PRC2与lncRNA相互作用的序列特异性研究获进展

国际学术期刊《科学报告》(Scientific Reports)近期在线发表了中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所邵振研究组关于PRC2与长非编码RNA(lncRNA)之间相互作用的序列特异性研究成果,题为The PRC2-binding long non-coding RNAs in human and mouse genomes are associated with predictive sequence features。 由多梳(PcG)家族蛋白组成的表观调控复合物PRC2是控制动物组织发育的重要因子,但在高等动物中PRC2如何被特异性招募到染色质特定区域的分子机制还不清楚。随着XIST与HOTAIR等PRC2结合lncRNA的发现,人们猜测此类lncRNA可能决定了PRC2染色质招募的特异性(Margueron et al. Nature 2011)。但是,直到现在PRC2与RNA结合是否具有序列特异性仍被......阅读全文

PRC2与lncRNA相互作用的序列特异性研究获进展

  国际学术期刊《科学报告》(Scientific Reports)近期在线发表了中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所邵振研究组关于PRC2与长非编码RNA(lncRNA)之间相互作用的序列特异性研究成果,题为The PRC2-binding long non-coding RNAs in hu

Sci-Rep:PRC2与lncRNA相互作用的序列特异性新发现

  国际学术期刊《科学报告》(Scientific Reports)近期在线发表了中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所邵振研究组关于PRC2与长非编码RNA(lncRNA)之间相互作用的序列特异性研究成果。  由多梳(PcG)家族蛋白组成的表观调控复合物PRC2是控制动物组织发育的重要因子,但在

序列特异性引物的概念

中文名称序列特异性引物英文名称sequence specific primer;SSP定  义一种测定基因突变的方法。即利用针对点突变的2个等位特异性寡核苷酸(ASO)引物(A、B标记其中之一)与另一共同引物(C)组成引物系统;在引物延伸时,A与B同时竞争靶序列上同一复性位点,扩增反应后,经凝胶电泳

序列特异性引物的概念

中文名称序列特异性引物英文名称sequence specific primer;SSP定  义一种测定基因突变的方法。即利用针对点突变的2个等位特异性寡核苷酸(ASO)引物(A、B标记其中之一)与另一共同引物(C)组成引物系统;在引物延伸时,A与B同时竞争靶序列上同一复性位点,扩增反应后,经凝胶电泳

序列特异性引物的作用

序列特异性引物指一种测定基因突变的方法。即利用针对点突变的2个等位特异性寡核苷酸(ASO)引物(A、B标记其中之一)与另一共同引物(C)组成引物系统;在引物延伸时,A与B同时竞争靶序列上同一复性位点,扩增反应后,经凝胶电泳及放射自显影,胶片上的显带是标记同位素的引物所扩增的产物。

序列特异性引物的定义和技术特点

序列特异性引物指一种测定基因突变的方法。即利用针对点突变的2个等位特异性寡核苷酸(ASO)引物(A、B标记其中之一)与另一共同引物(C)组成引物系统;在引物延伸时,A与B同时竞争靶序列上同一复性位点,扩增反应后,经凝胶电泳及放射自显影,胶片上的显带是标记同位素的引物所扩增的产物。

序列特异性DNA结合蛋白的亲和层析纯化实验

DNA亲和介质的制备 DNA偶联于溴化氰活化的琼脂糖上 用制备性凝胶电泳纯化寡核苷酸 DNA亲和层析法             实验方法原理

序列特异性DNA结合蛋白的亲和层析纯化实验

实验方法原理 实验材料 两种带有结合位点的合成寡核苷酸各440μg试剂、试剂盒 TE缓冲液 pH 7.810×T4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液20 mmol L ATP (钠盐) pH 7.0150 m Ci mL [γ-32P] ATP (6000 Ci mmol)10 U μL T4噬菌体多

天然RNA文库筛选与蛋白特异性结合的RNA序列实验

实验方法原理 细胞中,蛋白质与 RNA 结合参与多种生理调控和发育过程。在 mRNA 的加帽,多聚腺苷酸化,剪切,核外运,翻译起始及降解等过程中都存在着蛋白质与 RNA 的直接相互作用。在发育的各个阶段,RNA 结合蛋白可以通过与 mRNA 的相互作用调控基因的表达。实验材料 mRNA寡核苷酸试剂、

天然RNA文库筛选与蛋白特异性结合的RNA序列实验

            实验方法原理 细胞中,蛋白质与 RNA 结合参与多种生理调控和发育过程。在 mRNA 的加帽,多聚腺苷酸化,剪切,核外运,翻译起始及降解等过程中都存在着蛋白质与 RNA 的直接相互作用。在发育的各个阶段,RNA 结合蛋白可以通过与 m

天然RNA文库筛选与蛋白特异性结合的RNA序列实验

细胞中,蛋白质与 RNA 结合参与多种生理调控和发育过程。在 mRNA 的加帽,多聚腺苷酸化,剪切,核外运,翻译起始及降解等过程中都存在着蛋白质与 RNA 的直接相互作用。在发育的各个阶段,RNA 结合蛋白可以通过与 mRNA 的相互作用调控基因的表达。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞

中国科学家9月参与发表多篇Nature文章

  9月中国学者参与的多项研究在Nature杂志及其重要子刊上发表,其中包括首次揭示m6A甲基化修饰的新作用,表观遗传调控核心复合物PRC2招募到基因组上重要位点的分子机制,以及兰花基因关键演化机制。  来自中科院动物研究所,北京基因组研究所的研究人员通过m6A测序技术(m6A-Seq),首次揭示m

