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机器学习新算法加速药物研发进程

据物理学家组织网2月6日报道,加拿大多伦多大学的科研人员最新研制出了一套新的机器学习算法,能生成微小蛋白质分子的3D结构。研究人员指出,新算法有望彻底变革药物的研发进程以及我们对生命的理解。 研发人员之一、多伦多大学的博士生阿里·普勒贾尼解释称,确定蛋白质分子的3D原子结构对于理解它们的工作原理及其对药物治疗产生何种反应至关重要。 药物会附着到特定蛋白质分子上,改变其3D形状及工作方式。理想的药物一般被设计成某种特定形状,使其仅附着到某个特定的蛋白质或与疾病相关的蛋白质上,而且在其附着到体内其他蛋白质上时不会出现副作用。 鉴于蛋白质比光波波长还小,如果不使用复杂技术,如冷冻电子显微镜(Cryo-EM)技术,无法直接看见它们。Cryo-EM技术使用高能显微镜,从不同方位将冷冻蛋白质的样本拍摄出成千上万张低清晰度图像,但用这些低清晰度2D图像拼接出正确的高清3D结构非常困难。 而新算法使用显微图像重建了蛋白质分子的3D结......阅读全文

国家基金委八大学部公布“优先发展领域及主要研究方向”

  “十三五”期间,通过支持我国优势学科和交叉学科的重要前沿方向,以及从国家重大需求中凝练可望取得重大原始创新的研究方向,进一步提升我国主要学科的国际地位,提高科学技术满足国家重大需求的能力。各科学部遴选优先发展领域及其主要研究方向的原则是:  (1)在重大前沿领域突出学科交叉,注重多学科协同攻关,

蒋华良研究组合作发表最新PNAS文章:蛋白互作界面预测

来自中科院上海药物研究所,美国莱斯大学的研究人员报道了最新研究成果,在可药性蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)界面预测与识别计算方法发展方面取得重要进展。这一研究成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上,文章的通讯作者是上海药物研究所蒋华良研究员,以及莱斯大学José N. Onuchic博

“十三五”第一批26个重大项目指南正式发布

  近日,国家自然科学基金委员会发布了《关于发布“十三五”第一批重大项目指南及申请注意事项的通告》。《通告》表示,国家自然科学基金委员根据6月发布的《国家自然科学基金“十三五”发展规划》优先发展领域,发布了“十三五”第一批26个重大项目指南。  6月,《自然科学基金委“十三五”发展规划》(以下简称“

构建癌症基因组学的非组织特异标签的药物重定位新方法

  10月9日,国际学术期刊《细胞通讯》(Cell Reports)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康研究院)计算生物学研究所韩敬东研究组的论文“Accurate Drug Reposition through Non-Tissue Specific Core Signatures

杨胜勇教授化学领域权威期刊Chemical Reviews发表重要论文

  近年来,以深度学习(deep learning)为代表的人工智能(artificial intelligence, AI)技术获得快速的发展,被认为是新一轮科技革命和产业变革的重要驱动力量,同时也为加快创新药物研发带来了新的希望,推动药物研发从传统的以靶点和结构信息为核心,逐渐转变为以数据和算法

梯瓦和IBM联手!或将改变药物创新和医疗护理格局?

  近日,全球最大的仿制药公司梯瓦(TEVA)和信息行业的领导者IBM就扩大合作范围达成了协议,二者将联手利用IBM最新的沃森计算系统来进行新药开发和慢性病管理。这将会改变目前药物创新和医疗护理格局吗?  据悉,它们的合作范围主要包括两大块:一是数据驱动的老药新适应症开发项目,二是慢性疾病主动管理项

科学家绘制出完整药用小分子空间“地图”

  据物理学家组织网4月23日(北京时间)报道,美国杜克大学化学家最近开发出一种新的计算机算法,能模拟出所有的含碳小分子,经过分类编目后形成一份特殊的小分子空间“地图”,帮助化学家在实验室里将这些分子真正制造出来。这一成果有望成为药物开发人员的得力工具,以寻找更有效的药物和新材料。相关论文在线发表于

AI进入制药行业 制药企业升级“2.0”

    近年来,人工智能技术(AI)与医疗健康领域的融合不断加深。AI在医疗领域主要应用场景包括语音录入病历、医疗影像辅助诊断、药物研发、医疗机器人和个人健康大数据的智能分析等。近日,医疗技术公司Atomwise宣布与礼来签署了一项多年期合作协议。根据协议,礼来获得Atomwise专有的AI药物勘探

精准医疗陷入尴尬局面,等着人工智能来救场?

