我国建成全球第四个综合基因组权威数据库
近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为“The BIG Data Center: from deposition to integration to translation”(北京基因组研究所生命与健康大数据中心:从存储到整合、再到转化)的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。这是我国首次以数据中心为模式整体发布我国生命组学数据资源建设情况,标志着我国建设综合性基因组数据资源获得国际同行认可。 北京基因组研究所有关人员表示,此前,国际上被认可的生物组学数据中心主要有美国的NCBI、欧洲的EBI及日本的DDBJ,要想在国际期刊发表论文,需要先将自己的原始数据提交到这三个官方指定的数据库中。“中国的生物组学数据产量约占全球的40%,是数据产出大国,却没有能够被国际认可的数据库系统,不得不将自己宝贵的数据资源交给他人代管。” 该数据库成为国际上第四个被......阅读全文
又一灭绝物种全基因组数据解析
日前,吉林大学考古学院蔡大伟教授团队与西北农林科技大学动物科技学院姜雨教授团队在马属动物古DNA研究领域取得重要进展。该研究在国际上首次成功获取已灭绝马属动物奥氏马的高质量全基因组数据,重建了马属动物的演化历史。 马科动物自古以来就与人们的关系密切,对人类社会文明的发展产生了重大影响。中国家马起源
中国开放最新家蚕基因组研究数据
“我们通过网络,以开放的姿态与世界共享家蚕基因组最新研究成果”,中国家蚕基因组计划项目主持人、中国工程院院士向仲怀26日介绍,包含有最新研究数据的中国家蚕遗传数据库目前已收到来自国内外科研人员的访问25万余次。 向仲怀介绍,中国家蚕遗传数据库由西南大学家蚕基因研究团队和深圳华大基因研究院合
基因组所完成开发RiceWiki数据库
近日,中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台,是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。 水稻是人类重
北京开建全球最大重疾数据样本资源库
记者12月5日从北京市科学技术委员会、北京市卫生局联合主办的“2010首都重大疾病防治科技创新高峰论坛”上了解到,北京已在全国率先启动“重大疾病临床数据和样本资源库”建设,预计到2012年,该资源库将成为拥有5万例临床数据、 40万例样本的全球最大的疾病临床数据和样本库。 据悉,患者临
分享一些-Immune-Cell-Atlas-数据集的资源
以下是一些可能获取 Immune Cell Atlas 数据集相关资源的途径: 1.官方网站:您可以访问 Immune Cell Atlas 项目的官方网站,了解数据集的获取方式和相关信息。2. 科研数据库:一些知名的科研数据存储库,如 NCBI 的 GEO 数据库、欧洲生物信息研究所(EMBL-E
资源三号传回第一批影像数据
1月11日上午10时37分,资源三号测绘卫星成功传回第一批影像数据。下午17时30分,接收的第一批影像数据由中国资源卫星应用中心地面接收站传至国家测绘地理信息局卫星测绘应用中心,技术人员连夜赶制出第一批影像。 当看到第一批高清立体影像样图时,国土资源部副部长,国家测绘地理信息局党组书记、局
陆林院士:数据资源亟需转化为有价值信息
随着科技的发展、医学诊疗手段的提高、精准医学的实施,很多躯体疾病已经被攻克,但精神心理疾病仍面临着病理生理机制不明、治疗手段单一且疗效个体差异大的困境,成为全球性的公共卫生问题和社会问题。中国科学院院士 陆林 据估计,我国精神心理疾病患者总数超过2亿,造成极大的疾病负担。对于精神疾病这类复杂疾
2015年国土资源主要统计数据公布
一、国有建设用地供应情况 全国国有建设用地供应53.4万公顷,同比下降12.5%。其中,工矿仓储用地12.5万公顷,同比下降15.2%;房地产用地12.0万公顷,同比下降20.9%;基础设施等其他用地28.9万公顷,同比下降7.1%。 二、主要监测城市地价情况 2015年四季度末,全国1
北京基因组所构建完成质体基因组结构变异数据库
