端加帽、3端多腺苷酸化和RNA剪接。RNA加工可能是真核生物细胞核带来的进化优势。在原核生物中

体内表达shRNA(短发夹RNA)的设计

1.克隆到shRNA表达载体中的shRNA包括两个短反向重复序列,中间由一茎环(loop)序列分隔的,组成发夹结构,由polⅢ启动子控制。随后在连上5-6个T作为RNA聚合酶Ⅲ的转录终止子。 2.两个互补的寡核苷酸两端须带有限制性酶切位点。 3.Stratagene发现29个寡核苷酸较之原先推荐的2

反义RNA调控细菌基因的表达功能介绍

  反义RNA对编码CAP的基因的调控作用已如前述。这里再介绍一下micF RNA对ompF基因的表达的调控。ompF蛋白质是大肠杆菌的外膜蛋白的主要成分这一。micF RNA是从另一基因(ompC基因)附近的DNA序列转录而来,和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互补,因此在体外m

关于基因表达的机制RNA加工的介绍

  基因表达的机制:原核蛋白编码基因的转录产生的是可以翻译成蛋白质的信使RNA(mRNA),但真核基因的转录会产生RNA的初级转录本(pre-mRNA),必须经过一系列加工才能成为成熟RNA(mRNA)。RNA的加工包括5端加帽、3端多腺苷酸化和RNA剪接。RNA加工可能是真核生物细胞核带来的进化优

DNA与RNA能协同互补调控基因表达

比利时布鲁塞尔自由大学主导的一项研究揭示,DNA和RNA的表观遗传学协同调控比过去想象的更加紧密。这项发表在最新一期《细胞》杂志上的研究,结合了DNA和RNA研究结果,指出这两种调控方式共同作用,形成一个互补系统:DNA表观遗传学决定了哪些基因可以被激活,而RNA表观遗传学则动态调整这些基因的表达水

反义RNA的调控细菌基因的表达功能

反义RNA对编码CAP的基因的调控作用已如前述。这里再介绍一下micF RNA对ompF基因的表达的调控。ompF蛋白质是大肠杆菌的外膜蛋白的主要成分这一。micF RNA是从另一基因(ompC基因)附近的DNA序列转录而来,和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互补,因此在体外mic

RNA干涉实验——采用RNA聚合酶Ⅲ启动子表达siRNA分子

实验方法原理因为哺乳动物细胞不具备低等真核生物细胞所具有的扩增 RNAi 信号的机制,因此人工合成或体外转录的 siRNA 分子在细胞内的作用是瞬时性的,不适合用于进行靶基因的表达受到抑制后细胞表型的长期变化观察,也不适于进行文库的筛选。此外,体外制备 siRNA 分子的成本比较高,而且 siRNA

婴儿鼻、肺细胞的RNA表达模式显著相似

   根据罗切斯特大学医学中心(URMC)最新的研究发现婴儿鼻细胞与肺部细胞非常类似,这一发现可使呼吸道合胞体病毒(RSV)和其他婴儿肺部疾病的诊断更精确。  患呼吸道疾病的婴儿十分脆弱,因此试图获取肺部样本是不安全的,该研究发表在科学报告上,为多年来受到挑战的医生提供了一条潜在诊断途径。然而,鼻细

关于基因表达的RNA输出和翻译的介绍

  1、基因表达的RNA输出  真核生物中,虽然一些RNA在细胞核中起作用,但大多数成熟的RNA必须通过核孔从细胞核输出到细胞质中。这些RNA包括蛋白质合成中涉及的所有RNA类型。在某些情况下,RNA被另外转运到细胞质的特定部分,如突触。  2、基因表达的翻译  成熟RNA是非编码RNA的最终基因表

过表达质粒与RNA干扰质粒有什么不同

本质上是一样的,都是让外源性的基因序列在细胞内得到表达。但是由于目的不同,技术细节上也会有不同。过表达的质粒如果是一过性表达,不需要整合到细胞染色体组,只要有强的启动子就可以了。稳定表达的,需要有筛选基因的表达来选出整合的细胞。而干扰质粒一般都需要是稳定的表达,现在都是通过慢病毒来实现,质粒基本都弃

环状RNA(circRNA)功能研究又一利器——过表达载体

circRNAs 环状 RNA(circular RNAs,circRNA)是一类具有闭合环状结构的 RNA 分子,早在 20 世纪八十年代即有研究报道,但由于其表达丰度低,文献报道较少,一直被认为是 RNA 转录剪切的罕见错误而被忽视。直到 2012 年开始有研究者开始大批量鉴定 circRN

T7RNA聚合酶系统基因表达实验

两种重组痘苗病毒共感染细胞 单病毒感染OST7-1细胞 利用VOTE系统             实验方法原理 含有 pT7 控制的外源基因(「痘苗病毒系统基

T7RNA聚合酶系统基因表达实验

实验方法原理 含有 pT7 控制的外源基因(「痘苗病毒系统基因表达实验」中「重组痘苗病毒(VTF7-3)感染后的脂质体转染」)的重组质粒,通过同源重组可整合到痘苗病毒中,并制备重组病毒储液。将此病毒储液与 vTF7-3 共同感染贴壁或悬浮细胞,在培养过程中,外源基因被高效的 T7 RNA

T7RNA聚合酶系统基因表达实验(三)

