Science采用改进CRISPR技术发现近500个新的lncRNAs

长链非编码RNA (lncRNAs)是一类长度大约为200个核苷酸,但不编码任何蛋白的神秘分子,一直以来科学家们都想知道基因组中这类分子到底是起什么作用的。 12月15日Science杂志公布了一项最新研究发现:来自加州大学旧金山分校的研究人员识别出了499个新lncRNAs,这为理解这些小分子的功能奠定了基础。同时研究人员也发现lncRNAs与大多数编码基因不同,后者能作用于多种细胞系,但令人惊讶的是,90%已发现的lncRNAs只会影响一种细胞类型的生长。 “大多数细胞中都具有大量的lncRNAs这种神秘分子,但我们不知道它们具体有多少,哪些对基本生物功能具有重要意义。这项最新成果让我们惊讶的是,大多数lncRNAs只在一种细胞类型内发挥功能,这种RNA功能的极度特异性是之前未曾发现过的,”文章作者,加州大学旧金山分校神经学家和临床医师 Daniel Lim说。 之前的研究表明,某些lncRNAs 在细胞生长和功能......阅读全文

第二军医大Hepatology解析非编码RNA与癌症

  来自第二军医大学的研究人员在新研究中揭示了一种与肝癌微血管浸润相关的长链非编码RNA,以及其促进血管生成的分子机制,这一RNA或可作为肝癌患者肝切除术后患者无复发的生存率不良的预测因子。相关论文发表在相关论文发表在国际著名肝脏疾病杂志Hepatology上(最新影响因子11.665)上。   

长链非编码RNA测序服务助力揭开lncRNA神秘面纱

  2012年12月18日,华大基因科技服务有限公司(简称“华大科技”)在国内推出长链非编码RNA测序(lncRNA-Seq)服务。该技术突破了常规研究方法效率低、研究范围受限的瓶颈,可一次性获得样本中几乎全部的lncRNA序列,不仅可以对已知lncRNA进行定量分析,还可对 novel lnc

长非编码RNA调控癌基因MYC表达的综述文章

  8月7日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员陈玲玲受邀在国际学术期刊Current Opinion in Genetics & Development 发表题为The long noncoding RNA regulation at the MYC locus 的综述论

第二军医大Hepatology解析非编码RNA与癌症

  来自第二军医大学的研究人员在新研究中揭示了一种与肝癌微血管浸润相关的长链非编码RNA,以及其促进血管生成的分子机制,这一RNA或可作为肝癌患者肝切除术后患者无复发的生存率不良的预测因子。相关论文发表在相关论文发表在国际著名肝脏疾病杂志Hepatology上(最新影响因子11.665)上。   

上海交通大学权威期刊解析癌症与非编码RNA

  来自上海交通大学附属瑞金医院的研究人员在新研究中证实,一种叫做ZFAS1的长链非编码RNA(lncRNA)编码基因发生扩增促进了肝细胞癌(HCC)转移。这一研究发现发表在6月11日的《癌症研究》(Cancer Research)杂志上。  文章的通讯作者是上海交通大学附属瑞金医院的祝哲诚(Zhu

研究发现非编码RNA控制高毒力超级细菌感染致病

  8月13日,中国科学院上海免疫与感染研究所晁彦杰研究组在《自然-通讯》(Nature Communications)上发表了题为RNA interactome of hypervirulent Klebsiella pneumoniae  reveals a small RNA inhibito

研究发现长非编码RNA调控学习记忆新机制

  4月30日,《自然-通讯》(Nature Communications)杂志以研究论文形式发表了中国科学技术大学刘强研究组题为Activity dependent LoNA Regulates Translation by Coordinating rRNA Transcription and

Nature子刊:长非编码RNA可模拟DNA起作用

  长期以来,人们一直认为基因组的大部分区域属于“禁飞区”。这些区域不编码任何蛋白,因此细胞的基因读取机器很少接近。然而近年来科学家们发现,许多非编码序列其实能够转录成RNA,Gas5就是其中之一。  GAS5是一段基因间的长非编码RNA(lincRNA),它来自于非编码的“垃圾DNA”或“基因组的

