科学家在蔷薇科叶绿体系统发育基因组研究中取得进展
系统发育基因组学是基因组学和系统发育生物学融合产生的一个交叉学科，主要用基因组水平的大规模分子数据解析生物之间的系统发育关系，并利用系统发育原理研究基因组进化机制。基因组大量的数据信息具有“缓冲”作用，能减少系统发育重建中的随机误差，使得引起基因树冲突的各种生物学因素被逐一分析，是当前重建生命之树，解析困难系统发育关系的最有效途径。由于大小适中、核苷酸置换率适度、容易比对、不存在旁系同源问题等优点，叶绿体基因组已经被广泛应用于解析困难类群的系统发育关系。蔷薇科包括约90属3000种，全球广布，具有多种世界最具经济价值的水果，如苹果、梨、桃、李、杏、樱桃、山楂，以及著名花卉如玫瑰、月季、梅花。植物学家对蔷薇科开展了大量分类和系统关系的研究，但由于频繁的杂交、孤雌生殖和可能的快速辐射分化等因素的影响，该科的亚科、族、属分类范畴仍存在很大争议，主要分支间系统发育关系难以解析，是系统发育重建最困难的植物类群之一。 中国科学院昆明植......阅读全文
昆明动物所研究团队在蝴蝶基因组大小进化方面获进展
蝴蝶因其丰富的形态多样性，自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一，近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型，已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。 中国科学院昆明动物研究所科研团队在2015年完成所有蝴蝶模式种金凤蝶及其
新研究揭示海生昆虫起源之谜
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505163.shtm 近日，中山大学教授谢强团队与华南师范大学教授栾云霞、荷兰自然历史博物馆博士陈萍萍等科研人员合作，研究揭示了海生昆虫起源之谜。相关研究以《海蝽回归海洋的3亿年进化历程》为题发表于《
细胞器基因组组装软件开发研究获进展
真核生物细胞器基因组包括线粒体和质体（包括叶绿体、白色体等）的全部DNA分子，是细胞质遗传的主要载体。在动植物和真菌的单个细胞内，有多个（甚至成千上万个）细胞器基因组单元的拷贝，使得利用低覆盖度的全基因组测序数据组装得到完整的细胞器基因组成为可能。随着DNA高通量测序技术的发展，测序成本下降，低
科学家在白腹鼠属系统发育研究中取得进展
中科院昆明动物所近日在白腹鼠属系统发育研究中取得进展，该研究成果发表于《BMC进化生物学》。 白腹鼠是一类分布于东南亚和中国大部地区的啮齿类动物，受限于其形态的相似性和模式标本保存地的分散性，白腹鼠属物种归属和界定与系统学一直存在诸多争议。 为解决白腹鼠属系统发育关系、厘定其分类系统、评估其
单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱
2019年10月10日，来自英国Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等机构的科学家在Nature上以长文形式发表了题为“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究，首次报道了由胎肝驱动的人胚胎
单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱
2019年10月10日，来自英国Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等机构的科学家在Nature上以长文形式发表了题为“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究，首次报道了由胎肝驱动的人胚胎
研究揭示纳米氧化锌干扰胎儿神经系统发育机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508395.shtm
首次发现人类外周神经系统发育的关键分子机制
近日，来自Geisinger's Sigfried and Janet Weis研究中心的研究者通过研究发现了人类外周神经系统发育的分子机制，相关研究刊登于国际杂志Nature Communications上，研究结果或为那些遭受遗传性神经病的患者提供帮助和治疗希望。 在文中，研究
