PacBioSMRT测序技术揭示第七次霍乱大流行致病菌的来源
霍乱是一种由霍乱弧菌引起的可怕疾病。在人类历史上,自1817年以来,全球曾发生过七次可怕的霍乱大流行。而离我们最近的第七次霍乱大流行起始于1961至今,发源地是印度尼西亚,由此逐渐散布到了全世界。到目前为止,第七次霍乱大流行已经感染的人数大概在每年300-500万人左右。2010年海地地震后,霍乱也出现了一次大的爆发,导致近70万人感染,超过8500人死亡。 图1,霍乱弧菌(来自bacteriainphotos.com) 对于这样一个极具历史意义的细菌性传染性疾病,现代科学技术能够研究的致病菌只有第六次(1899-1923)和第七次(1961至今)霍乱大流行。通过血清学分析,第六次由经典型(classical)引起,而第七由El Tor型引起。而经过基因组分析进化树,发现除第七次大流行外,其他几次的霍乱菌全部来源于同一个classical型。这也说明第七次大流行并不是由第六次大流行的菌株直接演变而来的。 在今天向大家介......阅读全文
PacBio-SMRT测序技术揭示第七次霍乱大流行致病菌的来源
霍乱是一种由霍乱弧菌引起的可怕疾病。在人类历史上,自1817年以来,全球曾发生过七次可怕的霍乱大流行。而离我们最近的第七次霍乱大流行起始于1961至今,发源地是印度尼西亚,由此逐渐散布到了全世界。到目前为止,第七次霍乱大流行已经感染的人数大概在每年300-500万人左右。2010年海地地震后,霍
简述单分子测序技术—第三代测序技术的基因组测序应用
由于具有读长长的特点,SMRT测序平台在基因组测序中能降低测序后的Contig数量,明显减少后续的基因组拼接和注释的工作量,节省大量的时间[25]。Christophern等[26]仅仅用0.5*的Pacbio RS系统长度的数据与38*的二代测序(NGS)的测序数据,对马达加斯加的一种指猴基因
霍乱到底是什么病?如何预防霍乱?
霍乱(cholera),早期译作虎力拉,中医俗称触恶,是由霍乱弧菌所致的烈性肠道传染病,临床上以剧烈无痛性泻吐,米泔样大便,严重脱水,肌肉痛性痉挛及周围循环衰竭等为特征,能在数小时内造成腹泻脱水甚至死亡。霍乱是由霍乱弧菌所引起的,通常是血清型O1的霍乱弧菌所致,但是在1992年曾经有O139的新
霍乱疫苗多久生效
rBS/WC霍乱疫苗(可唯适)只要按照疗程吃完3粒就会生效,之后便能产生抗体,预防霍乱、旅行者腹泻、儿童细菌性腹泻,但是要注意霍乱疫苗是有免疫有效期的,可根据地区疫情情况或者在流行季节加强一次,确保效果不会减弱。
全球霍乱疫苗储备告罄
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霍乱弧菌介绍(二)
(二)免疫性 患过霍乱的人可获得牢固的免疫力,再感染者少见。病人在发病数日,血液中即可出现特异性抗体,7℃14天抗体滴度达高峰,随后逐渐下降至较低水平,但能持续约3个月之外。病后小肠内可出现分泌型lgA。体液抗体与免疫的关系尚不清楚,一般认为局部SlgA可在肠粘膜与病菌之间形成免疫屏障,有阻断
霍乱弧菌的简介
弧菌属(Vibrio)中霍乱弧菌(V.cholerae)、引起一种烈性肠道传染病,发病急、传染性强、病死率高,属于国际检疫传染病。 霍乱弧菌包括两个生物型:古典生物型(Classical biotype)和埃尔托生物型(EL-Tor bio-type)。这两种型别除个别生物学性状稍有不同外,形
霍乱弧菌及其检验
1.分类(1)血清分型 霍乱弧菌(V.cholerae)有不耐热的H抗原和耐热的O抗原。前者为共同抗原,特异性低,后者具有群特异性和型特异性,是霍乱弧菌分群和分型的基础。根据O抗原的不同,霍乱弧菌现有155个血清群,其中仅O1群和O139群引起霍乱。O139血清群是新出现的型别,与O1群抗血清无交
霍乱弧菌介绍(一)