中科院Cell-Res发表非编码RNA研究新成果

  来自中科院上海生命科学研究院的研究人员近日在新研究中证实,在精子发生后期粗线期piRNAs导致了大量的mRNA消失。这一研究发现发表在5月2日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。  中科院上海生命科学学院的刘默芳(Mo-Fang Liu)研究员是这篇论文的通讯作者,其研究方向是非

云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

  RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN

云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

  RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN

曹雪涛团队再发Nature——揭示新型非编码RNA调控网络

  先天性免疫反应可保护宿主免受病原体感染,并向病原体施加进化压力,以减弱这些反应并确保其存活和复制的策略。这些不断变化的压力导致了跨宿主-病原体相互作用的先天性免疫稳态的复杂机制,但尚未得到全面了解。尤其是,更好地了解控制宿主与病原体相互作用并促进入侵病原体清除或逃逸的调节剂,可以确定传染病和慢性

仅需1个长非编码RNA变化足以逆转细胞衰老

  随着时间推移,细胞慢慢老化,许多疾病发病都跟细胞衰老有关。诱导细胞再生是对抗细胞衰老相关疾病的核心策略之一。然而,老化细胞往往高度抵抗任何旨在诱导再生的操作。(老年成纤维细胞重编程效果低下)  虽然众所周知RNA负责细胞内蛋白质合成,但是一类被称为非编码RNA的特殊分子从来不会被转化为蛋白质,事

基因组所发表长非编码RNA分类问题综述文章

  近日,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室的“百人计划”研究员章张及其团队,与沙特阿卜杜拉国王科技大学(King Abdullah University of Science and Technology)开展科研合作,对长非编码RNA的分类问题进行了系统综述,相关论文在RN

中科院Nature子刊发表非编码RNA研究重要发现

  来自中科院动物研究所生物膜与膜生物功能国家重点实验室的研究人员在新研究中证实,CARL lncRNA通过破坏miR-539依赖性的PHB2下调,抑制了心肌细胞中缺氧诱导的线粒体分裂和凋亡。   领导这一研究的是中科院动物研究所细胞增殖与信号调控研究组组长李培峰(Pei-Feng Li)

研究发现空气污染诱发肺癌关键长链非编码RNA

  中科院动物所周光飚研究组通过深入研究,发现了空气污染诱发肺癌的关键长链非编码RNA。相关成果日前发表于肿瘤学杂志Oncotarge。  据了解,肺癌已成为全球发病率最高、致死人数最多的癌症,其中90%的肺癌由吸烟、空气污染等环境因素引起。然而,空气污染诱发肺癌的分子机制目前尚不清楚。  此前研究

我科学家发现一类新型长非编码RNA

  国际著名学术期刊《分子细胞》近日以封面故事发表了中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组的最新研究论文,揭示了一类全新内含子来源的长非编码RNA的产生机制,及其参与剪接调控的重要功能。这将为进一步了解PWS综合征的病理机制提供新的研究思路。   几乎所有哺乳动物细胞的基因

长非编码RNA调控炎症小体组装激活研究中取得进展

  4月3日,中国科学技术大学教授吴缅研究组在国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)上在线发表题为The lncRNA Neat1 promotes activation of inflammasomes in macrophages 的研究论文。   在固有免疫反

长链非编码RNA对脑生长起重要作用

  “长非编码RNA通常被描述为‘基因组的暗物质’。在这里,我们系统地研究了它们对大脑发育、长期记忆储存、衰老和痴呆导致的记忆力下降的分子机制,”Puthanveettil说。  RNA是细胞的主要调节因子,是读取、转录和调节DNA表达以及构建蛋白质的小型核苷酸链,虽然科学家们已经掌握了脑细胞之间如

中国科大在动物长链非编码RNA研究中取得进展

  中国科学技术大学生命科学学院非编码RNA功能及功能机理研究团队近日在国际期刊《基因组生物学》(Genome Biology)发表了题为Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants 的文章,报道了