  在日前的Fast Company Innovation Festival活动上,医疗行业的一批专家就精准医疗这种个性化、有针对性的医疗保健新模式的发展潜力以及存在问题进行了深入探讨。  生物制药公司伯格健康首席执行官Niven R. Narain与来自西奈山以及哥伦比亚大学的行业专家进行了交流。

Cell突破30年瓶颈:新型抗癌组合炮

  来自德国科隆大学的研究人员证实,可联合给予Chk1和MK2抑制剂来治疗KRAS或BRAF突变肿瘤。这一重要的研究发现发布在7月2日的《细胞》(Cell)杂志上。  来自科隆大学的Felix Dietlein博士和H. Christian Reinhardt博士是这篇论文的共同通讯作者。  自30

FDA局长最新演讲:人工智能和数字医疗要怎么管?

  19世纪著名医生William Osler曾经说过:“好的医生治疗疾病,而伟大的医生治疗得病的患者。”但在20世纪,医学界通常将患者视为一系列症状的集合,而不是一个个体。这种情况随着医疗服务系统的发展而加剧,它让患者的护理变得零散。  数字健康有可能使William Osler医生以患者为中心的

基因测序市场深度剖析

   Technologies(现为Thermo Fisher收购)公司全国临床与科研事业部销售总监、ThermoFisher公司全国临床市场战略总监柴映爽写了一系列文章,对基因测序领域进行了深入剖析。让我们看看这个领域深入工作的人士,怎么看待2015年基因测序市场大热这一现实的。   ▌第一篇:基

上海药物所发布免费在线药物靶标预测平台

   药物靶标的识别与验证是药物发现过程中至关重要的第一步,在药物研发过程中,30%-40%的在研药物由于药物靶标选择的不恰当而以失败告终。因此,发展一种高效的计算方法来预测新的药物靶标就显得尤其重要。  最近,中国科学院上海药物研究所朱维良研究组发布免费在线药物靶标预测平台D3TPredictor

新技术加速新药发现

  对分子目标的高通量筛选虽早已成为生物制药产业早期药物发现的首选模式,但近年来才被用于抗寄生虫病新药的筛选。随着越来越多的寄生虫基因序列的破译,研究人员使用高通量筛选和化合物库的机会增多,预计这一方法将更显其重要性。  典型的高通量筛选方法可在成百上千大量化合物的筛查中确定分子目标,尤其是在以寄生

克服肿瘤耐药性的“组合拳”

  数学、生物学和纳米技术越来越奇特,但在对抗肿瘤治疗耐药性方面,它们却是有效的“组合拳”。最近,美国滑铁卢大学和哈佛医学院的研究人员,设计了一种革命性的新方法用于癌症治疗,这种方法将一个致命的药物组合,放入单个的纳米颗粒中。  他们的研究结果于2016年6月3日发表在纳米技术权威杂志《ACS Na

个性化新抗原疫苗引发强烈抗肿瘤反应

  Dana-Farber癌症研究所和麻省理工学院广泛研究所的研究已经显示靶向肿瘤细胞上特征性的“新抗原”的个体癌症治疗疫苗可刺激黑素瘤患者的有效,安全和高度特异性的免疫抗肿瘤反应。  研究人员Catherine J. Wu说,“Nature”在线发表的这项研究提供了原理证明,即针对患者肿瘤定制的个

清华大学Nature Methods发文:新型的冷冻电镜三维重构算法

  蛋白质是生命体的最主要组成元素,作为一种生物大分子机器,蛋白质功能的实现高度依赖于其复杂的三维原子结构。了解蛋白质的结构及其与功能的关系对探索生命的基本原理,理解疾病的分子机制以及药物的研发具有重要的意义。基于粒子滤波的三维重构算法示意图。  冷冻电子显微镜,简称冷冻电镜,使用电子束作为光源,是

人工智能替代是“快一点”还是“慢一点”?

  在刚刚过去的 2020 年,人工智能技术狠狠地刷了一波存在感,抗疫中、 救灾中、扶贫中……它的身影无处不在。未来人工智能该如何发展?日前发布的《中共中央关于制定国民经济和社会发展第十四个五年规划和二〇三五年远景目标的建议》明确提出, “推动互联网、大数据、人工智能等同各产业深

囊性纤维化疾病最新研究成果

  小编整理了近年来科学家们发表的多篇研究成果,共同解析囊性纤维化疾病研究成果,与大家一起学习!图片来源:CC0 Public Domain  【1】Nat Commun:囊性纤维化治疗新希望 科学家有望利用CRISPR-Cas技术剔除致病基因突变  doi:10.1038/s41467-019-1

