T7RNA聚合酶系统基因表达实验(一)
本节介绍依赖于在哺乳动物细胞质合成噬菌体T7 RNA聚合酶的瞬时细胞质表达系统。首先,将感兴趣的基因插入质粒中,使其位于T7 RNA聚合酶启动子(PT7)的控制下。在培养过程中,外源基因被高效的 T7 RNA聚合酶转录。这种转染方案适用于分析的目的,因为不需要构建新的重组病毒,所以比较简单。对于大规模的工作,PT7 操纵的基因可以通过同源重组插入另一个重组痘苗病毒中,使之与 vTF7-3 共同感染悬浮细胞(见「两种重组痘苗病毒共感染细胞」)或感染 OST7-1 细胞(可以持续表达 T7 RNA 聚合酶的稳定细胞系;见「单病毒感染OST7-1细胞」)。表达的蛋白质可以用脉冲标记的方法或用「重组痘苗病毒及其产物的鉴定实验」中叙述的方法分析鉴定,用「离子交换层析实验」描述的方法纯化。对痘苗病毒/T7 RNA聚合酶杂交表达系统有几种创新的方法,其中的一个新的改进是VOTE诱导的表达系统,它不需要应用两种重组病毒或特殊细胞系(见......阅读全文
T7RNA聚合酶系统基因表达实验
实验方法原理 含有 pT7 控制的外源基因(「痘苗病毒系统基因表达实验」中「重组痘苗病毒(VTF7-3)感染后的脂质体转染」)的重组质粒,通过同源重组可整合到痘苗病毒中,并制备重组病毒储液。将此病毒储液与 vTF7-3 共同感染贴壁或悬浮细胞,在培养过程中,外源基因被高效的 T7 RNA
T7RNA聚合酶系统基因表达实验
两种重组痘苗病毒共感染细胞 单病毒感染OST7-1细胞 利用VOTE系统 实验方法原理 含有 pT7 控制的外源基因(「痘苗病毒系统基
T7RNA聚合酶的基本信息
T7RNA聚合酶具有高度启动子专一性,且只会转录T7噬菌体中位于T7启动子下游的的DNA或DNA复制品。此酶在合成RNA的过程中,需要DNA模板与镁离子(Mg2+)作为辅因子。牛血清蛋白(bovine serum albumin,BSA)及精胺(spermidine)对此酶具促进效果。与细菌的RNA
T7RNA聚合酶的基本信息
T7RNA聚合酶具有高度启动子专一性,且只会转录T7噬菌体中位于T7启动子下游的的DNA或DNA复制品。此酶在合成RNA的过程中,需要DNA模板与镁离子(Mg2+)作为辅因子。牛血清蛋白(bovine serum albumin,BSA)及精胺(spermidine)对此酶具促进效果。与细菌的RNA
T7RNA聚合酶系统基因表达实验(二)
单病毒感染OST7-1细胞实验方法原理OST7-1 细胞来源于鼠 L929 细胞,能在细胞质中持续表达噬菌体 T7 RNA 聚合酶,因此,应用此细胞系无需用 vTF7-3 感染细胞。实验材料贴壁培养的单层 OST7-1 细胞含有 pT7 控制的外源基因的重组病毒储液试剂、试剂盒完全 MEM-2.5
T7RNA聚合酶系统基因表达实验(三)
实验方法原理VOTE是最近发展的痘苗病毒/T7 RNA聚合酶混合表达系统,将外源基因克隆到质粒 pVOTE. 1或 pVOTE. 2 中,通过同源重组将其整合到痘苗病毒 vT7lacOI 基因组中,制备重组病毒储液。在异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)存在的条件下,用重组病毒感染细胞,外源基因
T7RNA聚合酶系统基因表达实验(一)
本节介绍依赖于在哺乳动物细胞质合成噬菌体T7 RNA聚合酶的瞬时细胞质表达系统。首先,将感兴趣的基因插入质粒中,使其位于T7 RNA聚合酶启动子(PT7)的控制下。在培养过程中,外源基因被高效的 T7 RNA聚合酶转录。这种转染方案适用于分析的目的,因为不需要构建新的重组病毒,所以比较简单。对于大规
RNA-大量转录合成
实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE TE 饱和酚 氯仿异内醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5X 转录缓冲液 lOOmmoL LDTT RNasin rATPrGTPrUTPrCTP SF6T3 或 T7RNA 聚合酶 异戊醇 DNase 7.5mol L 乙酸铵 无水乙醇 乙醇实验
