Cell:神秘的非编码RNA在基因表达中起重要作用

在细胞中,DNA被转录成RNA,提供给细胞制造蛋白质的分子配方。大多数的基因组被转录成RNA,但实际上只有一小部分的RNA是来自于基因组中的蛋白质编码区域。 宾夕法尼亚大学Perelman医学院Penn表观遗传学研究所主任Shelley Berger博士说:“为什么非编码区能转录?它们的功能一直是神秘的。” Berger及其实验室的博士后Daniel Bose博士,研究来自增强子的基因表达调控,是基因组上离蛋白编码区较远的非编码区。增强子可提高附近的蛋白编码基因的基因表达率,所以细胞能够泵出更多所需的蛋白分子。一小部分神秘的非编码RNA,称为增强子RNAs(eRNAs)是从增强子序列转录而来的。虽然这些对于提高基因表达是非常重要的,但是它们是如何实现这一点的,仍然还是完全未知的。 通过揭示这些难以捉摸的eRNAs,他们表明,CBP——激活来自增强子的转录的一种酶,可直接结合eRNAs。这种简单的行为通过调节乙酰化,来控......阅读全文

组蛋白修饰分工调控基因表达水平和基因表达噪音

  基因表达过程依赖于转录因子、染色质调控因子和染色质等生物大分子在布朗运动过程中的随机碰撞,因此,即使是基因型和分化类型完全相同的细胞在相同环境下也存在基因表达的差异,被称为基因表达噪音。研究基因表达噪音,对研究干细胞增殖分化、个体发育、病原菌的抗药性以及农作物的稳产有着重要的意义,而其在人类早期

超高分辨直接观测基因表达的染色质时空调控

  生命科学的一个基本问题是在个体发育中,单个细胞如何分化成各种类型的组织细胞。这个过程高度依赖于基因表达的精确时空调控,而这种细胞特异基因表达与染色质的调控密切相关。比如,不同的顺式调控原件增强子能够在不同细胞中选择性地激活目标基因。每个基因经常由分布在千碱基(kb)甚至兆碱基(Mb)以外的多个增

CRISPR后起之秀《Nature》最新发现20,000个平行实验”发现增强子

  最开始大家都以为是“垃圾”DNA的基因组“暗物质”近年来备受关注,增强子就是其中之一,来自加州大学旧金山分校的一组研究人员修改了现有的基因编辑CRISPR技术,用以来寻找增强子,他们的方法并不是编辑增强子,而是利用一种称为CRISPRa(CRISPR activation)的工具,搜寻影响T细胞

Cell-亮点|-反义lncRNA如何调控基因的表达?

  反义lncRNA(antisense lncRNA)是指由基因(通常是蛋白编码基因)的反义链转录,并与该基因的mRNA存在序列重叠的RNA分子。随着对非编码RNA研究的深入,研究发现约70%的基因均有反义lncRNA【1】。更为重要的是,反义lncRNA往往与其正义链基因的表达存在相关性,提示反

Nature:CRISPRa截然不同的非编码调控序列分析技术

  来自加州大学旧金山分校的一组研究人员修改了现有的基因编辑CRISPR技术,用以来寻找增强子,他们的方法并不是编辑增强子,令其发挥作用,而是利用一种称为CRISPRa(CRISPR activation)的工具,搜寻影响T细胞免疫细胞发育的一种基因的增强子。这项研究发现将有助于解析自身免疫疾病,如

利用CRISPR研究基因组“暗物质”

  超过98%的人类基因组由非编码基因组成。这些非编码基因被称为基因组的“暗物质”,它们能调控编码基因的表达,从而影响人类健康和疾病进程。自从人类基因组序列被公开发表以来,科学家们努力解析基因中的功能元件,包括非编码调节区——参与转录调节的顺式调节区和非编码RNA(ncRNA)。转录因子在整个基因组

我国学者揭示长链非编码RNA顺式调控基因表达的新模式

  国际学术期刊Cell Stem Cell(《细胞·干细胞》)于近日在线发表了清华大学医学院沈晓骅研究组的最新研究成果“Divergent lncRNAs regulate gene expression and lineage differentiation in pluripotent cel

