机器学习新算法加速药物研发进程

据物理学家组织网2月6日报道,加拿大多伦多大学的科研人员最新研制出了一套新的机器学习算法,能生成微小蛋白质分子的3D结构。研究人员指出,新算法有望彻底变革药物的研发进程以及我们对生命的理解。 研发人员之一、多伦多大学的博士生阿里·普勒贾尼解释称,确定蛋白质分子的3D原子结构对于理解它们的工作原理及其对药物治疗产生何种反应至关重要。 药物会附着到特定蛋白质分子上,改变其3D形状及工作方式。理想的药物一般被设计成某种特定形状,使其仅附着到某个特定的蛋白质或与疾病相关的蛋白质上,而且在其附着到体内其他蛋白质上时不会出现副作用。 鉴于蛋白质比光波波长还小,如果不使用复杂技术,如冷冻电子显微镜(Cryo-EM)技术,无法直接看见它们。Cryo-EM技术使用高能显微镜,从不同方位将冷冻蛋白质的样本拍摄出成千上万张低清晰度图像,但用这些低清晰度2D图像拼接出正确的高清3D结构非常困难。 而新算法使用显微图像重建了蛋白质分子的3D结......阅读全文

机器学习新算法加速药物研发进程

  据物理学家组织网2月6日报道,加拿大多伦多大学的科研人员最新研制出了一套新的机器学习算法,能生成微小蛋白质分子的3D结构。研究人员指出,新算法有望彻底变革药物的研发进程以及我们对生命的理解。  研发人员之一、多伦多大学的博士生阿里·普勒贾尼解释称,确定蛋白质分子的3D原子结构对于理解它们的工作原

新冠药物,引发药物研发新变革

在新冠药物研发中,我国新药研发力量得到加强,实力渐显。五十余个新冠药物获批进入临床试验阶段,抗疫“三方”中药新药获批上市,我国首款抗新冠病毒药物获批上市……经过两年多的攻坚研发,中国原创新冠药物正在或即将参与到终结新冠大流行的战斗中。 国家药品监督管理局的最新统计数据显示:截至2022年2月底,

药物动力学模拟新算法,将减少新冠药物开发时间

英国《自然》杂志近日在线发表一篇重磅研究。在美国华盛顿大学蛋白质设计研究所所长、2021年生命科学突破奖获得者戴维·贝克的带领下,研究人员创造了一种生产蛋白质药物的强大新方法。利用计算机,他们设计了可以针对体内重要蛋白质(如胰岛素受体,以及病毒的表面蛋白)的小分子结合蛋白。这一进展或有助于开发应对诸

Science:新算法有望加快艾滋病疫苗研发

  美国研究人员9日在学术期刊《科学》上报告说,他们开发出一种新计算方法,可以更快地发现抵御艾滋病病毒的强力抗体,这一成果有望加快艾滋病疫苗研发。   开发艾滋病疫苗是全球面临的重要任务和挑战。尽管艾滋病病毒已发现30多年,但由于其多变和多样性,迄今还没有一种针对该病的疫苗能离开实验室并大量应用。

新算法突破实现药物靶标亲合力快速精准预测

海南大学药学院教授罗海彬团队联合中山大学药学院副教授李哲团队提出了一种基于组合结构的相对结合自由能 (CS-FEP) 的药物设计新方法,实现小分子药物与生物大分子靶标间的结合自由能(以下简称药物-靶标亲合力)的快速精准预测,取得药物设计关键技术的突破,实现自由能微扰(FEP)在药物设计新方法领域的国

新算法突破实现药物靶标亲合力快速精准预测

  海南大学药学院教授罗海彬团队联合中山大学药学院副教授李哲团队提出了一种基于组合结构的相对结合自由能 (CS-FEP) 的药物设计新方法,实现小分子药物与生物大分子靶标间的结合自由能(以下简称药物-靶标亲合力)的快速精准预测,取得药物设计关键技术的突破,实现自由能微扰(FEP)在药物设计新方法领域

科学家研发新算法-可快速揭示细胞内部结构

  借由高功率显微镜和机器学习,美国科学家研发出一种新算法,可在整个细胞的超高分辨率图像中自动识别大约30种不同类型的细胞器和其他结构。相关论文发表在最新一期的《自然》杂志上。  领导该COSEM(电子显微镜下细胞分割)项目团队的奥布蕾·魏格尔说,这些图像中的细节几乎不可能在整个细胞中手动解析。仅一

加速新药研发!新算法助力质谱数据准确高效预测小分子

  小分子的鉴定是生命科学一项关键任务。质谱(mass spectrometry,MS)可用于分析化合物成分,高通量质谱技术能够从数十万个环境中收集小分子的串联质谱。然而,现有的方法是基于化学领域的知识,无法解释小分子质谱中的许多峰。  卡内基梅隆大学和俄罗斯圣彼得堡国立大学的研究人员提出一种算法—

