Science：测序需警惕！你可能检测到了“假突变”
你可能检测到了一个“假突变”！2月17日，科学家们在Science上表示，在DNA样本中检测到的的一些序列突变实际上可能是样本处理过程中遭受损伤所造成，诱导损伤引发的突变占据了大多数的低频及中频突变。更重要的是，他们发现，被广泛使用的测序数据集中也存在着DNA损伤的印迹，包括千人基因组计划数据集（1000 Genomes Project ）和Atlas癌症基因计划数据集（The Cancer Genome Atlas）。这些损伤直接混淆了数据集中体细胞突变的鉴定。 发现问题再解决问题，这是科学的发展模式。针对这种现象，研究人员已经设计出了专门用于评估损伤程度的算法，并建议在样品制备过程中使用DNA修复酶，或许这种方法可以纠正“假突变”的问题。 DNA样本制备引发突变 众所周知，从古老标本或福尔马林固定的石蜡包埋组织中提取DNA样本很容易造成破碎和引发化学修饰，这会导致DNA发生突变。最近的证据表明，事实上任何DNA样本......阅读全文
SDS碱裂解法制备质粒DNA：大量制备实验
实验方法原理 用碱和SDS处理可以从大规模（500ml）的细菌培养物中分离质粒DNA，所获得的质粒则可通过柱层析或CsCl-溴化乙锭梯度离心进一步纯化实验步骤 材料：缓冲液和溶液：碱裂解液 I：50 mmol/L 葡萄糖25 mmol/L Tris-HCl（pH8.0）10 mmol/L EDTA（
SDS碱裂解法制备质粒DNA：大量制备实验
实验方法原理 用碱和SDS处理可以从大规模（500ml）的细菌培养物中分离质粒DNA，所获得的质粒则可通过柱层析或CsCl-溴化乙锭梯度离心进一步纯化 实验步骤
Science：测序需警惕！你可能检测到了“假突变”
你可能检测到了一个“假突变”！2月17日，科学家们在Science上表示，在DNA样本中检测到的的一些序列突变实际上可能是样本处理过程中遭受损伤所造成，诱导损伤引发的突变占据了大多数的低频及中频突变。更重要的是，他们发现，被广泛使用的测序数据集中也存在着DNA损伤的印迹，包括千人基因组计划数据集
折叠DNA有望精准制备纳米材料
DNA纳米折纸术已被应用于光学材料的诸多领域。图片来源：科界App DNA折纸术虽然给纳米材料带来了无限的想象空间，但是，想要随心所欲地折叠DNA链，说起来容易做起来难。 DNA只能是双螺旋结构吗？当然不是，它还可以是网状、方形、心形，甚至可以拼出复杂的“中国地图”。 需要通过光学显微镜才能查
DNA荧光染色的样品制备实验
试剂、试剂盒 PBS 仪器、耗材 DNA荧光染料 流式细胞仪 实验步骤
折叠DNA有望精准制备纳米材料
DNA只能是双螺旋结构吗？当然不是，它还可以是网状、方形、心形，甚至可以拼出复杂的“中国地图”。 需要通过光学显微镜才能查看的DNA链，科学家竟然也能像折纸一样，把它们有目的地折叠成各种纳米结构，这也被称为DNA纳米折纸术。 作为一种精确高效的DNA自组装方法，DNA纳米折纸术应用的范围越来
DNA荧光染色的样品制备实验
试剂、试剂盒PBS仪器、耗材DNA荧光染料流式细胞仪实验步骤DNA是细胞内含量比较恒定的参量，随着细胞增殖周期的各时相而发生变化。荧光染料（如PI）可选择性地定量嵌入核酸（DNA/RNA）的双螺旋碱基之间，与细胞特异性结合，DNA含量与荧光染料的结合量成正比，因此通过测定荧光强度可获知细胞的增殖情况
DNA疫苗的制备方法和特点
DNA疫苗 又称基因疫苗或核酸疫苗，将能编码引起保护性免疫应答的病原体免疫原基因片段和质粒重组，重组体直接注入宿主机体，使体内持续表达该抗原，进而诱导出保护性体液免疫和细胞免疫的新型疫苗.这种核酸既是载体，又能在真核细胞中表达抗原，刺激机体产生特异而有效的免疫反应。优点：免疫效果好，可激发机体全面免
小鼠肝基因组DNA制备