非编码RNA在调节压力恢复过程中具有微调基因表达的作用

  在最近一项研究中,科学家发现非编码RNA在调节压力恢复过程中具有微调基因表达的作用。  当细胞暴露于热或化学胁迫下时,就会形成称为细胞核应激体的细胞器。根据研究人员发表在《EMBO》杂志上的结果,当条件恢复正常时,细胞器会促进称为“内含子(intron)”的RNA片段的保留。  这很重要,因为内

核糖体RNA基因拷贝数变异和表达调控的新进展

  核糖体是细胞中最重要的细胞器之一,负责将细胞转录出来的信使RNA(messenger RNA,简称“mRNA”)翻译成蛋白质。真核生物的核糖体,主要由4种核糖体 RNA(rRNA)和80多种核糖体蛋白组成。其中,45S rRNA基因位点通过转录加工可以产生18S、5.8S和25S rRNA;而5

表达基因的克隆策略与分离表达基因序列的技术方法

人类基因组计划的主要任务之一就是要从大片段基因组区域或整条染色体DNA 上鉴定出基因表达序列(gene expressed sequences)或转录单位(transcription units)。在人类基因组30亿个碱基对中,发生转录的表达序列(即基因)仅占总序列的3~5%。基因组中绝大部

RNA干涉实验——采用RNA聚合酶Ⅲ启动子表达siRNA分子

实验方法原理因为哺乳动物细胞不具备低等真核生物细胞所具有的扩增 RNAi 信号的机制,因此人工合成或体外转录的 siRNA 分子在细胞内的作用是瞬时性的,不适合用于进行靶基因的表达受到抑制后细胞表型的长期变化观察,也不适于进行文库的筛选。此外,体外制备 siRNA 分子的成本比较高,而且 siRNA

关于顺式作用元件的简介

  顺式作用元件是指与结构基因串联的特定DNA序列,是转录因子的结合位点,它们通过与转录因子结合而调控基因转录的精确起始和转录效率。  在分子遗传学领域,相对同一染色体或DNA分子而言为“顺式”(cis);对不同染色体或DNA分子而言为“反式”(trans)。  顺式作用元件是转录调节因子的结合位点

基因的分类

结构基因基因中编码RNA或蛋白质的碱基序列。(1)原核生物结构基因:连续的,RNA合成不需要剪接加工;(2)真核生物结构基因:由外显子(编码序列)和内含子(非编码序列)两部分组成。非结构基因结构基因两侧的一段不编码的DNA片段(即侧翼序列),参与基因表达调控。(1)顺式作用元件:能影响基因表达,但不

基因的分类

结构基因基因中编码RNA或蛋白质的碱基序列。(1)原核生物结构基因:连续的,RNA合成不需要剪接加工;(2)真核生物结构基因:由外显子(编码序列)和内含子(非编码序列)两部分组成。非结构基因结构基因两侧的一段不编码的DNA片段(即侧翼序列),参与基因表达调控。(1)顺式作用元件:能影响基因表达,但不

基因的基本分类

结构基因基因中编码RNA或蛋白质的碱基序列。(1)原核生物结构基因:连续的,RNA合成不需要剪接加工;(2)真核生物结构基因:由外显子(编码序列)和内含子(非编码序列)两部分组成。非结构基因结构基因两侧的一段不编码的DNA片段(即侧翼序列),参与基因表达调控。(1)顺式作用元件:能影响基因表达,但不

关于基因的分类介绍

  一、结构基因  基因中编码RNA或蛋白质的碱基序列。  (1)原核生物结构基因:连续的,RNA合成不需要剪接加工;  (2)真核生物结构基因:由外显子(编码序列)和内含子(非编码序列)两部分组成。  二、非结构基因  结构基因两侧的一段不编码的DNA片段(即侧翼序列),参与基因表达调控。  (1