霍乱弧菌(V.cholera)是人类霍乱的病原体,霍乱是一种古老且流行广泛的烈性传染病之一。曾在世界上引起多次大流行,主要表现为剧烈的呕吐,腹泻,失水,死亡率甚高。属于国际检疫传染病。 霍乱弧菌包括两个生物型:古典生物型(Classical biotype)和埃尔托生物型(EL-Tor b
江苏7月报一霍乱病例-目前腹泻患者都要查霍乱
江苏省卫生厅最新公布的全省法定报告传染病疫情信息显示,7月发现1例霍乱,未有死亡病例。这是今年该省首次发现的霍乱病例,去年7、8月分别有两例零散霍乱报告。江苏省霍乱一直处于散发状态,但邻省安徽蒙城近期暴发霍乱疫情,防治形势不容乐观,省卫生厅要求保持高度警
PacBio单分子测序最新科研动态
DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。测序技术的应用也扩展到了生物、医学、制药、健康、农林、园艺、花卉、环保、法医等许多领域,并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业。据最新统计,2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿,按最近几年增长
PacBio推出小而强大的测序系统
之前,人们一直在猜测Pacific Biosciences可能会推出小型的单分子测序仪,但PacBio从未给出肯定的答复。而在2015年9月的最后一天,PacBio给了人们一个惊喜,突然宣布推出Sequel测序系统。Sequel系统保留了SMRT技术的优点,与现有的PacBio RS II系统相
罗氏联手PacBio打造NGS诊断产品
美国Pacific Biosciences公司周三宣布与罗氏诊断签订一项协议,以PacBio的SMRT技术为基础开发诊断产品。包括前期、里程碑和供应付款在内,罗氏将向PacBio支付7500万美元。 罗氏选择了PacBio公司的SMRT技术 去年,罗氏曾向 Illumina发起收
PacBio单分子测序最新科研动态
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霍乱灭活疫苗的功能
中文名称霍乱灭活疫苗英文名称cholera inactivated vaccine定 义用灭活霍乱弧菌制成的预防霍乱的生物制品。应用学科免疫学(一级学科),应用免疫(二级学科),免疫预防(三级学科)
什么是霍乱弧菌病?
霍乱弧菌(Vibrio cholerae)是革兰氏阴性菌,菌体短小呈逗点状,有单鞭毛、菌毛,部分有荚膜。共分为139个血清群,其中O1群和O139群可引起霍乱 。 霍乱弧菌是人类霍乱的病原体,霍乱是一种古老且流行广泛的烈性传染病之一。曾在世界上引起多次大流行,主要表现为剧烈的呕吐,腹泻,失水,
霍乱弧菌的诊断介绍
由于霍乱流行迅速,且在流行期间发病率及死亡率均高,危害极大,因此早期迅速和正确的诊断,对治疗和预防本病的蔓延有重大意义。 直接镜检 采取病人“米泔水样”大便或呕吐物。镜检(涂片染色及悬滴法检查)观察细菌形态,动力特征。 细菌分离培养 可将材料接种至碱性蛋白胨水37℃培养6~8小时后,取生
霍乱毒素B亚单位简介
霍乱毒素由(Cholera toxin,CT)两个亚单位组成,即A亚单位(CTA)和B亚单位(CTB)。A亚单位是霍乱毒素的活性部分,B亚单位的主要功能是通过与哺乳动物小肠上皮细胞上的单唾液酸神经节苷脂GM1结合而使得A亚单位进入细胞。霍乱毒素由霍乱操纵子(ctx)编码,从5到3方向,依次是反激
关于霍乱疫苗的基本介绍
霍乱疫苗的预防接种,可以降低霍乱的发病率,减轻症状和降低死亡率。霍乱是一种烈性肠道传染病,由革兰氏阴性的霍乱弧菌引起,发病特征是水样腹泻,迅速造成脱水,严重者可造成血容量减少性休克和酸中毒导致死亡。
实例分析霍乱患者的护理
霍乱是由霍乱弧菌引起的急性烈性肠道传染病,属国际检疫传染病,是《中华人民共和国传染病防止法》重点防控的甲类传染病之一,夏秋季流行,以7~10月为高峰。在历史上曾引起7次大流行。我国自1961年开始也出现霍乱流行,1992年出现新的霍乱的暴发流行。其病理变化系由霍乱弧菌产生的肠毒素引起,典型的临床