RNA-大量转录合成
实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE TE 饱和酚 氯仿
3.1.2-RNA-大量转录合成
RNA 标准转录体系的一般回收率为 lugRNA/ug 质粒 DNA, 使用下面的方法,可以提高回收率至 5〜l0ug RNA/ug 质粒 DNA。大量制备 RNA 可以用于体外翻译。实验材料模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒TETE 饱和酚氯仿异内醇3mol LNaAc无水乙醇5X 转录缓冲液lOO
依赖核酸序列的扩增技术解析
1.概述:依赖核酸序列的扩增(Nucleic acid sequence-basedamplification,NASBA),又称自主序列复制系统(self-sustainedsequence replication,3SR)或再生长序列复制技术。1990年Guatelli等首先报道了这一技术.NA
依赖核酸序列的扩增的基本方法
基本方法为:将引物,标本加入扩增反应液,65℃1min使RNA分子二级结构打开,降温至37℃加入逆转录酶,T7rna聚合酶和RNaseH,并在37℃反应1——1.5小时,其产物经琼脂 糖电泳,溴乙锭染色即可在紫外仪下看到条带.NASBA的特点为操作简便,不需特殊仪器,不需温度循环.整个反应过程由三种
核酸序列扩增法的技术特点
中文名称核酸序列扩增法英文名称nucleic acid sequence-based amplification;NASBA定 义一种在等温系统中扩增核酸的方法。即利用T7RNA聚合酶仅在结合核酸上相应位点时才能起作用的特点,将结合位点序列与靶序列相连,然后产生靶分子的RNA拷贝,形成反转录和RN
核酸序列扩增法的定义和原理
中文名称核酸序列扩增法英文名称nucleic acid sequence-based amplification;NASBA定 义一种在等温系统中扩增核酸的方法。即利用T7RNA聚合酶仅在结合核酸上相应位点时才能起作用的特点,将结合位点序列与靶序列相连,然后产生靶分子的RNA拷贝,形成反转录和RN
核酸序列扩增法的定义
中文名称核酸序列扩增法英文名称nucleic acid sequence-based amplification;NASBA定 义一种在等温系统中扩增核酸的方法。即利用T7RNA聚合酶仅在结合核酸上相应位点时才能起作用的特点,将结合位点序列与靶序列相连,然后产生靶分子的RNA拷贝,形成反转录和RN
如何做原核表达(prokaryotic-expression)(二)
几个常用的启动子和诱导调控表达系统最早应用于的表达系统是Lac乳糖操纵子,由 启动子Plac + 操纵基因lacO +结构基因组成。其转录受CAP正调控和lacI负调控。lacUV5突变能够在没有CAP的存在下更有效地起始转录,该启动子在转录水平上只受lacI 的调控,因而随后得到了更广泛采用。la
原核表达载体的重要调控元件(启动子、SD序列与终止子)
1.启动子 启动子是DNA链上一段能与RNA聚合酶结合并起始RNA合成的序列,它是基因表达不可缺少的重要调控序列。没有启动子,基因就不能转录。由于细菌RNA聚合酶不能识别真核基因的启动子,因此原核表达载体所用的启动子必须是原核启动子。 原核启动子是由两段彼此分开且又高度保守的核苷酸序列组成,
关于PCR技术的各种变体的介绍
1.递减PCR(touchdown PCR):前几循环温度逐渐下降。 2.逆转录PCR(RT-PCR):以由mRNA逆转录而来的DNA为模板,由此产生出来的DNA不带有内含子(基因中不具意义的段落),常应用于分子克隆技术。 3.热启动PCR(hot start PCR):以高热活化型核酸聚合
聚合酶的分类
