Cell子刊：“垃圾”DNA的阴暗面
在基因之间的DNA片段，散布着重复序列，曾经被认为是“基因组垃圾”，但现在科学家们了解到，一些这样的垃圾DNA并不是无害的。在《Cell Reports》发表的一项研究中，来自北卡罗来那大学（UNC）Lineberger综合癌症中心的研究人员报道称，某些短的DNA重复序列，或“垃圾DNA”，在尤文肉瘤的发展中起着重要的作用，这是一种罕见的骨与软组织肿瘤，在儿童和青少年中最常见。该研究的资深作者、UNC儿科肿瘤学家、UNC医学院儿童癌症副教授Ian J. Davis博士说：“有些人可能仍然认为这些非编码序列是垃圾序列；它们的确不起什么作用，只是基因组更著名部分的随处者。但是我们发现，这些重复序列基于它们与不成熟细胞共有的特性，有助于尤文氏肉瘤的发展。”对于大多数尤文氏肉瘤患者来说，他们的肿瘤有一个突变，可产生一个新的基因称为EWSR1-FLI1。该基因可编码一种突变蛋白，称为癌基因，可驱动癌症。但事实证明，该突变蛋白不能单独起作用......阅读全文
Cell子刊：“垃圾”DNA的阴暗面
在基因之间的DNA片段，散布着重复序列，曾经被认为是“基因组垃圾”，但现在科学家们了解到，一些这样的垃圾DNA并不是无害的。在《Cell Reports》发表的一项研究中，来自北卡罗来那大学（UNC）Lineberger综合癌症中心的研究人员报道称，某些短的DNA重复序列，或“垃圾DNA”，在尤文肉
研究人员“沉默”重要的致癌基因
最近，来自北卡罗来纳大学（UNC）医学院和德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员，开发出一种新方法，阻断KRAS致癌基因——在人类癌症中最常见的一个突变基因。这项研究，由UNC医学副教授Chad Pecot带领，为攻击KRAS提供了另外一种途径，这个突变被证明是药物开发当中一个难懂而令人沮丧的
真核基因组的中度重复顺序—组蛋白基因的基本介绍
组蛋白基因在各种生物体内重复的次数不一样，但都在中度重复的范围内。通常每种组蛋白的基因在同一种生物中拷贝数是相同的。鸡的基因组中组蛋白基因有10个拷贝，在哺乳动物中为20拷贝，非洲爪蟾为40拷贝，而海胆的每种组蛋白的基因达300-600拷贝。不同生物中组蛋白基因在基因组中的排列不一样，组蛋白基因
Mol－Cancer－Ther：研究人员沉默重要致癌基因
近日，北卡罗来纳大学（UNC）医学院和德克萨斯大学MD安德森癌症中心研究人员开发出一种新方法，能阻断KRAS致癌基因，KRAS是在人类癌症中最常见的一个突变基因。这种新方法依赖于小干扰RNA（siRNA）的一种特定序列类型。 RNAi技术已经在肝脏疾病，病毒感染以及癌症的治疗中显示出有很大潜能
从抑癌基因到致癌基因，这个蛋白有“两副面孔”
科学家们早就知道p53蛋白，它的突变是引发许多不同类型癌症发病的一个关键因素。然而，其未突变的形式却可以预防癌症。 这些“两面派”的特性，使得p53蛋白和调控基因成为生物学研究最多的对象之一。但调控其稳定性和功能的分子机制，我们并不完全了解。 威斯康星大学麦迪逊分校(University o
关于真核基因组的高度重复序列的介绍
1、真核基因组的高度重复序列— 简介 高度重复序列在基因组中重复频率高，可达10^3以上，因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异，约占10-60%，在人基因组中约占20%。高度重复顺序又按其结构特点分为三种。 2、真核基因组的高度重复序列—倒位重复序列 这种重复顺序复性速度极快，即
新算法TRFill解决生物基因组重复序列组装难题
近日，中国农业科学院农业基因组研究所农业基因组学技术研发与应用创新团队开发出了一种新算法——TRFill，解决了现有工具无法完全填补基因组间隙的难题，显著提升了基因组质量。相关研究成果发表在《基因组生物学》（Genome Biology）上。 动植物基因组的许多区域存在大量高度重复的DNA片段
厦门大学PNAS发表癌症研究新成果
来自厦门大学的研究人员证实，Menin通过表观遗传上调Yap1的转录促进了肝癌的形成。这一研究发现在线发表在10月7日的《美国科学院院刊》(PNAS)上。 文章的通讯作者是厦门大学金光辉(Guang-Hui Jin)教授，金教授早年毕业于白求恩医科大学，主要研究领域为探讨疾病发病进程中
反向重复[序列]的定义
存在于双链核酸分子中排列顺序方向相反的一段核苷酸序列。
串联重复[序列]的定义
中文名称串联重复[序列]英文名称tandem repeat定 义首尾相连的重复序列。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
重复[DNA]序列的概念
中文名称重复[DNA]序列英文名称repetitive [DNA] sequence定 义DNA分子中重复出现的核苷酸序列。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
简单重复序列的概念
简单重复序列（Simple Sequence Repeat，简称SSR），是指重复单位长度和碱基组成基本一致，只 有少数基因出现微小的差异的一类短串联重复序列。
Alu重复序列的概念
中文名称Alu重复序列英文名称Alu repetitive sequence;Alu family定 义哺乳动物和人基因组中的一种中等重复序列，因该序列中有限制性内切酶Alu的切点而得名。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