蚜虫核基因EF1－alpha基因序列测定及系统发育分析
实验概要核基因含有更加丰富的遗传信息，生物的性状基本上是由核基因决定的，用适当的核基因研究昆虫的系统发育，结果更有可能真实地反映昆虫的进化历史。本研究采用DNA序列分析法，对三种蚜虫的核基因EF-1 alpha进行比较，通过系统发育树分析了它们的系统进化。这一结果结合三种蚜虫的mtDNA的C
Circ－Res－新研究揭秘对淋巴系统发育至关重要的蛋白
由淋巴管组成的淋巴循环系统在控制组织液含量中发挥重要作用，也是免疫系统发现并靶向威胁的重要场所。当淋巴系统功能异常时，组织液会富集在组织中，造成水肿。这可能是致命的，如肺水肿会造成呼吸停止。但是迄今为止淋巴系统发育背后的分子学机制还没有研究清楚，尤其是涉及淋巴系统发育后期，初级淋巴系统重塑形成成
昆明植物所在荨麻科分子系统发育框架研究中取得进展
荨麻科(Urticaceae)是被子植物一个中等大小的科，约有54属，2000余种，广泛分布于两半球的热带地区，延伸至温带，其中热带的亚洲是该科的多样性分布中心。荨麻科的很多种类有重要的经济价值、药用价值和生态价值，但由于其很多重要分类性状极其微小，不易观察，因此自该科1789年成立以来，其科下
华南植物园发表菊科一新属
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519636.shtm记者从中国科学院华南植物园获悉，该园植物中心研究员陈又生及其团队通过标本查阅和野外考察，描述了一个新种——亲二菊（Qineryangia baoxingensis Y. S. Chen
新研究确认被子植物八大主干支（祖传系）和22个分支
被子植物的崛起重塑了全球各大陆块主要生态系统格局，被子植物的起源和早期快速演化问题是植物学皇冠上的璀璨明珠。1879年，达尔文在给时任英国皇家植物园（邱园）主任J. D. Hooker爵士的信中称之为一个“恼人之谜”。此后的140年间，被子植物的起源与早期演化一直是植物学、古生物学和进化生物学研
Nature－Genetics：多种技术解析草莓基因组
近日，美国密歇根州立大学和加州大学戴维斯分校的研究人员组装出近乎完整的栽培草莓基因组，并揭示了这种复杂的异源多倍体的起源和进化过程。 一转眼又到了草莓上市的季节。这种小巧可爱的果实有着酸甜可口的味道，可搭配出各种各样的美妙滋味。不过，对于草莓的基因组，你又了解多少？ 世界各地广泛种植的凤梨草
植物所等在活化石植物分子进化速率研究中获进展
活化石是指起源古老，呈孑遗分布，并保留祖先形态特征的现存生物。这类生物通常有较低的分类多样性和孤立的系统位置，且通常濒临灭绝或者亟需保护。然而，目前对活化石，特别是植物活化石的分子进化和生态特性仍知之甚少。中国科学院植物研究所研究员王伟团队等以起源于白垩纪的活化石植物——领春木科（Eupteleac
植物所等在活化石植物分子进化速率研究中获进展
活化石是指起源古老，呈孑遗分布，并保留祖先形态特征的现存生物。这类生物通常有较低的分类多样性和孤立的系统位置，且通常濒临灭绝或者亟需保护。然而，目前对活化石，特别是植物活化石的分子进化和生态特性仍知之甚少。中国科学院植物研究所研究员王伟团队等以起源于白垩纪的活化石植物——领春木科（Eupteleac
研究解析簕杜鹃的演化历史和花色密码
近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所解析了簕杜鹃的演化历史，揭示了甜菜碱合成通路参与基因的表达模式与簕杜鹃花色形成之间的关联性，为进一步研究簕杜鹃重要观赏性状提供了理论依据。相关研究发表在《园艺研究(Horticulture Research)》上。 簕杜鹃又名三角梅，具有重要的园艺、生态
基因组测序揭示龟鳖躯体发育及进化机制
龟鳖类有着漫长且成功的演化历史，是形态学上最为特化的爬行动物之一。全球共有龟鳖类动物13科、89属、270余种，被分为两个特征明确的支系 ——侧颈龟亚目和曲颈龟亚目。中华鳖和绿海龟分别是曲颈龟中鳖类和海龟类的典型代表，对其进行基因组学研究，有助于理清龟鳖类系统发育及其躯体进化机制。 日
黄连助力解析小檗碱型生物碱生物合成机制
黄连是一种珍贵的中药材，其药用价值在神农本草经和本草纲目中均有记载。研究表明，黄连中的药用活性物质主要是小檗碱、黄连碱、药根碱、等原小檗碱类生物碱，并且这类物质被报道在心血管、糖尿病和癌症等的防治中具有重要作用。然而，由于基因组资源的限制，目前关于黄连地下根茎中丰富的原小檗碱型生物碱形成的进化机
