Antpedia LOGO WIKI资讯

机器学习新算法加速药物研发进程

据物理学家组织网2月6日报道,加拿大多伦多大学的科研人员最新研制出了一套新的机器学习算法,能生成微小蛋白质分子的3D结构。研究人员指出,新算法有望彻底变革药物的研发进程以及我们对生命的理解。 研发人员之一、多伦多大学的博士生阿里·普勒贾尼解释称,确定蛋白质分子的3D原子结构对于理解它们的工作原理及其对药物治疗产生何种反应至关重要。 药物会附着到特定蛋白质分子上,改变其3D形状及工作方式。理想的药物一般被设计成某种特定形状,使其仅附着到某个特定的蛋白质或与疾病相关的蛋白质上,而且在其附着到体内其他蛋白质上时不会出现副作用。 鉴于蛋白质比光波波长还小,如果不使用复杂技术,如冷冻电子显微镜(Cryo-EM)技术,无法直接看见它们。Cryo-EM技术使用高能显微镜,从不同方位将冷冻蛋白质的样本拍摄出成千上万张低清晰度图像,但用这些低清晰度2D图像拼接出正确的高清3D结构非常困难。 而新算法使用显微图像重建了蛋白质分子的3D结......阅读全文

震惊!全基因组测序还能这样用在癌症治疗上?

   近年来,随着全基因组测序所需时间和成本的降低,个体化治疗将造福更多的癌症患者。近日发表于《Nature Medicine》的一项研究表明,开发新的机器学习算法对肿瘤全基因组序列信息进行分析,有助于预测患者的预后,帮助患者选择最佳的治疗方案。  全基因组测序(Whole-genome seque

Cell:揭示癌症特有的致命弱点

  尽管近几十年来,生物技术已经发生了革命性的进步,但人们仍然未能找到理想的抗癌疗法,这样的疗法应当能够立刻杀死癌细胞,无损于健康细胞,并且可以防止癌症复发。  不过,“合成致死”概念(synthetic lethality)为研究者们带来了新的希望。合成致死是指两个非致死基因同时失活导致细胞死亡的

华大基因成功开发移植瘤生物信息分析新算法――PDXomics™

  2012年7月17日,华大基因宣布其成功开发出一套适用于异种移植瘤模型生物信息学分析的新算法——PDXomics™,该算法能够将移植瘤与宿主基因组序列进行区分,有效地排除后续分析中异源物种数据的污染,保证分析结果的准确性和可靠性,从而可使移植瘤模型更为有效的应用于肿瘤新药开发和疾病机理研究。

计算机研究新药的五个途径

  在这个高速发展的时代,计算机已经无所不能了。飞机、桥梁、甚至心脏支架的设计都可以通过特定的计算机模型生成。当然觉不仅仅是外观设计这些皮毛,还包括它们在不同模拟环境下一些使用情况。近年来,科学家们开始使用相同的方法设计新药。下面就来简单介绍一下计算机在前导化学物的识别,临床试验

如何利用人工智能来改善人类健康?

  近年来,越来越多的科学家们开始使用人工智能技术加速多项领域的研究,当然了他们也取得了很多研究成果,本文中,小编就对近期相关研究成果进行整理,与大家一起学习!  【1】Com Biol Med:人工智能帮助治疗糖尿病引发的眼疾  doi:10.1016/j.compbiomed.2018.10.0

化学界“AlphaGo”问世:加速合成人类所需的化合物

  人工智能带来的革命仍在继续:从沃森(Waston)机器人不到10分钟诊断出白血病,到AlphaGo击败世界排名第一的围棋选手;从战场到太空,随处都可见其身影。其实,AI也早已渗透进科研领域,成为科学家进行学术研究的新手段。  现在,科学家们已经构建出了化学界的“Alphago”:科学家们在《Na

预测抗癌药物活性方面获进展

  癌症是目前世界人口死亡的第一原因。全世界每年因癌症死亡的人口超过720万人。而在中国,每年因癌症死亡的人口也超过了 170万。因此,开发新的抗癌药物是科学界和医学界的热点和难点。但直接采用实验的方法筛选抗癌药物具有花费大、时间长的特点。以小分子为例,现在已知的小分子化合物超过了1000万个,

昆明动物所在预测抗癌药物活性方面获进展

  癌症是目前世界人口死亡的第一原因。全世界每年因癌症死亡的人口超过720万人。而在中国,每年因癌症死亡的人口也超过了170万。因此,开发新的抗癌药物是科学界和医学界的热点和难点。但直接采用实验的方法筛选抗癌药物具有花费大、时间长的特点。以小分子为例,现在已知的小分子化合物超过了100

