江苏疾控首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒
该病毒是我中心病原所对今年9月27日江苏出入境检验检疫局送检的一例从新加坡回国的发热病人咽拭子样本进行病原体检测后所得。病原所实验室人员通过对送检样本用高通量测序技术检测发现其中含有一种新型环状单链DNA病毒片段，后根据高通量测序reads序列设计特异引物，对病人咽拭子样本进行PCR扩增，产物经过sanger测序、序列组装，于10月26日获得该病毒全长基因序列3018 nt。 该病毒基因组含2种主要开放读码框（ORFs），分别编码复制酶蛋白Rep和衣壳蛋白Cap；有2个基因间隔区，其中大的间隔区含有环状病毒特征性茎环结构。与该病毒最相似的为猪粪相关的环状病毒5（porcine stool-associated circular virus 5 (PoSCV5) , isolate CP3），编码蛋白氨基酸序列相似性约为43%和50%，进化分析揭示这2种编码蛋白分别与环状病毒科及未分类的环状单链DNA病毒聚为一类，疑似为一种......阅读全文
江苏疾控首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒
该病毒是我中心病原所对今年9月27日江苏出入境检验检疫局送检的一例从新加坡回国的发热病人咽拭子样本进行病原体检测后所得。病原所实验室人员通过对送检样本用高通量测序技术检测发现其中含有一种新型环状单链DNA病毒片段，后根据高通量测序reads序列设计特异引物，对病人咽拭子样本进行PCR扩增，产物经
江苏疾控首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒
该病毒是我中心病原所对今年9月27日江苏出入境检验检疫局送检的一例从新加坡回国的发热病人咽拭子样本进行病原体检测后所得。病原所实验室人员通过对送检样本用高通量测序技术检测发现其中含有一种新型环状单链DNA病毒片段，后根据高通量测序reads序列设计特异引物，对病人咽拭子样本进行PCR扩增，产物经
单链DNA测序技术助力获取游离核酸多组学数据
游离DNA（cfDNA）是指游离在细胞外的DNA，存在于血浆、血清或尿液等体液中。cfDNA的片段组学特征可用于微创、实时、动态地监测生理和病理状态，在肿瘤早筛与复发监测、母婴健康、器官移植、感染疾病等领域具有广阔的应用前景。高通量测序技术是表征cfDNA片段组学特征的主要手段，其中，双链DNA文库
制备DNA测序模板实验——制备单链M13噬菌体DNA
本实验包含了用于制备适用于双脱氧测序的模板及适用于末端标记和化学测序的DNA的实验方案。所有用于双脱氧测序的双链模板在与引物退火前必须变性，在一般应用上，碱变性在测序中的效果比热变性好。实验材料大肠杆菌试剂、试剂盒LBTEM13聚乙二醇容易让顶层琼脂乙酸钠乙醇仪器、耗材巴斯德吸管试管离心机实验步骤1
单链互补DNA的定义
中文名称单链互补DNA英文名称single-strand cDNA;sscDNA定 义在逆转录酶催化下，以信使核糖核酸(mRNA)为模板合成与mRNA序列互补的单链DNA。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
细胞化学词汇单链DNA
中文名称：单链DNA外文名称：single－stranded DNA术语含义：单链DNA就是指以这种状态存在的DNA。单链DNA在分子流体力学性质、吸收光谱、碱基反应性质等方面都和双链DNA不同。某些噬菌体粒子内含有单链环状的DNA，这样的噬菌体DNA在细胞内增殖时则形成双链DNA。
单链DNA探针技术简介
用双链探针杂交检测另一个远缘DNA时,探针序列与被检测序列间有很多错配。而两条探针互补链之间的配对却十分稳定,即形成自身的无效杂交,结果使检测效率下降。采用单链探针则可解决这一问题。单链DNA探针的合成方法主要有下列两种:(1) 以M13载体衍生序列为模板,用Klenow片段合成单链探针; (2)
单链DNA的结构特点