抗真菌药物研发找到新靶点

  近日,四川大学华西二院教授刘瀚旻团队、研究员邓东团队和研究员王祥合作在抗真菌药物作用机制研究中取得重要突破。该研究聚焦药物分子Manogepix抑制真菌GWT1的分子机制,为抗真菌药物的研发提供重要理论支撑。相关研究成果发表于《自然—通讯》。  近年来,真菌感染已成为全球公共卫生领域的一大挑战。

港中大等研发新演算法预测糖尿病患者肾脏功能

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500677.shtm

新抑制剂有助研发抗肿瘤药物

  近日,中科院广州生物医药与健康研究院的研究人员利用计算机辅助药物设计原理和合理药物设计的方法,成功设计合成了新型组蛋白去乙酰化酶I型选择性抑制剂。这为进一步研究具有选择性的组蛋白去乙酰化酶抑制剂提供了非常好的模型,对肿瘤表观遗传及个体化治疗提供了有益的方向。相关研究成果日前在《美国化学会药物化学

“我不是药神”,我是“药物研发新模型”

  “吃个橘子”,蹭个旧热度,安利一种新型的药物研发细胞模型:人iPS细胞来源组织细胞。  《我不是药神》堪称今年爆款,小编观影时也是完全沉浸其中,跟着剧情嬉笑怒骂。可电影只是电影,观影后小编也在思考这天价药到底是谁的锅?推给药物公司貌似也不妥,毕竟从药物发现到新药注册,涉及药物筛选、药效学研究、药

新细胞培养技术确保药物研发更成功

研究人员开发出了一种独特的实验室内细胞和组织培养技术,其培养条件与人体内环境很相似。 这项技术的ZL权由Durham大学的研究人员和附属的公司ReInnervate有限公司持有。该技术利用一种塑料支架使细胞在一种更接近体内细胞生长环境的三维环境中生长,而通常的细胞培养都是在培养皿的平面上。 该

新算法提升基因融合检测效率

  近日,华大基因公开一种基因融合检测算法SOAPfuse。模拟数据和真实验证数据的综合测评表明,该算法具有准确率高、敏感性强、精度高、资源消耗少等优点。该算法主要采用局部穷举算法和一系列精细的过滤策略,从而对基因融合进行快速、精确的检测。相关研究成果在《基因组生物学》(Genome

癌症细胞补给线或为药物研发提供新靶标

如果血管生成拟态的确为转移铺就了道路,那么阻止它就会拯救生命。 2000年3月的一个大冷天,上百位研究人员挤在美国盐湖城一个宾馆的礼堂内,迫切想观看就癌症研究中最具争议性的观点发起的终极对决。一边是爱荷华大学癌症中心癌症生物学家Mary Hendrix。1年前,她的团队报告称,肿瘤细胞能利用血液

流动化学作为新的技术在药物研发领域兴起

  流动化学(有时指间断式流动,微化学或连续流动化学)创新地将传统独立分开的合成操作过程整合起来,加快了合成的速度,尤其是能进行危险的、不易实现的反应条件,对于绿色化学和实验室自动化领域具有非常重要的意义。   流动化学极易实现化学反应器的微型化,即微反应器或芯

新冠疫情给癌症药物研发按下“暂停键”

由于医院将更多资源用于照顾新冠肺炎重症患者,临床研究已经中断。图片来源:Alberto Pizzoli/AFP/Getty  科学家们正急于启动针对冠状病毒的实验性疫苗和COVID-19治疗的临床试验。但是,由于医院面临COVID-19危重病人的冲击,全世界的实验室都被打乱,研究人员不得不搁置其他疾

癌症细胞补给线或为药物研发提供新靶标

   如果血管生成拟态的确为转移铺就了道路,那么阻止它就会拯救生命。  2000年3月的一个大冷天,上百位研究人员挤在美国盐湖城一个宾馆的礼堂内,迫切想观看就癌症研究中最具争议性的观点发起的终极对决。一边是爱荷华大学癌症中心癌症生物学家Mary Hendrix。1年前,她的团队报告称,肿瘤细胞能利用

BioCon-2021聚焦新冠热点:核酸疫苗与药物研发

  分析测试百科网讯 2021年4月22-23日,BioCon 2021第八届国际生物药大会暨生物技术仪器设备与试剂展览会在上海宝华万豪酒店盛大开幕。在以“核酸疫苗与药物研发”为主题的分论坛上,生物医药产业大咖纷纷带来前沿的核酸疫苗研发进展,探讨了新冠疫苗的开发工艺和研发流程及现状,吸引了大批现场参