鸟类家谱被重写！物种大爆发证实在恐龙灭绝后
鸟类是恐龙的后裔，所有其他类群的恐龙在白垩纪末期的大灭绝事件中走向了终结，但绝大多数现生鸟类的祖先却在短短不到1千万年的时间里，快速繁衍、分化出了非常多新的类群，堪称演化奇迹。可是，在过去一个多世纪里，现生鸟类家谱的内部关系一直悬而未决，成为了构建生命之树的代表性难题。4月2日，以我国科学家为发起方
科学家发表苔藓多样性、系统发育和适应性综述
近日，中国科学院植物研究所科研人员与合作者在《实验植物学杂志》上发表了基于基因组和转录组数据针对苔藓植物的多样性、系统发育和适应性研究的综述，该综述对目前已经发布的14个苔藓植物的基因组和151个苔藓植物的转录组进行了总结和梳理。 苔藓植物包括苔、藓和角苔三大分支，是现存最早的陆生植物，为
实蕨属植物系统发育和生物地理学研究获进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/509585.shtm
昆明植物所构建马先蒿属植物的分子系统发育框架
马先蒿属（Pedicularis Linn.）隶属于列当科，是北温带大属之一，包括约600余种，其中中国有360余种。喜马拉雅-横断山是该属的分布和多样化中心之一。马先蒿属花部形态特征极其多样化，属下系统划分和形态分类非常困难。依据形态性状建立的马先蒿属分类系统，包括李惠林系统（1948-194
昆明动物所在鼩鼹亚科系统发育研究中取得新进展
现生鼩鼹(shrew-like moles)栖息在中国西南的横断山系及周边地区，是鼹科中最原始的一支。由于形态上的保守性和野外采样的难度，有关该类群生物系统学的研究仍十分有限。另外，现生鼩鼹的分布区是全球最重要的生物多样性热点地区之一。中新世以来的全球气候变化和频繁的地质运动造就了这一区域复
昆明动物所中国野鲮亚科分子系统发育研究获进展
野鲮亚科 (Labeoninae) 鱼类隶属于鲤形目 (Cypriniformes) 鲤科 (Cyprinidae)，除了具有鲤科鱼类所有的典型共同特征外，在口唇及其相关软组织形态结构上具有鲤科鱼类其他亚科类群无法比拟的多样性。在系统发育研究历史上，由于选用的类群不全或较片面，诸多
木本植物系统发育特性对森林土壤真菌群落分布的影响
天然林土壤是真菌多样性的沃土和热区，包括了种类繁多的功能类群。这些功能类群对森林的养分循环、林木健康和生态系统稳定有重要作用。木本植物是森林的主体，不间断地将光合碳源转移至邻近土壤（以下简称根基土），并与土壤微生物间维系着紧密的联系。近期研究发现森林树木-真菌关系中存在极强的系统发育信号，然而，
Nature单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱
哺乳动物的造血与免疫系统发育是在胚胎发育过程中由多个组织以复杂的协同作用所驱动的【1】。尽管研究界对于人体中这一过程所涉及的功能主体和时间序列都有了较为准确的认识，例如造血干细胞是先从受孕后2至3周的胚胎外卵黄囊（yolk sac）中，以及从3至4周的胚胎主动脉-性腺-中肾区域（aorta-go
蚜虫mtDNA12S/16SrRNA基因序列测定及系统发育分析
实验概要线粒体DNA在分子进化中具有许多独特的优越性，mtDNA己成为研究生物(主要是动物)进化的重要材料。本研究所利用的mtDNA基因序列包括12SrRNA，16SrRNA以及12SrRNA和16SrRNA之间的序列，通过分析三种蚜虫mtDNA 12S/16SrRNA基因序列的进化，不仅揭示了
横断山高山竹类的快速辐射演化和物种多样性的形成机制
高山竹类是竹亚科青篱竹族（温带木本竹类）一个独特的分支，包括箭竹属（Fargesia）、玉山竹属（Yushania）、筱竹属（Thamnocalamus）、香竹属（Chimonocalamus）、冷箭竹属（Sarocalamus，即“alpine Bashania”），以及Bergbambos，
华南植物园在报春苣苔属叶绿体基因组装研究取得进展
报春苣苔属是典型的喀斯特岩溶洞穴植物，具有非常丰富的物种多样性和特有性，是研究喀斯特植物适应性进化和物种形成的理想模式。图1. 报春苣苔属叶绿体基因组一致性圈图 中科院华南植物园植物科学研究中心冯超博士等人在康明研究员的指导下，以报春苣苔属植物为材料，率先搭建了该属三个完整的叶绿体基因组并进行