同济大学刘琦教授在Nature旗下刊物发表了研究论文

  2015年3月,同济大学生命科学与技术学院刘琦教授在Nature旗下刊物,临床药理学国际著名期刊《Clinical Pharmacology & Therapeutics》在线发表了题为:“Mining drug-disease relationships

当AI遇到癌症疗法 “癌症=感冒”不是梦

  1、AI多方面改善肿瘤疗法  人工智能(artificial intelligence, AI)方法有潜力影响癌症疗法的多个方面,包括药物的发现、临床开发,以及最终的临床应用(图表1)。目前,这些过程既昂贵又耗时漫长(平均约20亿美元,10年),而且因为常规有限样本随机对照试验的局限性,对更广泛

Nature发布突破性蛋白质新技术

  斯克里普斯研究所(TSRI)的科学家们开发出了一种强大的新方法来寻找结合特定蛋白质的候选药物。  发表在本周《自然》(Nature)杂志上的这种新方法是一个重大的进展,它可以同时应用于大量的蛋白质,甚至直接应用于自然细胞环境中成千上万不同的蛋白质。一些小分子可以用来确定它们靶蛋白的功能,并可充当

2019中国生命科学领域CNS盘点:曹雪涛 颜宁 施一公上榜

  截至2019年12月23日,中国学者在Cell,Nature及Science在线发表了107篇文章(2019年的Cell ,Nature 及Science 已经全部更新),iNature团队对于这些文章做了系统的总结:  按杂志来划分:Cell 发表了31篇,Nature 发表了44篇,Scie

2016年关于肿瘤这些研究进展,你都知道吗?

  肿瘤一直是科学家们想要攻克的难题,也一直在探寻肿瘤治疗的方法。2016年,国内外的科学家们在肿瘤研究领域取得了一些喜人的成绩,下面让我们来看看2016的肿瘤研究都有哪些进展吧。  2016年1月8日,索尔克研究所的科学家发现了多形性成胶质细胞瘤细胞能够快速增殖的机理,并且将此作为癌症治疗的靶点。

微纳激光粒度分析技术在药物制剂研究和产业化中的应用

药物剂型是药物存在和给入机体的形式。药物制剂技术的优劣标志着一个国家医药和医疗科学水平的高低。这项技术的研究和应用在医疗卫生实践和工业实践中占据着极其重要的地位,起着推动医、药科学向前发展的作用。近年来,由于药物新制剂已经成为了医药产业的增长点,全世界新释药系统销售额稳步增长,约占整个医药市场的10

激光粒度分析技术在药物制剂研究和产业化中的应用

     药物剂型是药物存在和给入机体的形式。药物制剂技术的优劣标志着一个国家医药和医疗科学水平的高低。这项技术的研究和应用在医疗卫生实践和工业实践中占据着极其重要的地位,起着推动医、药科学向前发展的作用。近年来,由于药物新制剂已经成为了医药产业的增长点,全世界新释药系

微纳激光粒度分析技术应用于药物制剂研究和产业化

    药物剂型是药物存在和给入机体的形式。药物制剂技术的优劣标志着一个国家医药和医疗科学水平的高低。这项技术的研究和应用在医疗卫生实践和工业实践中占据着极其重要的地位,起着推动医、药科学向前发展的作用。近年来,由于药物新制剂已经成为了医药产业的增长点,全世界新释药系统销售额稳步

新算法比较分析可搜索癌症基因突变

  桑福德伯翰医学研究所(Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute,SBP)承担了前所未有的对一个新兴算法类别的比较分析,该算法通过聚焦内部基因结构,在癌症数据库中挖掘遗传信息(即亚基因像素算法),这与专注于基因视其为单个单元的经典方法形成

生物医学光学技术

  摘 要:随着生物分子光学标记技术的不断进步,光学技术在揭示生命活动基本规律的研究中正发挥越来越重要的作用,也为医学诊断与治疗提供了更多、更有效的手段。本报告首先简要介绍光学技术在生物医学应用中的发展概况,然后从基因表达及蛋白质—蛋白质相互作用研究方面,讨论生物分子光学技术的特点与优势,阐明基于分

生物医学光学技术

  摘 要:随着生物分子光学标记技术的不断进步,光学技术在揭示生命活动基本规律的研究中正发挥越来越重要的作用,也为医学诊断与治疗提供了更多、更有效的手段。本报告首先简要介绍光学技术在生物医学应用中的发展概况,然后从基因表达及蛋白质—蛋白质相互作用研究方面,讨论生物分子光学技术的特点与优势,阐明基于分