霍乱弧菌的发病机制
正常胃酸可杀灭霍乱弧菌,当胃酸分泌缺乏或低下,或入侵的霍乱弧菌数量较多,未被杀灭的弧菌就进入小肠,在碱性肠液内迅速繁殖,并通过粘液对细菌的趋化吸引作用、细菌鞭毛活动及弧菌粘蛋白溶解酶和粘附素等的作用,粘附于小肠粘膜的上皮细胞表面,并在此大量繁殖。 此菌产生强烈的外毒素,即霍乱肠毒素,由A亚单位
霍乱诊断标准及处理原则
霍乱是由01群和0139群霍乱弧菌引起的急性肠道传染病,是发病急、传播快、波及面广、危害严重的甲类传染病,也是当今三种国际检疫传染病中最严重的一种。 根据《中华人民共和国传染病防治法》和《中华人民共和国传染病防治法实施办法》的规定,制定本病的诊断标准及处理原则。 1
关于霍乱疫苗的种类介绍
1. 非肠道注射的原始霍乱死疫苗,含有一种经热处理致死、苯酚保存的霍乱弧菌inaba和ogawa亚型混合悬浮液,serover 01(dittman,1992)。现已不再建议使用这种疫苗,世界卫生组织的要求不再生效。 2. 迄今为止可获得3种口服霍乱疫苗。它们已显示是安全的、具有免疫原性和有效
副霍乱的抗菌治疗介绍
虽然及时而适当的补液可使所有病人基本上获愈,但抗菌药物的应用可明显地使腹泻时间缩短和粪便量减少,使弧菌较早地自粪便中消失。必须指出,抗菌药物的应用不能代替补液治疗,只能作为有效的辅助治疗之一。 (一)四环素族抗生素霍乱弧菌对四环素族药物敏感,四环素为治疗霍乱的首选药物之一。成人每6h口服0.5
霍乱弧菌如何分离培养
可将材料接种至碱性蛋白胨水37摄氏度培养6~8小时后,取生长物作形态观察,并转种于碱性平板作分离培养,取可疑菌落作玻片凝集,阳性者再作生化反应及生物型别鉴定试验。特异性制动试验取检材或新鲜碱性蛋白胨水培养物一滴,置于载玻片上,再加霍乱弧菌多价诊断血清,加盖玻片,用暗视野镜观察,3分钟内运动被抑制的即
PacBio如何获得又长又准确的reads
Pacific Biosciences公司近日以单分子环形一致性测序(CCS)为基础开发出一种方案,能够在Sequel测序平台上生成高度准确的长reads。这种方法有望克服短读长测序的读长不足以及长读长测序的准确性有限的问题。 这篇题为“Highly-accurate long-read se
PacBio完成大型基因组测序项目
什么叫PacBio技术应用到大型基因组测序项目中会大打折扣,在哪个环节大打折扣?提出这个问题的读者几乎都是抱有同样的心态,尽管大多数读者都基本认同了,如果为了得到Finishing Genome,那么PacBio无论技术和成本,理论上都是最低的,但即使这样,客观成本还是高的吓人,而假如将就D
PacBio助力感染菌株基因组重测序
Andrew Kasarskis博士是Icahn基因中心遗传与基因组中心的副主任。他目前领导着一些专攻治疗和诊断的合作项目,而他自己的研究也主要在病原体检测,药物基因组学,睡眠与遗传的关系几个方面展开。在加入西奈山之前,他曾经就职于PacBio,Sage Bionetworks和Merck。他有
PacBio第三季度仪器销售强劲
美国Pacific Biosciences公司在上周宣布,其第三季度的收入同比增长178%,环比增长81%。 这家单分子测序技术公司今年Q3的营业收入达到2060万美元,而去年Q3为740万美元,今年Q2为1140万美元。这也超过了华尔街预计的1720万美元。 在这一季度,产品收入为680万
PacBio推出首款检测DNA碱基修饰的软件
美国第三代测序公司Pacific Biosciences近日宣布推出一个独特的解决方案,可利用PacBio® RS测序仪检测与表观遗传学调控和DNA损伤相关的DNA碱基修饰。 DNA碱基修饰(如甲基化)在多个生物进程中扮演了重要角色,包括生长和衰老、免疫、细菌致病性以及疾病发展。Pac