“非编码RNA调控作用”重大研究计划2015项目指南

   国家自然科学基金委员会现发布重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”2015年度项目指南,请申请人及依托单位按项目指南中所述的要求和注意事项申报。  附件:“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”重大研究计划2015年度项目指南  国家自然科学基金委员会 

分卓中心发现长非编码RNA对细胞核仁和RNA转录的调控机制

  7月30日,《科学》(Science)以Research Article形式发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员陈玲玲研究组和研究员刘珈泉研究组的合作研究成果——lncRNA SLERT controls phase separation of FC/DF

中山大学RNA团队开发PolⅢ转录的非编码RNA功能网络信息库

  中山大学生命科学学院RNA组学团队杨建华教授等开发了Pol3Base数据和信息库,系统鉴定RNA聚合酶III(PolⅢ)转录的非编码RNA(P3RNA),全面解析P3RNA的互作组、表达、进化、表观转录组、疾病变异及调控网络。  Pol3Base 网站整合了由不同转录因子调控的数千个 RNA 聚

非编码RNA结合肌细胞增强因子2D调控肌肉发育

  近日,农科院特产研究所李光玉研究员带领的研究团队发现了一个新的在肌肉发育过程中发挥重要功能的长非编码RNA,该非编码RNA-Irm通过直接结合肌细胞增强因子2D来调节肌源性基因的转录,进而调节肌生成。该研究结果为动物肌肉生长发育研究提供了新的调节因子和表观调控机制,对深入解析肌肉生长发育的分子调

从心脏病到癌症——长非编码RNA到底发挥了什么作用?

  直到近几年才发现人类基因的70%是非编码RNA,非编码RNA不能翻译为蛋白质,但仍在人体中发挥重要作用。Stefanie Dimmeler是首批发现一个microRNA亚群在血管再生中发挥重要作用的研究人员之一,她最近获得了欧洲研究委员会(ERC)的ERC高级研究员资助,这使她能够对另一群非编码

第二军医大学Hepatology解析癌症与非编码RNA

  来自第二军医大学的研究人员发现,一种癌胚胎非编码RNA通过稳定NOP2促进了肝癌细胞增殖以及获得干细胞样特性。这项研究已被在国际著名肝脏疾病杂志Hepatology(最新影响因子12.003)接受并在线发布。  第二军医大学的孙树汉(Shu-Han Sun)教授、李文(Wen Li)副教授以及李

华人学者Cancer-Cell:首张人类癌症非编码RNA综合图谱

  随着对重要但知之甚少的基因组部分——“DNA暗物质”的认识日渐增加,从根本上改变了科学家们研究疾病的方式。人类基因组中包含有大约2万个蛋白质编码基因(占总数的不到2%),而70%的基因组被转录为非编码RNA。但当前仍尚未系统地调查过这些称作为长链非编码RNAs (lncRNAs)的片段以及它们发

李培峰教授Cell、Nature子刊非编码RNA研究重要发现

  青岛大学转化医学研究院院长李培峰(Pei-Feng Li)教授曾在国际上首先提出“抗氧化酶自身被氧化”的新理论,是国际上少数几个最早将细胞凋亡引入心血管研究的科学家之一。近日李培峰教授领导的研究小组连接在非编码RNA研究领域取得重要研究发现,相关论文发表在《分子细胞》(Molecular Cel

微生物所揭示CMV非编码卫星RNA的起源和发生

  烟草植物感染黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)以后,随着连续继代和病毒感染,一个长链非编码RNA(long non-coding RNA)神奇地出现并被称为CMV卫星RNA(satellite RNA,satRNA)。satRNA因能够利用CMV编码的复制酶进行复

科学家通过多种方法探究长链非编码RNA

   直到今天,针对lncRNA的简洁且合理的分类系统仍遥不可及。长链非编码RNA的概念模型   2013年,一群研究人员决定更加深入地挖掘一种名为H1的人类胚胎干细胞系,并且获得了一些惊喜。H1是最著名的干细胞系之一,但该团队还是成功发现了2000多个此前未被阐明的RNA片段。更重要的是,其中有1