新冠药物研发应急项目2022年度指南

新型冠状病毒药物研发应急项目2022年度申报指南  按照国家重点研发计划“公共安全风险防控与应急技术装备”重点专项组织管理的相关要求发布,遴选项目择优支持。其中项目不下设课题、对项目负责人无限项要求。网上填报时间:2022 年 5 月 19 日 08:00 至 2022 年 6 月 6 日 16:0

新算法让监控复杂系统变简单

  在一个复杂系统中,如包含了2万个互相联系的基因的人类基因组,要想一次监控整个系统几乎是不可能的。据物理学家组织网近日报道,来自美国东北大学、麻省理工大学等单位的研究人员开发出一种新算法,能识别出复杂系统的子单位或必要结点,使监控大型复杂系统成为可能。相关论文发表在最近出版

拥有-“嗅觉”-的新神经算法芯片介绍

前言: 人类除视觉、听觉之外,在嗅觉研究上有新突破,带来新想象空间和应用空间,人类对大脑的认知以及类脑芯片、AI芯片又跨上新台阶,未来的芯片发展之路又有可能另辟蹊径。类似人类大脑的神经拟态芯片神经拟态计算一直被寄予厚望。就算摩尔定律终结,它仍能继续带领信息时代向前。神经拟态计算可以大幅度提升

德研发出由算法自动生成的机器人

  “遗传机器人”正朝着不需要人类插手即能完全自行制造的机器人进发。最近,德国科学家使用遗传软件算法和快速制造技术创造出了这种能自动生成的机器人结构,并将于12月1日至4日在德国法兰克福欧洲国际模具展览会上展示这些移动机器人。   对于工程师来说,让机器人的运动模式化并使它们移动或

国际团队提出一种新量子算法

  一个国际研究小组近日在美国《科学进展》杂志上介绍,他们设计了一种新型量子算法,有望推动量子计算在物理、化学等多个领域的应用。  据介绍,在复杂量子系统中存在能量较小的基态,还有能量较高的激发态。过去的量子算法只能对基态问题进行有效且精确求解。针对这个问题,英国布里斯托尔大学、美国微软公司、中国中

预测小分子抗癌活性有了新算法

  记者从中科院昆明动物研究所获悉,该所李功华博士在研究员黄京飞的指导下,开发了一个新的基于分子药效团的小分子比对算法,并成功应用于预测小分子的抗癌活性。近日,该研究发表在顶级计算生物学杂志《生物信息学》上。   据李功华介绍,开发新的抗癌药物是科学界和医学界的热点和难点。直接采用实验的方法筛选抗

新算法可大幅提高图像边界识别效率

  美国麻省理工学院的研究人员日前称,他们开发出了一种新的图像分割算法,可将传统分割算法的效率提高上万倍。该研究将有助于改善医疗成像系统的识别精度并实现对特定3D物体的连续跟踪识别。  当我们推开窗户向外张望时,马上就能看到汽车、人行道、行人或者远处高大的建筑。这在计算机领域中被称为视觉识别,对人类

新算法TarCA用于揭示早期细胞命运决定

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518091.shtm近日,中山大学生命科学学院教授贺雄雷团队基于细胞谱系追踪技术构建的发育细胞谱系树,结合群体遗传学的经典溯祖理论思想,建立了一种估计祖先细胞群体大小的统计方法TarCA,以此来研究胚胎发

新算法可模拟人脑整体神经电路

   下一代超级计算机利用新算法,可模拟人脑整体神经电路。图片来自网络  科技日报东京3月28日电 (记者陈超)日本理化学研究所日前宣布,他们的一个国际联合研究小组成功开发出模拟人脑整体神经电路的算法,可在下一代超级计算机上应用。新算法不仅节省内存,也能大幅提高现有超级计算机上的脑模拟速度。  神经

新算法将物理问题转化为量子语言

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/515050.shtm科技日报讯 (记者刘霞)谷歌公司科学家设计出一种算法,可将复杂的物理问题转化为量子物理学的语言,这可能使量子计算机变得更有用。相关论文发表于最近的《物理评论X》杂志。 新成果

新冠肺炎:30种可能有效的成熟药物+5种加快研发药物

  由于受到新型冠状病毒(简称“新冠”,2019-nCOV)感染肺炎疫情的影响,国家药监局药审中心(CDE)日前调整了疫情期间的药品注册受理等事项,除防控2019-nCOV感染肺炎等特殊产品的申报可随时联系CDE之外,其他现场注册、签收、申报、咨询等业务将暂停。  2月8日,国家卫健委印发了《关于印