原理DNA 以核蛋白形式存在于细胞核中，制备 DNA 的原则是既要将 DNA 与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及链霉蛋白酶 E 的应用使这两个原则得到了保证。蛋白酶K 或链霉蛋白酶 E 均为广谱蛋白酶，其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。
牙签法小量制备质粒DNA实验
用牙签从琼脂培养基上挑取的菌落可直接用于制备质粒 DNA。所得的闭合环状 DNA 往往杂质太多，不能作为大多数限制酶的底物。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理用牙签从琼脂培养基上挑取的菌落可直接用于制备质粒 DNA。所得的闭合环状 DNA 往往杂质太多，不能作为大多数限制酶
用于－PCR－的模板－DNA－制备实验
酚-氯仿法提取石蜡组织中 DNA 改进的石蜡切片 DNA 提取方法 直接法（DNA 免提法） 冰冻片 含血标本 胸腹水或尿液
小鼠肝基因组DNA制备
原理DNA 以核蛋白形式存在于细胞核中，制备 DNA 的原则是既要将 DNA 与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及链霉蛋白酶 E 的应用使这两个原则得到了保证。蛋白酶K 或链霉蛋白酶 E 均为广谱蛋白酶，其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。
DNA－亲和介质的制备实验（二）
寡核苷酸的连接1) 取 10ul 10X 接头-激酶缓冲液加入 65ul 水中，将 DNA 震荡溶解于此溶液。2) 加 20ul 20 mmol/L ATP(pH7.0) 及 5ulT4 DNA 连接酶（30Weiss 单位)，得最终反应体积为 100ul。3) 在室温下孵育≥2 h。若 AP-1
细菌质粒－DNA－的小量制备实验
细菌质粒的发现是微生物学对现代分子生物学发展的重要贡献之一。特别是自 70 年代末以来，根据质粒分子生物学特性而构建的一系列克隆和表达载体更是现代分子生物学发展、改良生物品种和获得基因工程产品不可缺少的分子载体，发展十分迅速，而质粒的分离和提取则是最常用和最基本的实验技术，其方法很多。仅大肠杆菌质粒
用于－PCR－的模板－DNA－制备实验
实验方法原理 实验步骤 1. 10 mm 厚石蜡切片 10～15 张，置入消毒后的 1.5 ml Eppendorf 管中。2. 脱蜡 二甲苯 1200 μl，9000 r/min，8 min×3。3. 脱水无水乙醇 1200 μl，9000 r/min，5 min×3。4. 打开 Eppendor
关于互补DNA的制备方法介绍
制备互补DNA，往往需要先分离从目的基因转录来的mRNA.如果该基因编码的蛋白质是细胞中的主要蛋白质，则此基因的产物是总mRNA的主要组成部分 [2] 。就胰岛B细胞而论，此细胞含有高水平胰岛素前体mRNA，后者有时可以沉淀正在翻译的mRNA的核糖核蛋白体，如果用特异抗体结合所表达的蛋白质(抗原
牙签法小量制备质粒DNA实验
实验方法原理 用牙签从琼脂培养基上挑取的菌落可直接用于制备质粒 DNA。所得的闭合环状 DNA 往往杂质太多，不能作为大多数限制酶的底物。试剂、试剂盒 抗生素溴酚蓝溶液EDTA溴化乙锭NSS 溶液KCl琼脂糖凝胶仪器、耗材 LB、YT 或 SOB热循环仪木质牙签实验步骤 一、材料1. 缓冲液和溶液(
DNA测序的凝胶的制备介绍
（1）玻璃板经粘合硅胶和Sigmacote处理后，即可固定玻璃板。该方法是用0.2 mm或0.4 mm厚的边条置于玻璃板左右两侧，将另一块玻璃板压于其上。在长玻璃板的一侧插入鲨鱼齿梳平的一面边缘，用夹子固定住。 （2）根据所需要的凝胶浓度，按下表制备测序凝胶，一般6%～8%的胶浓度可获得较好的
牙签法小量制备质粒DNA实验
实验方法原理 用牙签从琼脂培养基上挑取的菌落可直接用于制备质粒 DNA。所得的闭合环状 DNA 往往杂质太多，不能作为大多数限制酶的底物。 试剂、试剂盒
制备互补DNA的方法和过程