2019年10月Science期刊不得不看的亮点研究

  10月份Science期刊又有哪些亮点研究值得学习呢?小编对此进行了整理,与各位分享。  1.Science:新研究揭示人类微生物组是潜力巨大的新型抗菌药物聚宝盆  doi:10.1126/science.aax9176  就像淘金热中的淘金者曾经在北加州的山上开采这种闪亮的贵金属一样,“生物勘

Nature:他们研发出匹敌吗啡、却不会上瘾的完美止痛药

  8月17日,《Nature》期刊发表一篇文章,揭示了一种能够与吗啡媲美的镇痛化合物。最让人惊喜的是,它不会出现明显的呼吸抑制、上瘾等副作用,至少小鼠试验是这样的。  这一突破由斯坦福大学医学院、北卡罗莱纳大学(UNC)和埃尔朗根-纽伦堡大学的科学团队合力完成,是他们集结上百万药物筛选、药物化学分

ICAS 2017分会(二):无处不在的质谱分析

  分析测试百科网讯 2017年5月7日,由国际纯粹与应用化学联合会(IUPAC)和中国化学会(CCS)主办的2017 年国际分析科学大会(ICAS 2017)质谱分析分会在海南国际会展中心举行。分会邀请了复旦大学教授杨芃原、俄罗斯科学院院士Evgeny Nikolaev、香港浸会大学化学系教授蔡宗

新药研发成功率降低,高内涵筛选能否力挽狂澜?

  研究人员认为,结合机器学习算法的高内涵筛选将广泛用于药物的研发。  上个世纪80年代,科研人员开发出了高通量筛选(high throughput screening),这是一种能对大量化合物样品进行药理活性评价分析的技术。在过去的几十年里,高通量筛选曾在新药的研发中发挥了重要的作用。  但在最近

蒋华良院士团队开发可解释性深度神经网络分子表征模型

  近日,上海科技大学免疫化学研究所特聘教授蒋华良院士团队在《Journal of Medicinal Chemistry》发表封面文章“Pushingthe Boundaries of Molecular Representation for Drug Discovery with the Gra

Science子刊发布一项免疫治疗新策略

  在一项新的研究中,来自美国塔斯基吉大学、美国国家癌症研究所和美国国家推进转化科学中心等研究机构的研究人员报道在几种类型的癌症中,一种新的免疫疗法在对免疫细胞进行重编程、杀死癌细胞和阻止肿瘤生长方面具有广阔的前景。相关研究结果发表在2020年2月12日的期刊上,论文标题为“Mannose rece

上海药物所计算机靶标预测及发现技术研究取得新进展

  中科院上海药物所蒋华良课题组与华东理工大学药学院李洪林课题组合作,继反向对接方法——TarFisDock后,该研究团队构建了药效团靶标库—PharmTargetDB(包含7000余个重要靶标结构的信息和药效团模型,涵盖了349种生物功能和110种临床适应症)。通过药效团匹配方法,课

2019年中国学者发表CNS统计,谁是CNS发表之王?

  【51/52】2019年4月4日,清华大学柴继杰课题组、中科院遗传发育所周俭民课题组和清华大学王宏伟课题联合同期背靠背发表两篇重量级Science文章,完成了植物NLR蛋白复合物的组装、结构和功能分析,揭示了NLR作用的关键分子机制,是植物免疫研究的里程碑事件。两篇文章分别是: "Li

大跃进 | 中国学者CNS发表超过100篇生命科学领域研究成果

  【50】2019年4月12日,中科院上海药物所徐华强,王明伟,浙江大学张岩及匹兹堡大学医学院Jean-Pierre Vilardaga共同通讯在Science发表题为“Structure and dynamics of the active human parathyroid hormone r

战“疫”中科技力量

   这是人类与病毒的殊死较量,这是科学与时间的生死竞赛。  “尽快攻克疫情防控的重点难点问题,为打赢疫情防控人民战争、总体战、阻击战提供强大科技支撑。”近日,习近平总书记多次强调要把新冠肺炎防控科研攻关作为一项重大而紧迫的任务。  自新冠肺炎疫情发生以来,全国各地高校、科研机构快速行动,在疫情可溯

深度学习算法 助力精准诊断结直肠肿瘤

  根据发表在《Life Science Alliance》杂志上的新研究,一种新的深度学习算法可以快速,准确地分析来自结直肠肿瘤的几种基因组数据,以进行更准确的分类,从而有助于改善诊断和相关的治疗选择。  大肠肿瘤的发展方式各不相同,需要接受的药物类型也不同,生存率也大不相同。通常,基于对基因表达