单链DNA就是指以这种状态存在的DNA。单链DNA在分子流体力学性质、吸收光谱、碱基反应性质等方面都和双链DNA不同。某些噬菌体粒子内含有单链环状的DNA，这样的噬菌体DNA在细胞内增殖时则形成双链DNA。
细胞化学词汇单链互补DNA
中文名称：单链互补DNA英文名称：single-strand cDNA;sscDNA定 义：在逆转录酶催化下，以信使核糖核酸(mRNA)为模板合成与mRNA序列互补的单链DNA。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
抗单链DNA抗体的概述
抗ssDNA是抗DNA抗体中临床意义和重要性都不如抗dsDNA的一种，DNA是一个大分子的复合物，由两条核苷酸链形成的双螺旋结构。加热时碱基间的氢键断裂，DNA变性产生ssDNA。抗ssDNA的反应位点主要是ssDNA上的嘌呤和嘧啶构成的碱基。
单链DNA文库的SELEX筛选实验
单链DNA文库的SELEX筛选实验可用于：（1）体外诊断；（2）体内治疗等。实验方法原理SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外，还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选，而且 DNA 文库具有更好的稳定性，操作也相对简便。实验材料3
分子遗传学词汇单链DNA
中文名称：单链DNA外文名称：single－stranded DNA定义：大部分DNA以双螺旋结构存在，但一经热或碱处理就会变为单链状态。
单链DNA的功概念和作用
单链DNA就是指以这种状态存在的DNA。单链DNA在分子流体力学性质、吸收光谱、碱基反应性质等方面都和双链DNA不同。某些噬菌体粒子内含有单链环状的DNA，这样的噬菌体DNA在细胞内增殖时则形成双链DNA。
单链DNA文库的SELEX筛选实验
实验方法原理 SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外，还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选，而且 DNA 文库具有更好的稳定性，操作也相对简便。
单链DNA结合蛋白的功能简介
单链DNA结合蛋白（Single-stranded DNA-binding protein，缩写SSB或SSBP）又称单链结合蛋白，是专门负责与DNA单链区域结合的一种蛋白质，为DNA复制、重组和修复所必需的成分。 防止两条互补单链再次结合为双螺旋，维持单链状态。防止单链区域形成链内二级结构。
单链DNA文库的SELEX筛选实验
实验方法原理 SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外，还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选，而且 DNA 文库具有更好的稳定性，操作也相对简便。实验材料 3' 引物链亲和素磁珠仪器、耗材 电泳仪PCR 仪离心机凝胶成像仪
DNA测序——双脱氧链末端终止法
实验方法原理DNA聚合酶催化的DNA链延伸是在3'-OH末端上进行的。由于2’，3’-双脱氧三磷酸核苷酸(ddNTP)的3'-位脱氧而失去游离-OH，当它参入到DNA链后，3'-OH末端消失，使DNA链的延伸终止。 本实验根据此原理，将待测DNA片段插入单链噬菌体M13载体，
用高通量免疫测序诊断病毒感染
药明康德合作伙伴 Adaptive Biotechnologies 宣布在《自然》子刊《Nature Genetics》上发表创新型研究论文，结果证明可提供一种潜在的新颖方法诊断慢性病毒感染。▲药明康德合作伙伴 Adaptive Biotechnologies 在《Nature Genetics》上
单链DNA基因组结构揭示了真核病毒的祖先事件