基因的分类

结构基因基因中编码RNA或蛋白质的碱基序列。(1)原核生物结构基因:连续的,RNA合成不需要剪接加工;(2)真核生物结构基因:由外显子(编码序列)和内含子(非编码序列)两部分组成。非结构基因结构基因两侧的一段不编码的DNA片段(即侧翼序列),参与基因表达调控。(1)顺式作用元件:能影响基因表达,但不

割裂基因的调控序列种类介绍

  ①在5′端转录起始点上游约20~30个核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。 TATA框是一个短的核苷酸序列,其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序,它是RNA聚合酶的重要的接触点,它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时,

基因表达调控的概念

基因表达调控是生物体内基因表达的调节控制,使细胞中基因表达的过程在时间、空间上处于有序状态,并对环境条件的变化作出反应的复杂过程。基因表达的调控可在多个层次上进行,包括基因水平、转录水平、转录后水平、翻译水平和翻译后水平的调控。基因表达调控是生物体内细胞分化、形态发生和个体发育的分子基础。

基因的复制与表达

  生物的遗传物质基础是核酸(nucleic acid),它也是基因的基本结构,它们的化学组成分子结构符合遗传物质的稳定性、连续性及多样性的要求。  (一)核酸的化学组成  核酸结构的基本单位是核苷酸(nucleic acid),每个核苷酸由1个磷酸、1个五碳糖和1个碱基3部分组成。核酸有两类:

基因超表达的定义

超表达是指目的基因的全长序列与高活性组成型启动子或组织特异性启动子融合,通过转化,获得该基因产物大量积累的植株。

基因表达的机制原理

转录转录过程由RNA聚合酶(RNAP)进行,以DNA为模板,产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动,留下新合成的RNA链。基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成,每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”(产生RNA转录物的模板)和“编码链”(含有转录本序列的DN

基因表达的系列分析

中文名称基因表达的系列分析英文名称serial analysis of gene expression;SAGE定  义通过构建较短的表达序列标签规模化地检测基因表达种类及其丰度的实验技术。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

基因超表达的概念

超表达是指目的基因的全长序列与高活性组成型启动子或组织特异性启动子融合,通过转化,获得该基因产物大量积累的植株。

关于基因表达的介绍

  基因的表达过程是将DNA上的遗传信息传递给mRNA,然后再经过翻译将其传递给蛋白质。在翻译过程中tRNA负责与特定氨基酸结合,并将它们运送到核糖体,这些氨基酸在那里相互连接形成蛋白质。这一过程由tRNA合成酶介导,一旦出现问题就会生成错误的蛋白质,进而造成灾难性的后果。值得庆幸的是,tRNA分子

基因表达调控主要表现

基因表达调控主要表现在以下几个方面:①转录水平上的调控;②mRNA加工、成熟水平上的调控;③翻译水平上的调控;

基因表达组件的概念

中文名称表达组件英文名称expression cassette定  义与基因表达有关的一系列序列元件的组合。常包括启动子、编码序列、终止子、增强子等。完整的表达组件是能够表达出目的物的成套基因元件。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

基因差异表达的概念

差异表达不仅有助于阐明生命的奥秘,而且还能为基因诊断与治疗提供重要的理论依据。近几年来,差异表达基因克隆技术不断完善与发展,已成为研究肿瘤和疾病等相关基因的重要手段。

基因表达系列分析简介

  1995年Velculescu等提出了基因表达系列分析(Serial Analysis of Gene Expression,SAGE)技术,能同时对上千个转录本进行研究。  SAGE是一种快速分析基因表达信息的技术,它通过快速和详细分析成千上万个表达序列标签(Expressed Sequenc

什么是基因表达调控

意义:1.适应环境、维持生长和增殖:生物体赖以生存的外环境是在不断变化的,为了生存,所有活细胞都必须对外环境变化作出适当反应,调节代谢,以适应环境变化。生物体适应环境、调节代谢的能力与蛋白质分子的生物学功能有关。而蛋白质的水平又受基因表达的调控。2.维持个体发育与分化:多细胞生物调节基因的表达除为适