多相催化是实现高效定向化学转化的关键技术,其中的一个重要基础科学问题是如何通过精确设计和调控催化活性位结构及所在环境,从而强化其定向催化功能并创造新型高效催化剂。近日,中国科学技术大学熊宇杰教授课题组和江俊教授课题组继在电催化体系中提出表面极化概念后,再次通过与黄伟新教授课题组合作,证实界面极化
小粒咖啡种质资源全基因组重测序解析获进展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/3/474824.shtm 随着全球对特色咖啡需求的显著增加,开发市场需求高的咖啡品种是必不可少的。近日,中国科学院武汉植物园的科研人员,通过基因组重测序等方式发现的SNPs,或与咖啡中重要农艺性状的重要基
癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据
研究人员希望,数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。 这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望:“让我们测序你的肿瘤,或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过,现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些
加拿大个人基因组计划公布首批数据
加拿大个人基因组计划(PGP-Canada)于2012年启动,欲建立一个在线的加拿大人基因组数据库,供全世界的研究人员使用。近日,该计划公布了首批测序数据。根据《加拿大环球邮报》(the Globe and Mail)的报道,研究人员发现了许多意想不到的结果。 这个计划测序了首批56名参与者的
15000年前“农民”全基因组数据出炉
英国《自然·通讯》杂志近日发表的一项遗传学报告中,德国科学家公布了生活在15000年前的安纳托利亚“农民”的首个全基因组数据。该研究结果有助于认识欧亚大陆的农业起源。图片来源于网络 农业在公元前10000年至9000年左右起源于亚洲西南部的新月沃土(Fertile Crescent),随后传
Illumina收购Edico-Genome,加速基因组数据分析
Edico的DRAGEN™ Bio-IT平台为新一代测序带来了更快更简化的输出。 圣迭戈——2018年5月15日——Illumina公司(纳斯达克代码:ILMN)宣布收购新一代测序(NGS)数据分析加速解决方案的领先供应商Edico Genome。Edico Genome的DRAGEN™ B
全球药典草药基因组数据库已上线
近期,中国中医科学院中药研究所团队建立了全球药典基因组数据库(GPGD)。该数据库是全球首个针对药典收载草药物种的大型基因组学数据库。相关研究成果发表在《Science China-Life Sciences》杂志,标题为“Global Pharmacopoeia Genome Database
基因组新数据或改写人类进化史
新的人类进化模型表明,人类起源于非洲大陆的多个祖先种群。5月17日发表在《自然》杂志上的一项新研究对主流理论提出了挑战,认为智人是从非洲多个不同的种群进化而来的,在经历了长期的基因混合后,最早可检测到的分裂发生在12万至13.5万年前。 在检测非洲当前种群的遗传物质,并将其与那里早期智人种群的现有
科学家搭建草莓基因组数据库
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓为蔷薇科草莓属,因芳香多汁、营养丰富受到喜爱,在全国各地均可种植。栽培草莓为异源多倍体,基因组复杂,杂合度高。 2019年,《自然—遗传学》发表了利用三代测序数据组装的高
“新疆维吾尔药资源数据库的建设”项目通过验收
6月9日,新疆维吾尔自治区科技厅组织专家对中科院新疆理化技术研究所承担的自治区科技基础条件建设项目“新疆维吾尔药资源数据库的建设”进行了验收。 该项目执行期间,对35种维吾尔医常用药材及部分新疆特有沙漠药用植物进行了系统的采集、鉴定、整理和标本制作工作,完善了新疆维吾尔药资源
打破“数据孤岛”,推动组学资源管理自立自强
今年1月,依托中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)(以下简称基因组所)的国家基因组科学数据中心(NGDC)有10篇论文集中亮相国际生物数据库期刊《核酸研究》。对于这样一本顶级期刊来说,这种情况并不多见。一个刚6岁的数据中心何以取得这样的成绩?近日,《中国科学报》走进基因组所了解NGDC成长