可分为以下几个类群:(1)依赖DNA的DNA聚合酶;(2)依赖RNA的DNA聚合酶;(3)依赖DNA的RNA聚合酶;(4)依赖RNA的RNA聚合酶。前两者是DNA聚合酶,它使DNA复制链按模板顺序延长。如在原核生物中仅就大肠杆菌中已被发现的就有三种(分别简称为PolⅠ,PolⅡ和PolⅢ等);D
聚合酶的分类
可分为以下几个类群:(1)依赖DNA的DNA聚合酶;(2)依赖RNA的DNA聚合酶;(3)依赖DNA的RNA聚合酶;(4)依赖RNA的RNA聚合酶。前两者是DNA聚合酶,它使DNA复制链按模板顺序延长。如在原核生物中仅就大肠杆菌中已被发现的就有三种(分别简称为PolⅠ,PolⅡ和PolⅢ等);DNA
PCR的相关技术
随着人们对PCR基本原理的认识和技术的掌握,通过对PCR 技术的大量改进,派生发展出一系列新的相关技术和改良方法。 逆转录PCR(RT-PCR): 以由mRNA逆转录而来的cDNA为模板,也因为是从表现型基因来进行增量的,由此产生出来的cDNA产物不带有内含子,常应用于分子克隆技术[6]。
依赖核酸序列的扩增技术相关
NASBA的简要过程如下:1.RNA模板链进入反应混合物后,第一个引物首先与模板链的3'端结束。2. 反转录酶,合成反义的补偿的DNA链。3. RNA 酶H(一种核糖核酸内切酶,能够特异性地水解杂交到DNA链上的RNA磷酸二酯键,分解RNA/DNA杂交体系中的RNA链,但不能消化单链或双
关于RNA探针的基本原理介绍
体外转录技术不断完善,已相继建立了单向和双向体外转录系统。该系统主要基于一类新型载体pSP和pGEM,这类载体在多克隆位点两侧分别带有SP6启动子和T7启动子,在SP6RNA聚合酶或T7RNA聚合酶作用下可以进行RNA转录,如果在多克隆位点接头中插入了外源DNA片段,则可以此DNA两条链中的一条
DNA聚合酶的特性
良好的热稳定性;70℃ 2h,残留90%活性;93℃ 2h,残留60%活性;94℃ 2h,残留40%活性。5'→3'聚合酶活性,对dATP有优先聚合活性;5'→3'外切酶活性;无3'→5'外切酶活性。
DNA聚合酶的用途
聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)。Taq酶扩增的PCR产物,3'末端总是带有1个非模板依赖型的突出碱基,而这个碱基几乎总是A,因为Taq酶对dATP具有优先聚合活性,故可用T载体克隆。
DNA聚合酶的缺点
缺点无3'→5'阅读校正功能,在PCR扩增过程可引起错配,30次循环错配率约0.25%。措施:选择高保真Taq酶,如Pfu。原因:Pfu具有3'→5'外切酶活性。注意:Pfu扩增产物为平末端。
聚合酶的基本特性
聚合作用在引物RNA'-OH末端,以dNTP为底物,按模板DNA上的指令由DNApolⅠ逐个将核苷酸加上去,就是DNApolⅠ的聚合作用。酶的专一性主要表现为新进入的脱氧核苷酸必须与模板DNA配对时才有催化作用。dNTP进入结合位点后,可能使酶的构象发生变化,促进3'-OH与5
聚合酶链[式]反应
中文名称聚合酶链[式]反应英文名称polymerase chain reaction;PCR定 义通过DNA互补双链解链、退火和聚合延伸的多次循环来扩增DNA特定序列的方法。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生物学技术(二级学科)
定量聚合酶链反应
中文名称定量聚合酶链反应英文名称quantitative PCR;qPCR定 义将某种已知含量的DNA模板作为内标准进行PCR反应,对待测模板进行定量分析的方法。更灵敏的定量PCR是采用实时PCR方法。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生物学技术(二级学科)
反向聚合酶链反应
中文名称反向聚合酶链反应英文名称inverse PCR;iPCR定 义用于扩增已知序列的DNA旁侧未知序列的方法。即先用在已知DNA序列上没有识别位点的限制内切酶,切出包含已知DNA、而两端带有未知序列的区段,将切出的DNA区段环化,然后再按已知的DNA序列设计一对引物进行扩增。应用学科细胞生物学