实验方法原理VOTE是最近发展的痘苗病毒/T7 RNA聚合酶混合表达系统,将外源基因克隆到质粒 pVOTE. 1或 pVOTE. 2 中,通过同源重组将其整合到痘苗病毒 vT7lacOI 基因组中,制备重组病毒储液。在异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)存在的条件下,用重组病毒感染细胞,外源基因

关于基因表达的机制非编码RNA的成熟的介绍

  多数生物体中的非编码基因(ncRNA)被转录为需要进一步加工的前体。核糖体RNA(rRNA)通常被转录为含有一个或多个rRNA的前体rRNA,前体rRNA后来在特定位点被大约150种不同的snoRNA切割和修饰。转移RNA(tRNA)的5'和3'端序列分别被RNase P和tRN

T7-RNA聚合酶/启动子表达实验

基本方案 备选方案 备选方案2             实验材料 载体 试剂、

T7RNA聚合酶系统基因表达实验(二)

单病毒感染OST7-1细胞实验方法原理OST7-1 细胞来源于鼠 L929 细胞,能在细胞质中持续表达噬菌体 T7 RNA 聚合酶,因此,应用此细胞系无需用 vTF7-3 感染细胞。实验材料贴壁培养的单层 OST7-1 细胞含有 pT7 控制的外源基因的重组病毒储液试剂、试剂盒完全 MEM-2.5

T7RNA聚合酶系统基因表达实验(一)

本节介绍依赖于在哺乳动物细胞质合成噬菌体T7 RNA聚合酶的瞬时细胞质表达系统。首先,将感兴趣的基因插入质粒中,使其位于T7 RNA聚合酶启动子(PT7)的控制下。在培养过程中,外源基因被高效的 T7 RNA聚合酶转录。这种转染方案适用于分析的目的,因为不需要构建新的重组病毒,所以比较简单。对于大规

长非编码RNA调控癌基因MYC表达的综述文章

  8月7日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员陈玲玲受邀在国际学术期刊Current Opinion in Genetics & Development 发表题为The long noncoding RNA regulation at the MYC locus 的综述论

北京生科院建立单细胞环形RNA分析技术及表达图谱

  环形RNA是一类在真核细胞中广泛存在的内源性非编码RNA分子,在生物体发育过程中发挥重要作用。之前研究已在不同物种中鉴定出数百万个环形RNA分子,并产生了大量用于揭示生物体组织表达模式的环形RNA数据资源。然而,由于大多数环形RNA表达量较低,传统的转录组测序方法无法表征单个细胞环形RNA表达谱

最准确的基因表达检测方法——RNA测序遭遇“信任”危机?

  当前,RNA测序成为了一种常用工具。  利用RNA测序,研究人员能够定量地检测各种生物体的基因表达,从而更好地了解细胞中正在发生的事情以及特定基因的功能。  RNA测序的准确性  早在2014年,《Nature Biotechnology》上发表了三篇文章。它们属于RNA测序质量控制(SEQC)

Nature子刊:RNA测序鉴定小胶质细胞独特表达基因

  马萨诸塞州综合医院(MGH)的研究者采用一种新的测序方法,鉴定了一组被脑免疫细胞——称为小胶质细胞—— 用来感知需要其做出反应的致病组织、毒素或损伤细胞的基因。这些基因的鉴定,能使我们更好地理解小胶质细胞在正常大脑和神经退行性疾病中的作用,为保护诸如阿尔茨海默氏病和帕金森氏综合症引起的损伤带

T7-RNA聚合酶/启动子表达实验

实验材料 载体试剂、试剂盒 氨苄青霉素卡那霉素pGP裂解缓冲液仪器、耗材 培养箱分光光度计离心机实验步骤 1.  将含有待表达基因的片段亚克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中,转化一种标准大肠杆菌菌株,此菌株不应带有可指导T7 RNA聚合酶合成的质粒。转化物涂布于氨苄青霉素平皿,于37℃温育培养

液相法筛选cDNA表达文库中RNA结合蛋白实验

将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上,然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法是筛选 RNA 结合蛋白研究中最常用的技术。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上,然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法

液相法筛选cDNA表达文库中RNA结合蛋白实验

实验方法原理 将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上,然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法是筛选 RNA 结合蛋白研究中最常用的技术。实验材料 TY试剂、试剂盒 储存液溶菌酶干粉细菌裂解缓冲液甘油水溶液实验步骤 一、材料与设备1. 2X TY:16 g 蛋白胨,10 g 酵母提

揭示宿主内的小RNA参与乙肝病毒表达调控

乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染可引起肝脏的急性和慢性炎症。急性感染一般表现为自限性肝炎,除爆发性肝炎外,对人体的危害较小;而慢性感染则与肝硬化(cirrhosis)和原发性肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的发生密切相关。全球

Nature:重大进展!揭示RNA中调节蛋白表达的隐藏信号

  科学家们早就知道RNA会编码表达蛋白的指令。组成RNA的构成单元(building block)---碱基A、U、C和G---形成了细胞中蛋白制造复合物(protein-making machinery)的蓝图。为了表达蛋白,这种复合物结合到RNA的一端上,然后沿着RNA扫描,直到它到达AUG密

T7-RNA聚合酶/启动子表达实验1

在适宜的条件下,T7 RNA聚合酶/启动子系统表达的基因产物可占细胞总蛋白的25%以上,但多数情况下产量比这个比例要低得多。实验材料载体试剂、试剂盒氨苄青霉素卡那霉素pGP裂解缓冲液仪器、耗材培养箱分光光度计离心机实验步骤1.  将含有待表达基因的片段亚克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中,转化