我国发布13种矿产资源全球储量评估数据
近日,自然资源部中国地质调查局全球矿产资源战略研究中心发布《全球矿产资源储量评估报告2023》。该报告是在2021年首次发布的《全球锂、钴、镍、锡、钾盐矿产资源储量评估报告》基础上新增铁、锰、铬、铜、铝、铅、锌、磷8种矿产,并更新了锂、钴、镍、锡、钾盐5种矿产数据,全面客观地评估了截至2021年
中国发布13种矿产资源全球储量评估数据
中国自然资源部中国地质调查局全球矿产资源战略研究中心8日发布《全球矿产资源储量评估报告2023》,报告评估了截至2021年底全球13种矿产资源储量信息。 据了解,这一报告在2021年首次发布的《全球锂、钴、镍、锡、钾盐矿产资源储量评估报告》基础上新增了铁、锰、铬、铜、铝、铅、锌、磷8种矿产,并
“科技成果与数据资源产权交易技术”项目启动
2018年7月13日,由南方电网科学研究院牵头的国家重点研发计划“现代服务业共性关键技术研发及应用示范”重点专项“科技成果与数据资源产权交易技术”项目启动暨实施方案专家咨询会在北京召开。项目牵头单位领导、总体专家组责任专家、项目参研单位主要负责人及专项办相关人员等30余人参加了会议。 “科
西北师大简牍学术资源数据共享平台上线
近日,西北师范大学举行简牍学术资源数据共享平台上线发布会。相关与会领导和特邀嘉宾共同为“西北师范大学简牍学术资源数据共享平台”揭牌上线。据了解,简牍学学术资源数据共享平台的上线,将大数据、人工智能等前沿信息科技与传统文化有机结合,极大地提高了简牍研究的效率和精确度,将有效助力简牍学一流学科发展。会后
农科院种质资源所解析绿豆基因组及驯化机制
种质资源所农作物种质资源收集保护和评价创新团队在绿豆(Vigna radiata)基因组组装及驯化机制研究上取得新进展。研究论文“Telomere-to-telomere, gap-free genome of mung bean (Vigna radiata) provides insights
迄今最详细人类基因组分析数据出炉
迄今最详细的人类基因组分析数据出炉。图片提供:ENCODE计划 一项大型国际计划显示,与青少年在学校掌握的知识相比,人类基因组—— 一个人的遗传信息总和——包含有更多的蛋白质编码基因。当研究人员决定在上世纪90年代晚期对人类基因组进行测序时,他们专注于寻找那些用来确定全部生
阿里联合生物技术公司打造基因组数据云
本报讯 近日,北京贝瑞和康生物技术有限公司与阿里云共同向外界宣布,双方将共同打造以海量的中国人群基因组数据为核心的数据云,实现对个人基因组数据的精准解读。此次,双方共同合作的“神州基因组数据云项目”将首先聚焦于基因组大数据在云平台上的批量计算、分析、存储,进而在基因大数据领域共同进行前沿探索。
首个中国地区古人全基因组数据被测序
近日,《当代生物学》发表了首次针对中国地区古人类的全基因组研究成果。该项目由中国科学院古脊椎动物与古人类研究所和德国马普进化人类研究所等团队合作完成,研究分析了距今4万年前出土于北京房山田园洞的一具男性个体基因组,发现东亚早期人群组成十分复杂。 虽然欧洲和西伯利亚地区都有古人类样本基因组被测序
基因组数据显示现代人类进化细节
据物理学家组织网报道,发表在5日出版的《公共科学图书馆·生物学》杂志上的研究论文显示,对英美两国21万人基因组数据分析发现,在长寿人群中,较少发生与阿尔茨海默症和重度吸烟相关的遗传变异,这表明自然选择一直在“努力”消除这些不利种群的变异。 进一步研究发现,与心脏病、高胆固醇、肥胖和哮喘相关的遗
首次公布!河南仰韶村遗址古人基因组数据发表
近日,河南省文物考古研究院、厦门大学等单位在国际学术期刊《科学通报》发表研究成果。研究发现,仰韶村遗址仰韶文化与龙山文化相关人群之间具有高度的遗传连续性,并对中华民族的形成有着重要的遗传贡献。 河南省文物考古研究院和厦门大学的研究人员取样提取和测序了仰韶村遗址的古人DNA,并于论文《古代基因组
分析和比较各种基因组数据的多面手
Partek®是一家致力于开发与整合用于生命科学研究数据分析软件的公司。该公司的系列软件包括――Partek® Flow™, Partek® Genomics Suite™, and Partek® Pathway™――可以提供基因组数据分析的整体解决方案,也是唯一一家可以提供