用原位筛选法分离编码序列特异性DNA结合蛋白的cDNA

放射性标记DNA探针的制备l      聚丙烯酰胺凝胶的制备1.按照(三)中操作流程灌制非变性聚丙烯酰胺凝胶。将10×TBE稀释成0.5×的工作浓度。聚丙烯酰胺的工作浓度取决于待测DNA片段的大小,200bp左右的片段需要4~5%的凝胶,小于100bp的片段应灌制6~8%的凝胶。 l      DN

序列特异性DNA结合蛋白亲和层析纯化实验DNA亲和介质制备

实验材料两种带有结合位点的合成寡核苷酸各440μg试剂、试剂盒TE缓冲液 pH 7.810×T4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液20 mmol L ATP (钠盐) pH 7.0150 m Ci mL [γ-32P] ATP (6000 Ci mmol)10 U μL T4噬菌体多核苷酸激酶(New Eng

The-PRC2-Complex-Sets-Long-杢erm-Gene-Silencing-Through-Modification

Packaging of DNA into chromatin allows the cell to store its genetic information efficiently and has an important role in regulating gene expression.

序列特异性DNA结合蛋白亲和层析纯化实验_DNA亲和层析法

实验材料制备性的DNA亲和层析树脂试剂、试剂盒缓冲液Z或其他柱缓冲液(如缓冲液Ze或TM)配制时含不同的KCl浓度(从缓冲液 Z 0.1 mol L KCl 至缓冲液 Z 1 mol L KCl对缓冲液Z 0. 1 mol L KCl透析的部分纯化的蛋白质组分非特异性的竞争DNA柱再生缓冲液柱储存缓

深度学习算法优化序列特异性的CtoG单碱基编辑器

  8月12日,Nature Communications发表了题为Optimization of C-to-G base editors with sequence context preference predictable by machine learning methods的研究论文,该研

科学家发现与HIV控制相关的患者特异性抗原表位序列

  1月15日,德国马普所科研人员在PNAS上发表了题为“HIV peptidome-wide association study reveals patient-specific epitope repertoires associated with HIV control”的文章,通过HIV多肽

遗传调控核心复合物-PRC2-基因组上重要位点的分子机制

  国际顶级学术期刊 Nature(《自然》)在线刊登了北京师范大学生命科学学院细胞增殖及调控生物学教育部重点实验室王占新教授课题组 发表 的题为“Polycomb-like proteins link the PRC2 complex to CpG islands”的文章,报道了该研究组关于 PC

研究基于学习算法优化序列特异性的CtoG单碱基编辑器

  8月12日,Nature Communications发表了题为Optimization of C-to-G base editors with sequence context preference predictable by machine learning methods的研究论文,该研

前导序列

中文名前导序列外文名leader sequence前导序列是结构基因中编码区之前的一段序列,这部分序列能被转录,但不被翻译,在mRNA是从5′端起至结构基因第一编码子开始点(通常 AUG)为止,在蛋白质合成过程中不被翻译。

Nat-Struct--Mol-Biol:鉴别出激活肿瘤抑制基因表达的新方法

  近日,一项刊登在国际杂志Nature Structural and Molecular Biology上的研究报告中,来自伦敦大学学院的科学家们通过研究发现了一种新方法能重新激活肿瘤抑制基因,相关研究结果有望帮助开发出治疗癌症的新型靶向性疗法。图片来源:National Institutes o

核酸序列分析

【实验目的】1、 掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基本步骤;2、 掌握使用BioEdit软件进行核酸序列的基本分析;3、 熟悉基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析(内含子/外显子分析);4、 了解基因的电子表达谱分析。【实验原理】针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因,找出基因的位置和

植物基因沉默怎么搞?

  “植物的种子时期,大量基因都被沉默,直到植物成年以后才按需活化,”植物生化和光合作用研究所(IBVF)的Myriam Calonje Macaya博士解释道。细胞分裂后,基因沉默状态还会传递给子细胞,从而建立细胞记忆。多梳蛋白家族(Polycomb-group proteins,PcG蛋白)参与

EZH1基因编码功能及结构描述

EZH1是一种非特异性多omb抑制复合物-2(PRC2)的组成部分,它介导组蛋白H3(见MIM 602812)lys27(H3K27)的甲基化,并在维持胚胎干细胞多能性和可塑性方面发挥作用(Shen等人,2008年【PubMed 19026780】。EZH1 is a component of a

设计引物用cds序列和cdna序列的区别

cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段。由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可。

冲激序列信号与阶跃序列信号各有什么特性

单位脉冲序列只在n=0 处有一个单位值1,其余点上皆为0;单位阶跃序列只有在n>=0时,才取非零值1,当n

EZH1基因突变与药物因子介绍

EZH1是一种非特异性多omb抑制复合物-2(PRC2)的组成部分,它介导组蛋白H3(见MIM 602812)lys27(H3K27)的甲基化,并在维持胚胎干细胞多能性和可塑性方面发挥作用(Shen等人,2008年【PubMed 19026780】。【由OMIM提供,2009年3月】EZH1 is

研究发现PRC2复合体能够缓冲ABA诱导的植物凋亡

  The Plant Journal 期刊在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组题为Polycomb repressive complex 2 attenuates ABA-induced senescence in Arabidopsis 的研究论文。该研究

研究发现PRC2复合体能够缓冲ABA诱导的植物凋亡

  10月11日,The Plant Journal 期刊在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组题为Polycomb repressive complex 2 attenuates ABA-induced senescence in Arabidopsis 的研