海藻病毒（Marine algae viruses）是控制海洋生态系统中微生物群落的重要组成部分，在病毒进化的早期起着基础性作用。在这里，我们关注的是一个主要的海藻病毒群，单链DNA（ssDNA）病毒Bacilladnaviridae。我们提出了海藻病毒Chaetoceros tenuissimus
单链DNA结合蛋白的基本内容
单链结合蛋白（SSB，single strand DNA-binding protein）：结合于螺旋酶沿复制叉方向向前推进产生的单链区，防止新形成的单链DNA重新配对形成双链DNA或被核酸酶降解的蛋白质。 螺旋酶沿复制叉方向向前推进产生了一段单链区，但是这种单链DNA不会长久存在，会很快重新
单链Oligo合成与DNA组装技术－（二）
2.2 Golden Gate组装Golden Gate组装技术是基于非同源重组的代表性技术，其利用Ⅱ型限制性酶 BsaⅠ在识别位点外部切割的特性，设计特异的突出序列同时组装多个片段，且酶切和酶连可以同时进行，原理如图3所示。首先，扩增目的片段，在两端加上BsaⅠ识别序列，同时在识别序列内侧
单链Oligo合成与DNA组装技术－（一）
合成生物学作为迅速发展的交叉学科，已在生物医药、新材料、诊断、能源和数据储存等领域展现越来越广泛的应用潜力。合成基因组学作为合成生物学的重要研究方向，着重于新生命体系的从头设计与合成，其以Oligo（寡核苷酸链）合成、拼装和转移等核心技术为支撑。新生命体系的从头设计与合成不仅需要合成组成基因组的小片
高通量测序
高通量测序技术又称“下一代”测序技术，以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。高通量测序包括：大规模平行签名测序、聚合酶克隆、454焦磷酸测序、离子半导体测序和DNA 纳米球测序等技术。 高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十万到几百万条DN
制备DNA测序模板实验——双脱氧测序的双链质粒DNA的碱变性
实验材料DNA试剂、试剂盒NaOHEDTA乙酸钠乙醇仪器、耗材离心管离心机摇床实验步骤1. 加入约0.5 pmol 重组质粒DNA于0.5 ml 微量离心管中，如果体积大于20 μl 应以乙醇沉淀，重溶于20 μl 水。2. 如果体积小于20 μl，用水补足20 μl。3. 加入2 μl 2
高通量DNA自动测序仪技术指标
高通量DNA自动测序仪是一种用于信息科学与系统科学领域的分析仪器，于2012年3月15日启用。 技术指标 1.双光速双侧激光和后置超薄CCD检测成像系统 2.内置一体化自动进样器及样品板储器。 3.内置样品板条形码自动识别。 4.100次（9600个样品）运行试剂一次性上机。 5.自
环状－RNA－测序案例分析
案例：以结肠癌，卵巢癌，特发性肺纤维化及正常的人组织为例探讨 circular RNAs 的富集与增殖的相关性 背景：最新研究表明，circular RNAs 大量存在，是构成生物体 RNA 网络的一部分，而且研究者们推测 circular RNAs 与 miRNAs 一样具有生物学功能。 目的
M13噬菌体单链DNA的制备
实验方法原理 M13 噬菌体单链 DNA 是从感染细胞分泌至周围培养液中的病毒颗粒中制备的，首先在高盐存在下，丝状病毒被聚乙二醇（PEG) 沉淀浓缩，然后用酚抽提释放单链 DNA，最后乙醇沉淀收集单链 DNA。
如何从单链dna中获取核酸适配体
加随机序列进行封闭
用噬菌粒载体制备单链DNA
实验方法原理 噬菌粒巧妙地组合了质粒和丝状噬菌体的特征。除了基本特征外，这些质粒通常是高拷贝数的，并带有一个修饰后的丝状噬菌体的主要基因间区。这个区域 ( 野生型为 508 bp)不表达蛋白，但含有全部的顺式作用序列，该作用是病毒 DNA
用噬菌粒载体制备单链DNA
噬菌粒巧妙地组合了质粒和丝状噬菌体的特征。除了基本特征外，这些质粒通常是高拷贝数的，并带有一个修饰后的丝状噬菌体的主要基因间区。这个区域 ( 野生型为 508 bp)不表达蛋白，但含有全部的顺式作用序列，该作用是病毒 DNA 合成起始和结束及噬菌体颗粒的形态发生必不可少的。本实验来源「分子克隆实验指