2020年十大突破性技术

  全球知名科技评论期刊《麻省理工学院技术评论》26日发布2020年“全球十大突破性技术”,量子霸权、人工智能筛选分子、数字货币、超个性化药物等入选。  今年榜单中两项技术与量子科学有关。其中,美国谷歌公司领衔的团队于2019年10月宣称成功演示“量子霸权”,使一个包含53个有效量子比特的处理器花费

预测小分子抗癌活性有了新算法

  记者从中科院昆明动物研究所获悉,该所李功华博士在研究员黄京飞的指导下,开发了一个新的基于分子药效团的小分子比对算法,并成功应用于预测小分子的抗癌活性。近日,该研究发表在顶级计算生物学杂志《生物信息学》上。   据李功华介绍,开发新的抗癌药物是科学界和医学界的热点和难点。直接采用实验的方法筛选抗

科技部等6部门印发《“十三五”健康产业科技创新专项规划》

  分析测试百科网讯 近日, 按照《中华人民共和国国民经济和社会发展第十三个五年规划纲要》、《“十三五”国家科技创新规划》、《“健康中国2030”规划纲要》等的总体部署,为加快推进健康产业科技发展,打造经济发展新动能,促进未来经济增长,引领健康服务模式变革,支撑健康中国建设,科技部等6部门制定《“十

科学家发现晶型识别新方法

  同一个化合物具有不同的晶型,而不同晶型的生物利用度可能差异很大。由于不同晶型的理化性质高度相似,在多晶型混合物中直接原位识别药物微粒的晶型是一项挑战,新方法研究对确定药物的晶型转变、晶型杂质的质量控制十分重要。  药物颗粒的形貌由它的晶型和晶习决定,晶型与药物颗粒的外形可能相关。基于计算机X-射

《大众科学》评出2016年度十大创新人物

  近日,《大众科学》杂志再次从美国科学和工程领域的研究人员中,评选出本年度最具创新型思维的10大年轻面孔。  斯达兹•噶哥:保护硬件免遭黑客破坏  芯片包含一系列功能模块,每个模块执行特定任务,中心模块会控制模块间的数据传送。黑客们伪装成工人潜伏到工厂,向芯片刷入一些恶意固件,日后就会控制或毁坏植

“天河二号”一天筛完地球上所有药用化合物

  日前,国防科技大学计算机学院联合中科院上海药物研究所、广州超算中心,成功研发出一种超高通量的药物分子虚拟筛选平台,可以利用“天河二号”超级计算机,在一天之内完成对4200多万个化合物的计算评价,相当于把包括现有药物、天然产物和人工合成有机化合物在内的地球上所有可用于药物研发的化合物都计算筛选一遍

AI从超1亿个分子中预测强力抗生素

  一项开创性的机器学习方法已经从1亿多个分子中识别出了强大的新型抗生素,包括一种可以对付多种细菌的分子--包括肺结核和被认为无法治愈的菌株。  研究人员表示,这种名为halicin的抗生素是第一个被人工智能发现的抗生素。尽管人工智能以前曾被用于协助抗生素发现过程的某些部分,但他们表示,这是人工智能

人工智能与数据挖掘驱动的肿瘤新药研发

  人工智能作为一种旨在模拟、延伸和扩展人的智能的科学,人工智能正在以前所未有的广度和越来越快的速度改变着世界的面貌。而在普瑞基准创始人季序我和梁晗看来,人工智能可以帮助我们更好地回答那些医学中最为本质的问题,对于新药研发、临床诊疗和医学基础研究,都有着不可估量的价值。 道路  在癌症诊治的过程中,

痕量分析实验室

高分辨分离分析及代谢组学组(1808组)是在许国旺研究员领导下的、在中科院大连化物所最具综合实力的课题组之一,其前身是国家色谱研究分析中心气相色谱组,2001年更名为高分辨分离分析及代谢组学组。课题组多年来一直致力于色谱理论及应用基础研究,优势研究领域为应用色谱及相关技术进行石油、化工、食品、

SCIEX推出跨SCIEX质谱平台OS 1.4软件,符合21 CFR Part 11规范

——通过增强的数据管理系统来提供改进的工作流效率,以及支持SCIEX质谱系列产品中符合21 CFR Part 11规范的工具  分析测试百科网讯 2018年6月4日,SCIEX公司宣布推出其LC和MS操作系统SCIEX OS软件的新版本,该软件提供了全面的法规遵从性和更新计算算法的新工具并支持大多数

大数据研究推翻常规认识

  近年来,科学创新日渐进入"大数据"时代,各种高通量的分析手段以及各类"组学"的发展,使得我们对生命科学的基本原理以及与人类健康有关的疾病发生机制方面有了更加深入的认识。针对最近一段时间以来科学家们利用"大数据"的手段产生的科学进展,我们