高度重复序列的概念
高度重复序列是一组基因序列，在基因组中重复频率高，可达百万(10^6)以上，因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异，约占10-60%，在人基因组中约占20%。
中度重复序列的概念
中度重复序列(moderately repetitive sequence )一般是非编码序列，有十个到几百个拷贝，如 rRNA基因和 tRNA 基因等。这类重复序列的平均长度大约为 300bp ，往往构成序列家族，常以回文序列形式出现在基因组的许多位置上，有些同单一序列间隔排列。大部分中度重复序列
低度重复序列的概念
低度重复序列在单倍体基因组中只出现一次或数次，因而复性速度很慢。单拷贝顺序在基因组中占50-80%，如人基因组中，大约有60-65%的顺序属于这一类。单拷贝顺序中储存了巨大的遗传信息，编码各种不同功能的蛋白质。尚不清楚单拷贝基因的确切数字，但是是有其在单拷贝顺序中只有一小部份用来编码各种蛋白质，其他
中山大学Cell－Stem－cell发布表观遗传重要成果
来自中山大学生命科学学院、Baylor医学院的研究人员证实，在DNA低甲基化时Daxx/Atrx复合物通过促进H3K9三甲基化（H3K9me3）保护了串联重复元件（Tandem Repetitive Elements）。这一重要的研究发现发布在9月3日的《细胞干细胞》（Cell stem Cel
Science：组蛋白单点突变可导致罕见儿童癌症
近日，国际学术期刊Science发表了一项最新研究进展，他们发现一种组蛋白编码基因发生缺陷与儿童恶性肿瘤的发生有关。来自美国威斯康星麦迪逊大学的Peter W. Lewis表示，大多数癌症的发生需要多个突变的共同作用，而他们发现的这个基因突变本身就足以导致形成肿瘤。 组蛋白除了用于形成核小体，
赵可吉教授Cell子刊解析干细胞调控
来自美国国立卫生研究院的研究人员在新研究中证实：一种称作H2A.Z的组蛋白变异体在胚胎干细胞(ESC)自我更新和分化过程中扮演重要角色，这将有助于对胚胎干细胞命运机制的进一步研究。相关论文发表在12月20日的《细胞干细胞》(Cell stem cell)杂志上。 领导这一研究的是NIH
Genes－Dev解析致癌组蛋白突变引发癌症的分子机制
来自清华大学医学院李海涛教授课题组7月31日在《基因与发育》(Genes&Development)杂志上发表了题为《Molecular basis for oncohistone H3 recognition by SETD2 methyltransferase》(甲基转移酶SETD2识别致癌组
microRNA的肿瘤抑制因子角色
美国南加州大学的研究人员报道说，一种新的方法通过活化癌细胞基因组中保护性的microRNA的表达，从而使致癌基因的表达水平显著降低。这篇发表在6月的Cancer Cell杂志上的文章证明已知能调节基因表达的制剂还能够影响调节性的RNA。这种调节性的RNA即为microRNA，它能充当正常细胞中的肿瘤
上海交大LncRNA研究刊登国际期刊
长非编码RNA（lncRNA）不编码蛋白质，最初被认为是基因组“暗物质”的一部分。最近，有研究表明，lncRNAs在染色质修饰复合物的招募过程中发挥作用，并能影响基因的表达。然而，是否lncRNAs以类似的方式在癌症中发挥作用，尚不明确。延伸阅读：中美学者JBC解析lncRNA在EMT中的作用。
散在重复序列的概念
散在重复序列是与串联重复序列的组织形式不同的另一类重复序列，是散在方式分布于基因组内的散在重复序列。
散在重复序列的定义
散在重复序列是与串联重复序列的组织形式不同的另一类重复序列,是散在方式分布于基因组内的散在重复序列。
简单重复序列的功能特点
SSR 标记具有高度重复性、丰富的多态性、共显性、高度可靠性等优点，但由于其需要对所研究物种的一系列微卫星位点进行克隆和测序分析，以便设计相应的引物，这是非常费时、费力和代价昂贵的工作，没有足够的投资、人力和时间，是不可能实现的，因而给它的利用带来了一定困难。
同向重复[序列]的概念
中文名称同向重复[序列]英文名称direct repeat定 义核苷酸排列次序一致的重复序列。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
长末端重复序列的定义
长末端重复序列(long terminal repeats,LTRs)是相同的DNA序列,重复数百或数千次发现在两端retrotransposons或前病毒的DNA由反转录的RNA逆转录病毒。
末端反向重复[序列]的定义
中文名称末端反向重复[序列]英文名称inverted terminal repeat;ITR定 义排列顺序相反的、等同的或密切相关的核苷酸序列。常出现于某些转座子的末端。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
高度重复序列的结构特点
倒位（反向）重复序列这种重复顺序复性速度极快，即使在极稀的DNA浓度下，也能很快复性，因此又称零时复性部分，约占人基因组的5%。反向重复序列由两个相同顺序的互补拷贝在同一DNA链上反向排列而成。变性后再复性时，同一条链内的互补的拷贝可以形成链内碱基配对，形成发夹式或“+”字形结构。倒位重复（即两个互