制备互补DNA，往往需要先分离从目的基因转录来的mRNA.如果该基因编码的蛋白质是细胞中的主要蛋白质，则此基因的产物是总mRNA的主要组成部分。就胰岛B细胞而论，此细胞含有高水平胰岛素前体mRNA，后者有时可以沉淀正在翻译的mRNA的核糖核蛋白体，如果用特异抗体结合所表达的蛋白质(抗原)，则可从沉淀
酵母菌DNA制备实验1
实验材料酵母试剂、试剂盒YPD破菌缓冲液酚氯仿异戊醇LB仪器、耗材玻璃珠试管摇床培养箱离心机实验步骤1. 注盛于一个13 mm×100 mm 无菌玻璃试管中的2 ml 培养基接种含有带目的基因的质粒的酵母单菌落，在转动或摇动培养箱中30℃过夜培养到静止期。 2. 将1.5 ml 的过夜培养物转移
真核细胞DNA的制备与定量
制备基因组DNA是进行基因结构和功能研究的重要步骤，通常要求得到的片段的长度不小于100-200kb。在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素，以保证DNA的完整性，为后续的实验打下基础。一般真核细胞基因组DNA有107-9bp，可以从新鲜组织、培养细胞或低温保存的组织细胞中提取，常
DNA－亲和介质的制备实验（一）
试剂、试剂盒 ATP[y-32P]ATPT4多核苷酸激酶乙酸铵乙醇酚 氯仿氯仿 异戊醇NaOAcT4 DNA连接酶酚异丙醇重蒸水Sepharose CL-2B溴化氰NN-二甲基甲酰胺NaOH磷酸钾KClCNBr-活化的Sepharose*.4BHClT4 多核苷酸激酶缓冲液TE接头-激酶
酵母菌DNA制备实验2
实验材料酵母试剂、试剂盒TERNA酶乙酸铵无水乙醇仪器、耗材离心机培养箱玻璃培养管实验步骤1. 在18 mm×150 mm 无菌玻璃培养管或17 mm×100 mm 无菌聚丙烯酰胺管中用10 ml YPD培养基过夜培养酵母菌至静止期。2. 培养物室温下在台式离心机上1 200 g 离心5 min
DNA荧光染色的样品制备实验
试剂、试剂盒 PBS 仪器、耗材 DNA荧光染料 流式细胞仪 实验步骤
DNA断裂修复增加基因突变风险
据美国物理学家组织网近日报道，美国印第安纳大学与普渡大学印第安纳波利斯联合分校（IUPUI）和瑞典优密欧大学（Umea University）最近的一项联合研究显示，有一种细胞用于修复自身DNA断裂的方法（称为断裂诱导复制），比正常合成DNA产生的基因变异要高出2800倍。
新研究挑战DNA随机突变进化理论
根据美国加州大学戴维斯分校和德国马克斯普朗克发育生物学研究所开展的一项新研究，拟南芥可能是理解和预测DNA突变的关键。这一发表在12日《自然》杂志上的新发现，将从根本上改变人们对进化的理解，有朝一日或可帮助研究人员培育出更好的作物，甚至帮助人类对抗癌症。 当DNA受损且未修复时，就会发生突变，从
DNA突变按照基因功能改变分类
功能丧失突变也称失活突变，导致基因产物具有较少或完全没有功能（部分或完全失活）。当等位基因完全丧失功能（无效等位基因）时，它通常被称为无定形突变，与此类突变相关的表型通常是隐性的。功能获得性突变也称为激活突变，改变的基因产物，使其功能变强（增强激活），甚至被不同的异常功能所取代。当新等位基因被创建时
衰老源头找到了？DNA突变是“元凶”
“哀吾生之须臾，羡长江之无穷。”从秦皇汉武到普通百姓，很多人都憧憬长生不老。人的生物钟究竟是如何运转的？是什么导致人类在分子水平上的衰老？这也是现代生命科学领域的热点问题。现在，美国加州大学圣地亚哥分校医学院的科学家首次发现，两种主要衰老理论之间存在着前所未见的联系，这一发现或从根本上改变人类对抗衰
新鲜实体组织样本的制备（机械法）_剪碎法
实验方法原理机械法分散实体组织。用手术剪刀剪碎组织、用锋利的解剖刀剁碎组织或用匀浆器制成组织匀浆，再用细注射针头抽吸细胞或用 300 日尼龙网滤出单细胞悬液；采用网搓法也能获得大量细胞。机械法易造成细胞碎片和细胞团块，所以常与其他方法配合使用。实验材料组织酶试剂、试剂盒生理盐水仪器、耗材剪刀尼龙网实